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卷叶木薯及其突变体叶片的比较转录组分析
肖明昆, 严炜, 宋记明, 张林辉, 刘倩, 段春芳, 李月仙, 姜太玲, 沈绍斌, 周迎春, 沈正松, 熊贤坤, 罗鑫, 白丽娜, 刘光华
作物学报    2024, 50 (8): 2143-2156.   DOI: 10.3724/SP.J.1006.2024.34168
摘要   (125 HTML5 PDF(pc) (9055KB)(99)  

为解析卷叶木薯叶片异常发育的分子调控机制及代谢通路, 以正常卷叶木薯叶片(JY)、突变株展叶叶片(ZY)和突变株卷叶叶片(BJ)为试验材料, 基于转录组测序(RNA-seq)数据进行生物信息学分析。DESeq差异分析结果显示, ZY vs BJ、JY vs ZY、JY vs BJ分别有327 (255个上调, 72个下调)、1085 (337个上调, 748个下调)、689 (381个上调, 308个下调)个DEGs, 有19个DEGs是3个比较组共同表达的。GO功能分析显示, DEGs在刺激反应、膜的组成部分、跨膜转运蛋白活性等途径差异显著。KEGG富集分析显示, DEGs在苯丙素的生物合成、植物激素信号转导、内质网中的蛋白加工等通路较为活跃。进一步对变异展叶与同株的卷叶和其他植株正常卷叶的DEGs分析发现集中富集到苯丙素的生物合成途径、淀粉和蔗糖代谢、植物激素信号转导, 这可能是展叶突变体形成的关键因子。展叶与卷叶差异基因的主要KEGG代谢通路有9条, 重要差异基因有9个。对不同类型叶片显微分析发现突变后的展叶木薯上表皮细胞层数增加、海绵组织结构变得疏松、维管束细胞减少。研究结果为进一步理解木薯叶片异常发育的分子机制提供了理论指导, 为木薯遗传改良、种质创新挖掘提供基因资源和改良策略。


名称
Name
株高
Plant height (cm)
主茎粗
Stem diameter (mm)
地上鲜重
Aboveground fresh weight (kg)
鲜薯个数
Number of fresh cassava
单株产量
Yield per plant (kg)
鲜薯内皮/外皮/薯肉颜色
Cassava inner skin color/exterior skin color/flesh color
BJ 220.80±10.71 a 24.18±1.30 a 1.70±0.55 a 10.0±2.36 a 1.54±0.69 a 白色/红褐色/白色
White/reddish brown/white
ZY 278.60±16.57 b 28.16±4.20 a 2.46±0.71 a 12.2±3.27 a 2.66±0.73 b 白色/红褐色/白色
White/reddish brown/white
JY 257.40±11.85 c 24.06±4.96 a 1.92±0.61 a 10.0±3.32 a 2.02±0.31 ab 白色/红褐色/白色
White/reddish brown/white
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表1 BJ、ZY和JY的农艺性状比较
正文中引用本图/表的段落
对3种材料扦插扩繁后的农艺性状观测结果如下表1所示, 突变株展叶扩繁群体与突变株卷叶群体相比其株高和单株产量明显增加且差异显著。突变株展叶扩繁群体与正常株卷叶群体相比, 株高差异显著, 其余性状间差异不显著, 但是突变株展叶扩繁群体的平均鲜薯个数、单株产量、地上鲜重和主茎粗这些农艺性状指标都大于正常卷叶木薯具有增产的潜质。
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