基于转录组分析鉴定甘蓝型油菜开花候选基因以及BnaCOR27功能验证 作物学报    2025, 51 (10): 2693-2704.   DOI: 10.3724/SP.J.1006.2025.55008

图1 差异基因火山图
纵坐标代表差异表达显著性, 横坐标代表基因表达量变化倍数, 红色点代表上调差异基因, 蓝色点代表下调差异基因。

正文中引用本图/表的段落

对春化处理前后的7个品种的差异基因进行并集统计分析, 一共检测到1305个基因差异表达, 其中上调基因有554个, 下调基因有751个。为了直观地展示这些差异表达基因的分布情况, 本研究绘制了差异基因火山图(图1)。通过对火山图的分析, 能够快速筛选出表达变化显著的基因, 为后续深入研究它们在油菜春化和开花调控中的功能提供了重要线索。

本文的其它图/表

• 图2 差异表达基因GO富集分析
  A: 上调基因GO富集分析; B: 下调基因GO富集分析。
  
• 图3 热图显示与开花相关的差异表达基因的表达量
  A: 上调差异基因的表达量热图; B: 下调差异基因的表达量热图。
  
• 图4 显著相关区域候选基因的分析
  A: 全基因组关联分析检测到单体型区域(16,048,376~16,594,153 bp)与开花期显著关联。红点表示BnaCOR27-C04中的SNP与开花期关联, 虚线表示显著性阈值; B: BnaCOR27-C04基因区域2个等位基因对应的表型分析。通过t检验分析等位基因座之间的差异。
  
• 图5 共表达网络分析
  A: 模块系统树图; B: 模块与春化相关性; C: 基因网络图。根据功能标注, 网络分为春化途径(粉色节点)、光周期途径(橙色节点)、花发育相关(淡紫色节点)、激素途径(深绿色节点)、低温途径(蓝绿色节点)、昼夜节律途径(翠绿色节点)、自主途径(紫色节点)和其他与开花有关的基因(灰色节点)。
  
• 图6 转基因植株靶点突变序列分析及开花表型
  A: BnaCOR27在A09染色体的敲除载体以及靶点突变情况示意图; B: BnaCOR27在C09染色体的敲除载体以及靶点突变情况示意图; C: 敲除突变体植株CAS:BnaCOR27-T3及对照植株ZS6开花时间表型图片; D: 敲除突变株系CAS:BnaCOR27-T3及对照植株ZS6开花时间柱状图; **: P < 0.01。在A09染色体上出现大片段缺失, C09染色体上插入单碱基。敲除突变体植株CAS:BnaCOR27-T3相较于对照植株ZS6开花时间提前约6.54 d。ZS6: 中双6号。标尺为5 cm。
  
• 图7 CAS:BnaCOR27-T3转基因植株转录组差异基因分析
  A: CAS:BnaCOR27-T3转基因材料差异基因火山图; B: CAS:BnaCOR27-T3转基因材料GO富集分析; C: CAS:BnaCOR27-T3转基因材料转录组差异基因表达量分析。ZS6: 中双6号。