%A 韩泽刚,赵曾强,李会会,张析,李潇玲,张薇 %T 枯萎病菌诱导感、抗陆地棉品种的基因表达谱分析 %0 Journal Article %D 2015 %J 作物学报 %R 10.3724/SP.J.1006.2015.01201 %P 1201-1211 %V 41 %N 08 %U {https://zwxb.chinacrops.org/CN/abstract/article_5927.shtml} %8 2015-08-12 %X

选用陆地棉抗枯萎病品种中棉所12和感枯萎病品种新陆早7号,利用Solexa高通量测序技术分析棉花幼苗受到枯萎病菌侵染后3 h6 h根部组织的基因表达谱。中棉所12受病菌侵染后3 h0 h相比,6 h0 h相比以及6 h3 h相比,分别鉴定出444754812559个差异表达基因;新陆早7号分别鉴定出861567272078个差异表达基因;2个品种比较,在3 h6 h分别鉴定出1879个和500个差异表达基因。基因功能分析表明,差异表达基因划分为生物学过程、细胞组分和分子功能注释本体,并进一步细分为48个功能类别。代谢通路分析显示,中棉所12和新陆早7号在枯萎病菌侵染后的6 h0 h相比鉴定出的Pathway最多,均有126条;在枯萎病菌侵染后6 h,从2个品种鉴定出的Pathway最少,仅有89条。各个比对组的Pathway涉及的基因可被划分为次生代谢产物的生物合成、多糖的生物合成和代谢、环境适应和免疫系统等13类。在环境适应和免疫系统分类中存在着植物与病原菌相互作用Pathway,涉及到996个已知功能的差异表达基因,有444个基因上调表达,552个基因下调表达。其中,差异表达基因最多的是WRKY转录因子家族基因,其次为丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶基因,而DNA损伤修复/耐受性蛋白,JAZ1RAR1RPM1互作蛋白,S位点的特异性糖蛋白S6前体以及钙牵引蛋白等6类基因参与该Pathway的数目最少。最后随机抽取6个基因进行实时荧光定量PCR验证,其结果与测序结果一致。