基于SNP和InDel标记的巴西木薯遗传多样性与群体遗传结构分析

孙倩, 邹枚伶, 张辰笈, 江思容, Eder Jorge de Oliveira, 张圣奎, 夏志强, 王文泉, 李有志

Genetic diversity and population structure analysis by SNP and InDel markers of cassava in Brazil

SUN Qian, ZOU Mei-Ling, ZHANG Chen-Ji, JIANG Si-Rong, Eder Jorge de Oliveira, ZHANG Sheng-Kui, XIA Zhi-Qiang, WANG Wen-Quan, LI You-Zhi

表1 192份木薯栽培种

Table 1 List of 192 cassava cultivars

编号 No. 名称 Name 编号 No. 名称 Name 编号 No. 名称 Name 编号 No. 名称 Name 编号 No. 名称 Name 编号 No. 名称 Name 001 9624-09 033 BGM0400 065 BGM0783 097 BGM1291 129 BGM1608 161 BGM1942 002 98150-06 034 BGM0405 066 BGM0788 098 BGM1313 130 BGM1615 162 BGM1957 003 BGM0020 035 BGM0408 067 BGM0807 099 BGM1324 131 BGM1622 163 BGM2022 004 BGM0042 036 BGM0425 068 BGM0886 100 BGM1327 132 BGM1626 164 BGM2028 005 BGM0045 037 BGM0428 069 BGM0889 101 BGM1328 133 BGM1640 165 BGM2041 006 BGM0073 038 BGM0436 070 BGM0896 102 BGM1364 134 BGM1662 166 BGM2047 007 BGM0087 039 BGM0443 071 BGM0905 103 BGM1370 135 BGM1667 167 BGM2052 008 BGM0103 040 BGM0451 072 BGM0917 104 BGM1376 136 BGM1668 168 BGM2061 009 BGM0135 041 BGM0452 073 BGM0930 105 BGM1387 137 BGM1672 169 BGM2062 010 BGM0145 042 BGM0467 074 BGM0972 106 BGM1396 138 BGM1679 170 BGM2063 011 BGM0152 043 BGM0495 075 BGM0976 107 BGM1409 139 BGM1682 171 BGM2071 012 BGM0163 044 BGM0501 076 BGM0982 108 BGM1412 140 BGM1684 172 BGM2078 013 BGM0179 045 BGM0507 077 BGM0989 109 BGM1429 141 BGM1690 173 BGM2081 014 BGM0188 046 BGM0523 078 BGM0993 110 BGM1437 142 BGM1697 174 BGM2082 015 BGM0206 047 BGM0540 079 BGM1042 111 BGM1440 143 BGM1698 175 BGM2083 016 BGM0209 048 BGM0542 080 BGM1050 112 BGM1458 144 BGM1704 176 BRS Amansa Burro 017 BGM0211 049 BGM0543 081 BGM1081 113 BGM1485 145 BGM1706 177 BRS Caipira 018 BGM0213 050 BGM0544 082 BGM1106 114 BGM1487 146 BGM1715 178 BRS Dourada 019 BGM0226 051 BGM0550 083 BGM1110 115 BGM1490 147 BGM1722 179 BRS Formosa 020 BGM0250 052 BGM0551 084 BGM1127 116 BGM1495 148 BGM1728 180 BRS Gema Ovo 021 BGM0261 053 BGM0562 085 BGM1153 117 BGM1510 149 BGM1732 181 BRS Jari 022 BGM0264 054 BGM0564 086 BGM1164 118 BGM1524 150 BGM1750 182 BRS Kiriris 023 BGM0269 055 BGM0574 087 BGM1165 119 BGM1535 151 BGM1757 183 BRS Mulatinha 024 BGM0283 056 BGM0600 088 BGM1171 120 BGM1537 152 BGM1760 184 BRS Tapioqueira 025 BGM0288 057 BGM0620 089 BGM1174 121 BGM1539 153 BGM1761 185 BRS Verdinha 026 BGM0331 058 BGM0624 090 BGM1178 122 BGM1549 154 BGM1763 186 Cascuda 027 BGM0336 059 BGM0640 091 BGM1180 123 BGM1552 155 BGM1794 187 Corrente 028 BGM0338 060 BGM0654 092 BGM1193 124 BGM1576 156 BGM1814 188 Eucalipto 029 BGM0352 061 BGM0670 093 BGM1202 125 BGM1581 157 BGM1835 189 Fécula Branca 030 BGM0361 062 BGM0678 094 BGM1226 126 BGM1590 158 BGM1850 190 IAC90 031 BGM0390 063 BGM0726 095 BGM1252 127 BGM1593 159 BGM1883 191 Olho Junto 032 BGM0394 064 BGM0752 096 BGM1281 128 BGM1596 160 BGM1884 192 Valencia