玉米杂交种纯度鉴定SNP核心引物的确定及高通量检测方案的建立

王蕊, 施龙建, 田红丽, 易红梅, 杨扬, 葛建镕, 范亚明, 任洁, 王璐, 陆大雷, 赵久然, 王凤格

Identification of SNP core primer and establishment of high throughput detection scheme for purity identification in maize hybrids

WANG Rui, SHI Long-Jian, TIAN Hong-Li, YI Hong-Mei, YANG Yang, GE Jian-Rong, FAN Ya-Ming, REN Jie, WANG Lu, LU Da-Lei, ZHAO Jiu-Ran, WANG Feng-Ge

表3 玉米杂交种纯度鉴定SNP核心引物信息表

Table 3 SNP core primer information for purity identification in maize hybrids

引物编号 Primer ID 引物名称 Primer name 染色体 Chromosome 染色体位置 Chromosome position 双亲互补率 Parental complementary rate (%) 最小等位 基因频率 MAF 多态信息 含量 PIC MSNP01 MG002 1 8974336 51.1 0.50 0.38 MSNP06 MG049 1 289408285 58.0 0.46 0.37 MSNP09 MG064 2 109563976 55.8 0.34 0.35 MSNP12 MG072 2 186339948 53.6 0.47 0.37 MSNP14 MG092 3 27775731 62.3 0.47 0.37 MSNP16 MG101 3 118083714 65.6 0.49 0.38 MSNP20 MG135 4 20077010 51.6 0.39 0.36 MSNP22 MG148 4 128874466 46.9 0.33 0.35 MSNP25 MG175 5 13402375 53.6 0.45 0.37 MSNP30 MG207 5 204879476 53.7 0.39 0.36 MSNP31 MG215 6 39822979 62.4 0.50 0.38 MSNP36 MG240 6 141476300 51.1 0.43 0.37 MSNP38 MG270 7 126677146 47.5 0.33 0.35 MSNP42 MG279 7 155821714 50.3 0.42 0.37 MSNP45 MG293 8 20978845 51.4 0.45 0.37 MSNP48 MG311 8 118299376 56.5 0.36 0.35 MSNP52 MG347 9 104695670 60.4 0.42 0.37 MSNP53 MG349 9 127197714 61.5 0.50 0.38 MSNP56 MG361 10 39960289 57.6 0.48 0.38 MSNP58 MG369 10 109396730 53.3 0.50 0.38