Please wait a minute...
欢迎访问作物学报,今天是
图/表 详细信息
两个不同籽粒硬度小麦的比较蛋白组学分析
刘培勋,马小飞,万洪深,郑建敏,罗江陶,蒲宗君
作物学报    2020, 46 (8): 1275-1282.   DOI: 10.3724/SP.J.1006.2020.91068
摘要   (599 HTML27 PDF(pc) (636KB)(679)  

小麦是全球种植面积最大粮食作物, 为全球45亿人提供日常蛋白和能量摄入的20%。弄清小麦籽粒硬度遗传基础, 对于改良小麦品质具有重大意义。为探讨不同硬度小麦种子的分子基础, 本实验选用西南麦区2个硬度差异极显著的小麦品种川麦66和蜀麦969, 从蛋白水平上分析其种子蛋白差异表达情况, 利用TMT定量蛋白质组学技术(tandem mass tags)结合生物信息学分析, 分析差异表达的蛋白及其功能和通路等富集情况。结果表明, 鉴定并定量了有效蛋白6020个, 其中显著差异表达蛋白113个, 在软质麦川麦66中上调表达的69个, 下调表达的44个。差异蛋白GO富集分析共富集到65个GO条目, 达到极显著富集水平的包括生物过程的1个条目、细胞组成的1个条目和分子功能的6个条目。推测营养库活性类蛋白、酶抑制剂活性类蛋白和谷胱甘肽代谢途径类蛋白可能参与小麦籽粒硬度形成。籽粒硬度相关蛋白可能主要分布于细胞胞外区, 具有防御作用。从系统发育分析推测, puroindolines蛋白及其同源蛋白, 可能既作为小麦籽粒贮藏蛋白, 同时还能作为酶抑制剂调控籽粒发育。本研究为进一步探索小麦籽粒硬度遗传机制提供了参考。



View image in article
图2 蛋白质功能注释结果
正文中引用本图/表的段落
通过数据库搜索, 鉴定到二级谱图(total spectra)数量为85,497个, 肽段(Peptide)数为32,552个, 蛋白数(protein)为6061个。利用GO、KEGG和COG数据库对鉴定到的蛋白质进行功能注释, 利用Pfam、ProDom、SMART等结构域的数据库进行结构域注释(IPR), 利用模式结构或特征进行功能未知蛋白的结构域注释, 共注释到6020个蛋白, 注释结果统计见图2, 有2819个蛋白可同时被4种数据库注释。
本文的其它图/表