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两个不同籽粒硬度小麦的比较蛋白组学分析
刘培勋,马小飞,万洪深,郑建敏,罗江陶,蒲宗君
作物学报    2020, 46 (8): 1275-1282.   DOI: 10.3724/SP.J.1006.2020.91068
摘要   (595 HTML27 PDF(pc) (636KB)(665)  

小麦是全球种植面积最大粮食作物, 为全球45亿人提供日常蛋白和能量摄入的20%。弄清小麦籽粒硬度遗传基础, 对于改良小麦品质具有重大意义。为探讨不同硬度小麦种子的分子基础, 本实验选用西南麦区2个硬度差异极显著的小麦品种川麦66和蜀麦969, 从蛋白水平上分析其种子蛋白差异表达情况, 利用TMT定量蛋白质组学技术(tandem mass tags)结合生物信息学分析, 分析差异表达的蛋白及其功能和通路等富集情况。结果表明, 鉴定并定量了有效蛋白6020个, 其中显著差异表达蛋白113个, 在软质麦川麦66中上调表达的69个, 下调表达的44个。差异蛋白GO富集分析共富集到65个GO条目, 达到极显著富集水平的包括生物过程的1个条目、细胞组成的1个条目和分子功能的6个条目。推测营养库活性类蛋白、酶抑制剂活性类蛋白和谷胱甘肽代谢途径类蛋白可能参与小麦籽粒硬度形成。籽粒硬度相关蛋白可能主要分布于细胞胞外区, 具有防御作用。从系统发育分析推测, puroindolines蛋白及其同源蛋白, 可能既作为小麦籽粒贮藏蛋白, 同时还能作为酶抑制剂调控籽粒发育。本研究为进一步探索小麦籽粒硬度遗传机制提供了参考。



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图4 GO富集柱状图
A属于生物过程(BP), B属于细胞组分(CC), C、D、E、F、G、H、I、J属于分子功能(MF)。A: 防御反应; B: 胞外区; C: 营养库活性; D: 酶抑制剂活性; E: 酶调节活性; F: 丝氨酸型内肽酶抑制剂活性; G: 肽链内切酶抑制剂活性; H: 天冬氨酸型内肽酶活性; I: 电子载体活性; J: 几丁质结合。
正文中引用本图/表的段落
GO显著性富集分析能分析差异蛋白行使的主要生物学功能。2个小麦样品中, 表达差异显著的113个蛋白经GO富集分析, 富集到65个GO条目中, 去除仅包含1个差异蛋白的条目, 剩余33个可靠GO条目。其中, 达到显著富集(P<0.05)水平的GO条目为10个, 属于生物过程1个, 细胞组分1个, 分子功能的8个(图4)。达到极显著富集(P<0.01)水平的条目为8个, 生物过程条目有1个, 为防御反应过程(defense response); 细胞组分条目有1个, 为胞外区(extracellular region); 分子功能条目有6个, 包括营养库活性(nutrient reservoir activity)、酶抑制剂活性(enzyme inhibitor activity)、酶调节活性(enzyme regulator activity)、丝氨酸型内肽酶抑制剂活性(serine-type endopeptidase inhibitor activity)、肽链内切酶抑制剂活性(endopeptidase inhibitor activity)和天冬氨酸型内肽酶活性类(aspartic-type endopeptidase activity)。
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