叉柱棉sHSP基因家族的鉴定与特征分析

范凯, 潘鑫峰, 毛志君, 叶方婷, 李兆伟, 林伟伟, 林文雄

Identification and analysis of sHSP gene family in Gossypioides kirkii

FAN Kai, PAN Xin-Feng, MAO Zhi-Jun, YE Fang-Ting, LI Zhao-Wei, LIN Wei-Wei, LIN Wen-Xiong

表3 叉柱棉中复制的sHSP成员的Ka和Ks分析

Table 3 Ka and Ks analysis for the duplicated sHSPs in Gossypioides kirkii

复制基因1 Duplicated gene 1 复制基因2 Duplicated gene 2 亚家族 Subfamily 非同义 替换率 Ka 同义替换率 Ks 非同义替换率/同义替换率 Ka/Ks 纯化选择 Purifying selection 复制类型 Duplicated type GksHSP05 GksHSP17 CII 0.063959 0.809673 0.078994 是Yes 片段复制事件 Segmental GksHSP06 GksHSP18 CII 0.090699 0.742610 0.122136 是Yes 片段复制事件Segmental GksHSP07 GksHSP20 CI 0.045458 0.629437 0.072220 是Yes 片段复制事件Segmental GksHSP09 GksHSP21 CI 0.159061 0.715073 0.222441 是Yes 片段复制事件Segmental GksHSP06 GksHSP24 CII 0.113536 1.039721 0.109199 是Yes 片段复制事件Segmental GksHSP18 GksHSP24 CII 0.103983 0.730373 0.142370 是Yes 片段复制事件Segmental GksHSP25 GksHSP34 CP 0.125830 0.606857 0.207347 是Yes 片段复制事件Segmental