小麦穗发芽性状的全基因组关联分析

谢磊, 任毅, 张新忠, 王继庆, 张志辉, 石书兵, 耿洪伟

Genome-wide association study of pre-harvest sprouting traits in wheat

XIE Lei, REN Yi, ZHANG Xin-Zhong, WANG Ji-Qing, ZHANG Zhi-Hui, SHI Shu-Bing, GENG Hong-Wei

表2 标记的分布及多态性

Table 2 Genome coverage and polymorphism of markers

染色体 Chromosome 标记数目 No. of markers 染色体长度 Chromosome length (Mb) 标记密度 Density of marker 多态信息量 PIC 平均值Mean 变异范围Range 1A 1263 592.38 0.47 0.27 0.01-0.38 2A 1145 780.46 0.68 0.24 0.01-0.38 3A 891 749.46 0.84 0.25 0.01-0.38 4A 708 741.73 1.05 0.25 0.01-0.38 5A 960 709.43 0.74 0.28 0.01-0.38 6A 1006 617.40 0.61 0.27 0.03-0.38 7A 1172 736.44 0.63 0.25 0.01-0.38 1B 1292 688.60 0.53 0.27 0.01-0.38 2B 1291 799.62 0.62 0.26 0.01-0.38 3B 1087 829.32 0.76 0.27 0.01-0.38 4B 571 672.56 1.18 0.26 0.01-0.38 5B 1156 712.82 0.62 0.28 0.01-0.38 6B 1085 720.82 0.66 0.25 0.01-0.38 7B 861 750.49 0.87 0.26 0.02-0.38 1D 568 495.14 0.87 0.13 0.01-0.38 2D 482 650.94 1.35 0.25 0.02-0.38 3D 232 613.92 2.65 0.24 0.01-0.38 4D 99 508.58 5.14 0.25 0.08-0.38 5D 240 563.41 2.35 0.26 0.02-0.38 6D 319 472.61 1.48 0.25 0.03-0.38 7D 260 637.17 2.45 0.23 0.01-0.38 A染色体组 Total genome A 7145 4927.30 0.72 0.26 0.01-0.38 B染色体组 Total genome B 7343 5174.23 0.75 0.27 0.01-0.38 D染色体组 Total genome D 2198 3941.77 2.33 0.23 0.01-0.38 总计Total 16686 14043.30 1.27 0.25 0.01-0.38