欢迎访问作物学报,今天是

作物学报 ›› 2008, Vol. 34 ›› Issue (04): 551-556.doi: 10.3724/SP.J.1006.2008.00551

• 作物遗传育种·种质资源·分子遗传学 • 上一篇    下一篇

水稻种子耐低温发芽力的QTL定位及上位性分析

纪素兰1;江玲1;王益华1;刘世家1;刘喜1;翟虎渠2;吉村醇3;万建民1,2,*   

  1. 1 南京农业大学作物遗传与种质创新国家重点实验室, 江苏南京210095; 2 中国农业科学院作物科学研究所, 北京100081; 3日本国立九州大学农学部, 日本福冈 812-8581
  • 收稿日期:2007-09-17 修回日期:1900-01-01 出版日期:2008-04-12 网络出版日期:2008-04-12
  • 通讯作者: 万建民

QTL and Epistasis for Low Temperature Germinability in Rice

JI Su-Lan1,JIANG Ling1,WANG Yi-Hua1,LIU Shi-Jia1,LIU Xi1,ZHAI Hu-Qu2,YOSHIMURA Atsushi3,WAN Jian-Min12*   

  1. 1 State Key Laboratory for Crop Genetics & Germplasm Enhancement, Nanjing Agricultural University, Nanjing 210095, Jiangsu; 2 Institute of Crop Sciences, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Beijing 100081, China; 3 Faculty of Agriculture, Kyushu University, Fukuoka 812-8581, Japan
  • Received:2007-09-17 Revised:1900-01-01 Published:2008-04-12 Published online:2008-04-12
  • Contact: WAN Jian-Min

摘要: 利用种植在不同环境[南京(2002)、海南(2002—2003)、南京(2003)]下的Kinmaze/DV85重组自交系(RILs)群体, 对水稻种子萌发第10天的低温发芽力进行QTL分析。利用QTL mapping 2.0软件共检测到11个QTL, 其中qLTG-7和qLTG-11可在3个环境中稳定表达, 且最大贡献率均达到27.93%, 增强低温发芽的基因分别来自Kinmaze和DV85。与前人的研究比较发现, 这2个QTL可以在不同环境下和遗传背景中稳定表达。进一步上位性分析的结果表明, qLTG-11并不参与上位性互作, 而qLTG-7虽参与互作但其贡献率较小。1

关键词: 水稻, RIL群体, 低温发芽力, QTL

Abstract: High germination ability at relatively low temperature is essential for direct-seeding rice varieties. A recombinant inbred line population (RILs), derived from a cross between varieties Kinmaze (japonica) and DV85 (indica) was used to detect QTL for low temperature germinability (LTG). The germination rate at 15℃ after 10 d germination culture in Nanjing, Jiangsu Province, and in Lingshui, Hainan Province, in 2002 and in Nanjing in 2003 was taken as LTG indicator. A total of 11 QTL on
chromosomes 2, 5, 7, 8, 11, and 12 were detected in the above three seed production environments. Of these, QTL on
chromosomes 7 and 11 mapped in similar genomic regions in all experiments and the maximum percentage of phenotypic variation explained (PVE) by each QTL was 27.93%, while epistatic interaction had slightly low PVE.

Key words: Rice, RIL population, Low temperature germinability, QTL analysis

[1] 郑玉珍, 齐飞艳, 孙子淇, 刘华, 秦利, 石磊, 王娟, 汪蒙蒙, 韩锁义, 徐静, 苗利娟, 黄冰艳, 董文召, 郑峥, 张新友. 花生籽仁总超长链脂肪酸和7种脂肪酸组分的QTL定位[J]. 作物学报, 2026, 52(6): 1646-1657.
[2] 胡赵, 钱润, 谢丰璞, 应素平. 水稻SPX基因家族鉴定及响应磷处理的表达分析[J]. 作物学报, 2026, 52(6): 1902-1912.
[3] 邹仪妹, 徐敏, 汪海洋, 姚辉, 王加峰, 刘浩, 任代胜. 两系不育系水稻幼苗根系响应盐胁迫的转录因子调控网络鉴定[J]. 作物学报, 2026, 52(6): 1728-1742.
[4] 闫安, 蒋昆炜, 王蓉圆, 田林, 张璐, 王韵, 徐建龙. 水稻剑叶小维管束数基因SVN7的鉴定与克隆[J]. 作物学报, 2026, 52(5): 1364-1372.
[5] 陈伟, 卫万娟, 赵其兵, 常东伟, 余凌波, 翟鹏飞, 冯志明, 陈宗祥, 任仰涛, 杨鹏, 刘海浪, 李珍富, 杨永乐, 金彦刚, 左示敏. 利用CRISPR/Cas9编辑Hd6基因创制优质早熟水稻新种质[J]. 作物学报, 2026, 52(4): 1046-1056.
[6] 石少阶, 刘凯, 陈姿夷, 王卉颖, 李三和, 周雷, 游艾青. 水稻矮化多分蘖基因DMT1的克隆与功能分析[J]. 作物学报, 2026, 52(4): 1022-1034.
[7] 覃奕琰, 付瑶, 苏畅, 李娜, 徐静茹, 程笑然, 张琪, 赵明辉. OsST41调控水稻苗期耐盐性的功能分析[J]. 作物学报, 2026, 52(3): 802-812.
[8] 刘长友, 王珅, 时会影, 沈颖超, 孙蕾, 王彦, 张志肖, 苏秋竹, 田静, 范保杰. 基于饭豆基因资源的小豆远缘杂交群体抗豆象QTL定位[J]. 作物学报, 2026, 52(3): 936-944.
[9] 叶凡, 李帅, 李思宇, 陈云, 窦超银, 刘立军. 不同节水灌溉方式对东北稻区水稻产量和群体质量的影响[J]. 作物学报, 2026, 52(3): 895-907.
[10] 王婵, 吴莹莹, 李文奇, 李霞, 王芳权, 周彤, 杨杰. 基于HRM技术开发水稻抗条纹叶枯病基因STV11功能标记[J]. 作物学报, 2025, 51(9): 2547-2556.
[11] 张飞飞, 何万龙, 焦文娟, 白斌, 耿洪伟, 程宇坤. 小麦抗条锈病相关性状元分析及候选基因分析[J]. 作物学报, 2025, 51(8): 2111-2127.
[12] 陈惠莹, 何嘉欣, 朱斌, 黄士轩, 周星佑, 伍君权, 杨美艳. 水稻黄单胞菌噬菌体vB_XaS_HDB2的全基因组分析和生物学特性研究[J]. 作物学报, 2025, 51(8): 2087-2099.
[13] 胡蒙, 沙丹, 张晟瑞, 谷勇哲, 张世碧, 李静, 孙君明, 邱丽娟, 李斌. 大豆分枝数QTL定位及候选基因筛选[J]. 作物学报, 2025, 51(7): 1747-1756.
[14] 邵顺伟, 陈卓, 兰振东, 蔡兴奎, 邹华芬, 李晨曦, 唐景华, 朱熙, 张彧, 董建科, 金辉, 宋波涛. 基于BSA-seq技术的块茎芽眼深度QTL定位分析[J]. 作物学报, 2025, 51(7): 1725-1735.
[15] 杨海洋, 吴林宣, 李博纹, 石翰峰, 袁禧龙, 刘金朝, 蔡海荣, 陈诗怡, 郭涛, 王慧. 基于QTL定位发现的OsWRI3调控水稻种子的落粒性[J]. 作物学报, 2025, 51(7): 1712-1724.
Viewed
Full text


Abstract

Cited

  Shared   
  Discussed   
No Suggested Reading articles found!