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作物学报 ›› 2023, Vol. 49 ›› Issue (10): 2687-2697.doi: 10.3724/SP.J.1006.2023.31006

• 作物遗传育种·种质资源·分子遗传学 • 上一篇    下一篇

江苏裸大麦种质资源遗传多样性和群体结构分析

李赢(), 刘海翠, 石吕, 石晓旭, 韩笑, 刘建, 魏亚凤()   

  1. 江苏沿江地区农业科学研究所 / 南通市循环农业重点实验室, 江苏南通 226001
  • 收稿日期:2023-01-28 接受日期:2023-04-17 出版日期:2023-10-12 网络出版日期:2023-04-24
  • 通讯作者: 魏亚凤, E-mail: w-yafeng@163.com
  • 作者简介:E-mail: 1185077523@qq.com
  • 基金资助:
    南通市科技项目(JC2021152);江苏省 “六大人才高峰” 高层次人才项目(NY-200);南通市科技项目(MS22020035);江苏沿江地区农业科学研究所青年科技基金项目(YJ(2021)001)

Genetic diversity and population structure analysis of naked barley germplasm resources in Jiangsu province

LI Ying(), LIU Hai-Cui, SHI Lyu, SHI Xiao-Xu, HAN Xiao, LIU Jian, WEI Ya-Feng()   

  1. Jiangsu Yanjiang Area Institute of Agricultural Sciences / Key Laboratory of Recycling Agriculture of Nantong City, Nantong 226001, Jiangsu, China
  • Received:2023-01-28 Accepted:2023-04-17 Published:2023-10-12 Published online:2023-04-24
  • Contact: E-mail: w-yafeng@163.com
  • Supported by:
    Scientific and Technological Project of Nantong City(JC2021152);Six Talent Peaks Project in Jiangsu Province(NY-200);Scientific and Technological Project of Nantong City(MS22020035);Youth Science and Technology Fund of Jiangsu Yanjiang Area Institute of Agricultural Sciences(YJ(2021)001)

摘要:

长江中下游及沿海地区曾是我国裸大麦的两大产区之一, 其中以江苏省面积最大, 是全国裸大麦重要生产基地。研究江苏裸大麦种质资源的遗传多样性和群体结构, 对于拓宽现有裸大麦资源的遗传基础、挖掘丰富优异等位变异、提高裸大麦育种效率具有重要意义。本研究利用38对SSR标记对230份江苏裸大麦材料和其他7个来源的109份裸大麦材料进行了遗传多样性分析, 共检测到242个等位变异, 平均每对引物检测到的等位基因数和有效等位基因数分别为6.3684个和3.0932个, 平均Shannon's多样性指数和Nei's基因多样性指数分别为1.2189和0.5857。多态性信息含量均值为0.5486, 具有高度多态性。按照来源划分群体, 江苏裸大麦群体观测到的等位基因数最多为5.4737个, 有效等位基因数为2.5347个, 平均Shannon's多样性指数、Nei's多样性指数和多态性信息含量(PIC)值为0.9551、0.5004和0.4593。群体间和群体内的遗传变异是导致裸大麦间产生遗传多样性的主要原因, 裸大麦群体间发生遗传分化的主要原因是基因流。不同群体间的遗传分化系数和遗传距离与地理位置的远近没有明确相关性。聚类分析、群体结构分析和主成分分析将裸大麦资源均分为4组, 聚类结果可相互佐证且与地理位置相关性不明显。群体结构分析表明, 江苏裸大麦群体在4个类群均有分布, 与其他群体分化明显。339份材料中295份材料Q值≥0.6, 大部分裸大麦材料血缘比较单一。

关键词: 裸大麦, SSR标记, 江苏, 遗传多样性, 群体结构

Abstract:

The middle and lower regions of the Yangtze River and the coastal areas were one of the two major production areas of naked barley in China, especially Jiangsu province, which was the largest planting area and was an important production base of naked barley. Studying the genetic diversity and population structure of Jiangsu naked barley germplasm resources is of great significance for broadening the genetic base of existing naked barley resources, mining excellent alleles, and improving the breeding efficiency of naked barley. In this study, a set of 38 simple sequence repeat (SSR) markers were used to assess the genetic diversity of 230 naked barley materials from Jiangsu and 109 materials from seven other sources. 242 alleles were detected with an average allele number of 6.3684 and the effective allele number of 3.092 for each SSR. The mean values of Shannon-Weaver index and Nei were 1.2189 and 0.5857, respectively. The average PIC value was 0.5486, indicating the high polymorphism of the SSRs. When the materials were divided into eight groups according to the regions, the largest number of alleles observed in Jiangsu population was 5.4737 and the mean values of effective alleles, Shannon's diversity index, Nei's diversity index, and PIC were 2.5347, 0.9551, 0.5004, and 0.4593, respectively. The genetic diversity of naked barley materials was mainly caused by genetic variation between and within populations, and gene flow was the main reason for the genetic differentiation among the naked barley materials of different groups. The genetic differentiation coefficient and genetic distance between various groups were not significantly correlated with the geographical location between groups. Based on clustering analysis, population structure analysis, and principal component analysis, the naked barley resources were divided into four groups, and the clustering results could corroborate each other and have not clear correlation with geographical location. The population structure analysis showed that the Jiangsu materials were distributed in all four groups and were clearly differentiated from other groups. In 339 materials, the Q-value of 295 materials were higher than 0.6, and most of them had relatively single genetic background.

Key words: naked barley, SSR primers, Jiangsu, genetic diversity, population structure

附表1

供试的339份裸大麦资源的名称和来源"

序号
No.
统一编号
Uniform No.
名称
Name
产地
Region
1 ZDM2183 红大元麦 Hongdayuanmai 中国江苏沛县 Peixian, Jiangsu, China
2 ZDM2184 白元麦 Baiyuanmai 中国江苏铜山 Tongshan, Jiangsu, China
3 ZDM2185 玉米麦 Yumimai 中国江苏铜山Tongshan, Jiangsu, China
4 ZDM2187 戴帽元麦 Daimaoyuanmai 中国江苏睢宁 Suining, Jiangsu, China
5 ZDM2188 沭阳三月黄 Shuyangsanyuehuang 中国江苏沭阳 Shuyang, Jiangsu, China
6 ZDM2189 青元麦 Qingyuanmai 中国江苏沭阳 Shuyang, Jiangsu, China
7 ZDM2194 白元麦 Baiyuanmai 中国江苏宿迁 Suqian, Jiangsu, China
8 ZDM2204 白元麦 Baiyuanmai 中国江苏滨海 Binhai, Jiangsu, China
9 ZDM2207 建湖三月黄 Jianhusanyuehuang 中国江苏建湖 Jianhu, Jiangsu, China
10 ZDM2209 洋辣子 Yanglazi 中国江苏建湖 Jianhu, Jiangsu, China
11 ZDM2211 盐城紫元麦 Yanchengziyuanmai 中国江苏盐城 Yancheng, Jiangsu, China
12 ZDM2212 四棱元麦 Silengyuanmai 中国江苏东台 Dongtai, Jiangsu, China
13 ZDM2222 太兴四棱 Taixingsileng 中国江苏太兴 Taixing, Jiangsu, China
14 ZDM2228 丹阳三月黄 Danyangsanyuehuang 中国江苏丹阳 Danyang, Jiangsu, China
15 ZDM2232 武进三月黄 Wujinsanyuehuang 中国江苏武进 Wujin, Jiangsu, China
16 ZDM2236 紫元麦 Ziyuanmai 中国江苏灌云 Guanyun, Jiangsu, China
17 ZDM2237 雁口黄 Yankouhuang 中国江苏灌云Guanyun, Jiangsu, China
18 ZDM2240 黄元麦 Huangyuanmai 中国江苏涟水 Lianshui, Jiangsu, China
19 ZDM2241 脱郎头 Tuolangtou 中国江苏涟水Lianshui, Jiangsu, China
20 ZDM2242 六棱元麦 Liulengyuanmai 中国江苏涟水Lianshui, Jiangsu, China
21 ZDM2243 团穗青朗头 Tuansuiqinglangtou 中国江苏涟水Lianshui, Jiangsu, China
22 ZDM2248 六棱元麦 Liulengyuanmai 中国江苏泗阳 Siyang, Jiangsu, China
23 ZDM2249 六棱孔麦 Liulengyuanmai 中国江苏泗阳Siyang, Jiangsu, China
24 ZDM2251 淮安狗尾 Huaiangouwei 中国江苏淮安 Huaian, Jiangsu, China
25 ZDM2251 洋腊元麦 Yanglayuanmai 中国江苏滨海 Binhai, Jiangsu, China
26 ZDM2254 狮子头 Shizitou 中国江苏射阳 Sheyang, Jiangsu, China
27 ZDM2258 洋辣子 Yanglazi 中国江苏建湖 Jianhu, Jiangsu, China
28 ZDM2259 建湖团六棱子 Jianhutuanliulengzi 中国江苏建湖 Jianhu, Jiangsu, China
29 ZDM2261 紫元麦 Ziyuanmai 中国江苏建湖 Jianhu, Jiangsu, China
30 ZDM2263 洋元麦 Yangyuanmai 中国江苏盐城 Yancheng, Jiangsu, China
31 ZDM2265 黑元麦 Heiyuanmai 中国江苏盐城 Yancheng, Jiangsu, China
32 ZDM2266 长六棱白壳 Changliulengbaike 中国江苏如皋 Rugao, Jiangsu, China
33 ZDM2270 紫秆六棱 Ziganliuleng 中国江苏南通 Nantong, Jiangsu, China
34 ZDM2271 南通倒八担 Nantongdaobadan 中国江苏南通 Nantong, Jiangsu, China
35 ZDM2274 南通倒八担 Nantongdaobadan 中国江苏南通 Nantong, Jiangsu, China
36 ZDM2275 南通白麦 Nantongbaimai 中国江苏南通 Nantong, Jiangsu, China
37 ZDM2276 南通冲天炮 Nantongchongtianpao 中国江苏南通 Nantong, Jiangsu, China
38 ZDM2279 南通铁麦 Nantongtiemai 中国江苏南通 Nantong, Jiangsu, China
39 ZDM2280 垂头六棱元麦 Chuitouliulengyuanmai 中国江苏南通 Nantong, Jiangsu, China
40 ZDM2282 如东早六棱头 Rudongzaoliulengtou 中国江苏如东 Rudong, Jiangsu, China
41 ZDM2283 海门火烧六柱头 Haimenhuoshaoliuzhutou 中国江苏海门 Haimen, Jiangsu, China
42 ZDM2284 海门火烧黑柱头 Haimenhuoshaoheizhutou 中国江苏海门 Haimen, Jiangsu, China
43 ZDM2285 海门白皮六棱头 Haimenbaipiliulengtou 中国江苏海门 Haimen, Jiangsu, China
44 ZDM2287 江都四棱子 Jiangdusilengzi 中国江苏江都 Jiangdu, Jiangsu, China
45 ZDM2289 太县洋六棱 Taixianyangliuleng 中国江苏太县 Taixian, Jiangsu, China
46 ZDM2290 太县洋六棱 Taixianyangliuleng 中国江苏太县 Taixian, Jiangsu, China
47 ZDM2291 白六棱 Bailiuleng 中国江苏靖江 Jingjiang, Jiangsu, China
48 ZDM2293 靖江晏来红 Jingjiangyanlaihong 中国江苏靖江 Jingjiang, Jiangsu, China
49 ZDM2295 句容六棱元麦Jurongliulengyuanmai 中国江苏句容 Jurong, Jiangsu, China
50 ZDM2296 扬中红 Yangzhonghong 中国江苏扬中 Yangzhong, Jiangsu, China
51 ZDM2298 丹阳长穗晚元麦 Danyangchangsuiwanyuanmai 中国江苏丹阳 Danyang, Jiangsu, China
52 ZDM2300 宜兴洋元麦 Yixingyangyuanmai 中国江苏宜兴 Yixing, Jiangsu, China
53 ZDM2301 武进晚粒红 Wujinwanlihong 中国江苏武进 Wujin, Jiangsu, China
54 ZDM2302 武进元麦 Wujinyuanmai 中国江苏武进 Wujin, Jiangsu, China
55 ZDM2303 武进四月黄团穗头 Wujinsiyuahuangtuansuitou 中国江苏武进 Wujin, Jiangsu, China
56 ZDM2304 武进六棱头 Wujinliulengtou 中国江苏武进 Wujin, Jiangsu, China
57 ZDM2306 太仓六柱头 Taicangliuzhutou 中国江苏太仓 Taicang, Jiangsu, China
58 ZDM2307 太仓四柱头 Taicangsizhutou 中国江苏太仓 Taicang, Jiangsu, China
59 ZDM2308 江阴六柱头 Jiangyinliuzhutou 中国江苏江阴 Jiangyin, Jiangsu, China
60 ZDM2310 常熟矮脚早裸麦 Changsuaijiaozaoluomai 中国江苏常熟 Changshu, Jiangsu, China
61 ZDM2311 键米大麦 Jianmidamai 中国江苏常熟 Changshu, Jiangsu, China
62 ZDM2313 常熟六棱元麦 Changsuiliulengyuanmai 中国江苏常熟 Changshu, Jiangsu, China
63 ZDM2314 常熟缠茎六柱 Changshuchanjingliuzhu 中国江苏常熟 Changshu, Jiangsu, China
64 ZDM2316 立新2号 Lixin 2 中国江苏大丰 Dafeng, Jiangsu, China
65 ZDM2318 通麦3号 Tongmai 3 中国江苏如皋 Rugao, Jiangsu, China
66 ZDM2320 早芒2号 Zaomang 2 中国江苏如皋 Rugao, Jiangsu, China
67 ZDM2321 海麦1号 Haimai 1 中国江苏海门 Haimen, Jiangsu, China
68 ZDM2322 8023白壳 Baike 8023 中国江苏 Jiangsu, China
69 ZDM2323 村农2号 Cunnong 2 中国江苏 Jiangsu, China
70 ZDM8505 江苏元麦108号 Jiangsuyuanmai 108 中国江苏 Jiangsu, China
71 ZDM8506 江苏元麦109号 Jiangsuyuanmai 109 中国江苏 Jiangsu, China
72 ZDM8508 江苏元麦110号 Jiangsuyuanmai 110 中国江苏 Jiangsu, China
73 ZDM8511 江苏元麦113号 Jiangsuyuanmai 113 中国江苏 Jiangsu, China
74 ZDM8514 江苏元麦116号 Jiangsuyuanmai 116 中国江苏 Jiangsu, China
75 ZDM8515 江苏元麦117号 Jiangsuyuanmai 117 中国江苏 Jiangsu, China
76 ZDM8518 江苏元麦11号 Jiangsuyuanmai 11 中国江苏 Jiangsu, China
77 ZDM8520 江苏元麦121号 Jiangsuyuanmai 121 中国江苏 Jiangsu, China
78 ZDM8522 江苏元麦123号 Jiangsuyuanmai 123 中国江苏 Jiangsu, China
79 ZDM8523 江苏元麦124号 Jiangsuyuanmai 124 中国江苏 Jiangsu, China
80 ZDM8524 江苏元麦125号 Jiangsuyuanmai 125 中国江苏 Jiangsu, China
81 ZDM8525 江苏元麦126号 Jiangsuyuanmai 126 中国江苏 Jiangsu, China
82 ZDM8534 江苏元麦134号 Jiangsuyuanmai 134 中国江苏 Jiangsu, China
83 ZDM8535 江苏元麦135号 Jiangsuyuanmai 135 中国江苏 Jiangsu, China
84 ZDM8536 江苏元麦136号 Jiangsuyuanmai 136 中国江苏 Jiangsu, China
85 ZDM8537 江苏元麦137号 Jiangsuyuanmai 137 中国江苏 Jiangsu, China
86 ZDM8538 江苏元麦138号 Jiangsuyuanmai 138 中国江苏 Jiangsu, China
87 ZDM8540 江苏元麦13号 Jiangsuyuanmai 13 中国江苏 Jiangsu, China
88 ZDM8541 江苏元麦140号 Jiangsuyuanmai 140 中国江苏 Jiangsu, China
89 ZDM8542 江苏元麦141号 Jiangsuyuanmai 141 中国江苏 Jiangsu, China
90 ZDM8543 江苏元麦142号 Jiangsuyuanmai 142 中国江苏 Jiangsu, China
91 ZDM8544 江苏元麦143号 Jiangsuyuanmai 143 中国江苏 Jiangsu, China
92 ZDM8545 江苏元麦144号 Jiangsuyuanmai 144 中国江苏 Jiangsu, China
93 ZDM8546 江苏元麦145号 Jiangsuyuanmai 145 中国江苏 Jiangsu, China
94 ZDM8547 江苏元麦146号 Jiangsuyuanmai 146 中国江苏 Jiangsu, China
95 ZDM8548 江苏元麦147号 Jiangsuyuanmai 147 中国江苏 Jiangsu, China
96 ZDM8549 江苏元麦148号 Jiangsuyuanmai 148 中国江苏 Jiangsu, China
97 ZDM8550 江苏元麦149号 Jiangsuyuanmai 149 中国江苏 Jiangsu, China
98 ZDM8553 江苏元麦151号 Jiangsuyuanmai 151 中国江苏 Jiangsu, China
99 ZDM8554 江苏元麦152号 Jiangsuyuanmai 152 中国江苏 Jiangsu, China
100 ZDM8555 江苏元麦153号 Jiangsuyuanmai 153 中国江苏 Jiangsu, China
101 ZDM8556 江苏元麦154号 Jiangsuyuanmai 154 中国江苏 Jiangsu, China
102 ZDM8557 江苏元麦155号 Jiangsuyuanmai 155 中国江苏 Jiangsu, China
103 ZDM8558 江苏元麦156号 Jiangsuyuanmai 156 中国江苏 Jiangsu, China
104 ZDM8559 江苏元麦157号 Jiangsuyuanmai 157 中国江苏 Jiangsu, China
105 ZDM8560 江苏元麦158号 Jiangsuyuanmai 158 中国江苏 Jiangsu, China
106 ZDM8561 江苏元麦159号 Jiangsuyuanmai 159 中国江苏 Jiangsu, China
107 ZDM8562 江苏元麦15号 Jiangsuyuanmai 15 中国江苏 Jiangsu, China
108 ZDM8563 江苏元麦160号 Jiangsuyuanmai 160 中国江苏 Jiangsu, China
109 ZDM8564 江苏元麦161号 Jiangsuyuanmai 161 中国江苏 Jiangsu, China
110 ZDM8565 江苏元麦162号 Jiangsuyuanmai 162 中国江苏 Jiangsu, China
111 ZDM8566 江苏元麦163号 Jiangsuyuanmai 163 中国江苏 Jiangsu, China
112 ZDM8567 江苏元麦164号 Jiangsuyuanmai 164 中国江苏 Jiangsu, China
113 ZDM8568 江苏元麦165号 Jiangsuyuanmai 165 中国江苏 Jiangsu, China
114 ZDM8569 江苏元麦166号 Jiangsuyuanmai 166 中国江苏 Jiangsu, China
115 ZDM8570 江苏元麦167号 Jiangsuyuanmai 167 中国江苏 Jiangsu, China
116 ZDM8572 江苏元麦17号 Jiangsuyuanmai 17 中国江苏 Jiangsu, China
117 ZDM8573 江苏元麦18号 Jiangsuyuanmai 18 中国江苏 Jiangsu, China
118 ZDM8574 江苏元麦19号 Jiangsuyuanmai 19 中国江苏 Jiangsu, China
119 ZDM8575 江苏元麦1号 Jiangsuyuanmai 1 中国江苏 Jiangsu, China
120 ZDM8576 江苏元麦20号 Jiangsuyuanmai 20 中国江苏 Jiangsu, China
121 ZDM8577 江苏元麦21号 Jiangsuyuanmai 21 中国江苏 Jiangsu, China
122 ZDM8578 江苏元麦22号 Jiangsuyuanmai 22 中国江苏 Jiangsu, China
123 ZDM8579 江苏元麦23号 Jiangsuyuanmai 23 中国江苏 Jiangsu, China
124 ZDM8580 江苏元麦24号 Jiangsuyuanmai 24 中国江苏 Jiangsu, China
125 ZDM8581 江苏元麦25号 Jiangsuyuanmai 25 中国江苏 Jiangsu, China
126 ZDM8582 江苏元麦26号 Jiangsuyuanmai 26 中国江苏 Jiangsu, China
127 ZDM8583 江苏元麦27号 Jiangsuyuanmai 27 中国江苏 Jiangsu, China
128 ZDM8584 江苏元麦28号 Jiangsuyuanmai 28 中国江苏 Jiangsu, China
129 ZDM8585 江苏元麦29号 Jiangsuyuanmai 29 中国江苏 Jiangsu, China
130 ZDM8586 江苏元麦2号 Jiangsuyuanmai 2 中国江苏 Jiangsu, China
131 ZDM8587 江苏元麦30号 Jiangsuyuanmai 30 中国江苏 Jiangsu, China
132 ZDM8588 江苏元麦31号 Jiangsuyuanmai 31 中国江苏 Jiangsu, China
133 ZDM8589 江苏元麦32号 Jiangsuyuanmai 32 中国江苏 Jiangsu, China
134 ZDM8590 江苏元麦33号 Jiangsuyuanmai 33 中国江苏 Jiangsu, China
135 ZDM8591 江苏元麦34号 Jiangsuyuanmai 34 中国江苏 Jiangsu, China
136 ZDM8592 江苏元麦35号 Jiangsuyuanmai 35 中国江苏 Jiangsu, China
137 ZDM8593 江苏元麦36号 Jiangsuyuanmai 36 中国江苏 Jiangsu, China
138 ZDM8594 江苏元麦37号 Jiangsuyuanmai 37 中国江苏 Jiangsu, China
139 ZDM8595 江苏元麦38号 Jiangsuyuanmai 38 中国江苏 Jiangsu, China
140 ZDM8596 江苏元麦39号 Jiangsuyuanmai 39 中国江苏 Jiangsu, China
141 ZDM8597 江苏元麦3号 Jiangsuyuanmai 3 中国江苏 Jiangsu, China
142 ZDM8598 江苏元麦40号 Jiangsuyuanmai 40 中国江苏 Jiangsu, China
143 ZDM8599 江苏元麦41号 Jiangsuyuanmai 41 中国江苏 Jiangsu, China
144 ZDM8600 江苏元麦42号 Jiangsuyuanmai 42 中国江苏 Jiangsu, China
145 ZDM8601 江苏元麦43号 Jiangsuyuanmai 43 中国江苏 Jiangsu, China
146 ZDM8602 江苏元麦44号 Jiangsuyuanmai 44 中国江苏 Jiangsu, China
147 ZDM8603 江苏元麦45号 Jiangsuyuanmai 45 中国江苏 Jiangsu, China
148 ZDM8604 江苏元麦46号 Jiangsuyuanmai 46 中国江苏 Jiangsu, China
149 ZDM8605 江苏元麦47号 Jiangsuyuanmai 47 中国江苏 Jiangsu, China
150 ZDM8606 江苏元麦48号 Jiangsuyuanmai 48 中国江苏 Jiangsu, China
151 ZDM8607 江苏元麦49号 Jiangsuyuanmai 49 中国江苏 Jiangsu, China
152 ZDM8608 江苏元麦4号 Jiangsuyuanmai 4 中国江苏 Jiangsu, China
153 ZDM8609 江苏元麦50号 Jiangsuyuanmai 50 中国江苏 Jiangsu, China
154 ZDM8610 江苏元麦51号 Jiangsuyuanmai 51 中国江苏 Jiangsu, China
155 ZDM8612 江苏元麦53号 Jiangsuyuanmai 53 中国江苏 Jiangsu, China
156 ZDM8613 江苏元麦54号 Jiangsuyuanmai 54 中国江苏 Jiangsu, China
157 ZDM8614 江苏元麦55号 Jiangsuyuanmai 55 中国江苏 Jiangsu, China
158 ZDM8615 江苏元麦56号 Jiangsuyuanmai 56 中国江苏 Jiangsu, China
159 ZDM8616 江苏元麦57号 Jiangsuyuanmai 57 中国江苏 Jiangsu, China
160 ZDM8617 江苏元麦58号 Jiangsuyuanmai 58 中国江苏 Jiangsu, China
161 ZDM8618 江苏元麦59号 Jiangsuyuanmai 59 中国江苏 Jiangsu, China
162 ZDM8619 江苏元麦5号 Jiangsuyuanmai 5 中国江苏 Jiangsu, China
163 ZDM8620 江苏元麦60号 Jiangsuyuanmai 60 中国江苏 Jiangsu, China
164 ZDM8621 江苏元麦61号 Jiangsuyuanmai 61 中国江苏 Jiangsu, China
165 ZDM8622 江苏元麦62号 Jiangsuyuanmai 62 中国江苏 Jiangsu, China
166 ZDM8623 江苏元麦63号 Jiangsuyuanmai 63 中国江苏 Jiangsu, China
167 ZDM8624 江苏元麦64号 Jiangsuyuanmai 64 中国江苏 Jiangsu, China
168 ZDM8625 江苏元麦65号 Jiangsuyuanmai 65 中国江苏 Jiangsu, China
169 ZDM8627 江苏元麦67号 Jiangsuyuanmai 67 中国江苏 Jiangsu, China
170 ZDM8630 江苏元麦6号 Jiangsuyuanmai 6 中国江苏 Jiangsu, China
171 ZDM8635 江苏元麦74号 Jiangsuyuanmai 74 中国江苏 Jiangsu, China
172 ZDM8636 江苏元麦75号 Jiangsuyuanmai 75 中国江苏 Jiangsu, China
173 ZDM8637 江苏元麦76号 Jiangsuyuanmai 76 中国江苏 Jiangsu, China
174 ZDM8638 江苏元麦77号 Jiangsuyuanmai 77 中国江苏 Jiangsu, China
175 ZDM8639 江苏元麦78号 Jiangsuyuanmai 78 中国江苏 Jiangsu, China
176 ZDM8640 江苏元麦79号 Jiangsuyuanmai 79 中国江苏 Jiangsu, China
177 ZDM8641 江苏元麦7号 Jiangsuyuanmai 7 中国江苏 Jiangsu, China
178 ZDM8642 江苏元麦80号 Jiangsuyuanmai 80 中国江苏 Jiangsu, China
179 ZDM8643 江苏元麦81号 Jiangsuyuanmai 81 中国江苏 Jiangsu, China
180 ZDM8645 江苏元麦83号 Jiangsuyuanmai 83 中国江苏 Jiangsu, China
181 ZDM8646 江苏元麦84号 Jiangsuyuanmai 84 中国江苏 Jiangsu, China
182 ZDM8647 江苏元麦85号 Jiangsuyuanmai 85 中国江苏 Jiangsu, China
183 ZDM8648 江苏元麦86号 Jiangsuyuanmai 86 中国江苏 Jiangsu, China
184 ZDM8649 江苏元麦87号 Jiangsuyuanmai 87 中国江苏 Jiangsu, China
185 ZDM8650 江苏元麦88号 Jiangsuyuanmai 88 中国江苏 Jiangsu, China
186 ZDM8651 江苏元麦89号 Jiangsuyuanmai 89 中国江苏 Jiangsu, China
187 ZDM8652 江苏元麦8号 Jiangsuyuanmai 8 中国江苏 Jiangsu, China
188 ZDM8653 江苏元麦90号 Jiangsuyuanmai 90 中国江苏 Jiangsu, China
189 ZDM8654 江苏元麦91号 Jiangsuyuanmai 91 中国江苏 Jiangsu, China
190 ZDM8655 江苏元麦92号 Jiangsuyuanmai 92 中国江苏 Jiangsu, China
191 ZDM8656 江苏元麦93号 Jiangsuyuanmai 93 中国江苏 Jiangsu, China
192 ZDM8657 江苏元麦94号 Jiangsuyuanmai 94 中国江苏 Jiangsu, China
193 ZDM8658 江苏元麦95号 Jiangsuyuanmai 95 中国江苏 Jiangsu, China
194 ZDM8659 江苏元麦96号 Jiangsuyuanmai 96 中国江苏 Jiangsu, China
195 ZDM8660 江苏元麦97号 Jiangsuyuanmai 97 中国江苏 Jiangsu, China
196 ZDM8661 江苏元麦98号 Jiangsuyuanmai 98 中国江苏 Jiangsu, China
197 ZDM8662 江苏元麦99号 Jiangsuyuanmai 99 中国江苏 Jiangsu, China
198 ZDM8663 江苏元麦9号 Jiangsuyuanmai 9 中国江苏 Jiangsu, China
199 ZDM09357 苏511元麦 Suyuanmai 511 中国江苏 Jiangsu, China
200 ZDM09450 苏728 Su728 中国江苏 Jiangsu, China
201 ZDM09455 苏71-27-1 Su71-27-1 中国江苏 Jiangsu, China
202 ZDM09462 苏71-43-2 Su71-43-2 中国江苏 Jiangsu, China
203 ZDM09463 苏71-43-8 Su71-43-8 中国江苏 Jiangsu, China
204 ZDM09464 苏71-58 Su71-58 中国江苏 Jiangsu, China
205 ZDM09465 苏71-59-34 Su71-59-34 中国江苏 Jiangsu, China
206 ZDM09466 苏71-75-12 Su 71-75-12 中国江苏 Jiangsu, China
207 ZDM09467 苏71-84 Su71-84 中国江苏 Jiangsu, China
208 ZDM09468 苏72-18-19(22) Su72-18-19(22) 中国江苏 Jiangsu, China
209 ZDM09469 苏72-28 Su72-28 中国江苏 Jiangsu, China
210 ZDM09471 苏72-37 Su72-37 中国江苏 Jiangsu, China
211 ZDM09472 苏72-38(9)Su72-38(9) 中国江苏 Jiangsu, China
212 ZDM09473 苏72-39-(2)Su72-39-(2) 中国江苏 Jiangsu, China
213 ZDM09474 苏72-41-3 Su72-41-3 中国江苏 Jiangsu, China
214 ZDM09475 苏72-44-(48)Su72-44-(48) 中国江苏 Jiangsu, China
215 ZDM09478 苏72-49 Su72-49 中国江苏 Jiangsu, China
216 ZDM09479 苏72-63 Su72-63 中国江苏 Jiangsu, China
217 ZDM09480 苏76-39 Su 76-39 中国江苏 Jiangsu, China
218 ZDM09481 苏785 Su 785 中国江苏 Jiangsu, China
219 昆仑12 Kunlun 12 中国青海 Qinghai, China
220 昆仑13 Kunlun 13 中国青海 Qinghai, China
221 昆仑14 Kunlun 14 中国青海 Qinghai, China
222 昆仑15 Kunlun 15 中国青海 Qinghai, China
223 柴青1号 Chaiqing 1 中国青海 Qinghai, China
224 21DJ1 中国江苏 Jiangsu, China
225 21DJ2 中国江苏 Jiangsu, China
226 21DJ3 中国江苏 Jiangsu, China
227 21DJ7 中国江苏 Jiangsu, China
228 21DJ8 中国江苏 Jiangsu, China
229 21DJ9 中国江苏 Jiangsu, China
230 甘垦5号 Ganken 5 中国甘肃 Gansu, China
231 苏裸麦2号 Suluomai 2 中国江苏 Jiangsu, China
232 通0914 Tong 0914 中国江苏 Jiangsu, China
233 紫元麦 Ziyuanmai 中国西藏 Tibet, China
234 肚里黄 Dulihuang 中国青海 Qinghai, China
235 5171 中国西藏 Tibet, China
236 甘青4号 Ganqing 4 中国青海 Qinghai, China
237 东陈元麦 Dongchenyuanmai 中国江苏 Jiangsu, China
238 青元麦 Qingyuanmai 中国江苏 Jiangsu, China
239 泰兴元麦 Taixingyuanmai 中国江苏 Jiangsu, China
240 ZDM00006 罗道庄大麦 Luodaozhuangdamai 中国北京 Beijing, China
241 ZDM03261 临海裸大麦Linhailuodamai 中国浙江 Zhejiang, China
242 ZDM06853 勒清 Leqing 中国西藏 Tibet, China
243 ZDM07528 尼泊尔青稞 Niboerqingke 尼泊尔 Nepal
244 ZDM07534 皮当蓝 Pidanglan 中国西藏 Tibet, China
245 ZDM07554 西嘎果那 Xigaguona 中国西藏 Tibet, China
246 ZDM07562 曲布蓝 Qubulan 中国西藏 Tibet, China
247 ZDM07571 竹居青 Zujuqing 中国西藏 Tibet, China
248 ZDM07573 色堆短芒 Seduiduanmang 中国西藏 Tibet, China
249 ZDM07610 沙尔兰 Shaerlan 中国西藏 Tibet, China
250 ZDM07612 沃马紫 Womazi 中国西藏 Tibet, China
251 ZDM07613 沃马兰 Womalan 中国西藏 Tibet, China
252 ZDM07635 油松 Yousong 中国西藏 Tibet, China
253 ZDM07646 定结牧紫 Dingjiemuzi 中国西藏 Tibet, China
254 ZDM07648 孟德黄 Mengdehuang 中国西藏 Tibet, China
255 ZDM07651 春丕青稞 Chunpeiqingke 中国西藏 Tibet, China
256 ZDM07738 雄马兰 Xiongmalan 中国西藏 Tibet, China
257 ZDM07746 短芒青稞 Duanmangqingke 中国西藏 Tibet, China
258 ZDM07747 稀穗短芒 Xisuiduanmang 中国西藏 Tibet, China
259 ZDM08086 白青稞 baiqingke 中国青海 Qinghai, China
260 ZDM08108 四棱黑青稞 Silengheiqingke 中国青海 Qinghai, China
261 ZDM08141 长芒黑青稞 Changmangheiqingke 中国青海 Qinghai, China
262 ZDM08177 红胶泥 Hongjiaoni 中国青海 Qinghai, China
263 ZDM08193 钩芒紫青稞 Goumangziqingke 中国青海 Qinghai, China
264 ZDM08205 紫青稞 Ziqingke 中国青海 Qinghai, China
265 ZDM08217 黑青稞 Heiqingke 中国青海 Qinghai, China
266 ZDM08227 蓝青稞 Lanqingke 中国青海 Qinghai, China
267 ZDM08706 阿黑 Ahei 中国四川 Sichuan, China
268 ZDM08751 色黑瑞朗 Seheiruilang 中国四川 Sichuan, China
269 ZDM08784 日大多 Ridaduo 中国四川 Sichuan, China
270 ZDM08790 泽盖紫青稞 Zegaiziqingke 中国四川 Sichuan, China
271 ZDM08811 足木足大头六棱 Zumuzudatouliuleng 中国四川 Sichuan, China
272 ZDM08841 小青稞 Xiaoqingke 中国四川 Sichuan, China
273 ZDM08846 荞窝青稞 Qiaowoqingke 中国四川 Sichuan, China
274 ZDM09082 长钩紫大麦 Changgouzidamai 中国云南 Yunnan, China
275 ZDM09113 光芒黄大麦 Guangmanghuangdamai 中国云南 Yunnan, China
276 ZDM09369 苏农370 Sunong 370 中国江苏 Jiangsu, China
277 ZDM09653 阿212 A 212 中国四川 Sichuan, China
278 ZDM09748 藏830187 Zang830187 中国西藏 Tibet, China
279 ZDM09767 藏830754 Zang830754 中国西藏 Tibet, China
280 ZDM09772 藏830928 Zang830928 中国西藏 Tibet, China
281 ZDM09777 藏831247 Zang831247 中国西藏 Tibet, China
282 ZDM09779 藏831339 Zang831339 中国西藏 Tibet, China
283 ZDM09802 藏840714 Zang840714 中国西藏 Tibet, China
284 ZDM09817 藏85品3872 Zang85Pin3872 中国西藏 Tibet, China
285 ZDM09824 藏861228 Zang861228 中国西藏 Tibet, China
286 WDM00772 Jet 丹麦 Denmark
287 WDM02118 H.tetrast.L.V.viol 捷克斯洛伐克 Czechoslovakia
288 WDM02131 H.Viol B.8c H 丹麦 Denmark
289 WDM02972 Bonanza 加拿大 Canada
290 WDM03202 83 加拿大 Canada
291 WDM03203 84 加拿大 Canada
292 WDM03227 Black Hulless 丹麦 Denmark
293 WDM03228 Black Hull-less C.I.596 美国 America
294 WDM03230 Black Hull-less C.I.1027 美国 America
295 WDM03233 Black Hull-less C.I.2320 美国 America
296 WDM03237 Brachiki 墨西哥 Mexico
297 WDM03238 C1334 加拿大 Canada
298 WDM03263 Gaffel byg nφgen 丹麦 Denmark
299 WDM03279 H.polyst.V.trif.C 丹麦 Denmark
300 WDM03280 H.riol.B.Sch 丹麦 Denmark
301 WDM03315 Lyallpur 丹麦 Denmark
302 WDM03361 SIBIRI"S" 墨西哥 Mexico
303 WDM03362 SNJCO"S" 墨西哥 Mexico
304 WDM03390 C 2734 加拿大 Canada
305 WDM03406 MANKER-OREGANO 墨西哥 Mexico
306 WDM03411 OREGANO 墨西哥 Mexico
307 WDM03419 Streng 叙利亚 Syria
308 WDM03846 C1264 加拿大 Canada
309 WDM04080 CMB-74A-1796-B-6B-1Y-1B-1Y-1B-OY 墨西哥 Mexico
310 WDM04276 CMB76-839-C-500Y-500B-501Y-503B-500Y-OB 墨西哥 Mexico
311 WDM05243 Japanische419 西德 West Germany
312 WDM05418 Muanbori 日本 Japan
313 WDM05675 Scout 加拿大 Canada
314 WDM06222 四国裸46号 Siguoluo46 日本 Japan
315 WDM06223 四国裸86号 Siguoluo86 日本 Japan
316 WDM06224 四国裸87号 Siguoluo87 日本 Japan
317 WDM06225 四国裸88号 Siguoluo88 日本 Japan
318 WDM06226 四国裸89号 Siguoluo89 日本 Japan
319 WDM06256 御岛裸 Yudaoluo 日本 Japan
320 WDM06275 III-134 日本 Japan
321 WDM06281 III-526 日本 Japan
322 WDM06288 III-558 日本 Japan
323 WDM06289 III-564 日本 Japan
324 WDM06290 III-570 日本 Japan
325 WDM06306 Ⅴ-193 日本 Japan
326 WDM06311 Ⅵ-109 日本 Japan
327 WDM06316 Ⅶ-131 日本 Japan
328 9H88-009 中国西藏 Tibet, China
329 藏青690 Zangqing 690 中国西藏 Tibet, China
330 冬青18 Dongqing 18 中国西藏 Tibet, China
331 2016-品比36 2016-pinbi36 中国西藏 Tibet, China
332 喜马拉雅22 Ximalaya22 中国西藏 Tibet, China
333 藏青25 Zanqging25 中国西藏 Tibet, China
334 09-5024-3 中国西藏 Tibet, China
335 喜马拉雅19 Ximalaya19 中国西藏 Tibet, China
336 12-10-556 中国西藏 Tibet, China
337 08-1128 中国西藏 Tibet, China
338 08-1127 中国西藏 Tibet, China
339 2016-品比42 2016-pinbi-42 中国西藏 Tibet, China

附表2

SSR引物信息"

引物
Primer
上游引物
Forward primer (5'-3')
下游引物
Reverse primer (5'-3')
染色体
Chromosome
位置
Position (cM)
退火温度
Annealing temperature ()
scssr04163 GAAGAAACAACCCAACTTCC AGGATCGTACGAAGAACAGC 1H 129.7 56
Bmag0579 CCTAGATAAGGAACATAGCCA CAAAGACCCTAACTCATGTTC 1H 127 56
AWBMS0080 GCTTTCAGCATCTCAACTGCG TGTATGCCAGGAAAACGGAACC 1H 59.1 56
Bmac0090 ACATCAACCCTCCTGCTC CCGCACATAGTGGTTACATC 1H 52.3 58
Bmac32 CCATCAAAGTCCGGCTAG GTCGGGCCTCATACTGAC 1H 105 58
HVM0054 AACCCAGTAACACCGTCCTG AGTTCCCTGACCCGATGTC 2H 122.41 58
Bmag0125 AATTAGCGAGAACAAAATCAC AGATAACGATGCACCACC 2H 89.83 56
scssr03381 CAGGGACGTACAATATTACCG AATAAGCAGGGTACCTTTTGG 2H 64.9 56
Bmag0692 GCAAGGTATCTCTTGTATTTTG GGCATCTACAATCTAAAACA 2H 46.23 56
EBmag0793 ATATATCAGCTCGGTCTCTCA AACATAGTAGAGGCGTAGGTG 2H 177 60
Bmag0013 AAGGGGAATCAAAATGGGAG TCGAATAGGTCTCCGAAGAAA 3H 104.2 58
Bmag0006 TTAAACCCCCCCCCTCTAG TGCAGTTACTATCGCTGATTTAGC 3H 41 58
Bmag0828 CATCTCCTAAGGTTTATCTTTGA AGATCGTGACCTCTCAAGAC 3H 42.1 58
Bmag0225 AACACACCAAAAATATTACATCA CGAGTAGTTCCCATGTGAC 3H 75.54 56
Bmag0603 ATACCATGATACATCACATCG GGGGGTATGTACGACTAACTA 3H 46.1 56
Bmac0209 CTAGCAACTTCCCAACCGAC ATGCCTGTGTGTGGACCAT 3H 52.39 56
HVM67 GTCGGGCTCCATTGCTCT CCGGTACCCAGTGACGAC 4H 102.5 56
Bmac310 CTACCTCTGAGATATCATGCC ATCTAGTGTGTGTTGCTTCCT 4H 64.37 58
HVM40 CGATTCCCCTTTTCCCAC ATTCTCCGCCGTCCACTC 4H 14 58
EBmac0701 ATGATGAGAACTCTTCACCC TGGCACTAAAGCAAAAGAC 4H 96.17 56
EBmac775 GCTTCCTTCATAGACCCAT ATATCATGCCAATGGTGTC 4H 80 56
EBmac0679 ATTGGAGCGGATTAGGAT CCCTATGTCATGTAGGAGATG 4H 101 56
Bmag0323 TTTGTGACATCTCAAGAACAC TGACAAACAAATAATCACAGG 5H 50.85 56
Bmac0096 GCTATGGCGTACTATGTATGGTTG TCACGATGAGGTATGATCAAAGA 5H 53.12 56
GMS001 CTGACCCTTTGCTTAACATGC TCAGCGTGACAAACAATAAAGG 5H 200 56
Bmag223 TTAGTCACCCTCAACGGT CCCCTAACTGCTGTGATG 5H 86.88 56
GBS0613 AGTGTTACATGCATCGCACCG GGCTTCATCGTCTACCCTTCG 5H 71.5 56
GBM1215 ATGACCAGAAAACGCCTGTC GGATTCTGCACACACGAGAA 6H 35.4 56
Bmac0316 ATGGTAGAGGTCCCAACTG ATCACTGCTGTGCCTAGC 6H 7.16 56
Bmag0870 AACCATAGGATTTGTACTAGTTTC TCATGACATCTCAAGAACG 6H 50.5 56
Bmag0496 AGTATAACCAACAGCCGTCTA CTATAGCACGCCTTTGAGA 6H 63.76 56
Ebmac0602 GATTGGAGCTTCGGATCAC CCGTCTAGGGAGAGGTTCTC 6H 75.42 56
scssr05599 TTCCATCATAACAGCAATGG TTCGTCGAAGGCTATGTAGG 6H 111 56
Bmag0206 TTTTCCCCTATTATAGTGACG TAGAACTGGGTATTTCCTTGA 7H 17.9 56
EBmac764 AGAATCAAGATCGACCAAAC AAAAACATGAACCGATGAA 7H 77 56
scssr04056 CCCATGAAGCCTCTTTACG GGAACGGAGGGAGTATTAAGC 7H 148.22 56
Bmag120 ATTTCATCCCAAAGGAGAC GTCACATAGACAGTTGTCTTCC 7H 152 56
Bmag7 TGAAGGAAGAATAAACAACCAACA TCCCCTATTATAGTGACGGTGTG 7H 27 56

图1

SSR标记Bmag0496在裸大麦种质中的部分扩增结果 数字为附表1中资源的序号。"

表1

38对SSR标记在339份材料中的遗传多样性参数"

引物
Primer name
等位基因数Number of
alleles
(Na)
有效等位基因数
Number of effective alleles
(Ne)
Shannon's多样性指数
Shannon's diversity
index
(I)
Nei's多样性指数
Nei's diversity
index
(H)
多态性信息含量
Polymorphism
information content
(PIC)
scssr04163 6 2.0982 1.1011 0.5234 0.4943
Bmag0579 4 1.5063 0.6839 0.3361 0.3161
AWBMS0080 4 2.4089 1.0325 0.5849 0.5125
Bmac0090 6 2.0496 1.0753 0.5121 0.4845
Bmac32 8 4.4001 1.7026 0.7727 0.7435
HVM0054 4 2.6254 1.1396 0.6191 0.5677
Bmag0125 7 3.9375 1.5629 0.7460 0.7097
scssr03381 5 3.0967 1.2437 0.6771 0.6173
Bmag0692 10 6.9871 2.0562 0.8569 0.8403
EBmag0793 6 2.9180 1.2420 0.6573 0.6068
Bmag0013 7 3.3836 1.4324 0.7045 0.6577
Bmag0006 5 3.7984 1.4307 0.7367 0.6915
Bmag0828 11 7.5891 2.1680 0.8682 0.8543
Bmag0225 7 3.9071 1.5401 0.7441 0.7044
Bmag0603 5 1.2531 0.4673 0.2020 0.1950
Bmac0209 5 2.7524 1.1854 0.6367 0.5773
HVM67 7 3.4316 1.4449 0.7086 0.6606
Bmac310 6 2.3389 1.2169 0.5724 0.5445
HVM40 4 1.8514 0.8109 0.4599 0.3989
EBmac0701 6 1.2764 0.5132 0.2165 0.2091
EBmac775 7 2.2267 1.1595 0.5509 0.5208
EBmac0679 6 1.3047 0.5691 0.2335 0.2273
Bmag0323 7 4.7185 1.6742 0.7881 0.7576
Bmac0096 6 2.4094 1.2118 0.5850 0.5549
GMS001 4 1.6010 0.7532 0.3754 0.3520
Bmag223 9 3.4627 1.5768 0.7112 0.6822
GBS0613 2 1.9725 0.6862 0.4930 0.3715
GBM1215 5 1.9051 0.8742 0.4751 0.4154
Bmac0316 5 1.1488 0.3308 0.1295 0.1269
Bmag0870 8 4.8852 1.7903 0.7953 0.7691
Bmag0496 10 7.2859 2.1266 0.8627 0.8483
Ebmac0602 5 1.5542 0.7220 0.3566 0.3334
scssr05599 3 1.3087 0.4580 0.2359 0.2178
Bmag0206 11 5.1443 1.8001 0.8056 0.7780
EBmac764 7 3.4792 1.4905 0.7126 0.6728
scssr04056 9 2.7031 1.2559 0.6301 0.5626
Bmag120 7 2.6230 1.1872 0.6188 0.5467
Bmag7 8 4.1988 1.6034 0.7618 0.7248
平均值Mean 6.3684 3.0932 1.2189 0.5857 0.5486

表2

不同群体的遗传多样性分析"

来源
Origin
组群大小
Sample size
等位基因数
Number of
alleles
(Na)
有效等位基因数
Number of
effective alleles (Ne)
Shannon's多样性指数
Shannon's
diversity index
(I)
Nei's多样性指数
Nei's diversity
index
(H)
多态性信息含量
Polymorphism
information content (PIC)
中国江苏Jiangsu, China 230 5.4737±2.0366 2.5347±1.3079 0.9951±0.4945 0.5004±0.2333 0.4593
中国西藏Tibet, China 38 3.2105±1.5796 2.3819±1.0639 0.8698±0.5037 0.4807±0.2506 0.5494
中国青海Qinghai, China 15 5.0000±1.6926 2.8656±1.0413 1.1693±0.3860 0.5944±0.1728 0.4339
中国四川Sichuan, China 8 3.0263±0.9722 2.7427±0.9586 0.9924±0.3693 0.5826±0.1799 0.3900
亚洲# Asia# 17 3.7105±1.1368 2.8741±1.0355 1.1135±0.3230 0.6111±0.1261 0.5192
欧洲 Europe 9 3.9211±1.5489 2.7827±1.0754 1.0619±0.4499 0.5691±0.2173 0.5559
北美洲 North America 17 4.8158±1.7531 3.3396±1.3056 1.2742±0.4197 0.6459±0.1651 0.6009

表3

国内外群体的遗传多样性分析"

群体
Population
等位基因数
Number of
alleles
(Na)
有效等位基因数
Number of
effective alleles
(Ne)
Shannon's多样性指数
Shannon's diversity
index
(I)
Nei's多样性指数
Nei's diversity
index
(H)
多态性信息含量
Polymorphism
information content
(PIC)
国内Domestic 6.1579±2.0603 2.9005 ±1.5723 1.1488±0.4885 0.5576±0.2135 0.5196
国外Abroad 5.6842±2.0547 3.7357 ±1.6537 1.3805±0.4296 0.6718±0.1564 0.6322

表4

不同来源地区裸大麦群体间遗传距离和遗传分化系数"

群体
Population
中国江苏 Jiangsu, China 中国西藏
Tibet, China
中国青海
Qinghai, China
中国四川
Sichuan, China
亚洲(除中国)
Asia (except China)
欧洲
Europe
北美洲
North America
中国江苏 Jiangsu, China 0 0.271 0.316 0.356 0.284 0.360 0.320
中国西藏 Tibet, China 0.083 0 0.182 0.211 0.202 0.241 0.234
中国青海 Qinghai, China 0.113 0.069 0 0.157 0.313 0.258 0.249
中国四川 Sichuan, China 0.132 0.084 0.078 0 0.341 0.318 0.323
亚洲# Asia# 0.089 0.059 0.110 0.122 0 0.356 0.315
欧洲 Europe 0.108 0.065 0.092 0.113 0.094 0 0.177
北美洲 North America 0.098 0.061 0.088 0.112 0.085 0.045 0

表5

基于SSR标记的不同来源地区裸大麦群体的分子方差分析(AMOVA)和基因分化"

变异来源
Source
自由度
DF
平方和
SS
均方差
MSE
方差分量
Variance component
方差分量百分率
Total variance (%)
基因流
Gene flow (Nm)
群体间 Among population 7 803.578 114.797 1.881 15.58
群体内 In population 331 6720.944 20.305 10.113 83.76
个体内 In individual 339 27.000 0.080 0.080 0.66
总体 Total 677 7551.522 12.073 100.00
平均 Mean 1.355

图2

339份材料基于Nei遗传距离的NJ聚类图 外圈颜色顺时针对应类群分类I~IV。"

图3

K值与ln P(D)、ΔK值折线图"

图4

8个来源地区的339份裸大麦种质遗传结构分析图 横坐标为8个来源地区群体代码, 纵坐标为Q值(每一个类群内每个个体之间的估测系数) 0~1.00, 8个群体间用黑线分隔。"

表6

295份裸大麦材料(Q值≥0.6)在各组群中的分布(K=4)"

群体Population 黄色 Yellow 蓝色 Blue 红色 Red 绿色 Green 合计 Total
中国江苏 Jiangsu, China 142 1 11 42 196
中国西藏 Tibet, China 0 33 2 0 35
中国青海 Qinghai, China 0 14 0 0 14
中国四川 Sichuan, China 0 8 0 0 8
中国其他地区 China (other areas) 0 0 3 1 4
亚洲# Asia# 0 9 0 6 15
欧洲 Europe 0 5 3 0 8
北美洲 North America 0 7 7 1 15
合计 Total 142 77 26 50 295

图5

基于SSR标记的339个裸大麦品种(系)主成分分析 1: 中国江苏品种(系); 2: 中国西藏品种(系); 3: 中国青海品种(系); 4: 中国四川品种(系); 5: 中国其他地区品种(系); 6: 亚洲(除中国)品种(系); 7: 欧洲品种(系); 8: 北美洲品种(系)。"

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