利用WGCNA鉴定花生主茎生长基因共表达模块

汪颖, 高芳, 刘兆新, 赵继浩, 赖华江, 潘小怡, 毕晨, 李向东, 杨东清

Identification of gene co-expression modules of peanut main stem growth by WGCNA

WANG Ying, GAO Fang, LIU Zhao-Xin, ZHAO Ji-Hao, LAI Hua-Jiang, PAN Xiao-Yi, BI Chen, LI Xiang-Dong, YANG Dong-Qing

表2 不同品种比较组共有的显著性GO富集

Table 2 Significant GO terms among different comparison groups

GO条目 GO term	GO注释 GO annotation	花育33号vs. Df216 Huayu 33 vs. Df216		山花108 vs. Df216 Shanhua 108 vs. Df216		山花108 vs. 花育33号 Shanhua 108 vs. Huayu 33
GO条目 GO term	GO注释 GO annotation	基因数 Count	校正后的P值 P-value	基因数 Count	校正后的P值 P-value	基因数 Count	校正后的P值 P-value
GO:0031225	膜的锚固成分 Anchored component of membrane	98	4.553E-11	89	0.0001002	67	7.96E-08
GO:0005578	蛋白质的细胞外基质 Proteinaceous extracellular matrix	12	0.004731	12	0.036629	13	8.511E-06
GO:0046658	质膜锚定成分 Anchored component of plasma membrane	55	0.0047443	57	0.0664356	52	5.388E-07
GO:2000652	次生细胞壁生物发生的调控 Regulation of secondary cell wall biogenesis	17	9.805E-05	16	0.0016265	10	0.0185837
GO:1903338	细胞壁组织或生物发生的调节 Regulation of cell wall organization or biogenesis	27	2.636E-05	24	0.0033336	18	0.0013154
GO:0051274	葡聚糖生物合成的过程 Beta-glucan biosynthetic process	42	0.0009383	48	0.0002424	29	0.0068829
GO:0051273	葡聚糖代谢过程 Beta-glucan metabolic process	55	2.754E-05	58	0.0001085	41	6.796E-05
GO:0044042	葡聚糖代谢过程 Glucan metabolic process	90	0.0001556	98	0.000349	66	0.0002696
GO:0034637	细胞碳水化合物的生物合成过程 Cellular carbohydrate biosynthetic process	74	0.0463189	97	9.156E-05	58	0.0042563
GO:0030244	纤维素生物合成的过程 Cellulose biosynthetic process	37	0.0003169	43	3.566E-05	24	0.0114207
GO:0030243	纤维素代谢过程 Cellulose metabolic process	48	2.636E-05	51	5.814E-05	36	5.853E-05
GO条目 GO term	GO注释 GO annotation	花育33号vs. Df216 Huayu 33 vs. Df216		山花108 vs. Df216 Shanhua 108 vs. Df216		山花108 vs. 花育33号 Shanhua 108 vs. Huayu 33
GO条目 GO term	GO注释 GO annotation	基因数 Count	校正后的P值 P-value	基因数 Count	校正后的P值 P-value	基因数 Count	校正后的P值 P-value
GO:0009834	次生细胞壁生物发生 Secondary cell wall biogenesis	70	1.901E-22	85	2.361E-31	23	0.0430558
GO:0009832	细胞壁生物起源 Cell wall biogenesis	103	3.631E-17	125	2.642E-24	45	0.016437
GO:0009831	植物型细胞壁修饰或参与多维细胞生长 Plant-type cell wall modification or involved in multidimensional cell growth	13	0.0017006	14	0.0013665	11	0.0007573
GO:0009825	多维细胞生长 Multidimensional cell growth	25	0.0487668	32	0.0017647	23	0.0010804
GO:0009664	细胞壁组织 Cell wall organization	70	1.685E-05	82	2.134E-07	54	5.871E-06
GO:0006865	氨基酸转运 Amino acid transport	40	0.0487668	53	0.0002826	32	0.0077748
GO:0006073	细胞葡聚糖代谢过程 Cellular glucan metabolic process	90	0.0001556	98	0.000349	66	0.0002696