适于陆地棉品种身份鉴定的SNP核心位点筛选与评价

朱国忠,张芳,付洁,李乐晨,牛二利,郭旺珍

Genome-wide Screening and Evaluation of SNP Core Loci for Identification of Upland Cotton Varieties

Guo-Zhong ZHU,Fang ZHANG,Jie FU,Le-Chen LI,Er-Li NIU,Wang-Zhen GUO

表2 用于品种指纹图谱分析的核心SNP位点特征统计

Table 2 Characteristic statistics of the core SNPs for fingerprint analysis

类型 Type 最大值 Max. 最小值 Min. 平均值 Mean 检出率 Call frequency 1.00 0.99 1.00 最小等位基因频率 MAF 0.50 0.20 0.34 杂合率 Heterozygosity 0.05 0.00 0.02 多态信息含量 PIC 0.50 0.32 0.44