玉米HD-ZIP I亚家族基因鉴定及表达分析

梁思维,姜昊梁,翟立红,万小荣,李小琴,蒋锋,孙伟

Genome-wide identification and expression analysis of HD-ZIP I subfamily genes in maize

Si-Wei LIANG,Hao-Liang JIANG,Li-Hong ZHAI,Xiao-Rong WAN,Xiao-Qin LI,Feng JIANG,Wei SUN

表1 玉米HD-ZIP I 亚家族基因信息

Table 1 Basic information of HD-ZIP I subfamily genes in maize

基因 Gene 基因编号 Gene accession Bin 基因组位置 Genome location (RefG.v3) 编码区 Coding sequence (bp) 蛋白长度 Protein (aa) 外显子数目 Exon number ZmHB5 GRMZM2G132367 1.02 19250088:19252388 981 326 3 ZmHB7 GRMZM2G122076 4.05 77636576:77641035 819 272 3 ZmHB12 AC233899.1_FGP004 9.07 149912584:149914098 1134 377 3 ZmHB22 GRMZM2G178741 9.07 151525953:151528343 1035 344 3 ZmHB34 GRMZM2G002915 2.06 178781917:178784182 852 283 3 ZmHB41 GRMZM2G117164 5.05 190526953:190528628 708 235 2 ZmHB49 GRMZM2G097349 1.08 243185151:243187447 1092 363 2 ZmHB54 GRMZM2G041127 2.07 188712314:188714917 825 274 3 ZmHB66 GRMZM2G351330 2.03 22220873:22222180 786 261 2 ZmHB68 GRMZM2G005624 1.02 23240104:23243489 720 239 3 ZmHB102 GRMZM2G139963 1.02 14957965:14960921 1035 344 3 ZmHB112 GRMZM2G003304 1.07 218768608:218773418 813 270 3 ZmHB115 GRMZM2G021339 4.06 165861785:165863994 1020 339 4 ZmHB120 GRMZM2G056600 7.03 129296234:129298384 786 261 3 ZmHB126 GRMZM2G034113 2.07 195705583:195707271 735 244 2 ZmHB127 GRMZM2G119999 1.05 139960481:139962631 885 294 3 ZmHB128 GRMZM2G041462 7.03 142432248:142434060 720 239 2