卷叶木薯及其突变体叶片的比较转录组分析 作物学报    2024, 50 (8): 2143-2156.   DOI: 10.3724/SP.J.1006.2024.34168

表4 主要 KEGG 代谢通路注释

正文中引用本图/表的段落

将突变株展叶与突变株卷叶和正常株卷叶间的差异基因富集于前20的KEGG代谢通路进行分类整理, 主要KEGG代谢通路有9条(表4), 主要涉及苯丙素类化合物的生物合成、苯丙氨酸代谢、氰胺酸代谢、谷胱甘肽代谢、淀粉和蔗糖代谢、α-亚麻酸代谢、二萜类化合物的生物合成、类黄酮的生物合成、及植物激素信号转导。其中展叶与另外2种卷叶的重要差异基因有9个(表5), 其ID为LOC110625143、LOC110619850和LOC122724051的3个基因同时参与了苯丙素类化合物的生物合成、α-亚麻酸代谢和谷胱甘肽代谢3条代谢通路的上调表达与下调表达, 他们分别是木薯β-葡萄糖苷酶12、木薯亚麻苦甙水解酶基因。ID为LOC110603741、LOC110618460和LOC110618773的3个基因在苯丙素类化合物的生物合成、α-亚麻酸代谢和谷胱甘肽代谢3条通路均下调了表达, 而基因ID为LOC110615840, 基因名称为木薯β-葡萄糖苷酶11的基因则上调了表达。ID为LOC110625014和LOC110618581的2个基因在苯丙氨酸代谢和类黄酮的生物合成通路中, 既参与了上调表达通路也参与了下调表达通路。推测此9个差异基因与突变株展叶发育密切相关, 将作为下一步的功能验证的依据。

更正：刊登于《作物学报》2024, 50(2): 414-424, 吴宇等“低氮条件下超级杂交稻苗期根系特征的变化及与其高氮素积累的关系”一文中“表4低氮处理对根解剖特征的影响”第1行中“根直径” “根皮层厚壁组织厚度” “根中柱直径”的单位“mm”更正为“μm”。

本文的其它图/表

• 图1 卷叶木薯突变株(A)和正常卷叶木薯(B)的表型特征
  BJ表示突变株卷叶叶片; ZY表示突变株展叶叶片; JY表示正常卷叶木薯叶片。
  
• 表1 BJ、ZY和JY的农艺性状比较
  
• 表2 转录组测序质量分析
  
• 图2 不同类型木薯叶片两两比较的差异基因表达情况
  BJ表示突变株卷叶叶片; ZY表示突变株展叶叶片; JY表示正常卷叶木薯叶片。
  
• 图3 木薯叶中DEGs的GO富集前10条目
  a: ZY vs BJ DEGs富集的GO条目; b: JY vs ZY DEGs富集的GO条目; c: JY vs BJ DEGs富集的GO条目。纵轴表示基因的数量, 横轴表示GO条目。
  
• 图4 木薯叶中DEGs的KEGG富集前20通路
  a: ZY vs BJ DEGs富集的KEGG通路; b: JY vs ZY DEGs富集的KEGG通路; c: JY vs BJ DEGs富集的KEGG通路。纵轴代表富集的KEGG通路, 横轴代表富集基因的比率, 点大小代表路径中富集的基因数。
  
• 表3 密码子突变类型分析
  
• 表5 重要差异基因表达分析
  
• 图5 不同类型木薯叶片切片观察
  BJ表示突变株卷叶叶片; ZY表示突变株展叶叶片; JY表示正常卷叶木薯叶片; a~c表示叶片横切; d~f表示主脉横切; g~i表示主脉横切放大图。