甘薯PHB基因家族的全基因组鉴定和表达分析 作物学报    2023, 49 (6): 1715-1725.   DOI: 10.3724/SP.J.1006.2023.24142

图4 甘薯PHB基因家族启动子预测

正文中引用本图/表的段落

利用PlantCARE网站对IbPHB基因家族基因启动子进行顺式作用元件预测分析(图4)发现, 11个IbPHB基因家族成员的启动子序列中, 除真核生物基因转录最基本的元件TATA-box、CAAT-box外, 还含有光响应元件(AE-box、CAG-motif、G-box、GA-motif、GATA-motif、GT1-motif、Gap-box、I-box、TCT-motif等)、逆境响应元件(干旱诱导元件MBS、厌氧诱导元件ARE、低温响应元件LTR、防御和应激反应元件TC-rich repeats等)、激素响应元件(脱落酸响应元件ABRE、生长素响应元件AuxRR-core和TGA-element、赤霉素响应元件GARE- motif、水杨酸响应元件TCA-element、茉莉酸甲酯响应元件CGTCA-motif和TGACG-motif等)和生长发育调节元件(AACA_motif、GCN4_motif、AACA-motif、HD-Zip1、O2-site)。表明, IbPHB基因与甘薯的生长发育和生物及非生物胁迫等生物过程密切相关, 它的转录表达调控与多种因素有关, 这些顺式作用元件能够响应外界环境的变化, 从而调控IbPHB基因的表达。

本文的其它图/表

• 表1 试验所用引物
  
• 表2 甘薯PHB基因家族
  
• 图1 甘薯和拟南芥的PHB基因家族蛋白系统发育树
  
• 图2 甘薯PHB基因家族在染色体上的分布
  
• 图3 甘薯PHB基因家族进化树与基因结构
  A: 甘薯PHB家族基因系统进化树; B: IbPHB保守基序; C: 保守结构域分布。
  
• 图5 IbPHB基因家族的组织特异性表达分析
  图中标以不同字母表示数据间在0.05概率水平差异显著。
  
• 图6 IbPHB基因家族响应高盐胁迫表达分析
  图中标以不同字母表示数据间在0.05概率水平差异显著。
  
• 图7 IbPHB基因家族响应干旱胁迫表达分析
  图中标以不同字母表示数据间在0.05概率水平差异显著。