普通小麦氮素利用效率相关性状全基因组关联分析

靳义荣, 刘金栋, 刘彩云, 贾德新, 刘鹏, 王雅美

Genome-wide association study of nitrogen use efficiency related traits in common wheat (Triticum aestivum L.)

JIN Yi-Rong, LIU Jin-Dong, LIU Cai-Yun, JIA De-Xin, LIU Peng, WANG Ya-Mei

表2 160份普通小麦品系基因型数据统计

Table 2 Genotype data statistics of 160 common wheat lines

染色体 Chr. 标记数目 Number of markers 长度 a Length a (Mb) 密度 Density (Mb/marker) 最小等位基因频率 Minimum allele frequency (MAF) 基因多态性 Genetic diversity 多态性信息含量 Polymorphic information content (PIC) 均值 Average 范围 Range 均值 Average 范围 Range 均值 Average 范围 Range 1A 18,975 594.00 0.031 0.26 0.05-0.50 0.37 0.10-0.50 0.28 0.09-0.38 1B 13,810 689.40 0.050 0.31 0.05-0.50 0.39 0.10-0.50 0.29 0.09-0.38 1D 4464 495.40 0.111 0.18 0.05-0.49 0.34 0.10-0.50 0.28 0.09-0.38 2A 2710 780.70 0.288 0.27 0.05-0.50 0.36 0.10-0.50 0.30 0.09-0.38 2B 14,287 801.20 0.056 0.25 0.05-0.50 0.38 0.10-0.50 0.30 0.09-0.38 2D 3604 651.60 0.181 0.32 0.05-0.50 0.36 0.10-0.50 0.30 0.09-0.38 3A 13,177 750.80 0.057 0.26 0.05-0.50 0.36 0.10-0.50 0.27 0.09-0.38 3B 20,116 830.30 0.041 0.27 0.05-0.50 0.40 0.10-0.50 0.31 0.09-0.38 3D 2417 615.40 0.255 0.20 0.05-0.50 0.31 0.10-0.50 0.26 0.09-0.38 4A 12,438 744.50 0.060 0.25 0.05-0.50 0.38 0.10-0.50 0.30 0.09-0.38 4B 10,680 673.40 0.063 0.23 0.05-0.50 0.36 0.10-0.50 0.28 0.09-0.38 4D 1055 509.60 0.483 0.26 0.05-0.49 0.38 0.10-0.50 0.31 0.09-0.38 5A 11,972 709.70 0.059 0.27 0.05-0.50 0.37 0.10-0.50 0.29 0.09-0.38 5B 23,584 713.00 0.030 0.29 0.05-0.50 0.37 0.10-0.50 0.29 0.09-0.38 5D 2512 566.00 0.225 0.29 0.05-0.50 0.33 0.10-0.50 0.27 0.09-0.38 6A 14,250 618.00 0.043 0.25 0.05-0.50 0.40 0.10-0.50 0.32 0.09-0.38 6B 14,434 720.90 0.050 0.27 0.05-0.50 0.33 0.10-0.50 0.27 0.09-0.38 6D 2544 473.50 0.186 0.25 0.05-0.50 0.36 0.10-0.50 0.27 0.09-0.38 7A 20,807 736.60 0.035 0.27 0.05-0.50 0.32 0.10-0.50 0.29 0.09-0.38 7B 12,025 750.60 0.062 0.28 0.05-0.50 0.36 0.10-0.50 0.28 0.09-0.38 7D 4537 638.60 0.141 0.22 0.05-0.50 0.29 0.10-0.50 0.26 0.09-0.38 A genome 93,664 4934.50 0.052 0.27 0.05-0.50 0.38 0.10-0.50 0.29 0.09-0.38 B genome 108,936 5179.00 0.048 0.29 0.05-0.50 0.36 0.10-0.50 0.28 0.09-0.38 D genome 20,568 3950.40 0.193 0.24 0.05-0.50 0.33 0.10-0.50 0.28 0.09-0.38