普通小麦主要农艺性状的全基因组关联分析

翟俊鹏,李海霞,毕惠惠,周思远,罗肖艳,陈树林,程西永,许海霞

Genome-wide association study for main agronomic traits in common wheat

Jun-Peng ZHAI,Hai-Xia LI,Hui-Hui BI,Si-Yuan ZHOU,Xiao-Yan LUO,Shu-Lin CHEN,Xi-Yong CHENG,Hai-Xia XU

表3 SNP标记信息

Table 3 Information of SNP markers

染色体 Chr. 标记数目 No. of markers 物理长度Physical distance (Mb) 最小等位基因频率 MAF 多态性信息量 PIC 标记密度 Density of marker (Mb marker-1) Mean Range Mean Range 1A 450 593.3 0.2583 0.0500-0.5000 0.3404 0.0950-0.5000 1.32 1B 717 689.0 0.1852 0.0526-0.4932 0.2843 0.0997-0.4999 0.96 1D 635 495.2 0.1999 0.0504-0.5000 0.2955 0.0956-0.5000 0.78 2A 517 780.7 0.2429 0.0500-0.5000 0.3275 0.0950-0.5000 1.51 2B 635 801.2 0.2597 0.0500-0.5000 0.3450 0.0950-0.5000 1.26 2D 557 651.4 0.226 0.0507-0.5000 0.3120 0.0963-0.5000 1.17 3A 318 749.5 0.2472 0.0504-0.4966 0.3377 0.0958-0.5000 2.36 3B 565 829.3 0.2870 0.0504-0.5000 0.3729 0.0956-0.5000 1.47 3D 339 614.0 0.2583 0.0504-0.5000 0.3448 0.0956-0.5000 1.81 4A 283 744.5 0.2114 0.0537-0.4966 0.3024 0.1016-0.5000 2.63 4B 316 673.2 0.1716 0.0500-0.4966 0.2663 0.0950-0.5000 2.13 4D 132 509.3 0.1676 0.0537-0.4823 0.2590 0.1016-0.4994 3.86 5A 451 708.2 0.2338 0.0500-0.5000 0.3239 0.0950-0.5000 1.57 5B 545 712.9 0.2384 0.0500-0.5000 0.3206 0.0950-0.5000 1.31 5D 393 565.9 0.2269 0.0500-0.4966 0.3083 0.0950-0.5000 1.44 6A 310 617.7 0.2449 0.0509-0.5000 0.3340 0.0965-0.5000 1.99 6B 523 720.5 0.2265 0.0507-0.5000 0.3172 0.0963-0.5000 1.38 6D 286 473.4 0.2041 0.0504-0.4932 0.2950 0.0956-0.4999 1.66 7A 418 736.5 0.2696 0.0522-0.5000 0.3561 0.0989-0.5000 1.76 7B 407 750.1 0.2737 0.0504-0.4966 0.3616 0.0958-0.5000 1.84 7D 314 636.8 0.2649 0.0500-0.5000 0.3556 0.0950-0.5000 2.03 Unmap 441 488.8 0.2262 0.0507-0.5000 0.3133 0.0963-0.5000 1.11 A 2747 4930.4 0.2440 0.0500-0.5000 0.3317 0.0950-0.5000 1.79 B 3708 5176.2 0.2346 0.0500-0.5000 0.3240 0.0950-0.5000 1.40 D 2656 3946.0 0.2211 0.0500-0.5000 0.3100 0.0950-0.5000 1.49 Whole 9552 14541.4 0.2329 0.0500-0.5000 0.3215 0.0950-0.5000 1.70