大豆生物钟基因GmLNK1/2、GmRVE4/8和GmTOC1 CRISPR/Cas9组织表达分析及敲除靶点的鉴定

甘卓然,石文茜,黎永力,侯智红,李海洋,程群,董利东,刘宝辉,芦思佳

Identification of CRISPR/Cas9 knockout targets and tissue expression analysis of circadian clock genes GmLNK1/2, GmRVE4/8, and GmTOC1 in soybean

Zhuo-Ran GAN,Wen-Qian SHI,Yong-Li LI,Zhi-Hong HOU,Hai-Yang LI,Qun CHENG,Li-Dong DONG,Bao-Hui LIU,Si-Jia LU

表3 靶点检测引物

Table 3 Target primer

靶点检测引物 Target primer 引物序列 Primer sequence (5°-3°) 靶点检测引物 Target primer 引物序列 Primer sequence (5°-3°) SP3 GTCGTGCTCCACATGTTGACCGG LNK2cT4&2R TCCTGAGGTTAGTAGTTCTCCACT SP1 GAAGTTATTGCATCTATGTCGGG LNK2dT3F CTCTCCGTCGCCGTTATAGCA LNK1aF TGACGCCAGGGTATCTTAAA LNK2dT3R ACCAAACGAAGCACGAACA LNK1aR TCTCCATGTGTGTGTTTTGGTA LNK2dT4&2F GGTGGTGGAGGGAGAAGATGAG LNK1bF CTCAGGGTAGGGAGGACTTG LNK2dT4&2R AGACACTTATTGCCGCTACAACTG LNK1bR CGGTAAAGTTGAGCCTTGGT RVE4/8aF ACAGCTCTTCAGCTAGGTGTT LNK1cF TCATATAGTGCCCCATGCCA RVE4/8aR GAGGAGAGGGGGTATGGGTT LNK1cR AGTTCTATAGCAGCTCATGACA RVE4/8bF AGCGAAGAACTCTGCAATCCA LNK1dF GCCCGATCATTGCTTCAAGAG RVE4/8bR CTACCACCTTGGGCCGAAAT LNK1dR AGTTCTATAGCAGCTCGTGGC RVE4/8cF TTCGAAGCCATGCTCAGAAG LNK2aT3F GAATTCGGCGATGTGTGAGC RVE4/8cR CCAGCAACAAGGTTCGTAGT LNK2aT3R ACAGCTACACAAAGACACACA RVE4/8dF TTCGTTGGTCATCTTGCTGGT LNK2aT1F CCGTCCAAGGAGATTGTCACTGA RVE4/8dR CTGGACATGGCCTTCTGTGT LNK2aT1R TCCTGAGGTAGGTAGTTCTCCACT TOC1aF TCCCTCAACGATGCTG LNK2bT3F TGATGGAGTGCGTTTCTCTG TOC1aR GCCTCCGTCTCCACAT LNK2bT3R CCCTGATTTTCCTGGCGTAA TOC1bF TTGAGCAAGTCCAGGGTT LNK2bT1F CCGTCCAAGGAGATTGTCACTGA TOC1bR ATGGCTGTGATGGTAACTCG LNK2bT1R TCCTGAGGTAGGTAGTTCTCCACT TOC1cF CTCTAACTAACTATCCAGACCCTA LNK2cT3F TTCTCCGTCGATCAGTGAAGTG TOC1cR ATGGCTGGTGGGTTGA LNK2cT3R GCTAAGAGTCACGCCTCCTTG TOC1dF TACGCCCTCCCTCTTT LNK2cT4&2F CGTGATGCCAAATTAGTTGGGTAT TOC1dR GGGACTTGGGAAATACA