东北春播区糜子核心种质的荧光微卫星标记鉴定

doi:10.3724/SP.J.1006.2024.34183

作物学报 ›› 2024, Vol. 50 ›› Issue (7): 1728-1739.doi: 10.3724/SP.J.1006.2024.34183

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东北春播区糜子核心种质的荧光微卫星标记鉴定

丁艺冰¹^,²(), 辛旭霞¹, 冯智尊¹, 郭娟¹, 曹越¹^,³, 陈喜明², 王晓丹¹, 曹晓宁³, SANTRA Dipak K⁴, 陈凌³, 乔治军³^,^*(), 王瑞云¹^,³^,^*()

¹山西农业大学农学院, 中国山西太谷 030801
²山西农业大学玉米研究所, 中国山西忻州 034000
³山西农业大学农业基因资源研究中心 / 农业农村部黄土高原作物基因资源与种质创制重点实验室 / 杂粮种质资源发掘与遗传改良山西省重点实验室, 中国山西太原 030031
⁴内布拉斯加大学林肯分校农艺系小宗粮豆研究与推广中心, 美国内布拉斯加州斯克茨布拉夫 69361

收稿日期:2023-11-06 接受日期:2024-01-31 出版日期:2024-07-12 网络出版日期:2024-02-09
通讯作者: *王瑞云, E-mail: wry925@126.com; 乔治军, E-mail: nkypzs@126.com
作者简介:E-mail: 2771284358@qq.com
基金资助:
山西农业大学杂粮种质创新与分子育种国家实验室(筹)项目(202204010910001);国家自然科学基金项目(31271791);财政部和农业农村部国家现代农业产业技术体系建设专项(CARS-06-14.5-A16);山西省现代农业产业技术体系建设专项资金项目(2023CYJSTX03-12);山西省重点研发项目(2022ZDYF110);山西农业大学杂粮种质创新与分子育种山西省重点实验室项目(K462202040);山西农业大学生物育种工程项目(YZGC069);山西农业大学农学院研究生教育改革项目(2023YJG05)

Core germplasm identification of proso millet in spring sowing area of Northeast China using fluorescent microsatellite markers

DING Yi-Bing¹^,²(), XIN Xu-Xia¹, FENG Zhi-Zun¹, GUO Juan¹, CAO Yue¹^,³, CHEN Xi-Ming², WANG Xiao-Dan¹, CAO Xiao-Ning³, SANTRA Dipak K⁴, CHEN Ling³, QIAO Zhi-Jun³^,^*(), WANG Rui-Yun¹^,³^,^*()

¹Agronomy College, Shanxi Agricultural University, Taigu 030801, Shanxi, China
²Corn Research Institute, Shanxi Agricultural University, Xinzhou 034000, Shanxi, China
³Center for Agricultural Genetic Resources Research, Shanxi Agricultural University / Key Laboratory of Crop Gene Resources and Germplasm Enhancement on Loess Plateau, Ministry of Agriculture and Rural Affairs / Shanxi Key Laboratory of Genetic Resources and Genetic Improvement of Minor Crops, Taiyuan 030031, Shanxi, China
⁴Panhandle Research & Extension Center, Department of Agronomy and Horticulture, University of Nebraska-Lincoln, Scottsbluff 69361, Nebraska, USA

Received:2023-11-06 Accepted:2024-01-31 Published:2024-07-12 Published online:2024-02-09
Contact: *E-mail: wry925@126.com; E-mail: nkypzs@126.com
Supported by:
National Laboratory of Minor Crops Germplasm Innovation and Molecular Breeding (In Prepare, 202204010910001);National Natural Science Foundation of China(31271791);China Agriculture Research System of MOF and MARA(CARS-06-14.5-A16);Special Fund for Construction of Modern Agricultural Industrial Technology System of Shanxi Province(2023CYJSTX03-12);Key Research & Development Project of Shanxi Province(2022ZDYF110);Shanxi Key Laboratory of Innovation and Molecular Breeding(K462202040);Biological Breeding Project of Shanxi Agricultural University(YZGC069);Graduate Education Reform Project of Agronomy College in Shanxi Agricultural University(2023YJG05)

摘要/Abstract

摘要：

优异种质资源是糜子新品种选育和产业发展的基础。本研究以190份东北春播区糜子核心种质为材料, 利用前期构建的SSR标记在5°端标注荧光, 进行PCR扩增和毛细管电泳。根据毛细管电泳检测的片段有无采用“0/1”表示, 利用ID Analysis4.0进行区分, 使用PopGene、PowerMarker、MEGA、Structure、NTSYS进行遗传多样性分析。试验结果表明, 3个荧光SSR标记组合(RYW3+RYW6+RYW28)可区分190份材料, 共检测出等位变异73个, 平均为24.3333; 有效等位基因数(N_e)为5.4728 (RYW3)~15.8922 (RYW6), 平均为9.6496; 检出Shannon多样性指数(I)为2.0851 (RYW3)~2.9457 (RYW6), 平均为2.4896; 观测杂合度(H_o)为0.7529 (RYW6)~0.9574 (RYW28), 平均为0.8876; 期望观测杂合度(H_e)为0.8194 (RYW3)~0.9398 (RYW6), 平均为0.8765; Nei’s基因多样性指数(Nei)为0.817 3(RYW3)~0.9371 (RYW6), 平均为0.8741; 多态性信息含量(PIC)为0.8656 (RYW3)~0.9722 (RYW6), 平均为0.9198。基于UPGMA将190份资源划分为3个群组。基于Structure的遗传结构分析(K=3)将糜子核心种质分为3个类群, 来源于东北地区的4个基因库(黑龙江、吉林、辽宁和内蒙古的一部分)。基于主成分分析将材料分为4个类群, 与地理来源一致。利用在线二维码技术(https://cli.im/)构建了190份东北糜子核心种质的DNA分子身份证。

关键词: 糜子, 东北春播区, 荧光微卫星标记, 毛细管电泳, DNA分子身份证

Abstract:

Rich germplasm resources are the basis of new varieties breeding and industrial development in proso millet. In this study, 190 core germplasms of proso millet in spring sowing area of northeast China were used as the experimental materials. PCR amplification and capillary electrophoresis were performed using the previously constructed SSR markers labeled with fluorescence at the 5° end. According to the fragments detected by capillary electrophoresis, “0/1” was used to represent without of the fragments, and ID Analysis 4.0 was used to distinguish them. PopGene, PowerMarker, MEGA, Structure, and NTSYS were used for genetic diversity analysis. The results showed that 190 materials could be distinguished by three fluorescent SSR (RYW3, RYW6, RYW28) marker combinations. A total of 73 alleles were detected, with an average of 24.3333. The effective number of alleles (N_e) was 5.4728 (RYW3)-15.8922 (RYW6), with an average of 9.6469. The Shannon diversity index (I) was 2.0851 (RYW3)-2.9457 (RYW6), with an average of 2.4896. The observed heterozygosity (H_o) was 0.7529 (RYW6) - 0.9574 (RYW28), with an average of 0.8876. The expected observed heterozygosity (H_e) was 0.8194 (RYW3) - 0.9398 (RYW6), with an average of 0.8765. The Nei’s gene diversity index (Nei) was 0.8173 (RYW3)-0.9371 (RYW6), with an average of 0.8741. The polymorphism information content (PIC) was 0.8656 (RYW3)-0.9722 (RYW6), with an average of 0.9198. Based on UPGMA, 190 resources were divided into three groups. Based on the genetic structure of Structure (K = 3), the core collection of proso millet was divided into three groups. The proso millet was derived from four provinces in northeast China (Heilongjiang, Jilin, Liaoning, and the part of Inner Mongolia). Based on principal component analysis, the materials were divided into four groups, which was consistent with their geographical origin. The DNA molecular identification cards of 190 core collections of northeast proso millet were constructed using online two-dimensional code technology (https://cli.im/).

Key words: Panicum miliaceum, the northeast spring sowing area, fluorescent SSR, capillary electrophoresis, DNA molecular ID card

丁艺冰, 辛旭霞, 冯智尊, 郭娟, 曹越, 陈喜明, 王晓丹, 曹晓宁, SANTRA Dipak K, 陈凌, 乔治军, 王瑞云. 东北春播区糜子核心种质的荧光微卫星标记鉴定[J]. 作物学报, 2024, 50(7): 1728-1739.

DING Yi-Bing, XIN Xu-Xia, FENG Zhi-Zun, GUO Juan, CAO Yue, CHEN Xi-Ming, WANG Xiao-Dan, CAO Xiao-Ning, SANTRA Dipak K, CHEN Ling, QIAO Zhi-Jun, WANG Rui-Yun. Core germplasm identification of proso millet in spring sowing area of Northeast China using fluorescent microsatellite markers[J]. Acta Agronomica Sinica, 2024, 50(7): 1728-1739.

图/表 12

附表1

190份核心种质明细表"

序号 Number	统一编号 Unified number	材料名称 Material name	材料来源 Material source	备注 Remark
1	00000001	64黍120 64 Shu 120	黑龙江嫩江所 Nenjiangsuo, Heilongjiang	地方品种 Landrace
2	00000012	白糜子 Baimeizi	黑龙江德都 Dedu, Heilongjiang	地方品种 Landrace
3	00000013	兔子争窝 Tuzizhengwo	黑龙江北安 Bei’an, Heilongjiang	地方品种 Landrace
4	00000014	黑糜子 Heimeizi	黑龙江讷河 Nehe, Heilongjiang	地方品种 Landrace
5	00000022	大粒糜子 Dalimeizi	黑龙江克山 Keshan, Heilongjiang	地方品种 Landrace
6	00000024	双粒糜子 Shuanglimeizi	黑龙江克东 Kedong, Heilongjiang	地方品种 Landrace
7	00000025	大黑糜子 Daheimeizi	黑龙江克东 Kedong, Heilongjiang	地方品种 Landrace
8	00000029	黑糜子 Heimeizi	黑龙江拜泉 Baiquan, Heilongjiang	地方品种 Landrace
9	00000030	双粒糜子 Shuanglimeizi	黑龙江拜泉 Baiquan, Heilongjiang	地方品种 Landrace
10	00000031	黄糜子 Huangmeizi	黑龙江依安 Yi’an, Heilongjiang	地方品种 Landrace
11	00000032	大黄糜子 Dahuangmeizi	黑龙江依安 Yi’an, Heilongjiang	地方品种 Landrace
12	00000036	红糜子 Hongmeizi	黑龙江海伦 Hailun, Heilongjiang	地方品种 Landrace
13	00000041	大黄糜子 Dahuangmeizi	黑龙江林甸 Lindian, Heilongjiang	地方品种 Landrace
14	00000047	兔子争窝 Tuzizhengwo	黑龙江林甸 Lindian, Heilongjiang	地方品种 Landrace
15	00000049	黑粘糜子 Heinianmeizi	黑龙江富裕 Fuyu, Heilongjiang	地方品种 Landrace
16	00000050	鹌鹑尾 Anchunwei	黑龙江富裕 Fuyu, Heilongjiang	地方品种 Landrace
17	00000052	白糜子 Baimeizi	黑龙江甘南 Gannan, Heilongjiang	地方品种 Landrace
18	00000056	鹅头 Etou	黑龙江甘南 Gannan, Heilongjiang	地方品种 Landrace
19	00000058	大红糜子 Dahongmeizi	黑龙江龙江 Longjiang, Heilongjiang	地方品种 Landrace
20	00000069	大白糜子 Dabaimeizi	黑龙江杜旗 Duqi, Heilongjiang	地方品种 Landrace
21	00000072	鹅头糜子 Etoumeizi	黑龙江杜旗 Duqi, Heilongjiang	地方品种 Landrace
22	00000073	红糜子 Hongmeizi	黑龙江齐齐哈尔 Qiqihar, Heilongjiang	地方品种 Landrace
23	00000074	黄糜子 Huangmeizi	黑龙江齐齐哈尔 Qiqihar, Heilongjiang	地方品种 Landrace
24	00000078	鹅头糜子 Etoumeizi	黑龙江安达 Anda, Heilongjiang	地方品种 Landrace
25	00000080	红糜子 Hongmeizi	黑龙江富锦 Fujin, Heilongjiang	地方品种 Landrace
26	00000089	黄壳 Huangke	黑龙江勃利 Boli, Heilongjiang	地方品种 Landrace
27	00000097	黄糜子 Huangmeizi	黑龙江桦川 Huachuan, Heilongjiang	地方品种 Landrace
28	00000103	黑糜子 Heimeizi	黑龙江桦川 Huachuan, Heilongjiang	地方品种 Landrace
29	00000105	黑糜子 Heimeizi	黑龙江同江 Tongjiang, Heilongjiang	地方品种 Landrace
30	00000106	杂花糜子 Zahuameizi	黑龙江同江 Tongjiang, Heilongjiang	地方品种 Landrace
31	00000108	黑糜子 Heimeizi	黑龙江宝清 Baoqing, Heilongjiang	地方品种 Landrace
32	00000110	黑糜子 Heimeizi	黑龙江罗北 Luobei, Heilongjiang	地方品种 Landrace
33	00000111	红糜子 Hongmeizi	黑龙江集贤 Jixian, Heilongjiang	地方品种 Landrace
34	00000112	大红黍 Dahongshu	黑龙江华南 Huanan, Heilongjiang	地方品种 Landrace
35	00000113	猪糜子 Zhumeizi	黑龙江虎林 Hulin, Heilongjiang	地方品种 Landrace
36	00000115	鹌鹑尾 Anchunwei	黑龙江密山 Mishan, Heilongjiang	地方品种 Landrace
37	00000137	黑粘糜子 Heinianmeizi	黑龙江密山 Mishan, Heilongjiang	地方品种 Landrace
38	00000148	黄糜子 Huangmeizi	黑龙江林口 Linkou, Heilongjiang	地方品种 Landrace
39	00000151	大红袍 Dahongpao	黑龙江鸡西 Jixi, Heilongjiang	地方品种 Landrace
40	00000161	红糜子 Hongmeizi	黑龙江东宁 Dongning, Heilongjiang	地方品种 Landrace
41	00000173	黄糜子 Huangmeizi	黑龙江穆棱 Muling, Heilongjiang	地方品种 Landrace
42	00000174	散黄糜子 Sanhuangmeizi	黑龙江穆棱 Muling, Heilongjiang	地方品种 Landrace
43	00000179	红糜子 Hongmeizi	黑龙江宁安 Ningan, Heilongjiang	地方品种 Landrace
44	00000186	红糜子 Hongmeizi	黑龙江牡丹江 Mudanjiang, Heilongjiang	地方品种 Landrace
45	00000189	红糜子 Hongmeizi	黑龙江海林 Hailin, Heilongjiang	地方品种 Landrace
46	00000197	粘糜子 Nianmeizi	黑龙江通河 Tonghe, Heilongjiang	地方品种 Landrace
47	00000203	散穗 Sansui	黑龙江方正 Fangzheng, Heilongjiang	地方品种 Landrace
48	00000204	黑雁头 Heiyantou	黑龙江木兰 Mulan, Heilongjiang	地方品种 Landrace
49	00000205	鹅头 Etou	黑龙江巴彦 Bayan, Heilongjiang	地方品种 Landrace
50	00000208	笊篱头 Zhaolitou	黑龙江宾县 Binxian, Heilongjiang	地方品种 Landrace
51	00000210	雁头 Yantou	黑龙江阿城 Acheng, Heilongjiang	地方品种 Landrace
52	00000211	大红糜子 Dahongmeizi	黑龙江呼兰 Hulan, Heilongjiang	地方品种 Landrace
53	00000212	灰白糜子 Huibaimeizi	黑龙江呼兰 Hulan, Heilongjiang	地方品种 Landrace
54	00000215	鸭子嘴 Yazizui	黑龙江哈尔滨 Harbin, Heilongjiang	地方品种 Landrace
55	00000218	白鹅头 Baietou	黑龙江双城 Shuangcheng, Heilongjiang	地方品种 Landrace
56	00000220	黄糜子 Huangmeizi	黑龙江五常 Wuchang, Heilongjiang	地方品种 Landrace
57	00000222	麦糜子 Maimeizi	黑龙江五常 Wuchang, Heilongjiang	地方品种 Landrace
58	00000225	黄糜子 Huangmeizi	黑龙江尚志 Shangzhi, Heilongjiang	地方品种 Landrace
59	00000229	大红袍 Dahongpao	黑龙江依兰 Yilan, Heilongjiang	地方品种 Landrace
60	00000230	雁头 Yantou	黑龙江铁力 Tieli, Heilongjiang	地方品种 Landrace
61	00000231	大黄黍 Dahuangshu	黑龙江绥化 Suihua, Heilongjiang	地方品种 Landrace
62	00000233	雁头 Yantou	黑龙江绥化 Suihua, Heilongjiang	地方品种 Landrace
63	00000234	黄糜子 Huangmeizi	黑龙江肇东 Zhaodong, Heilongjiang	地方品种 Landrace
64	00000238	白鹅头 Baietou	黑龙江兰西 Lanxi, Heilongjiang	地方品种 Landrace
65	00000239	红散糜子 Hongsanmeizi	黑龙江肇州 Zhaozhou, Heilongjiang	地方品种 Landrace
66	00000244	大白糜 Dabaimei	黑龙江肇源 Zhaoyuan, Heilongjiang	地方品种 Landrace
67	00000245	龙糜2号 Longmei 2	黑龙江农业科学院 Heilongjiang Academy of Agricultural Sciences	地方品种 Landrace
68	00000255	早熟糜子 Zaoshumeizi	黑龙江农业科学院 Heilongjiang Academy of Agricultural Sciences	地方品种 Landrace
69	00000257	69-4103	黑龙江农业科学院 Heilongjiang Academy of Agricultural Sciences	选育品种 Bred variety
70	00000266	龙黍8号异型(双粒) Longshu 8 haoyixing (shuangli)	黑龙江农业科学院 Heilongjiang Academy of Agricultural Sciences	选育品种 Bred variety
71	00000299	77-4007	黑龙江农业科学院 Heilongjiang Academy of Agricultural Sciences	选育品种 Bred variety
72	00000302	龙黍6号 Longshu 6	黑龙江农业科学院 Heilongjiang Academy of Agricultural Sciences	选育品种 Bred variety
73	00001977	稷子 Jizi	黑龙江克山 Keshan, Heilongjiang	地方品种 Landrace
74	00001978	稷子 Jizi	黑龙江龙江 Longjiang, Heilongjiang	地方品种 Landrace
75	00001979	稷子 Jizi	黑龙江安达 Anda, Heilongjiang	地方品种 Landrace
76	00001980	万星稷子 Wanxingjizi	黑龙江泰来 Tailai, Heilongjiang	地方品种 Landrace
77	00001986	稷子 Jizi	黑龙江密山 Mishan, Heilongjiang	地方品种 Landrace
78	00004204	64黍62 64 Shu 62	黑龙江讷河种子站 Heilongjiang Nehe Seed Station	地方品种 Landrace
79	00004211	糜子(黍) Meizi (shu)	黑龙江方正 Fangzheng, Heilongjiang	地方品种 Landrace
80	00004222	菊食糜子 Jushimeizi	黑龙江农业科学院 Heilongjiang Academy of Agricultural Sciences	选育品种 Bred variety
81	00004861	黑糜子 Heimeizi	黑龙江龙江 Longjiang, Heilongjiang	地方品种 Landrace
82	00004864	2号糜子兔子争窝 2Haomeizituzizhengwo	黑龙江农业科学院 Heilongjiang Academy of Agricultural Sciences	地方品种 Landrace
83	00005594	龙黍23号 Longshu 23	黑龙江嫩江农业科学研究所 Heilongjiang Nenjiang Agricultural Science Research Institute	地方品种 Landrace
84	00006459	龙黍2号(2260) Longshu 2 (2260)	黑龙江农业科学院 Heilongjiang Academy of Agricultural Sciences	地方品种 Landrace
85	00006460	2078	黑龙江嫩江农业科学研究所 Heilongjiang Nenjiang Agricultural Science Research Institute	地方品种 Landrace
86	00006463	2135	黑龙江农业科学院 Heilongjiang Academy of Agricultural Sciences	地方品种 Landrace
87	00007558	B75-2	黑龙江 Heilongjiang	地方品种 Landrace
88	00007635	年丰四号 Nianfengsihao	黑龙江 Heilongjiang	选育品种 Bred variety
89	00007820	嫩黍11 Nenshu 11	黑龙江 Heilongjiang	地方品种 Landrace
90	00000326	红糜子 Hongmeizi	吉林镇赉 Zhenlai, Jilin	地方品种 Landrace
91	00000338	黑糜子 Heimeizi	吉林安广 Anguang, Jilin	地方品种 Landrace
92	00000339	白糜子 Baimeizi	吉林大赉 Dalai, Jilin	地方品种 Landrace
93	00000346	黎糜子 Limeizi	吉林洮南 Taonan, Jilin	地方品种 Landrace
94	00000347	红糜子 Hongmeizi	吉林扶余 Fuyu, Jilin	地方品种 Landrace
95	00000350	白糜子 Baimeizi	吉林前郭 Qianguo, Jilin	地方品种 Landrace
96	00000351	黑糜子 Heimeizi	吉林前郭 Qianguo, Jilin	地方品种 Landrace
97	00000352	黑糜子 Heimeizi	吉林乾安 Qianan, Jilin	地方品种 Landrace
98	00000353	红糜子 Hongmeizi	吉林榆树 Yushu, Jilin	地方品种 Landrace
99	00000356	黑糜子 Heimeizi	吉林开通 Kaitong, Jilin	地方品种 Landrace
100	00000357	红糜子 Hongmeizi	吉林瞻榆 Zhanyu, Jilin	地方品种 Landrace
101	00000358	红糜子 Hongmeizi	吉林德惠 Dehui, Jilin	地方品种 Landrace
102	00000359	黑糜子 Heimeizi	吉林德惠 Dehui, Jilin	地方品种 Landrace
103	00000360	白糜子 Baimeizi	吉林长岭 Changling, Jilin	地方品种 Landrace
104	00000362	白糜子 Baimeizi	吉林怀德 Huaide, Jilin	地方品种 Landrace
105	00000365	白糜子 Baimeizi	吉林双辽 Shuangliao, Jilin	地方品种 Landrace
106	00000366	白糜子 Baimeizi	吉林梨树 Lishu, Jilin	地方品种 Landrace
107	00000367	白糜子 Baimeizi	吉林汪清 Wangqing, Jilin	地方品种 Landrace
108	00000368	黑糜子 Heimeizi	吉林汪清 Wangqing, Jilin	地方品种 Landrace
109	00000369	黑糜子 Heimeizi	吉林伊通 Yitong, Jilin	地方品种 Landrace
110	00000372	糜子 Meizi	吉林延吉 Yanji, Jilin	地方品种 Landrace
111	00000374	红糜子 Hongmeizi	吉林珲春 Huichun, Jilin	地方品种 Landrace
112	00000375	黄糜子 Huangmeizi	吉林珲春 Huichun, Jilin	地方品种 Landrace
113	00000376	黄泥河 Huangnihe	吉林东丰 Dongfeng, Jilin	地方品种 Landrace
114	00000377	黄糜子 Huangmeizi	吉林海龙 Hailong, Jilin	地方品种 Landrace
115	00000378	紧穗糜子 Jinsuimeizi	吉林辉南 Huinan, Jilin	地方品种 Landrace
116	00000389	黑糜子 Heimeizi	吉林安图 Antu, Jilin	地方品种 Landrace
117	00000392	糜子 Meizi	吉林和龙 Helong, Jilin	地方品种 Landrace
118	00000395	红壳粘糜子 Hongkenianmeizi	吉林柳河 Liuhe, Jilin	地方品种 Landrace
119	00000397	糜子 Meizi	吉林柳河 Liuhe, Jilin	地方品种 Landrace
120	00000400	黑糜子 Heimeizi	吉林柳河 Liuhe, Jilin	地方品种 Landrace
121	00000401	红糜子 Hongmeizi	吉林通化 Tonghua, Jilin	地方品种 Landrace
122	00000406	红糜子 Hongmeizi	吉林临江 Linjiang, Jilin	地方品种 Landrace
123	00000407	白糜子 Baimeizi	吉林临江 Linjiang, Jilin	地方品种 Landrace
124	00000408	红糜子 Hongmeizi	吉林长白 Changbai, Jilin	地方品种 Landrace
125	00000410	红糜子 Hongmeizi	吉林集安 Ji’an, Jilin	地方品种 Landrace
126	00002035	黑糜子 Heimeizi	吉林白城 Baicheng, Jilin	地方品种 Landrace
127	00002036	黎糜子 Limeizi	吉林安广 Anguang, Jilin	地方品种 Landrace
128	00002038	白糜子 Baimeizi	吉林开通 Kaitong, Jilin	地方品种 Landrace
129	00002039	红糜子 Hongmeizi	吉林瞻榆 Zhanyu, Jilin	地方品种 Landrace
130	00002041	黄糜子 Huangmeizi	吉林双辽 Shuangliao, Jilin	地方品种 Landrace
131	00002044	红糜子 Hongmeizi	吉林延吉 Yanji, Jilin	地方品种 Landrace
132	00002047	白糜子 Baimeizi	吉林通化 Tonghua, Jilin	地方品种 Landrace
133	00004223	九台红糜子(黍) Jiutaihongmeizi (shu)	吉林九台 Jiutai, Jilin	地方品种 Landrace
134	00004231	千斤糜子(黍) Qianjinmeizi (shu)	吉林永吉 Yongji, Jilin	地方品种 Landrace
135	00004263	林家糜子(黍) Linjiameizi (shu)	吉林长春 Changchun, Jilin	地方品种 Landrace
136	00005630	农安白糜子 Yianbaimeizi	吉林农安 Nong’an, Jilin	地方品种 Landrace
137	00005668	三湾白糜子 Sanwanbaimeizi	吉林辽源 Liaoyuan, Jilin	地方品种 Landrace
138	00005674	卧龙白糜子 Wolongbaimeizi	吉林和龙 Helong, Jilin	地方品种 Landrace
139	00005682	三峰黄糜子 Sanfenghuangmeizi	吉林龙井 Longjing, Jilin	地方品种 Landrace
140	00005705	月清白糜子 Yueqingbaimeizi	吉林图门 Tumen, Jilin	地方品种 Landrace
141	00005713	大川黑糜子 Dachuanheimeizi	吉林通化 Tonghua, Jilin	地方品种 Landrace
142	00005716	板石黑糜子 Banshiheimeizi	吉林浑江 Hunjiang, Jilin	地方品种 Landrace
143	00005725	湾沟糜子 Wangoumeizi	吉林浑江 Hunjiang, Jilin	地方品种 Landrace
144	00006571	黄糜 Huangmei	吉林 Jilin	地方品种 Landrace
145	00007260	黍稷16 Shuji 16	吉林双阳 Shuangyang, Jilin	地方品种 Landrace
146	00007261	梨糜子 Limeizi	吉林镇来 Zhenlai, Jilin	地方品种 Landrace
147	00007262	白糜子 Baimeizi	吉林双辽 Shuangliao, Jilin	地方品种 Landrace
148	00007594	D75-1	吉林 Jilin	地方品种 Landrace
149	00007872	E75-B	吉林 Jilin	地方品种 Landrace
150	00008054	吉红软糜 Jihongruanmei	吉林 Jilin	地方品种 Landrace
151	00008055	吉高粱黍 Jigaoliangshu	吉林 Jilin	地方品种 Landrace
152	00000413	昌图红糜子 Changtuhongmeizi	辽宁昌图 Changtu, Liaoning	地方品种 Landrace
153	00000414	康平散穗 Kangpingsansui	辽宁康平 Kangping, Liaoning	地方品种 Landrace
154	00000415	法库黄糜子 Fakuhuangmeizi	辽宁法库 Faku, Liaoning	地方品种 Landrace
155	00000416	清源褐糜子 Qingyuanhemeizi	辽宁清源 Qingyuan, Liaoning	地方品种 Landrace
156	00000417	新宾红糜子 Xinbinhongmeizi	辽宁新宾 Xinbin, Liaoning	地方品种 Landrace
157	00000418	新宾黑糜子 Xinbinheimeizi	辽宁新宾 Xinbin, Liaoning	地方品种 Landrace
158	00000420	辽糜56号 Liaomei 56	辽宁农业科学院 Liaoning Academy of Agricultural Sciences	地方品种 Landrace
159	00000421	阜新白糜子 Fuxinbaimeizi	辽宁阜新 Fuxin, Liaoning	地方品种 Landrace
160	00000423	黑山红黍 Heishanhongshu	辽宁黑山 Heishan, Liaoning	地方品种 Landrace
161	00000435	辽中黄糜子 Liaozhonghuangmeizi	辽宁辽中 Liaozhong, Liaoning	地方品种 Landrace
162	00000442	本溪白糜子 Benxibaimeizi	辽宁本溪 Benxi, Liaoning	地方品种 Landrace
163	00000445	台安白糜子 Taianbaimeizi	辽宁台安 Taian, Liaoning	地方品种 Landrace
164	00000448	宽甸黑糜子 Kuandianheimeizi	辽宁宽甸 Kuandian, Liaoning	地方品种 Landrace
165	00000450	凤城黄糜子 Fengchenghuangmeizi	辽宁凤城 Fengcheng, Liaoning	地方品种 Landrace
166	00000451	岫岩褐糜子 Xiuyanhemeizi	辽宁岫岩 Xiuyan, Liaoning	地方品种 Landrace
167	00000452	海城紧穗 Haichengjinsui	辽宁海城 Haicheng, Liaoning	地方品种 Landrace
168	00000455	营口白糜子 Yingkoubaimeizi	辽宁营口 Yingkou, Liaoning	地方品种 Landrace
169	00000456	锦县黄糜子 Jinxianhuangmeizi	辽宁锦县 Jinxian, Liaoning	地方品种 Landrace
170	00000457	锦县白糜子 Jinxianbaimeizi	辽宁锦县 Jinxian, Liaoning	地方品种 Landrace
171	00000460	红糜子 Hongmeizi	辽宁东沟 Donggou, Liaoning	地方品种 Landrace
172	00000464	熊岳红糜子 Xiongyuehongmeizi	辽宁盖县 Gaixian, Liaoning	地方品种 Landrace
173	00000470	73-48	辽宁庄河 Zhuanghe, Liaoning	地方品种 Landrace
174	00000471	新金黄糜子 Xinjinhuangmeizi	辽宁新金 Xinjin, Liaoning	地方品种 Landrace
175	00000472	新金白糜子 Xinjinbaimeizi	辽宁新金 Xinjin, Liaoning	地方品种 Landrace
176	00000473	金黄黍 Jinhuangshu	辽宁复县 Fuxian, Liaoning	地方品种 Landrace
177	00000476	紧穗白糜子 Jinsuibaimeizi	辽宁金县 Jinxian, Liaoning	地方品种 Landrace
178	00000477	金县褐糜子 Jinxianhemeizi	辽宁金县 Jinxian, Liaoning	地方品种 Landrace
179	00005776	粘丰2号 Nianfeng 2	辽宁辽阳 Liaoyang, Liaoning	地方品种 Landrace
180	00005777	粘丰2号 Nianfeng 2	辽宁辽阳 Liaoyang, Liaoning	地方品种 Landrace
181	00006532	昌图糜子 Changtumeizi	辽宁锦州农业科学研究所 Liaoning Jinzhou Institute of Agricultural Sciences	地方品种 Landrace
182	00006533	千斤黍 Qianjinmei	辽宁锦州农业科学研究所 Liaoning Jinzhou Institute of Agricultural Sciences	地方品种 Landrace
183	00007256	法库黄糜子 Fakuhuangmeizi	辽宁 Liaoning	地方品种 Landrace
184	00007257	黑山红糜子 Heishanhongmeizi	辽宁 Liaoning	地方品种 Landrace
185	00000485	扎旗糜子 Zhaqimeizi	内蒙古兴安盟扎旗 Jalaid Banner, Hinggan League, Inner Mongolia	地方品种 Landrace
186	00000486	科右前大白黍 Keyouqiandabaishu	内蒙古兴安盟科右 Horqin Right Wing Middle Banne, Hinggan League, Inner Mongolia	地方品种 Landrace
187	00000487	突泉白糜子 Tuquanbaimeizi	内蒙古兴安盟突泉 Tuquan, Hinggan League, Inner Mongolia	地方品种 Landrace
188	00000503	通辽黑黏糜子 Tongliaoheinianmeizi	内蒙古通辽 Tongliao, Inner Mongolia	地方品种 Landrace
189	00002054	扎旗稷子 Zhaqijizi	内蒙古兴安盟扎旗 Jalaid Banner, Hinggan League, Inner Mongolia	地方品种 Landrace
190	00002064	通辽红散糜 Tongliaohongsanmei	内蒙古通辽 Tongliao, Inner Mongolia	地方品种 Landrace

附表1

附表2

30对荧光SSR引物信息"

引物 Primer name	正向引物 Forword primer (5′-3′)	反向引物 Reverse primer (5′-3′)	5′端修饰 5′ end modification	退火温度 T_m (℃)
RYW2	TTAGGGCTCTCCTGCATCC	CAGCGAGTTCACCGTCAAG	5′6-FAM	56.8
RYW3	GGAGGCGTGACAATAAAAC	GGCGTGAGGTGTTGTTTTT	5′6-FAM	52.5
RYW5	GACGATGCTCTTGACCTTGT	CACCGTGAAATGTCTCTGCT	5′6-FAM	55.0
RYW6	AGCCGATTTGCTGTGGAGT	CTGCCTCCGATGAGTTGGT	5′6-FAM	57.4
RYW8	GGGTCAGAGAATACACAGCG	GTAGGGAAGGAGAAGTGGGT	5′6-FAM	55.9
RYW12	ACCATCCCAGCACAAACCA	TGCCTGAAGGAGAAGAGCG	5′HEX	57.5
RYW16	ATCTCCTCCGCCTTCTAACCC	TGGCAATGGTCGTACAAACT	5′HEX	56.7
RYW17	TCAGCTACTTCGAACGGC	GGATCATGCGATACATTTGG	5′HEX	53.0
RYW20	ACCTCTTGCCGCACACTAC	TTCTACATCCCCGAACCAC	5′HEX	56.2
RYW28	CCAAGGCTGAGCAGAAAGAT	ACAAGGTGAAACCCGAAGC	5′6-FAM	55.4
RYW29	CTTGATTTCTCACGCACCG	TGTCCAGCAGTAGTCGTTCCT	5′6-FAM	56.2
RYW30	TAGCCTTCTTTGCCACCACT	GCCCGTGATGATATTCGAC	5′6-FAM	54.9
RYW40	TGCTCTTCGGCTCTTCTCC	ATCAGCTCATCGTGACCCC	5′6-FAM	57.4
RYW42	AGACACCCTGGGCAACATC	CTGGACTGGGCTTCGTTCT	5′HEX	57.8
RYW43	GGAGATGCTTGCTTGGTTG	CAGGAATCGCAAGGAACAG	5′HEX	54.0
RYW47	TTGTTTTTGCTGCTGCCTC	TGCTGGACTTCTTTTTGCC	5′HEX	53.7
RYW50	CAAGGCAGATAGGGCAAGT	TCGTCTGCTGCTGGTTTGT	5′6-FAM	56.1
RYW52	AGTAGTCCTCCACCGCCAT	CTCTTCCTCGTTCTCGGCT	5′6-FAM	57.8
RYW53	ATGCCTCCGATGTAGATGC	GCCGCCTTCTCTTCATTCT	5′6-FAM	54.9
RYW55	CTGGTGGTGGTAGTTAGCG	TTATGCCACCCACCGTAGC	5′6-FAM	56.9
RYW62	GTTTAGAGAGCAGGAGGCG	AGCCCTGTCCACCCTAATC	5′6-FAM	56.4
RYW67	GAAGGAAACGCACCAGAGT	TTGGGTTTGTGCTTGGAGT	5′6-FAM	54.9
RYW99	CGGAGTTCTTGGTGGCTT	GCGTTCGCCAAAGAGCAT	5′6-FAM	56.1
RYW125	TTGACGACGACTGTGTGC	TGTTGGTGGAGTTGAGGAC	5′6-FAM	55.1
RYW145	CTTTTTCTGCTGCTCCCT	TGATGCCATACCCAACTG	5′6-FAM	52.2
RYW146	TGATGCTTCTTGGGTTCG	CGCCGTCCACTTCTGTAT	5′HEX	53.6
RYW149	CAGGACTTGGGTGATTGC	GAGCGGAGGAGGAAACTA	5′HEX	53.7
RYW156	TTTACAACCCTTCCCGCC	AGGACTTTCCGCCTCTACCC	5′HEX	57.5
RYW158	GGTAGGGTTCAAGGTGGTT	CAGGCAATCTCTTCAGGC	5′6-FAM	54.0
RYW164	AGACAGCCATTCAACCACG	CCATCTCCTCATCCACCA	5′6-FAM	54.6

附表2

表1

表2

图1

图2

图3

图4

表3

3对引物毛细管电泳结果及带型编码"

引物 Primer	电泳条带数目 Polymorphism bands	电泳片段长度及编码 Length and code of electrophoresis fragments (bp)
RYW3	133	101 (001), 101/107/133/154 (002), 101/112 (003), 101/112/123 (004), 101/112/123/195 (005), 101/112/128/133 (006), 101/112/154 (007), 101/118/133/154 (008), 101/118/138/164 (009), 101/118/169 (010), 101/118/175/231 (011), 101/118/195 (012), 101/133 (013), 101/133/175 (014), 101/138/143/164 (015), 101/143/154/195 (016), 101/154 (017), 101/169/242 (018), 101/195 (019), 101/242 (020), 107 (021), 107/112/148/175 (022), 107/112/175/195 (023), 107/118/123/175 (024), 107/118/143/195 (025), 107/118/154 (026), 107/118/154/175 (027), 107/118/164/175 (028), 107/123/133/195 (029), 107/123/195/242 (030), 107/128/138/242 (031), 107/128/154/175 (032), 107/128/154/200 (033), 107/128/195/207 (034), 107/148/175/215/321 (035), 107/154/207 (036), 107/164/195/242 (037), 107/175/195 (038), 107/181/195/242 (039), 107/189 (040), 107/195 (041), 112 (042), 112/118 (043), 112/118/123/154 (044), 112/118/133/164 (045), 112/118/154/195 (046), 112/118/189/195 (047), 112/118/195 (048), 112/123/148/175 (049), 112/123/164/242 (050), 112/128/148/207 (051), 112/133/143/175 (052), 112/133/189/283 (053), 112/138/154/195 (054), 112/138/231 (055), 112/148/164 (056), 112/148/175/195 (057), 112/175/195 (058), 112/175/242/262 (059), 112/195/207/231 (060), 112/200/321 (061), 118 (062), 118/123 (063), 118/123/138/181 (064), 118/123/154/175 (065), 118/123/154/195 (066), 118/128/138/143 (067), 118/128/154/207/242 (068), 118/128/207/242 (069), 118/133/143/207 (070), 118/133/154/169 (071), 118/133/164/175 (072), 118/133/164/207 (073), 118/133/195/242 (074), 118/138/154/169 (075), 118/138/154/200 (076), 118/138/154/207 (077), 118/138/207 (078), 118/154/164 (079), 118/154/195/242 (080), 118/175/189/242 (081), 118/189/215/242 (082), 118/207/236 (083), 118/207/267/321 (084), 123 (085), 123/128/154/175 (086), 123/128/159/169 (087), 123/133 (088), 123/133/159/189 (089), 123/138/148/164 (090), 123/148 (091), 123/148/175/195 (092), 123/148/195/242 (093), 123/154/181/242 (094), 123/175/181/207 (095), 123/175/195 (096), 123/195 (097), 123/195/262 (098), 128 (099), 128/133/148/189 (100), 128/133/175/195 (101), 128/138/181 (102), 128/175 (103), 128/175/207 (104), 128/195/242 (105), 128/321 (106), 133 (107), 133/138/175 (108), 133/143/169/175 (109), 133/148/195/242 (110), 133/154 (111), 133/159/181/195 (112), 133/175 (113), 133/195 (114), 138/148 (115), 138/242 (116), 143 (117), 143/154/195/242 (118), 143/164/195/242 (119), 148/189/321 (120), 154/175/189/242 (121), 154/175/195/242 (122), 154/195 (123), 175/189 (124), 175/195 (125), 175/195/242 (126), 175/207 (127), 181/195 (128), 181/195/242/296 (129), 189/195/242 (130), 195 (131), 207 (132), 242 (133)
RYW6	80	93/99/113/125/150 (001), 93/99/150 (002), 99 (003), 99/106/113/125/150 (004), 99/106/113/131 (005), 99/106/113/150 (006), 99/106/113/203/217 (007), 99/106/118/131/138/150/196 (008), 99/106/119/125/150 (009), 99/106/119/150 (010), 99/106/125 (011), 99/106/125/138/150 (012), 99/106/125/150 (013), 99/106/125/150/156 (014), 99/106/131/150/178 (015), 99/106/150 (016), 99/106/150/160 (017), 99/106/150/184 (018), 99/106/156 (019), 99/113 (020), 99/113/119/150 (021), 99/113/125/150 (022), 99/113/138/150 (023), 99/113/144 (024), 99/113/150 (025), 99/113/150/156 (026), 99/113/150/217 (027), 99/113/160 (028), 99/119 (029), 99/119/125 (030), 99/119/125/150 (031), 99/119/125/150/178 (032), 99/119/138 (033), 99/119/138/150 (034), 99/119/138/160 (035), 99/119/150 (036), 99/119/150/156 (037), 99/119/150/160 (038), 99/119/156 (039), 99/125 (040), 99/125/150 (041), 99/125/150/160 (042), 99/125/150/217 (043), 99/131/150 (044), 99/144/150 (045), 99/150 (046), 99/150/156 (047), 99/150/217 (048), 99/156 (049), 99/165 (050), 106 (051), 106/113/125/150/217 (052), 106/113/144/150 (053), 106/113/150 (054), 106/113/150/156/178 (055), 106/119 (056), 106/119/138/160 (057), 106/119/150 (058), 106/125/150 (059), 106/125/150/156 (060), 106/125/156 (061), 106/138/150 (062), 106/144 (063), 106/144/150 (064), 106/144/156 (065), 106/150 (066), 106/150/160 (067), 106/150/171 (068), 106/150/211/217 (069), 106/156 (070), 113/125/150 (071), 113/150 (072), 113/150/156 (073), 113/150/217 (074), 119/150 (075), 125/150 (076), 125/203 (077), 138/150 (078), 150 (079), 150/155 (080)
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表3

图5

图6

附图1

参考文献 39

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	N_a	N_e	I	H_o	H_e	Nei	PIC
荧光RYW3	19	5.4728	2.0851	0.9524	0.8194	0.8173	0.8656
荧光RYW6	27	15.8922	2.9457	0.7529	0.9398	0.9371	0.9722
荧光RYW28	27	7.5756	2.4382	0.9574	0.8703	0.8680	0.9216
合计Total	73	—	—	—	—	—	—
平均 Mean	24.3333	9.6469	2.4896	0.8876	0.8765	0.8741	0.9198
RYW3	3	2.8443	1.0705	0.6505	0.6484	0.6484	0.7658
RYW6	3	2.9044	1.0824	0.6579	0.6557	0.6557	0.8200
RYW28	3	2.9056	1.0815	0.658	0.6558	0.6558	0.8221
合计Total	9	—	—	—	—	—	—
平均 Mean	3	2.8848	1.0782	0.6554	0.6533	0.6533	0.8026

东北春播区糜子核心种质的荧光微卫星标记鉴定

Core germplasm identification of proso millet in spring sowing area of Northeast China using fluorescent microsatellite markers

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引物/组合 Primer/combination	区分种质数 Number of distinguished germplasms	区分率 Discrimination rate (%)
RYW3	60	31.58
RYW6	122	64.21
RYW28	95	50.00
RYW3+RYW6	182	95.79
RYW3+RYW6+RYW28	190	100.00

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