基于高密度SNP遗传图谱的粳稻芽期耐低温QTL鉴定

姜树坤,王立志,杨贤莉,李波,母伟杰,董世晨,车韦才,李忠杰,迟力勇,李明贤,张喜娟,姜辉,李锐,赵茜,李文华

Detection of QTLs controlling cold tolerance at bud bursting stage by using a high-density SNP linkage map in japonica rice

Shu-Kun JIANG,Li-Zhi WANG,Xian-Li YANG,Bo LI,Wei-Jie MU,Shi-Chen DONG,Wei-Cai CHE,Zhong-Jie LI,Li-Yong CHI,Ming-Xian LI,Xi-Juan ZHANG,Hui JIANG,Rui LI,Qian ZHAO,Wen-Hua LI

表1 利用丽江新团黑谷-沈农265的重组自交系群体检测的芽期耐冷QTL信息

Table 1 QTLs controlling cold tolerance at bud bursting stage identified in LTH-SN265 RILs

数量性状 基因座 QTL 染色体 Chr. 峰值位置a Peak pos.a 峰值标记 Peak marker QTL区间QTL interval LOD值 LOD value 表型贡献率 Var. (%) 加性 效应 Add. 增效等位 基因来源 Positive allele 物理图谱 Physical (Mb) 定位区间 Location interval (Mb) qCTB1 1 0.73 Bin01-002 0.43-0.93 0.50 3.26 8.20 0.22 LTH qCTB3 3 29.40 Bin03-281 29.40-32.87 3.47 3.05 8.00 0.21 LTH qCTB9 9 21.45 Bin09-185 19.90-22.30 2.40 5.36 16.60 0.34 LTH qCTB11a 11 9.71 Bin11-087 8.53-9.93 1.40 8.58 24.10 0.39 LTH qCTB11b 11 21.80 Bin11-141 21.24-22.03 0.79 24.01 53.50 0.64 LTH