利用陆地棉MAGIC群体定位产量、生育期和株高性状的QTL

黄聪,李晓方,李定国,林忠旭

QTL Mapping for Yield, Growth Period and Plant Height Traits Using MAGIC Population in Upland Cotton

Cong HUANG,Xiao-Fang LI,Ding-Guo LI,Zhong-Xu LIN

表4 检测到与8个性状显著关联的SSR标记

Table 4 Significant SSR markers associated with the eight traits

性状 Trait SSR标记 SSR marker 染色体 Chromosome 遗传位置 Position (cM) P值 P-value 解释率 R2 (%) 环境 Environment 开花期 NBRI_HQ527566 1 150.22 4.24E-03 (*, #) 1.45 BLUP FT MON_CGR5525 6 49.08 3.91E-03 (*, #) 1.20 BLUP MON_DC20094 8 101.49 1.33E-03 (**) 1.12 BLUP MON_CER0167 10 101.22 9.83E-03 (*, #) 0.81 BLUP MON_CGR5113 11 10.25 1.38E-03 (**, #) 5.44 BLUP MON_CGR5390 13 55.20 7.07E-03 (*, #) 1.10 BLUP MON_DPL0522 21 16.34 1.35E-03 (**, #) 1.52 BLUP MON_DC30015 23 85.25 1.04E-05 (**, #) 7.23 BLUP DPL0461 24 63.21 6.98E-03 (*, #) 0.78 BLUP, E5 MON_SHIN0607 26 137.12 2.09E-03 (**, #) 1.52 BLUP 第一果枝节位 NBRI_HQ527566 1 150.22 5.85E-03 (*) 1.28 BLUP FFSBN MON_CGR5534 2 17.30 5.68E-03 (*, #) 1.24 BLUP 性状 Trait SSR标记 SSR marker 染色体 Chromosome 遗传位置 Position (cM) P值 P-value 解释率 R2 (%) 环境 Environment NAU2858 2 133.14 1.64E-03 (**, #) 2.03 BLUP MON_CER0086b 6 106.70 5.23E-05 (**, #) 2.48 BLUP MON_CGR5001b 7 22.05 8.69E-03 (*, #) 0.73 BLUP MON_DC20094 8 101.49 6.08E-03 (*, #) 0.80 BLUP, E2 BNL3442 11 31.48 6.41E-03 (*, #) 0.79 BLUP HAU2489 15 44.81 5.03E-03 (*) 0.84 BLUP MUSS422b 15 115.63 2.58E-08 (**, #) 3.33 BLUP MON_CGR5001a 16 39.66 1.26E-03 (**, #) 1.10 BLUP HAU3069 19 206.66 3.92E-03 (*, #) 1.18 BLUP, E3 NAU7153 21 59.03 9.20E-05 (**, #) 1.97 BLUP BNL3171 21 72.70 4.07E-03 (*) 1.89 BLUP MON_DC30015 23 85.25 8.21E-08 (**, #) 7.27 BLUP MON_CGR5423 24 10.95 2.18E-03 (**, #) 1.43 BLUP HAU3812 24 43.09 5.18E-03 (*, #) 1.12 BLUP MON_CER0086a 25 86.68 1.69E-03 (**, #) 1.49 BLUP 株高 miR393-Me4 8 67.26 9.45E-03 (*) 0.71 BLUP PH MON_CGR5113 11 10.25 8.72E-03 (*, #) 4.02 BLUP MON_CGR6580a 11 78.45 7.93E-03 (*, #) 1.21 BLUP MON_SHIN1343 17 40.41 6.26E-03 (*, #) 1.11 BLUP HAU3069 19 206.66 7.38E-03 (*, #) 1.04 BLUP, E3 MON_DPL0522 21 16.34 1.61E-03 (**, #) 1.40 BLUP DPL0461 24 63.21 7.63E-05 (**, #) 1.66 BLUP MON_DC20035 24 198.85 1.49E-03 (**, #) 1.36 BLUP MON_DPL0811a 25 113.14 6.02E-03 (*, #) 0.79 BLUP 单株有效铃数 MON_DC40052 1 51.96 5.92E-03 (*, #) 1.69 BLUP EBN NBRI_HQ527566 1 150.22 2.93E-03 (**) 1.52 BLUP CIR381 2 38.87 3.97E-04 (**, #) 1.68 BLUP CCRI523 5 39.95 9.49E-03 (*) 0.72 BLUP BNL584 6 17.52 7.51E-03 (*, #) 1.26 BLUP MON_CER0086b 6 106.70 1.34E-03 (**, #) 1.61 BLUP HAU2147 10 4.91 4.40E-03 (*) 0.87 BLUP BNL511 10 59.83 9.83E-03 (*, #) 0.71 BLUP HAU3909 10 63.97 6.86E-06 (**, #) 2.63 BLUP MON_CGR5352b 13 22.19 9.17E-04 (**, #) 1.85 BLUP MON_CGR5390 13 55.20 2.17E-03 (**, #) 1.36 BLUP MON_DC30178 13 90.51 6.32E-03 (*) 0.80 BLUP MON_DPL0535 13 97.44 2.52E-03 (**, #) 2.01 BLUP MON_CER0157 13 148.92 1.41E-03 (**, #) 1.09 BLUP MON_CGR5001a 16 39.66 7.63E-03 (*) 0.76 BLUP HAU0197 17 61.97 5.67E-04 (**, #) 2.04 BLUP BNL3875 19 125.78 3.76E-03 (*, #) 1.45 BLUP MON_CGR5845 19 177.05 1.72E-05 (**, #) 4.55 BLUP NAU7153 21 59.03 6.31E-05 (**, #) 2.05 BLUP 性状 Trait SSR标记 SSR marker 染色体 Chromosome 遗传位置 Position (cM) P值 P-value 解释率 R2 (%) 环境 Environment HAU2959 21 107.97 3.53E-03 (*, #) 0.89 BLUP MUSS298 23 29.08 3.94E-03 (*, #) 0.86 BLUP, E5 MON_DPL0524 23 31.92 4.30E-03 (*) 1.44 BLUP, E3 MON_DC30015 23 85.25 6.46E-07 (**, #) 6.19 BLUP HAU4497 24 185.64 5.50E-05 (**, #) 2.05 BLUP MON_DC40117 26 62.97 6.25E-03 (*, #) 1.05 BLUP, E2 单铃籽棉重 HAU1619a 1 168.64 3.66E-03 (*) 0.92 BLUP BW CIR381 2 38.87 9.59E-04 (**, #) 1.48 BLUP HAU0800a 2 142.99 9.39E-03 (*) 0.73 BLUP MON_CER0086b 6 106.70 1.74E-03 (**, #) 1.74 BLUP MUSB0812 8 107.81 7.25E-03 (*, #) 1.42 BLUP HAU0119 17 0.00 4.71E-03 (*, #) 1.75 BLUP HAU3986 17 100.50 3.67E-03 (*, #) 1.68 BLUP MUSB1135a 18 140.00 5.50E-05 (**, #) 1.73 BLUP MON_CGR5845 19 177.05 2.16E-03 (**) 3.63 BLUP MON_DC40103 20 60.87 3.84E-03 (*, #) 1.17 BLUP 单铃皮棉重 HAU2959 21 107.97 3.16E-03 (**, #) 0.91 BLUP LW NAU5418 21 108.18 8.76E-04 (**, #) 1.63 BLUP HAU3640 24 175.90 6.59E-03 (*, #) 1.09 BLUP HAU0800a 2 142.99 6.07E-03 (*) 0.79 BLUP BNL3034 14 66.47 5.81E-03 (*, #) 1.67 BLUP MUSB1135a 18 140.00 2.51E-03 (**, #) 0.95 BLUP HAU3640 24 175.90 1.62E-03 (**, #) 1.37 BLUP MON_DPL0811a 25 113.14 1.75E-03 (**, #) 1.02 BLUP 衣分 MON_CGR5707 9 61.36 2.37E-03 (**, #) 1.32 BLUP LP MON_DPL0095b 17 78.11 3.67E-03 (*, #) 1.34 BLUP MON_DC30015 23 85.25 8.92E-03 (*, #) 3.60 BLUP 籽指 CIR381 02 38.87 5.35E-06 (**, #) 2.60 BLUP SI HAU1321 12 29.33 7.26E-03 (*) 2.12 BLUP MON_SHIN1558 13 54.09 9.94E-03 (*) 0.71 BLUP MON_C2-0118 14 135.20 7.01E-03 (*, #) 0.78 BLUP NAU6468 16 28.49 8.77E-04 (**, #) 2.51 BLUP