彩色棉多药和有毒化合物输出蛋白MATE家族基因的鉴定及表达分析

王作敏,刘瑾,孙士超,张新宇,薛飞,李艳军,孙杰

Identification and Expression Analysis of Multidrug and Toxic Compound Extrusion Protein Family Genes in Colored Cotton

Zuo-Min WANG,Jin LIU,Shi-Chao SUN,Xin-Yu ZHANG,Fei XUE,Yan-Jun LI,Jie SUN

表2 陆地棉MATE蛋白家族成员的鉴定

Table 2 Identification of MATE protein family members in Gossypium hirsutum L.

基因 Gene 序列号 Sequence number 染色体 Chr. 编码序列 Coding sequence (bp) 蛋白残基数 Protein length (aa) 分子量 Molecular weight (kD) 等电点 pI 亚细胞定位预测 Subcellular location prediction GhMATE1 GhA01G0453 1 1455 484 48.1 7.72 细胞膜Cell membrane GhMATE2 GhA01G0959 1 1455 484 49.3 8.62 细胞膜Cell membrane GhMATE3 GhA03G0955 3 1383 460 46.4 5.21 叶绿体Chloroplast GhMATE4 GhA03G1185 3 1554 517 48.1 9.05 细胞质Cytoplasm GhMATE5 GhA03G1186 3 1545 514 48.2 6.48 细胞膜Cell membrane GhMATE6 GhA03G1321 3 1470 489 47.1 7.58 液泡膜Tonoplast GhMATE7 GhA03G1323 3 1467 488 47.2 7.58 细胞膜Cell membrane GhMATE8 GhA04G0255 4 1275 424 45.3 8.62 细胞膜Cell membrane GhMATE9 GhA04G0282 4 1416 471 47.0 7.96 细胞膜Cell membrane GhMATE10 GhA05G1449 5 1575 524 48.0 5.85 细胞质Cytoplasm GhMATE11 GhA05G1901 5 1476 491 47.5 8.36 叶绿体Chloroplast GhMATE12 GhA06G0259 6 1479 492 48.5 8.36 细胞质Cytoplasm GhMATE13 GhA09G0073 9 1470 489 48.1 8.86 液泡膜Tonoplast GhMATE14 GhA08G2343 8 1497 498 53.7 5.60 细胞膜Cell membrane GhMATE15 GhA09G0412 9 1521 506 49.9 5.49 细胞膜Cell membrane GhMATE16 GhA10G0781 10 1458 485 49.3 5.55 细胞膜Cell membrane GhMATE17 GhA11G0039 11 1404 467 45.6 8.52 细胞膜Cell membrane GhMATE18 GhA11G0040 11 1533 510 48.5 8.65 细胞膜Cell membrane GhMATE19 GhA11G1853 11 1473 490 49.5 8.34 细胞膜Cell membrane GhMATE20 GhA11G2034 11 1452 483 48.7 8.58 细胞膜Cell membrane GhMATE21 GhA11G3233 11 1473 490 48.2 8.22 液泡膜Tonoplast GhMATE22 GhA11G3238 11 1419 472 48.8 8.43 细胞膜Cell membrane GhMATE23 GhA12G0812 12 1503 500 53.8 6.99 液泡膜Tonoplast GhMATE24 GhA12G0971 12 1368 455 36.6 6.21 细胞膜Cell membrane GhMATE25 GhA12G2733 12 1431 476 42.8 8.28 细胞膜Cell membrane GhMATE26 GhA13G0797 13 1518 505 48.7 8.17 细胞膜Cell membrane GhMATE27 GhA13G1248 13 1455 484 48.0 6.18 细胞膜Cell membrane GhMATE28 GhD01G0136 1 1586 528 49.5 5.08 细胞膜Cell membrane GhMATE29 GhD01G1006 1 1452 483 49.5 8.89 细胞膜Cell membrane GhMATE30 GhD02G1336 2 1518 505 50.8 5.59 叶绿体Chloroplast GhMATE31 GhD02G1620 2 1563 520 48.1 9.00 细胞质Cytoplasm GhMATE32 GhD02G1621 2 1545 514 48.4 7.66 细胞膜Cell membrane GhMATE33 GhD02G1761 2 1449 482 47.2 8.38 细胞膜Cell membrane GhMATE34 GhD02G1762 2 1470 489 47.0 7.96 细胞膜Cell membrane GhMATE35 GhD05G1622 5 1557 518 47.4 5.98 细胞质Cytoplasm GhMATE36 GhD05G2137 5 1476 491 47.8 8.34 叶绿体Chloroplast GhMATE37 GhD05G3073 5 1488 495 45.9 7.05 细胞膜Cell membrane GhMATE38 GhD05G3385 5 1416 471 44.2 8.28 细胞膜Cell membrane GhMATE39 GhD06G0281 6 1479 492 52.6 5.17 细胞膜Cell membrane 基因 Gene 序列号 Sequence number 染色体 Chr. 编码序列 Coding sequence (bp) 蛋白残基数 Protein length (aa) 分子量 Molecular weight (kD) 等电点 pI 亚细胞定位预测 Subcellular location prediction GhMATE40 GhD08G2334 8 1476 491 43.8 8.39 细胞膜Cell membrane GhMATE41 GhD09G0426 9 1476 491 49.9 5.75 细胞膜Cell membrane GhMATE42 GhD10G0979 10 1479 492 48.5 8.82 细胞膜Cell membrane GhMATE43 GhD11G0038 11 1533 510 48.5 8.65 细胞膜Cell membrane GhMATE44 GhD11G2135 11 1473 490 49.6 8.68 细胞质Cytoplasm GhMATE45 GhD11G2314 11 1452 483 48.7 8.57 细胞膜Cell membrane GhMATE46 GhD11G2334 11 1464 487 43.8 8.39 液泡膜Tonoplast GhMATE47 GhD12G0830 12 1521 506 53.9 6.99 细胞膜Cell membrane GhMATE48 GhD12G1083 12 1530 509 48.6 5.47 细胞膜Cell membrane GhMATE49 GhD13G1038 13 1377 548 41.9 7.61 细胞膜Cell membrane GhMATE50 GhD13G2211 13 1434 477 47.2 9.22 细胞膜Cell membrane GhMATE51 GhD07G0751 7 1314 434 47.8 7.49 细胞膜Cell membrane GhMATE52 GhD01G0461 1 1455 484 53.0 5.83 细胞膜Cell membrane GhMATE53 GhA01G0098 1 1125 374 40.6 8.94 细胞膜Cell membrane GhMATE54 GhA12G0513 12 1416 471 51.8 7.83 液泡膜Tonoplast GhMATE55 GhA07G0673 7 1314 437 47.4 5.33 细胞膜Cell membrane GhMATE56 GhA05G2769 5 1452 483 52.7 6.59 细胞膜Cell membrane GhMATE57 GhD03G1484 3 1563 520 56.6 8.46 液泡膜Tonoplast GhMATE58 GhA08G1613 8 1608 535 58.3 8.08 细胞膜Cell membrane GhMATE59 GhA12G2353 12 1644 547 59.7 6.69 细胞膜Cell membrane GhMATE60 GhA13G1249 13 1293 430 46.8 9.08 细胞膜Cell membrane GhMATE61 GhD07G0089 7 1512 503 55.1 6.59 细胞膜Cell membrane GhMATE62 GhA06G0589 6 1575 524 56.8 8.62 细胞膜Cell membrane GhMATE63 GhD09G1100 9 1506 507 54.0 5.89 细胞质Cytoplasm GhMATE64 GhA10G2322 10 1401 466 50.7 8.19 细胞膜Cell membrane GhMATE65 GhD09G2422 9 1311 436 47.4 7.05 细胞膜Cell membrane GhMATE66 GhA03G0114 3 1500 499 54.3 9.02 细胞膜Cell membrane GhMATE67 GhD02G0545 2 1482 493 53.2 7.94 叶绿体Chloroplast GhMATE68 GhA10G1472 10 1398 465 50.1 7.48 细胞膜Cell membrane GhMATE69 GhA03G2015 3 1563 520 56.5 8.21 细胞膜Cell membrane GhMATE70 GhA03G1320 3 1341 446 49.1 8.04 细胞膜Cell membrane GhMATE71 GhD05G2075 5 1662 553 60.3 7.47 细胞质Cytoplasm GhMATE72 GhD11G0087 11 1602 533 58.1 8.54 细胞膜Cell membrane GhMATE73 GhA09G0385 9 1581 526 57.8 8.70 细胞膜Cell membrane GhMATE74 GhA08G2165 8 1530 509 55.5 8.36 细胞膜Cell membrane GhMATE75 GhD06G0667 6 1575 524 57.0 8.58 细胞膜Cell membrane GhMATE76 GhA09G1094 9 1509 502 54.1 5.67 细胞膜Cell membrane GhMATE77 GhD05G0259 5 1617 538 58.4 7.51 细胞膜Cell membrane GhMATE78 GhD10G1146 10 1404 466 50.7 8.19 液泡膜Tonoplast GhMATE79 GhA02G0487 2 1524 507 54.8 7.48 细胞膜Cell membrane GhMATE80 GhA05G2384 5 1386 467 50.3 6.51 叶绿体Chloroplast GhMATE81 GhD12G2539 12 1119 392 42.6 5.48 细胞膜Cell membrane GhMATE82 GhD06G2314 6 1611 536 58.4 6.46 细胞膜Cell membrane GhMATE83 GhD12G2490 12 1632 543 59.2 8.90 细胞膜Cell membrane 基因 Gene 序列号 Sequence number 染色体 Chr. 编码序列 Coding sequence (bp) 蛋白残基数 Protein length (aa) 分子量 Molecular weight (kD) 等电点 pI 亚细胞定位预测 Subcellular location prediction GhMATE84 GhA11G0083 11 1602 533 58.1 8.34 细胞膜Cell membrane GhMATE85 GhD09G0403 9 1611 536 58.8 8.15 细胞膜Cell membrane GhMATE86 GhA09G2299 9 1404 467 50.7 7.09 细胞质Cytoplasm GhMATE87 GhA05G0185 5 1614 537 58.3 7.50 细胞膜Cell membrane GhMATE88 GhD03G1526 3 1500 499 54.0 8.85 叶绿体Chloroplast GhMATE89 GhD11G3461 11 1569 522 56.1 5.02 细胞膜Cell membrane GhMATE90 GhA03G0113 3 1500 424 45.7 8.40 细胞质Cytoplasm GhMATE91 GhD10G1714 10 1530 509 54.9 6.98 细胞膜Cell membrane