利用WGCNA鉴定花生主茎生长基因共表达模块

汪颖, 高芳, 刘兆新, 赵继浩, 赖华江, 潘小怡, 毕晨, 李向东, 杨东清

Identification of gene co-expression modules of peanut main stem growth by WGCNA

WANG Ying, GAO Fang, LIU Zhao-Xin, ZHAO Ji-Hao, LAI Hua-Jiang, PAN Xiao-Yi, BI Chen, LI Xiang-Dong, YANG Dong-Qing

表1 不同比较组特有的显著性GO富集

Table 1 Significant GO terms in each different comparison groups

比较组 Comparison group GO本体类型 GO ontology GO条目 GO term GO注释 GO annotation 基因数 Count 校正后的P值 P-value 花育33号vs. Df216 Huayu 33 vs. Df216 生化过程 Biological process GO:0009250 葡聚糖生物合成的过程 Glucan biosynthetic process 50 0.041165 生化过程 Biological process GO:0010411 木葡聚糖代谢过程 Xyloglucan metabolic process 23 0.018282 山花108 vs. Df216 Shanhua 108 vs. Df216 分子功能 Molecular function GO:0001046 核心启动子序列特异性DNA结合 Core promoter sequence-specific DNA binding 21 0.003117 分子功能 Molecular function GO:0001047 核心启动子整合 Core promoter binding 21 0.003117 分子功能 Molecular function GO:0016762 木葡聚糖: 木葡糖基转移酶活性 Xyloglucan:xyloglucosyl transferase activity 21 0.003117 分子功能 Molecular function GO:0015171 氨基酸跨膜转运蛋白活性 Amino acid transmembrane transporter activity 47 0.025596 生化过程 Biological process GO:0000271 多糖生物合成的过程 Polysaccharide biosynthetic process 92 0.001366 生化过程 Biological process GO:0015849 有机酸运输 Organic acid transport 74 0.003012 生化过程 Biological process GO:0046942 羧酸运输 Carboxylic acid transport 74 0.003012 山花108 vs. 花育33号 Shanhua 108 vs. Huayu 33 细胞组成 Cellular component GO:0044421 胞外区部分 Extracellular region part 34 0.001703 分子功能 Molecular function GO:0004185 丝氨酸型羧肽酶活性 Serine-type carboxypeptidase activity 16 0.003464 分子功能 Molecular function GO:0070008 丝氨酸型外肽酶活性 Serine-type exopeptidase activity 16 0.00394 生化过程 Biological process GO:0003333 氨基酸跨膜转运 Amino acid transmembrane transport 25 0.001824 生化过程 Biological process GO:0007267 细胞间信号传导 Cell-cell signaling 13 0.011421 生化过程 Biological process GO:0098656 阴离子跨膜转运 Anion transmembrane transport 39 0.039813