甘蓝型油菜桔红花显性基因候选区域的NGS定位及InDel标记开发

郭青青, 周蓉, 陈雪, 陈蕾, 李加纳, 王瑞

Location and InDel markers for candidate interval of the orange petal gene in Brassica napus L. by next generation sequencing

GUO Qing-Qing, ZHOU Rong, CHEN Xue, CHEN Lei, LI Jia-Na, WANG Rui

表2 基于候选区间设计的InDel引物序列

Table 2 InDel primer sequences designed in candidate intervals

引物名称 Primer name InDel位点 InDel site InDel 正向引物序列 Positive Primer sequence (5′-3′) 反向引物序列 Reverse primer sequence (5′-3′) InDel-65 18,968,634-18,968,641 D7 GGGTCGAGATACGGTTACGG CGTCGGTAAGTCTTCTTCACC InDel-69 18,949,999-18,950,007 D8 TACCGAGCTCCAGGTCTCTC TGCGCAACTGTAACCATTCT InDel-56 18,789,060-18,789,066 D6 ACAAGCAAGGCCTATATTTTGC TCGGGTGAAGCAAATGTGGA