基于株高性状的玉米EST序列与水稻基因组的比较研究

作物学报 ›› 2004, Vol. 30 ›› Issue (07): 657-667.

基于株高性状的玉米EST序列与水稻基因组的比较研究

严建兵;王毅;汤华;黄益勤;李建生;郑用琏

华中农业大学作物遗传改良国家重点实验室和国家作物分子育种中心，湖北武汉 430070

收稿日期:2003-11-17 修回日期:2004-02-25 出版日期:2004-07-12 网络出版日期:2004-07-12
通讯作者: 郑用琏

Comparative Analyses between EST Sequences Concerning Plant Height of Maize and Sequences of Rice Genome Database

YAN Jian-Bing;WANG Yi;TANG Hua; HUANG Yi-Qin; LI Jian-Sheng;ZHENG Yong-Lian

National Key Laboratory of Crop Genetic Improvement and National Center of Crop Molecular Breeding, Huazhong Agricultural University, Wuhan 430070, Hubei

Received:2003-11-17 Revised:2004-02-25 Published:2004-07-12 Published online:2004-07-12
Contact: ZHENG Yong-Lian

摘要/Abstract

摘要： 从已公布的玉米分子标记中，挑选出均匀覆盖玉米全基因组、平均间距小于10 cM的224个SSR和RFLP分子标记，从NCBI上查找这些标记所在的玉米EST或基因的原始序列，逐一与水稻数据库的序列信息进行同源性比较。结果表明：在PN<1e-5水平上，从水稻数据库中共找到16 939段同源序列，平均每段玉米的序列可以在水稻数据库中找到75.6

关键词: 玉米, 分子标记, 比较基因组, 水稻数据库

Abstract: Homologic comparisons were investigated between EST or genetic sequences of maize searched from NCBI, which corresponded to 224 of SSR and RFLP markers covering whole maize genome with average distance about 10 cM, and sequences searched from rice genome database. By BLASTn, 16 939 sequences from r

Key words: Maize, Molecular marker, Comparative genome, Rice database

中图分类号:

S513

严建兵;王毅;汤华;黄益勤;李建生;郑用琏. 基于株高性状的玉米EST序列与水稻基因组的比较研究[J]. 作物学报, 2004, 30(07): 657-667.

YAN Jian-Bing;WANG Yi;TANG Hua; HUANG Yi-Qin; LI Jian-Sheng;ZHENG Yong-Lian. Comparative Analyses between EST Sequences Concerning Plant Height of Maize and Sequences of Rice Genome Database[J]. Acta Agron Sin, 2004, 30(07): 657-667.

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