Please wait a minute...
欢迎访问作物学报,今天是
图/表 详细信息
甘薯PHB基因家族的全基因组鉴定和表达分析
梅玉琴, 刘意, 王崇, 雷剑, 朱国鹏, 杨新笋
作物学报    2023, 49 (6): 1715-1725.   DOI: 10.3724/SP.J.1006.2023.24142
摘要   (386 HTML42 PDF(pc) (2453KB)(450)  

蛋白质抑制素(prohibitin, PHB)是在原核生物到真核生物中发现的含有SPFH结构域的蛋白质。植物PHB基因家族参与多种不同生物过程的重要功能, 包括生长发育以及对生物和非生物胁迫的响应。目前PHB蛋白在拟南芥、水稻、玉米、大豆、番茄和陆地棉等多种植物中被鉴定。但对甘薯中PHB家族的系统分析仍未确定。本研究鉴定出甘薯11个PHB基因, 且对这些保守的蛋白质基序和基因结构的分析显示它们在系统发育亚群中具有高度的保守性。此外, 启动子区域预测出与多种激素调节及胁迫相关的顺式作用元件, 同时研究发现IbPHB基因在植物不同部位及受到不同的非生物胁迫时的表达模式存在差异。本研究系统分析了甘薯中IbPHB基因的一般特性, 为甘薯及其他植物中PHB基因的功能特性研究提供了理论基础。



View image in article
图2 甘薯PHB基因家族在染色体上的分布
正文中引用本图/表的段落
将甘薯11个IbPHB家族基因与拟南芥PHB基因家族的蛋白质序列构建系统发育进化树, 如图1所示, 进化树中聚类关系可以反映基因功能的相似程度, 基因功能相似则聚类关系近。根据进化树聚类关系以及基因在染色体上的位置(图2), 将甘薯IbPHB家族的11个基因分别命名为IbPHB1~IbPHB11
本文的其它图/表