谷子PEPC基因的鉴定及其对非生物逆境的响应特性

赵晋锋,杜艳伟,王高鸿,李颜方,赵根有,王振华,王玉文,余爱丽

Identification of PEPC genes from foxtail millet and its response to abiotic stress

Jin-Feng ZHAO,Yan-Wei DU,Gao-Hong WANG,Yan-Fang LI,Gen-You ZHAO,Zhen-Hua WANG,Yu-Wen WANG,Ai-Li YU

表2 预测谷子PEPC基因参数

Table 2 Parameters of predicted foxtail millet PEPC genes

基因 Gene 基因ID Gene ID 染色体位置 Chr. location 基因长度 Genome length (bp) 氨基酸数目 No. of amino acid 等电点 pI 分子量 Molecular weight (kD) 内含子数 Intron number 不稳定指数 Instability index 脂肪系数 Aliphatic index 平均疏水指数 Grand average of hydropathicity PEPcse保守域位置 PEPcse domain location SiPEPC1 Seita.1G020700 1784608-1791259 6652 965 5.83 109.82 9 48.48 87.36 -0.392 163-965 SiPEPC2 Seita.2G173700 26198697-26204510 5814 967 5.77 110.20 9 44.74 92.41 -0.351 164-967 SiPEPC3 Seita.4G175200 28034663-28043265 8603 964 5.95 109.98 8 45.83 85.81 -0.418 162-964 SiPEPC4 Seita.5G074200 6390259-6398514 8256 1032 7.14 114.89 20 52.09 93.87 -0.277 144-348, 414-1032 SiPEPC5 Seita.5G147000 13061164-13065839 4676 1015 5.89 113.53 6 49.05 87.69 -0.319 213-1015 SiPEPC6 Seita.5G324500 37380598-37387338 6741 969 5.70 110.44 9 44.10 89.79 -0.375 165-969