卷叶木薯及其突变体叶片的比较转录组分析 作物学报    2024, 50 (8): 2143-2156.   DOI: 10.3724/SP.J.1006.2024.34168

表5 重要差异基因表达分析

正文中引用本图/表的段落

将突变株展叶与突变株卷叶和正常株卷叶间的差异基因富集于前20的KEGG代谢通路进行分类整理, 主要KEGG代谢通路有9条(表4), 主要涉及苯丙素类化合物的生物合成、苯丙氨酸代谢、氰胺酸代谢、谷胱甘肽代谢、淀粉和蔗糖代谢、α-亚麻酸代谢、二萜类化合物的生物合成、类黄酮的生物合成、及植物激素信号转导。其中展叶与另外2种卷叶的重要差异基因有9个(表5), 其ID为LOC110625143、LOC110619850和LOC122724051的3个基因同时参与了苯丙素类化合物的生物合成、α-亚麻酸代谢和谷胱甘肽代谢3条代谢通路的上调表达与下调表达, 他们分别是木薯β-葡萄糖苷酶12、木薯亚麻苦甙水解酶基因。ID为LOC110603741、LOC110618460和LOC110618773的3个基因在苯丙素类化合物的生物合成、α-亚麻酸代谢和谷胱甘肽代谢3条通路均下调了表达, 而基因ID为LOC110615840, 基因名称为木薯β-葡萄糖苷酶11的基因则上调了表达。ID为LOC110625014和LOC110618581的2个基因在苯丙氨酸代谢和类黄酮的生物合成通路中, 既参与了上调表达通路也参与了下调表达通路。推测此9个差异基因与突变株展叶发育密切相关, 将作为下一步的功能验证的依据。

本文的其它图/表

• 图1 卷叶木薯突变株(A)和正常卷叶木薯(B)的表型特征
  BJ表示突变株卷叶叶片; ZY表示突变株展叶叶片; JY表示正常卷叶木薯叶片。
  
• 表1 BJ、ZY和JY的农艺性状比较
  
• 表2 转录组测序质量分析
  
• 图2 不同类型木薯叶片两两比较的差异基因表达情况
  BJ表示突变株卷叶叶片; ZY表示突变株展叶叶片; JY表示正常卷叶木薯叶片。
  
• 图3 木薯叶中DEGs的GO富集前10条目
  a: ZY vs BJ DEGs富集的GO条目; b: JY vs ZY DEGs富集的GO条目; c: JY vs BJ DEGs富集的GO条目。纵轴表示基因的数量, 横轴表示GO条目。
  
• 图4 木薯叶中DEGs的KEGG富集前20通路
  a: ZY vs BJ DEGs富集的KEGG通路; b: JY vs ZY DEGs富集的KEGG通路; c: JY vs BJ DEGs富集的KEGG通路。纵轴代表富集的KEGG通路, 横轴代表富集基因的比率, 点大小代表路径中富集的基因数。
  
• 表3 密码子突变类型分析
  
• 表4 主要 KEGG 代谢通路注释
  
• 图5 不同类型木薯叶片切片观察
  BJ表示突变株卷叶叶片; ZY表示突变株展叶叶片; JY表示正常卷叶木薯叶片; a~c表示叶片横切; d~f表示主脉横切; g~i表示主脉横切放大图。