作物学报

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1. 作物生长模型研究综述

林忠辉;莫兴国;项月琴

作物学报 2003, 29 (05): 750-758.

摘要（3091）

PDF（pc）（237KB）（10812）

作物生长模型的构建有利于既有科研成果的综合集成，也是作物种植管理决策现代化的基础，还是辅助决策的有力工具.本文以荷兰Wageningen，美国DSSAT，澳大利亚APSIM和中国CCSODS等作物生长模型研究流派为例，回顾了作物生长模型的发展历程，论述了作物生长模型的主要功用，并指出了在模型研究和开发应用中存在的问题.

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2. 中国作物新基因发掘：现状、挑战与展望

邱丽娟, 郭勇, 黎裕, 王晓波, 周国安, 刘章雄, 周时荣, 李新海, 马有志, 王建康, 万建民

作物学报 2011, 37 (01): 1-17. DOI: 10.3724/SP.J.1006.2011.00001

摘要（4299）

PDF（pc）（376KB）（9571）

中国作物新基因发掘是实现中国作物种质资源优势向基因资源优势转变和作物分子育种的基础。本文对中国近10年来水稻、小麦、玉米、大豆、棉花和油菜等主要作物基因发掘研究的进展进行了分析和评述。中国作物基因发掘也取得了一系列突破性进展：(1)创制出一批具有特色的基因发掘材料，包括基于中国作物遗传多样性的核心种质、基于优异资源的遗传分离群体和基于人工诱变的突变体等；(2)基因发掘技术和方法有所突破，尤其是在针对基因特点整合各种基因发掘技术、改进基因/QTL的生物统计算法等，提高了基因发掘的效率；(3)作物农艺性状的标记与基因定位已成为常规遗传研究方法，初步定位了一批抗病、抗逆、优质、养分高效、高产相关基因/QTL，其中，有500多个基因已精细定位；(4)以水稻为代表的作物基因克隆及功能研究在国际上受到瞩目，在主要作物中已克隆了300多个基因，其中，在目标作物中验证的基因数超过70个。在国际作物基因发掘高效化、规模化及实用化发展过程中，中国作物基因发掘也取得了重要进展。然而，中国作物基因发掘的数量和质量还远远不能满足作物分子育种的需求，与国际作物基因发掘也存在差距，具体表现为不同作物基因发掘研究进展不平衡、发掘基因的数量还相对有限、已发掘的基因中具有重大利用价值的基因不多。针对中国基因发掘面临的问题和世界各国以及跨国生物技术公司争夺基因的巨大挑战，作者提出了中国作物基因发掘应重点提高基因发掘效率，加强重要基因克隆及基因的价值评估，以生物产业发展需求为导向的基因发掘策略。

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3. 中国作物分子育种现状与发展前景

黎裕,王建康,邱丽娟,马有志,李新海,万建民

作物学报 2010, 36 (09): 1425-1430. DOI: 10.3724/SP.J.1006.2010.01425

摘要（5901）

PDF（pc）（160KB）（7564）

近年来，随着基因组测序等多种技术实现突破，基因组学、表型组学等多门“组学”及生物信息学得到迅猛发展，作物育种理论和技术也发生了重大变革。以分子标记育种、转基因育种、分子设计育种为代表的现代作物分子育种技术逐渐成为了全世界作物育种的主流，在我国也正在成为作物遗传改良的重要手段。本文在界定分子育种的基础上，简要分析了中国作物分子育种研究现状和面临的问题，探讨了未来我国作物分子育种的发展策略。

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4. 中国小麦育种进展与展望

何中虎, 夏先春, 陈新民, 庄巧生

作物学报 2011, 37 (02): 202-215. DOI: 10.3724/SP.J.1006.2011.00202

摘要（5710）

PDF（pc）（229KB）（7055）

近10年我国小麦育种研究在3个方面取得新进展：育成一批高产优质多抗新品种，周8425B、鲁麦14和普通小麦-簇毛麦6VS/6AL易位系在全国小麦育种中发挥了重要作用，育种技术研究也取得重要进展。但育种工作也存在4个主要问题。从育种角度评述分子标记辅助育种中连锁标记和功能标记的研究现状和存在的主要问题，并提出今后的重点领域。概括小麦品质研究中与育种密切相关的实用技术和方法，即面包、面条和饼干品质育种中的品质评价方法和选择指标，建议今后加强5个方面的工作。对未来小麦育种4个重要问题做了分析，提出国内进一步加强高产潜力研究的初步设想，建议加大持久抗性的研究力度，重视抗旱、抗热及适应性等与气候变化相关性状的研究，还分析了种业商业化等问题。

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5. 中国作物分子设计育种

王建康, 李慧慧, 张学才, 尹长斌, 黎裕, 马有志, 李新海, 邱丽娟, 万建民

作物学报 2011, 37 (02): 191-201. DOI: 10.3724/SP.J.1006.2011.00191

摘要（6001）

PDF（pc）（261KB）（6915）

分子设计育种通过多种技术的集成与整合，对育种程序中的诸多因素进行模拟、筛选和优化，提出最佳的符合育种目标的基因型以及实现目标基因型的亲本选配和后代选择策略，以提高作物育种中的预见性和育种效率，实现从传统的“经验育种”到定向、高效的“精确育种”的转化。分子设计育种主要包含以下3个步骤：(1)研究目标性状基因以及基因间的相互关系，即找基因(或生产品种的原材料)，这一步骤包括构建遗传群体、筛选多态性标记、构建遗传连锁图谱、数量性状表型鉴定和遗传分析等内容；(2)根据不同生态环境条件下的育种目标设计目标基因型，即找目标(或设计品种原型)，这一步骤利用已经鉴定出的各种重要育种性状的基因信息，包括基因在染色体上的位置、遗传效应、基因到性状的生化网络和表达途径、基因之间的互作、基因与遗传背景和环境之间的互作等，模拟预测各种可能基因型的表现型，从中选择符合特定育种目标的基因型；(3)选育目标基因型的途径分析，即找途径(或制定生产品种的育种方案)。本文评述近几年来我国在遗传研究材料创新、重要性状遗传分析、育种模拟工具开发和应用、设计育种实践、分子设计育种技术体系建设等方面取得的重要进展，结合国内外研究现状对分子设计育种的未来进行展望，最后指出我国近期应加强育种预测方法和工具、基因和环境互作、遗传交配设计、作物功能基因组学、生物信息学方法和工具、设计育种技术体系和决策支持平台等领域的研究，同时重视人才培养和团队建设。

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6. 植物天然免疫性研究进展及其对作物抗病育种的可能影响

赵开军, 李岩强, 王春连, 高英

作物学报 2011, 37 (06): 935-942. DOI: 10.3724/SP.J.1006.2011.00935

摘要（3341）

PDF（pc）（571KB）（6268）

植物定植在充满各种病原菌的环境中却能健康生长，显示其拥有一套免疫系统以应对病原物的侵染。最近，人们发现植物免疫系统至少包括2个层次：第一层为病原相关分子模式(PAMP)激发的免疫性(PTI)，即植物通过细胞表面模式识别受体(PRRs)对病原菌的PAMPs进行分子识别，从而启动植物的防卫反应；第二层为病原菌效应子激发的免疫性(ETI)，即有些毒性强的病原菌通过产生效应子(effectors)来抑制PTI，从而突破植物的第一道防线，而植物又进化出新的分子受体(例如R基因编码的NBS-LRR蛋白质)以侦察病原菌效应子并启动第二道防卫反应。数亿年来，病原菌的侵染和植物的防卫交替进行，促进了病原菌和植物基因组的共进化。最新的研究还发现，黄单胞杆菌TAL effectors和寄主植物DNA 的相互识别中，利用了精准的分子密码。TAL effector类蛋白识别植物靶基因的启动子序列，识别模式是2个氨基酸识别一个核苷酸。通过这种识别，TAL effector操控植物靶基因的表达，引起寄主植物的感病或抗病反应。上述抗病分子机理研究的突破，将对植物抗病育种产生重要影响。

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7. 功能基因组学及其研究方法

张祖新;张方东;郑用琏

作物学报 2003, 29 (02): 194-201.

摘要（3261）

PDF（pc）（167KB）（6107）

功能基因组学是在结构基因组学丰富信息资源的基础上, 应用大通量的实验分析方法并结合统计和计算机分析研究基因的表达、调控与功能以及生物的生长、发育规律的新型交叉学科. 基因功能研究采用从基因到表型和从表型到基因两种策略, 使用多种方法创造大量变异及大通量识别并克隆基因和研究基因表达模式的技术. 如基因陷阱、基

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8. 玉米穗行数全基因组关联分析

张焕欣,翁建峰,张晓聪,刘昌林,雍洪军,郝转芳,李新海

作物学报 2014, 40 (01): 1-6. DOI: 10.3724/SP.J.1006.2014.00001

摘要（1842）

HTML （3）

PDF（pc）（846KB）（5407）

穗行数是玉米产量的重要组成性状，其遗传解析对高产育种具有指导意义。本文以 203 份主要玉米自交系为材料， 2007 年在新疆乌鲁木齐、吉林公主岭和海南三亚进行穗行数测定；采用分布于玉米基因组的 41 101 个单核苷酸多态性 (SNP) 标记对穗行数进行关联分析。共鉴定出 9 个与穗行数显著关联 (P < 0.0001) 的 SNP ，分别位于染色体框 1.02 、 1.10 、 7.03 、 8.02 、 9.06 和 10.03 。 8 个 SNP 位于已定位的数量性状座位 (QTL) 区间内。在显著 SNP 位点 LD 区域内发掘出 4 个候选基因，分别编码含 F-box 结构域的生长素受体蛋白、玉米 kn1 蛋白、 AP2 结构域蛋白和富亮氨酸重复的跨膜蛋白激酶。采用全基因组关联分析策略发掘穗行数基因位点及候选基因，将为克隆控制玉米产量性状基因奠定基础。

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9. 关于Mapmaker/Exp遗传作图中标记分群和排序操作技术的讨论

邢光南;赵团结;盖钧镒

作物学报 2008, 34 (02): 217-223. DOI: 10.3724/SP.J.1006.2008.00217

摘要（3520）

PDF（pc）（579KB）（5148）

Mapmaker/Exp (3.0)是国内外广泛使用的遗传连锁数据分析软件, 在分子标记数量大时(多于500个)往往出现所绘制连锁图谱图距偏大的现象。本文从标记分群和标记排序两个遗传作图环节分析原因并概括出以下两个实施要点：(1)标记分群不应强求同一LOD值, 对特殊的连锁群可试用不同LOD值; (2)在标记排序时, 一次order命令后用ripple命令反复梳理有时并不能获得最佳排列顺序, 而应多次使用order, 每次order后用ripple反复梳理, 经反复比较才能得出最佳排列顺序, 必要时还须结合人工调整。通过大豆遗传作图实例比较了软件推荐思路2的通常用法和作者建议的新用法所构建的遗传图谱及相应QTL定位的差异, 认为新用法具有更好的效果。

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10. 用生物信息学挖掘玉米中的microRNAs及其靶基因

张志明,宋锐,彭华,罗茂,沈亚欧,刘丽,赵茂俊,潘光堂*

作物学报 2010, 36 (08): 1324-1335. DOI: 10.3724/SP.J.1006.2010.01324

摘要（3641）

PDF（pc）（1472KB）（5112）

microRNA (miRNA)是一类内源性的、19~24碱基长度的小分子非编码RNA，通过碱基互补调控靶基因的表达，在多细胞生物的基因表达调控过程中扮演着十分重要的角色。植物中的miRNAs具有高度的保守性，这为通过同源比对发现保守的miRNAs提供了思路和途径。本研究通过对拟南芥、水稻等植物已知的miRNAs与玉米EST和GSS数据库的比对，并设置一系列严格的筛选标准，共筛选到23条新的玉米miRNAs；利用WMD 3在线植物miRNAs靶基因预测软件，对新发现的玉米miRNAs进行靶基因预测，总共预测到89个靶基因，进一步功能分析发现这些靶基因参与玉米的生长发育、信号转导、转录调节、新陈代谢及逆境胁迫响应等调控过程。

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11. 利用永久F ₂群体定位小麦株高的QTL

王岩，李卓坤，田纪春

作物学报 2009, 35 (6): 1038-1043. DOI: 10.3724/SP.J.1006.2009.01038

摘要（2834）

PDF（pc）（143KB）（5048）

为研究小麦株高的遗传机制，利用DH群体构建了一套包含168个杂交组合的小麦永久F₂群体, 并于2007年种植于山东泰安和山东聊城。构建了一套覆盖小麦21条染色体的遗传连锁图谱并利用该图谱的324个SSR标记对小麦株高进行QTL定位研究，使用基于混合线性模型的QTLNetwork 2.0软件进行QTL分析。在永久F₂群体中定位了7个株高QTL，包括4个加性QTL，一个显性QTL，一对上位性QTL，共解释株高变异的20%，其中位于4D染色体的qPh4D，具有最大的遗传效应，贡献率为7.5%；位于2D 染色体显性效应位点qPh2D，可解释1.6%的表型变异；位于5B~6D染色体上位效应位点，可解释1.7%的表型变异。还发现加性效应、显性效应和上位效应对小麦株高的遗传起重要作用，并且基因与环境具有互作效应，结果表明利用永久F₂群体进行QTL定位研究的方法有助于分子标记辅助育种。

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12. 玉米幼苗对盐胁迫的生理响应

王丽燕;赵可夫

作物学报 2005, 31 (02): 264-268.

摘要（2316）

PDF（pc）（180KB）（4866）

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13. 小麦亚硝酸还原酶基因及调控序列克隆、定位和表达分析

佘茂云, 陈朵朵, 冯晨, 杜丽璞, 叶兴国

作物学报 2011, 37 (01): 28-39. DOI: 10.3724/SP.J.1006.2011.00028

摘要（3437）

PDF（pc）（960KB）（4865）

利用in silico及反向PCR技术, 从小麦中克隆了亚硝酸还原酶编码基因及其调控序列, 进一步利用原核诱导表达、半定量RT-PCR、AS-PCR及生物信息学手段对克隆的新基因进行鉴定及染色体定位分析。开放阅读框预测结合测序结果表明, 该基因gDNA长2 881 bp, 包含4个外显子和3个内含子, cDNA长1 830 bp, GenBank登录号分别为FJ555239和FJ527909, 预测编码产物大小约为65.7 kD, 与NCBI已公布的亚硝酸还原酶基因编码产物同源性达60%以上, 其中与其他单子叶谷类作物同源性达80%以上。IPCR技术延伸该基因5′端侧翼序列至-2 924 bp (以ATG起始计算), 经1 mmol L ^- ¹ IPTG诱导后可表达大小约为70 kD的蛋白(含约3.8 kD的组氨酸标签)。RT-PCR结果显示, 30 mmol L ^- ¹ KNO ₃处理小麦幼苗1 h, 亚硝酸还原酶基因表达量最高。酶活性测定表明, 随着KNO ₃处理时间延长亚硝酸还原酶活性增强。AS-PCR检测发现, 该基因在普通小麦6A及6B染色体上至少各存在1个拷贝。

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14. 气候变化对中国水稻生产的影响研究进展

凌霄霞,张作林,翟景秋,叶树春,黄见良

作物学报 2019, 45 (3): 323-334. DOI: 10.3724/SP.J.1006.2019.82044

摘要（2362）

HTML （172）

PDF（pc）（593KB）（4797）

水稻生产系统是响应气候变化最敏感的农业生态系统之一, 本文综述了当前和未来气候变化对我国水稻生产的影响。气候变化背景下, 我国水稻生长季的热量资源增多, 辐射资源减少, 降水不均一性加大。高温热害、干旱、暴雨和洪涝灾害发生更频繁, 这可能降低水、热资源的有效性。气候变化使我国单季稻和双季稻潜在种植边界显著北移, 导致单季稻、早稻和晚稻的主要生育期缩短。基于统计模型和水稻生长模型的研究结果表明, 如果不考虑品种改良和栽培技术的进步, 气候变化使单季稻、早稻和晚稻产量下降, 但不同稻作区和方法间存在差异。我国水稻生产重心北移、实测生育期延长和产量增加的变化趋势, 反映了水稻生产系统通过种植分布调整、品种改良和技术改进来适应气候变化的能力。未来气候变化将进一步导致水稻生育期缩短和产量下降, 对我国水稻生产和粮食安全带来严峻挑战。仍需加强气候变化影响机制的研究及其在影响评估中的应用, 减小影响评估的不确定性并增加其系统性, 为制定有效的应对策略提供可靠的理论支持。

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15. 植物关联分析方法的研究进展

冯建英,温阳俊,张瑾,章元明

作物学报 2016, 42 (07): 945-956. DOI: 10.3724/SP.J.1006.2016.00945

摘要（1602）

HTML （6）

PDF（pc）（950KB）（4679）

关联分析在人类和动植物遗传研究中的应用日益广泛，新方法及其软件包不断涌现。为对其更好选择和应用，本文综述了关联分析的主要方法及其软件包。首先，介绍了群体结构对关联分析的影响；其次，重点介绍了单位点关联分析、多位点关联分析、上位性和多性状关联分析方法及其软件包；最后，展望了关联分析的发展动向。应当指出，基于群体结构和多基因整体背景控制的全基因组单标记快速扫描算法在目前的实际资料分析中应用较广泛，与其结果互补的是假阳性率较高的非参数方法。但是，今后的方法应当是以多位点模型、环境互作、上位性检验和多个相关性状联合分析为主。这为今后的理论与应用研究提供了有益信息。

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16. 植物组织培养再生相关基因鉴定、克隆和应用研究进展

叶兴国, 佘茂云, 王轲, 杜丽璞, 徐惠君

作物学报 2012, 38 (02): 191-201. DOI: 10.3724/SP.J.1006.2012.00191

摘要（3700）

PDF（pc）（2584KB）（4665）

离体植物组织体细胞胚胎发生是一个复杂的无性繁殖过程，依次经历外源植物激素信号应答、已分化细胞的脱分化、静止细胞的再分裂以及特定组织、器官原基或分生组织的形成等，是多个基因在外界因素刺激下协调、有序表达和互作的结果，不但受培养基中植物激素和营养成分的影响，也与外植体的生理状态关系密切。本文综述了外源激素和内源激素在植物组织培养中的作用，以及外源激素对内源激素的调节功能；重点介绍了5类与植物体细胞胚胎发生有关的候选基因，包括体细胞胚胎发生相关类受体蛋白激酶、阿拉伯葡聚糖酶、亚硝酸还原酶、生长素结合蛋白和抗氧化酶。再生相关基因的利用不但有助于提高植物组织培养植株再生率和遗传转化率，而且有助于获得安全型转基因植物，在基因工程育种中具有潜在应用前景。不同植物和同种植物不同外植体组织培养中调控体细胞胚胎发生的主效基因可能不同，关键再生相关基因的克隆和功能鉴定是今后需要加强的方向。

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17. 甘蓝型油菜种子不同发育时期SSH文库的构建

彭琦,胡燕,杜培粉,谢青轩,阮颖,刘春林

作物学报 2009, 35 (9): 1576-1583. DOI: 10.3724/SP.J.1006.2009.01576

摘要（3630）

PDF（pc）（462KB）（4660）

利用抑制差减杂交技术构建了20 d和35 d甘蓝型油菜湘油15发育种子特异表达基因的SSH文库。随机挑取单菌落进行PCR表明，文库质量较好。在20 d和35 d SSH文库中随机挑选489个阳性克隆进行测序，获得452条高质量的表达序列标签(EST)。对序列进行Blast比对及功能注释，比较20 d和35 d SSH文库的基因表达谱，发现在20 d SSH库中参与糖代谢的基因出现频率较高，而在35 d SSH库中与脂肪酸储存有关的油体蛋白家族、与脂肪酸转运有关的柠檬酸合酶、与脂肪酸合成有关的酰基载体蛋白去饱和酶等，参与油脂代谢相关基因出现频率较高。该结果对进一步研究油菜脂肪酸代谢调控的分子机制打下了基础。

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18. 种植方式对水稻产量及根系性状的影响

郑华斌,姚林,刘建霞,贺慧,陈阳,黄璜

作物学报 2014, 40 (04): 667-677. DOI: 10.3724/SP.J.1006.2014.00667

摘要（1164）

HTML （2）

PDF（pc）（15075KB）（4651）

2011—2012 年在湖南长沙以超级杂交稻 Y 两优 1 号、杂交稻汕优 63 和常规稻黄华占为材料的大田定位试验 , 比较了垄作梯式栽培技术 ( 两种垄规格 ) 和垄厢栽培技术 (3 种厢规格 ) 对水稻产量和根系性状的影响。与平作栽培 (T0) 相比 , 窄垄作梯式栽培 (T1) 和垄厢栽培 (T3) 均可提高水稻产量 , 其中以 T1 的产量最高 , 比 T0 平均增产 22.2% (17.1%~27.2%), 其次 T3 平均增产 10.4% (5.8%~15.0%), 但随着垄宽或厢宽的增加 , 产量增幅逐渐下降。较高的穗数和每穗粒数、良好的根系特性 ( 根系氧化力、根表面吸收面积、根系孔隙度 ) 以及齐穗后干物质积累量大是上述两种栽培技术增产的重要原因。同时 , 根解剖结构表明垄作梯式栽培的根皮层减小、中柱和导管面积增大 , 增强了水分吸收能力。

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19. 黏类小麦细胞质雄性不育相关基因cMDH的克隆与表达分析

张龙雨,李红霞,张改生*,王俊生,韩艳芬,袁正杰,牛娜,马守才

作物学报 2009, 35 (9): 1620-1627. DOI: 10.3724/SP.J.1006.2009.01620

摘要（3583）

PDF（pc）（654KB）（4628）

为深入研究黏类小麦雄性不育的分子遗传机制，利用抑制差减杂交技术构建了黏类小麦育性相关基因的二核期SSH文库。经文库筛选后，得到一个在可育文库中表达的与胞质苹果酸脱氢酶基因同源的EST序列。以该EST序列为信息探针, 经电子克隆、RT-PCR、PCR克隆与序列分析，获得了小麦胞质苹果酸脱氢酶(cytosolic malate dehydrogenases, cMDH)基因的cDNA与DNA序列，利用荧光定量PCR技术对该基因在不育株和可育株花药中的表达进行了分析，并比较了MDH在小麦不育株和可育株中的活性变化。结果表明，该基因的cDNA序列长1 213 bp，编码333个氨基酸；DNA序列长2 908 bp，含有7个外显子和6个内含子；该基因在不育株和可育株花药发育三个时期(单核、二核和三核)的表达均表现为先升后降的模式，而且该基因在不育株花药发育的二核期和三核期的表达相对于可育株被明显抑制；MDH在小麦不育株和可育株中的活性变化趋势与定量结果一致。推测该基因在花粉发育早期表达，它的下调表达可能影响了小麦雄蕊发育过程中的能量供应而导致雄性不育。

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20. 中国栽培和野生大豆农艺品质性状与SSR标记的关联分析 I. 群体结构及关联标记

文自翔;赵团结;郑永战;刘顺湖;王春娥;王芳;盖钧镒

作物学报 2008, 34 (07): 1169-1178.

摘要（3834）

PDF（pc）（1333KB）（4602）

关联作图是一种利用连锁不平衡(linkage disequilibrium, LD)检测自然群体中基因位点及其等位变异的方法。利用60个SSR标记, 对全国大豆地方品种群体(393份代表性材料)和野生大豆群体(196份代表性材料)的基因组变异进行扫描, 分析两类群体的连锁不平衡位点、群体结构, 并采用TASSEL软件的GLM (general linear model)方法对16个农艺、品质性状观测值进行标记与性状的关联分析。结果表明: (1)在公共图谱上不论共线性的或是非共线性的SSR位点组合都有一定程度的LD, 说明历史上发生过连锁群间的重组; 栽培群体的连锁不平衡成对位点数较野生群体多, 但野生群体位点间连锁不平衡程度高, 随距离的衰减慢。(2) 群体SSR数据遗传结构分析发现, 栽培群体和野生群体分别由9和4个亚群体组成, 亚群的划分与群体地理生态类型相关联, 证实地理生态类型划分有其遗传基础。(3) 栽培群体中累计有27个位点与性状相关; 野生大豆种质中累计有34个位点与性状相关。部分标记在两类群体中都表现与同一性状关联, 检出的位点有一致性, 也有互补性; 一些标记同时与2个或多个性状相关联, 可能是性状相关乃至一因多效的遗传基础; 关联位点中累计有24位点(次)与遗传群体连锁分析定位的QTL一致。

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21. 水稻种子蛋白质含量及组分在品种间的变异与分布

周丽慧，刘巧泉，张昌泉，徐勇，汤述翥，顾铭洪*

作物学报 2009, 35 (5): 884-891. DOI: 10.3724/SP.J.1006.2009.00884

摘要（3131）

PDF（pc）（400KB）（4563）

采用近红外光谱技术测定分析了351份不同类型水稻品种(系)糙米中的蛋白质含量，结果显示粗蛋白含量在9.3%~17.7%之间，平均为12.4%；籼稻平均蛋白质含量为13.2%，比粳稻高约1个百分点。蛋白质含量低的粳稻品种明显偏多，表现出明显的遗传不平衡现象。现有生产上主栽品种稻米蛋白质含量大多处于中等水平，而高蛋白粳稻种质极少。但仍有部分蛋白质含量极高或低的种质，如饲料稻、早籼稻和一些籼粳交后代品系蛋白质含量较高，而部分粳稻和外来籼稻品种中的蛋白质含量较低。因此可以从一些地方品种、外来品种以及籼粳交后代中筛选到极端类型的种质，为遗传育种提供研究的原材料。SDS-PAGE分析结果显示不同类型水稻间各贮藏蛋白组分具一定差异。

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22. 实时荧光定量PCR技术在转基因玉米检测中的应用研究

陈颖;徐宝梁;苏宁;葛毅强;王曙光

作物学报 2004, 30 (06): 602-607.

摘要（2717）

PDF（pc）（175KB）（4552）

采用实时荧光定量PCR技术，通过使用特异的引物和探针，对玉米中的内源基因Invertase和转基因玉米Mon 810、Event 176中的外源基因进行了定量检测，建立了商业化转基因玉米Mon 810 (YieldGard)和Event 176 (Maximizer)的定量PCR检测方法。该方法的检测灵敏度小于0.01％，是国际上设定的转基因最低限量的100倍。

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23. 植物生长物质对大豆叶片形态解剖结构及光合特性的影响

冯乃杰，郑殿峰,赵玖香，祖伟，杜吉到，张玉先，梁喜龙

作物学报 2009, 35 (9): 1691-1697. DOI: 10.3724/SP.J.1006.2009.01691

摘要（3470）

PDF（pc）（877KB）（4510）

2006年度在黑龙江八一农垦大学实验农场大田栽培条件下，以大豆垦农4号为试材，选用植物生长物质为2-N,N-二乙氨基乙基己酸酯(DTA)、氯化胆碱(CC)和SOD模拟物(SOD_M)，于开花始期叶面喷施，对大豆叶片形态解剖结构和光合指标进行了研究。结果表明，各处理的叶片栅栏组织厚度及栅海比增加，栅栏组织细胞排列的紧密程度为SOD_M＞DTA ＞CC＞CK；各处理不同程度地增加了单个细胞的叶绿体数、单个叶绿体中的基粒片层数和淀粉粒数，降低了叶绿体中的嗜锇体数；SOD_M、DTA分别显著、极显著增加了叶绿体的基粒数；各处理普遍提高了生育后期叶片Chl a、Chl b和Chl(a+b)含量，增加了Chl b/a比值；在较干旱条件下，与对照相比，各处理能使叶面积指数和光合势达到最大值时间提前，增加了籽粒干物质积累时期的总光合势，提高了净光合速率。

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24. 全基因组分析PEG胁迫下水稻根系转录因子表达变化

马廷臣，陈荣军，余蓉蓉，曾汉来，张端品

作物学报 2009, 35 (6): 1030-1037. DOI: 10.3724/SP.J.1006.2009.01030

摘要（2988）

PDF（pc）（209KB）（4459）

转录因子在植物抗逆境中起重要的调节作用。本文使用Affymetrix水稻60K芯片全基因组研究PEG胁迫时2个耐旱性不同的水稻品种的转录因子及转录因子家族的变化，结果表明，在PEG胁迫下，耐旱品种湘丰早119根系共有95个转录因子转录本与对照处理比较表达发生变化(24个为转录水平下调表达, 71个为转录水平上调表达)；干旱敏感品种爱华5号根系有129个转录因子转录本表达发生变化(转录水平上调的转录因子转录本60个，转录水平下调的转录因子转录本69个)；2个品种PEG胁迫响应转录因子隶属的转录因子家族都为30个，但各转录因子所属的30个家族并不完全相同；PEG胁迫逆境中，PEG胁迫响应转录因子转录本表现出品种特异性，湘丰早119有72个为特异响应转录本，爱华5号有106个特异响应的转录因子转录本；2个品种在干旱胁迫下响应的转录因子有23个为重叠转录本，其中有16个在转录水平上调表达，7个在转录水平下调表达；2个品种的PEG胁迫响应转录因子基因在染色体上的分布不同，重叠转录因子基因主要位于第2染色体0.432~26.139 Mb和第5染色体0.076~20.597 Mb之间。

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25. 冬小麦-夏玉米“双晚”种植模式的产量形成及资源效率研究

付雪丽，张惠，贾继增，杜立丰，付金东，赵明

作物学报 2009, 35 (9): 1708-1714. DOI: 10.3724/SP.J.1006.2009.01708

摘要（3610）

PDF（pc）（254KB）（4452）

为了进一步明确黄淮平原冬小麦晚播、夏玉米晚收的“双晚”增产及资源高效的效应，选用2个中熟冬小麦品种和2个中晚熟夏玉米品种，于2006—2008年先后在河南温县和焦作进行大田试验，研究作物群体物质生产、产量形成参数定量指标及光温资源的分配利用。结果表明，冬小麦晚播产量降低不明显，夏玉米晚收产量显著提高747~2 700 kg hm^-2，“双晚”周年产量21 891~22 507 kg hm^-2，比对照提高442~2 575 kg hm^-2。冬小麦晚播平均叶面积指数、每平方米穗数和穗粒数降低，但平均净同化率、收获指数和粒重提高达5%显著水平；夏玉米晚收平均叶面积指数、收获指数、生育期天数和粒重均显著提高。“双晚”栽培优化了周年资源分配，提高生育期与光、温资源变化的吻合度，其生产效率分别提高2.22%~10.86%和0.47%~11.56%。小麦和玉米品种的遗传类型是影响“双晚”栽培技术的关键。因此，选用小麦晚播早熟高产和玉米长生育期晚熟品种，通过有效调节资源配置，将小麦冗余的光温资源分配给C₄高光效作物玉米，是提高周年高产高效的重要途径。

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26. 植物抗病毒侵染的分子机制

侯静，刘青青，徐明良

作物学报 2012, 38 (05): 761-772. DOI: 10.3724/SP.J.1006.2012.00761

摘要（3174）

PDF（pc）（430KB）（4446）

植物病毒病是一类严重危害农作物生产的重要病害。已报道的植物抗病毒基因主要在抑制病毒增殖和阻止病毒扩散中起作用。病毒的复制涉及自身的编码蛋白及其与寄主蛋白间的互作, 参与病毒复制的寄主蛋白很多, 如真核翻译起始因子eIF4E和eIF4G, 植物的内膜系统等, 相关蛋白的功能丧失或构型改变可阻滞病毒的复制；此外, 植物细胞内的硫氧还蛋白可调节细胞的氧化还原状态, 进而阻断病毒的增殖。病毒在植物体内的扩散包括胞间移动和长距离迁移, 植物抗病蛋白(R蛋白)通过识别病毒的无毒因子(Avr)促发防御反应, 诱导过敏性坏死, 限制病毒在细胞间的扩散, 编码这类抗病蛋白的基因主要为TIR-NBS-LRR和CC-NBS-LRR。病毒的长距离迁移涉及的因素很多, 目前仅发现韧皮部的RTM蛋白可能以多聚蛋白的形式抵制病毒的长距离移动。另外, RNA沉默也是植物抵制病毒侵染的免疫反应机制。本文旨在综述植物的各种抗病毒机制和相关的抗病基因, 并探讨分子标记辅助选择(marker-assisted selection, MAS), 定向诱导基因组局部突变(targeting induced local lesions in genomes, TILLING)和转基因等生物技术在抗病改良中的应用前景。

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27. 花椰菜花叶病毒（CaMV）35S启动子在转基因棉花中的表达

焦改丽;孟钊红;聂安全;南芝润;张换样;李俊峰;王娇娟

作物学报 2004, 30 (11): 1135-1139.

摘要（2698）

PDF（pc）（368KB）（4445）

利用GUS作为报告基因，通过GUS组织化学定位法检测棉花转化愈伤组织、体细胞胚，R0代棉花根、茎、叶、花器官以及正在发育的胚GUS基因表达情况，详细阐述了CaMV 35S启动子在棉花细胞中的表达轮廓。结果表明，在愈伤组织细胞有丝分裂和增殖过程中GUS基因能稳定表达并遗传给后代细胞；在根、茎、叶细胞中检测到GUS表达活性。在

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28. 种子休眠与萌发调控的研究进展

宋松泉, 唐翠芳, 雷华平, 姜孝成, 王伟青, 程红焱

作物学报 2024, 50 (1): 1-15. DOI: 10.3724/SP.J.1006.2024.34012

摘要（2485）

HTML （228）

PDF（pc）（3074KB）（4428）

休眠使植物种子能够为萌发安排时间, 直到环境条件变得有利于幼苗的存活与生长。种子的休眠特性具有重要的生态适应性意义和显著的农业价值。植物激素脱落酸(ABA)和赤霉素(GA)是种子休眠与萌发的关键因素, 处于休眠状态的成熟种子含有高水平的ABA和低水平的GA; ABA诱导和维持种子休眠, 而GA拮抗ABA的作用和促进种子萌发。萌发延迟-1 (DOG1)是种子休眠的主要调控因子, 与ABA协同作用延迟萌发。DOG1通过与PP2C ABA过敏感萌发(AHG1/AHG3)结合以增强ABA的信号转导, 以及抑制AHG1的作用以增加ABA的敏感性和强加种子休眠。印记基因在受精前后受到表观遗传机制的调控, 与种子休眠的建立与释放密切相关。近年来, 种子休眠的调控研究取得了显著的进展。本文综述了植物激素ABA和GA对种子休眠与萌发的控制, DOG1调控种子休眠的作用机制, 以及种子休眠与萌发的表观遗传调控, 并提出了在本领域需要进一步研究的科学问题, 以期为深入理解种子休眠与萌发的分子机制、抗穗萌发育种以及促进休眠种子的萌发提供参考。

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29. 种植密度对不同玉米品种叶片光合特性与碳、氮变化的影响

陈传永, 侯海鹏, 李强, 朱平, 张振勇, 董志强, 赵明

作物学报 2010, 36 (05): 871-878.

摘要（3195）

PDF（pc）（713KB）（4391）

选用玉米品种先玉335、郑单958和吉单209，设计了6.0、7.5、9.0和10.5万株 hm^-2 4个种植密度。测定了不同生育时期(吐丝期为重点)的叶片叶绿素含量、可溶性糖含量、全氮含量与碳氮比的动态变化。结果表明，3个品种的叶片叶绿素含量在灌浆期最高，可溶性糖含量在吐丝期最高，碳氮比在吐丝期与成熟期出现2个高峰；叶绿素含量、灌浆期光合速率、叶片可溶性糖、全氮、碳氮比均随种植密度增加而降低；吐丝后光合速率呈下降趋势；吐丝后生育天数与叶绿素含量、光合速率、可溶性糖、C/N呈二次曲线关系，与全氮含量呈线性关系；高种植密度主要影响叶片碳代谢；叶绿素含量不是影响吐丝后光合速率的主要因素。不同基因型耐密性不同，先玉335最好，郑单958次之，吉单209最差。

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30. 我国玉米自交系叶片保绿性及其与产量的关系

刘开昌,董树亭,赵海军,王庆成,李宗新,刘霞,张慧

作物学报 2009, 35 (9): 1662-1671. DOI: 10.3724/SP.J.1006.2009.01662

摘要（3683）

PDF（pc）（252KB）（4346）

选用我国75个常用不同基因型玉米自交系，对其叶片保绿性参数进行了定点动态测定。结果表明，不同自交系抽丝后叶片保绿度的变化均符合方程y = ae^b^-cx/ (1+e^b^-cx)，成熟期的绿叶数、成熟期叶绿素含量和相对绿叶面积平均衰减速率(V_m)可作为区分玉米保绿型与非保绿型的关键指标。按照Hiechical聚类分析方法，筛选出12个保绿型自交系，其成熟期相对绿叶面积在60%以上，其V_m平均值为0.687% d^-1，在生长季内相对绿叶面积无大幅度衰减，成熟期绿叶数多，叶绿素含量较高；其余63个为非保绿型自交系，还可分为植株叶片衰老较快型与植株叶片衰老较慢型两个亚类。不同自交系抽丝后叶片保绿性与叶面积持续期、单株产量均呈正相关。保绿型的叶面积持续期和单株产量比非保绿型分别高20.02%~23.87%和50.44%~59.38%；与非保绿型自交系相比，保绿型在籽粒灌浆期绿叶面积大，叶绿素含量高，群体光合速率高，光合作用时间长，因而生物产量较高。

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31. 生物炭与化学肥料互作的大豆生物学效应

张伟明，管学超，黄玉威，孙大荃，孟军，陈温福*

作物学报 2015, 41 (01): 109-122. DOI: 10.3724/SP.J.1006.2015.00109

摘要（1050）

HTML （7）

PDF（pc）（11059KB）（4273）

以大豆品种铁丰40为试材，在2010—2011年的大田试验中调查生物炭与不同用量化肥配施对大豆生长发育、光合作用、产量与品质及肥料表观利用率等的影响。结果表明，炭/肥互作在不同程度上提高了大豆株高、叶片净光合速率与蒸腾速率，增加了叶、茎干物重。炭/肥互作对大豆生长前期的氮、磷吸收影响不明显，但随着生育期的推进，叶、茎对氮、磷吸收逐步增加，单株氮、磷积累量明显提高。炭/肥互作提高单株荚数、单株粒数、单株粒重和产量，平均比单施化肥增产13.2%。其中，在常规施肥量减少15%、30%和60%基础上增施生物炭，2年平均产量分别比常规施肥提高11.20%、11.00%和8.17%，平均增产10.1%。并且，炭/肥配施处理的蛋白质与脂肪总量明显优于单施化肥处理，表现为配施化肥量越少效应越明显。生物炭与化肥配施“减量增效”作用明显，可应用于大豆生产。

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32. 被子植物的无融合生殖和它的应用前景

母锡金;蔡雪;孙德兰;时光春;朱至清

作物学报 2001, 27 (05): 590-599.

摘要（2009）

PDF（pc）（268KB）（4269）

无融合生殖是植物以无性繁殖产生种子的一种生殖方式.被子植物的无融合生殖以其发生的细胞学机制分为:未减数配子体无融合生殖;减数配子体无融合生殖和珠心胚结构(或孢子体无融合生殖)三种不同的基本类型.体细胞无孢子生殖,二倍体孢子生殖和珠心胚结构是被子植物常见的无融合生殖类型.这三种常见类型发生的细胞学机制和遗传特

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33. 小麦籽粒A-型和B-型淀粉粒的理化特性

田益华，张传辉，蔡剑，周琴，姜东，戴廷波，荆奇，曹卫星

作物学报 2009, 35 (9): 1755-1758. DOI: 10.3724/SP.J.1006.2009.01755

摘要（3872）

PDF（pc）（403KB）（4245）

以小麦面粉中分离纯化出的A-、B-型淀粉粒为材料，研究其形态及理化特性。淀粉粒扫描电镜形态观察显示，小麦全淀粉中A-、B-型淀粉粒形态差异显著，分离出的A-、B-型淀粉粒无混杂。分离纯化出的A-型和B-型淀粉粒粒径范围分别为4.45~44.46 μm和0.47~11.16 μm，单位质量数量分别为1.23×10¹⁰ g^-1和6.70×10¹⁰ g^-1，直链淀粉含量分别为27.70%和22.62%。B-型淀粉粒的膨胀势较大，但糊化值明显小于A-型淀粉粒。重组淀粉中B-型淀粉粒的重量比例小于30%时对淀粉糊化特性影响很大，超过30%后，淀粉粒粒级分布对糊化特性的影响变小。

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34. 基于贝叶斯统计的谷物胚乳性状QTL多区间作图方法

王亚民,汤在祥,陆鑫,徐辰武

作物学报 2009, 35 (9): 1569-1575. DOI: 10.3724/SP.J.1006.2009.01569

摘要（3311）

PDF（pc）（413KB）（4224）

贝叶斯统计学已被广泛地应用在现代科学的各个研究领域。本研究将贝叶斯统计方法和谷物三倍体胚乳性状数量遗传模型相结合，以F₂群体中各植株的分子标记基因型以及植株上若干粒自交种子胚乳性状的单粒观测值为数据模式，提出了胚乳数量性状基因座(QTL)多区间作图的贝叶斯方法。该方法首先构建胚乳性状的多区间多QTL遗传模型，然后通过基于Gibbs抽样和Metropolis-Hastings算法实现的马尔可夫链蒙特卡罗(MCMC)方法同时获得多个QTL效应和位置的估计。方法的有效性通过一条长染色体的模拟实验进行了验证，结果表明，本文提出的贝叶斯多区间方法能够准确地估计胚乳性状QTL的位置和效应，并可有效区分两种显性效应。

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35. 利用cDNA-AFLP技术分析小麦应答低磷胁迫的特异表达基因

谷俊涛,鲍金香,王效颖,郭程瑾,李小娟,路文静,肖凯

作物学报 2009, 35 (9): 1597-1605. DOI: 10.3724/SP.J.1006.2009.01597

摘要（3795）

PDF（pc）（331KB）（4216）

以磷高效小麦品种石新828为材料，采用cDNA-AFLP技术，鉴定了短期(1~6 h)、中期(12~48 h)和长期(72~144 h)低磷胁迫根系特异上、下调表达基因的表达序列标签(EST)。共有非重复的上调ESTs 142个，下调ESTs 94个。胁迫下的前者分别含短、中和长期23、53和66个；后者分别含短、中和长期17、39和38个。对其功能比对发现，上调ESTs在功能上归属于信号转导、转录调控、代谢、逆境响应、发育、物质运输、脂类代谢和功能未知等类别，下调EST除上述类别外，还含有蛋白质合成和降解等类别。部分转录因子基因(如水稻OsPTF1和拟南芥ZAT10高度同源的转录因子基因)、促分裂原激酶基因MAPK1a、钙依赖蛋白激酶基因CPK1A和蛋白激酶基因(如serine/threonine kinase)、高亲和磷转运蛋白基因(PHT3和PT2)、过氧化物酶基因(如peroxidase 73)和谷胱甘肽-S-转移酶基因(glutathione S-transferase)，受到低磷胁迫的特异增强诱导，在改善小麦植株对低磷胁迫的适应能力中可能具有重要作用。研究表明，小麦对低磷胁迫的响应，在分子水平上存在着植株感受低磷胁迫信号和信号转导、进一步在生理生化方面对胁迫信号产生应答等复杂的过程。

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36. 水稻糖苷水解酶基因 OsBE1在叶绿体发育中的功能

王兴春,王敏,季芝娟,陈钊,刘文真,韩渊怀,杨长登

作物学报 2014, 40 (12): 2090-2097. DOI: 10.3724/SP.J.1006.2014.02090

摘要（1260）

HTML （0）

PDF（pc）（13916KB）（4201）

叶绿体在植物碳水化合物代谢中起着至关重要的作用，然而有关碳水化合物代谢在叶绿体发育过程中的功能却知之甚少。从水稻中克隆了一个Oryza sativa Branching Enzyme 1 (OsBE1)基因，该基因编码一个糖苷水解酶13家族的蛋白。OsBE1与拟南芥AtBE1的一致性为66%，但与水稻典型淀粉分支酶的一致性仅约为40%。该基因的T-DNA插入功能缺失突变体osbe1幼苗白化，且其白化表型不能用外源糖类拯救。osbe1突变体幼苗最终在三叶期死亡。淀粉染色表明，osbe1突变体中淀粉的含量与野生型无明显差异。进一步的研究表明，osbe1突变体叶绿体数目较少，且无明显的基质片层结构。构建了OsBE1基因过量表达载体pCAMBIA1300-35S-OsBE1，并将其转化水稻中花11。获得的108株转基因水稻中，77株表现不同程度的黄化。本文初步揭示了碳水化合物代谢调控叶绿体发育的机制，并为深入研究糖苷水解酶BE1的功能奠定了基础。

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37. 水稻实地氮肥管理的氮肥利用效率及其生理原因

刘立军，杨立年，孙小淋，王志琴，杨建昌

作物学报 2009, 35 (9): 1672-1680. DOI: 10.3724/SP.J.1006.2009.01672

摘要（3875）

PDF（pc）（406KB）（4157）

以代表性品种为材料，研究了水稻实地氮肥管理(SSNM)的氮肥利用效率及其生理机制。结果表明，SSNM的施氮量较常规施肥方法(FFP)降低了48.1%~63.0%，产量提高了0.1%~9.3%。SSNM的氮肥吸收利用率和农学利用率分别较FFP提高了31.4%~56.8%和143.6%~166.0%。水稻氮吸收高峰出现在穗分化期至抽穗期，此阶段SSNM处理氮的吸收量和其占最终总吸收量的比例均明显高于FFP。抽穗后SSNM水稻的吸氮量也明显高于FFP。自幼穗分化期开始，SSNM水稻根系重量和根系活力(尤其是单茎占有的根系活性)逐步超过FFP。SSNM 明显提高了幼穗分化期和抽穗期水稻叶片中谷氨酰胺合成酶、硝酸还原酶和Fd-谷氨酸合酶的活性。抽穗后SSNM处理水稻剑叶的光合速率高于FFP，上述结果表明SSNM有利于促进水稻中后期根系生长，提高物质生产和养分吸收，从而提高氮肥的利用效率。

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38. 水稻弱势粒灌浆机理与调控途径

杨建昌

作物学报 2010, 36 (12): 2011-2019. DOI: 10.3724/SP.J.1006.2010.02011

摘要（4318）

PDF（pc）（427KB）（4148）

水稻籽粒充实优劣和粒重高低与颖花在穗上着生的部位有密切关系。通常, 着生在稻穗中上部早开花的强势粒, 灌浆快、充实好、粒重高; 着生在稻穗下部迟开花的弱势粒, 灌浆慢、充实差、粒重低。这种强、弱势粒灌浆的差异在大穗型超级稻品种上表现更为突出。弱势粒充实差和粒重低不仅阻碍了水稻产量潜力的发挥, 而且还会降低稻米品质, 尤其是加工品质和外观品质。关于弱势粒灌浆差的机理有许多假设, 包括同化物供应限制、库容限制、激素间不平衡、蔗糖-淀粉代谢途径关键酶活性或基因表达量低、“流”不畅等。最近研究表明, 灌浆始期籽粒库生理活性低和活跃灌浆期蔗糖转化为淀粉的生化效率低是弱势粒灌浆差的重要原因; 增加抽穗期糖花比(抽穗期茎与鞘中非结构性碳水化合物与颖花数之比)及灌浆期脱落酸与乙烯比值可以显著提高籽粒库生理活性和籽粒灌浆速率。从环境(含栽培)、植株整体水平以及籽粒内在因素等不同层次上深入研究水稻弱势粒灌浆差的机理及其调控途径, 对于破解弱势粒灌浆差的科学难题、挖掘水稻生产潜力具有十分重要的意义。

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39. 论植物表型组和植物表型组学的概念与范畴

潘映红

作物学报 2015, 41 (02): 175-186. DOI: 10.3724/SP.J.1006.2015.00175

摘要（1973）

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PDF（pc）（477KB）（4140）

植物表型分析是理解植物基因功能及环境效应的关键环节，随着植物功能基因组学和作物分子育种研究的深入，传统的表型观测已经成为制约其发展的主要瓶颈，而高通量的植物表型组分析技术和植物表型组学研究是解决这一困境的有效途径。虽然植物表型组分析正在成为国内外研究的热点，相关概念仍然较为模糊，阻碍了这一新兴学科的发展。本文分析了植物表型组和植物表型组学的相关概念和范畴，引入了准表型组、可辨识性状、映射性状、植物表型的遗传和环境包容性等新概念，将植物表型组定义为“受基因组和环境因素决定或影响的，反映植物结构及组成、植物生长发育过程及结果的全部物理、生理、生化特征和性状”，将植物表型组学定义为“对植物表型组信息及相关环境参数的综合控制、完整采集和系统分析”，并提出了植物表型组学的研究范围、研究方向和顶层设计原则。

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40. 利用WGCNA进行玉米花期基因共表达模块鉴定

杨宇昕,桑志勤,许诚,代文双,邹枨

作物学报 2019, 45 (2): 161-174. DOI: 10.3724/SP.J.1006.2019.83053

摘要（2826）

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权重基因共表达网络分析(weighted gene co-expression network analysis, WGCNA)是系统生物学的一种研究方法, 在挖掘生物学数据与特定性状之间的生物学关系方面具有十分重要的作用。本研究利用玉米(Zea mays L.)自交系B73的14份不同发育阶段的转录组数据, 筛选掉低表达丰度的基因, 最终得到了22,426个高表达的基因用于创建基因表达矩阵; 利用不同组织作为性状, 创建表型矩阵。然后利用R软件中的WGCNA包建立了共表达网络, 共得到20个模块。本研究将与组织相关性高于0.65的模块定义为组织特异性模块, 最终鉴定到14个组织特异性模块。利用在线网站Agrigo对组织特异性模块中的基因进行GO (gene ontology)富集分析, 发现14个模块中均可以得到富集种类。开花作为玉米生育周期中的一个重要生理过程, 不仅代表着植物从营养生长到生殖生长的转变, 也关系到产量、株高和抗逆性等农艺性状。本研究发现8个组织特异性模块中的基因可以富集到与开花调控的代谢通。此外, 有17个已经报道过的开花时间调控基因存在于共表达模块中, 并且主要分布在Blue模块和Darkmagenta模块, 因此本研究重点关注了这2个模块内部的基因调控网络。本研究通过计算不同组织中的基因表达丰度, 并联合权重基因共表达网络分析的方法, 鉴定到了具有生物学意义的共表达基因模块, 挖掘到了数个开花相关的模块, 有助于揭示玉米开花调控的遗传机制。

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