小麦主栽品种济麦22与良星99的基因组序列多态性比较分析

杨正钊, 王梓豪, 胡兆荣, 辛明明, 姚颖垠, 彭惠茹, 尤明山, 宿振起, 郭伟龙

Comparative analysis of the genomic sequences between commercial wheat varieties Jimai 22 and Liangxing 99

YANG Zheng-Zhao, WANG Zi-Hao, HU Zhao-Rong, XIN Ming-Ming, YAO Ying-Yin, PENG Hui-Ru, YOU Ming-Shan, SU Zhen-Qi, GUO Wei-Long

表7 济麦22与良星99的纯合InDel变异的长度分布

Table 7 Length distribution of differential homozygous InDels in Jimai 22 and Liangxing 99

InDel类型 Types of InDel InDel长度 Length of InDel 差异区间 Differential genetic region 相似区间 Similar genetic region 全基因组 Whole genome region 数量 Count 每Mb密度 Density per Mb 数量 Count 每Mb密度 Density per Mb 数量 Count 每Mb密度 Density per Mb 在济麦22中插入, 在良星99中丢失 Insertion in Jimai 22, deletion in Liangxing 99 1 34,031 17.77 7723 0.67 41,754 3.10 2 7259 3.79 3017 0.26 10,276 0.76 3 2664 1.39 1242 0.11 3906 0.29 4 1685 0.88 843 0.07 2528 0.19 5 701 0.37 419 0.04 1120 0.08 6 883 0.46 370 0.03 1253 0.09 7 453 0.24 225 0.02 678 0.05 8 476 0.25 216 0.02 692 0.05 9 363 0.19 153 0.01 516 0.04 ≥10 4131 2.16 1599 0.14 5730 0.43 全部Total 52,646 27.49 15,807 1.37 68,453 5.08 在良星99中插入, 在济麦22中丢失 Insertion in Liangxing 99, deletion in Jimai 22 1 34,083 17.80 7796 0.67 41,879 3.11 2 7315 3.82 3037 0.26 10,352 0.77 3 2690 1.40 1190 0.10 3880 0.29 4 1710 0.89 785 0.07 2495 0.19 5 746 0.39 420 0.04 1166 0.09 6 832 0.43 356 0.03 1188 0.09 7 412 0.22 227 0.02 639 0.05 8 509 0.27 208 0.02 717 0.05 9 402 0.21 183 0.02 585 0.04 ≥10 3993 2.09 1637 0.14 5630 0.42 全部Total 52,696 27.52 15,835 1.37 68,531 5.09