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甘薯PHB基因家族的全基因组鉴定和表达分析
梅玉琴, 刘意, 王崇, 雷剑, 朱国鹏, 杨新笋
作物学报    2023, 49 (6): 1715-1725.   DOI: 10.3724/SP.J.1006.2023.24142
摘要   (386 HTML42 PDF(pc) (2453KB)(450)  

蛋白质抑制素(prohibitin, PHB)是在原核生物到真核生物中发现的含有SPFH结构域的蛋白质。植物PHB基因家族参与多种不同生物过程的重要功能, 包括生长发育以及对生物和非生物胁迫的响应。目前PHB蛋白在拟南芥、水稻、玉米、大豆、番茄和陆地棉等多种植物中被鉴定。但对甘薯中PHB家族的系统分析仍未确定。本研究鉴定出甘薯11个PHB基因, 且对这些保守的蛋白质基序和基因结构的分析显示它们在系统发育亚群中具有高度的保守性。此外, 启动子区域预测出与多种激素调节及胁迫相关的顺式作用元件, 同时研究发现IbPHB基因在植物不同部位及受到不同的非生物胁迫时的表达模式存在差异。本研究系统分析了甘薯中IbPHB基因的一般特性, 为甘薯及其他植物中PHB基因的功能特性研究提供了理论基础。



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图5 IbPHB基因家族的组织特异性表达分析
图中标以不同字母表示数据间在0.05概率水平差异显著。
正文中引用本图/表的段落
由图5可知, IbPHB基因的表达具有组织特异性, 除IbPHB3IbPHB5IbPHB9IbPHB10外, 其他基因在甘薯叶片中的表达量最高。IbPHB1IbPHB7在茎中的表达量高于根, 其他IbPHB基因则是在根中的表达量高于茎。IbPHB3IbPHB5IbPHB9IbPHB10的表达量均为根>茎>叶, IbPHB1在茎和根中的表达量约为叶片中的1/15, IbPHB2在茎和根中的表达量约为叶片中的1/4, IbPHB4在茎和根中的表达量约为叶片中的1/8, IbPHB6在茎和根中的表达量约为叶片中的1/6, IbPHB7在茎和根中的表达量约为叶片中的1/12, IbPHB8在茎和根中的表达量约为叶片中的1/10, IbPHB11在茎和根中的表达量约为叶片中的1/7。
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