利用WGCNA鉴定非生物胁迫相关基因共表达网络

李旭凯,李任建,张宝俊

Identification of rice stress-related gene co-expression modules by WGCNA

Xu-Kai LI,Ren-Jian LI,Bao-Jun ZHANG

表5 候选基因功能注释

Table 5 Annotation of candidate gene

候选基因 Candidate gene 候选基因在水稻中注释 Annotation of candidate genes in rice 候选基因在玉米同源基因 Homology gene in maize 基因功能 Gene function LOC_Os02g30900 激酶结构域蛋白 Protein kinase domain containing protein GRMZM2G137468 蛋白激酶APK1A Protein kinase APK1A LOC_Os11g28990 TBC结构域蛋白质 TBC domain containing protein GRMZM2G122935 含有RabGAP/TBC结构域的蛋白质 RabGAP/TBC domain-containing protein LOC_Os09g32040 无顶端分生组织蛋白 No apical meristem protein GRMZM2G004531 N-乙酰-L-蛋氨酸/N-乙酰-L-甲硫氨酸 Nam 7 LOC_Os07g35750 DUF26激酶 DUF26 kinases GRMZM2G075438 受体激酶RK20-1 Receptor kinase RK20-1 LOC_Os05g45210 呼吸爆发氧化酶 Respiratory burst oxidase GRMZM2G043435 呼吸爆发氧化酶C Respiratory burst oxidase C 候选基因 Candidate gene 候选基因在水稻中注释 Annotation of candidate genes in rice 候选基因在玉米同源基因 Homology gene in maize 基因功能 Gene function LOC_Os01g58150 表达蛋白质 Expressed protein GRMZM2G139460 功能未知的保守基因 Conserved gene of unknown function LOC_Os03g13300 谷氨酸脱羧酶 Glutamate decarboxylase GRMZM2G098875 谷氨酸脱羧酶 Glutamate decarboxylase