基于WGCNA的马铃薯根系抗旱相关共表达模块鉴定和核心基因发掘

秦天元,孙超,毕真真,梁文君,李鹏程,张俊莲,白江平

Identification of drought-related co-expression modules and hub genes in potato roots based on WGCNA

Tian-Yuan QIN,Chao SUN,Zhen-Zhen BI,Wen-Jun LIANG,Peng-Cheng LI,Jun-Lian ZHANG,Jiang-Ping BAI

表2 目标模块的部分GO富集分析结果

Table 2 Partial GO enrichment analysis of target modules

模块 Module GO条目 GO term 基因本体 Ontology 描述 Description P值 P-value Red GO:0016705 F 氧化还原酶活性, 作用于成对供体, 与分子氧结合或还原。 Oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen. 2.90E-09 Red GO:0004866 F 内肽酶抑制剂活性。 Endopeptidase inhibitor activity. 0.00062 Red GO:0030414 F 肽酶抑制剂活性。 Peptidase inhibitor activity. 0.00062 Red GO:0005515 F 蛋白质结合。 Protein binding. 0.0012 Yellow GO:0005515 F 蛋白质结合。 Protein binding. 2.20E-13 Turquoise GO:0015979 P 光合作用。 Photosynthesis. 7.10E-07 模块 Module GO条目 GO term 基因本体 Ontology 描述 Description P值 P-value Turquoise GO:0019684 P 光合作用, 光反应。 Photosynthesis, light reaction. 5.90E-06 Turquoise GO:0006694 P 类固醇生物合成过程。 Steroid biosynthetic process. 5.60E-05 Turquoise GO:0010033 P 对有机物质的反应。 Response to organic substance. 0.00023 Turquoise GO:0005515 F 蛋白结合。 Protein binding. 4.00E-27 Turquoise GO:0016705 F 氧化还原酶活性, 作用于成对供体, 与分子氧结合或还原。 Oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen. 3.00E-07 Turquoise GO:0003854 F 3-β-羟基-Δ5-类固醇脱氢酶活性。 3-beta-hydroxy-delta5-steroid dehydrogenase activity. 3.30E-05 Turquoise GO:0033764 F 类固醇脱氢酶活性, 作用于供体的羟基, NAD或NADP作为受体。 Steroid dehydrogenase activity, acting on the CH-OH group of donors, NAD or NADP as acceptor. 3.30E-05 Turquoise GO:0016229 F 类固醇脱氢酶活性。 Steroid dehydrogenase activity. 3.30E-05 Turquoise GO:0016614 F 氧化还原酶活性, 作用于供体的羟基。 Ooxidoreductase activity, acting on CH-OH group of donors. 7.10E-05 Turquoise GO:0016616 F 氧化还原酶活性, 作用于供体的羟基, NAD或NADP作为受体。 Oxidoreductase activity, acting on the CH-OH group of donors, NAD or NADP as acceptor. 0.00026 Turquoise GO:0051287 F NAD或NADH结合。 NAD or NADH binding. 0.00039 Turquoise GO:0008092 F 细胞骨架蛋白结合。 Cytoskeletal protein binding. 0.00062 Blue GO:0007010 P 细胞骨架组织。 Cytoskeleton organization. 1.20E-05 Blue GO:0005515 F 蛋白结合。 Protein binding. 2.70E-29 Blue GO:0016705 F 氧化还原酶活性, 作用于成对供体, 与分子氧结合或还原。 Oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen. 2.50E-10 Blue GO:0016021 C 膜结合。 Integral to membrane. 7.30E-05 Blue GO:0015629 C 肌动蛋白细胞骨架。 Actin cytoskeleton. 0.00021 Blue GO:0031224 C 膜固有的。 Intrinsic to membrane. 0.00036