利用东乡普通野生稻染色体片段置换系定位产量相关性状QTL

罗兰, 雷丽霞, 刘进, 张瑞华, 金桂秀, 崔迪, 黎毛毛, 马小定, 赵正武, 韩龙植

Mapping QTLs for yield-related traits using chromosome segment substitution lines of Dongxiang common wild rice (Oryza rufipogon Griff.) and Nipponbare (Oryza sativa L.)

LUO Lan, LEI Li-Xia, LIU Jin, ZHANG Rui-Hua, JIN Gui-Xiu, CUI Di, LI Mao-Mao, MA Xiao-Ding, ZHAO Zheng-Wu, HAN Long-Zhi

表2 北京、临沂和南昌3地产量相关性状QTL分析

Table 2 QTL information of yield-related traits detected in the CSSLs in Beijing, Linyi, and Nanchang

性状 Trait 位点 QTL 染色体 Chr. 标记名称 Marker 北京Beijing 临沂Linyi 南昌Nanchang 阈值 LOD value 贡献率 PVE (%) 加性效应 Additive 阈值 LOD value 贡献率 PVE (%) 加性效应 Additive 阈值 LOD value 贡献率 PVE (%) 加性效应 Additive 株高PH qPH2 2 DX-C2-13 5.87 20.74 6.06 2.63 10.90 4.17 qPH5 5 DX-C5-10 3.54 11.80 6.54 qPH7 7 Indel-c7-1 2.93 9.86 5.91 qPH8 8 DX-C8-12 2.80 8.99 5.52 穗长PL qPL1 1 01-009 3.06 9.17 0.61 qPL2-1 2 DX-C2-13 5.48 17.36 0.86 qPL2-2 2 02-067 3.26 12.87 1.06 3.37 11.88 1.07 qPL5 5 05-028 3.39 10.42 2.08 qPL10 10 DX-S10-1 2.66 8.06 0.94 分蘖数TN qTN1-1 1 DX-C1-2 3.03 10.96 -1.31 qTN1-2 1 010-060 3.89 13.32 -1.70 一次枝梗数PBPP qPBPP1-1 1 DX-C1-6 2.77 9.25 1.03 qPBPP1-2 1 DX-C1-10 2.68 8.34 2.33 qPBPP3 3 DX-C3-8 3.08 9.86 -0.69 qPBPP5 5 DX-C5-3 3.48 11.23 1.05 qPBPP8-1 8 DX-C8-11 4.23 6.79 -1.41 qPBPP8-2 8 DX-C8-12 7.98 13.99 1.36 一次枝梗数PBPP qPBPP8-3 8 DX-S8-14 5.43 18.54 1.23 一次枝梗粒数PBGN qPBGN1-1 1 DX-C1-3 3.00 9.85 4.05 qPBGN1-2 1 DX-C1-10 3.74 12.29 -17.18 qPBGN1-3 1 01-046 4.10 17.32 4.94 qPBGN3 3 DX-C3-28 2.61 8.18 -5.57 qPBGN8-1 8 DX-C8-11 4.70 7.45 -10.34 qPBGN8-2 8 DX-C8-12 9.27 16.35 10.25 qPBGN8-3 8 DX-S8-14 2.90 9.33 6.36 qPBGN11 11 DX-S11-10 3.11 9.86 6.12 二次枝梗数SBPP qSBPP1 1 DX-C1-7 3.26 8.86 3.50 qSBPP2-1 2 DX-C2-1 5.52 15.83 10.49 qSBPP2-2 2 DX-C2-2 9.46 23.99 7.76 qSBPP2-3 2 02-057 5.26 12.01 2.71 qSBPP4-1 4 DX-C4-12 3.68 8.10 -1.51 qSBPP4-2 4 S4-12-2 5.50 15.75 -5.73 qSBPP6-1 6 DX-C6-2 3.17 13.08 2.93 二次枝梗数SBPP qSBPP6-2 6 S6-9-1 3.09 6.71 2.27 二次枝梗粒数SBGN qSBGN2-1 2 DX-C2-1 12.66 27.79 56.08 qSBGN2-2 2 DX-C2-2 8.56 21.39 20.58 qSBGN2-3 2 02-057 4.33 9.79 6.87 qSBGN3-1 3 DX-S3-16 3.90 6.99 20.08 qSBGN3-2 3 DX-S3-17 4.03 15.34 17.26 qSBGN4-1 4 DX-C4-2 4.93 9.03 -15.61 qSBGN4-2 4 DX-C4-8 2.68 4.67 -11.22 qSBGN4-3 4 DX-C4-12 4.64 10.55 -4.84 qSBGN6-1 6 DX-C6-2 2.85 10.56 9.59 qSBGN6-2 6 S6-9-1 4.21 9.47 7.58 每穗粒数GPP qGPP1 1 01-046 4.39 13.92 14.35 qGPP2 2 DX-C2-1 4.02 14.43 37.54 qGPP4 4 S4-12-2 3.55 12.58 -19.21 qGPP6-1 6 06-013 3.26 13.45 20.53 qGPP6-2 6 06-037 5.14 17.43 14.15 qGPP11 11 DX-S11-10 3.08 9.96 10.70 千粒重TGW qTGW2 2 02-008 4.39 14.36 -2.79 3.26 9.19 -1.98 4.21 10.96 -2.56 qTGW3 3 DX-C3-1 3.27 10.64 1.31 qTGW8-1 8 DX-C8-3 4.07 11.68 -3.14 qTGW8-2 8 DX-S8-14 3.02 8.54 -1.12 3.07 7.86 -1.27 qTGW9-1 9 DX-C9-4 2.90 8.12 1.33 qTGW9-2 9 DX-C9-10 3.02 7.81 -2.15 qTGW12 12 S12-6-3 5.28 14.11 -2.38 粒长GL qGL1 1 DX-C1-18 5.29 16.65 0.42 qGL2 2 02-067 3.13 10.71 0.13 2.86 7.12 0.15 qGL3-1 3 DX-C3-8 3.89 13.44 0.17 qGL3-2 3 indel-c3-12 3.08 9.22 0.12 qGL3-3 3 DX-S3-17 5.75 15.14 0.37 qGL3-4 3 DX-C3-23 4.78 14.90 0.17 5.69 14.95 0.25 qGL4 4 S4-12-2 3.14 10.68 0.18 qGL10 10 DX-C10-8 3.55 8.88 0.20 粒宽GW qGW3 3 DX-S3-17 2.50 10.06 -0.11 qGW8 8 DX-C8-15 4.59 17.86 -0.07 3.53 14.49 -0.07 qGW10 10 DX-C10-10 2.56 10.33 -0.08