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Acta Agronomica Sinica ›› 2021, Vol. 47 ›› Issue (3): 438-450.doi: 10.3724/SP.J.1006.2021.04063

• CROP GENETICS & BREEDING·GERMPLASM RESOURCES·MOLECULAR GENETICS • Previous Articles     Next Articles

Association analysis of drought tolerance traits of upland cotton accessions (Gossypium hirsutum L.)

HAN Bei1(), WANG Xu-Wen2(), LI Bao-Qi1, YU Yu2, TIAN Qin2,*(), YANG Xi-Yan1,*()   

  1. 1National Key Laboratory of Crop Genetic Improvement, Huazhong Agricultural University, Wuhan 430070, Hubei, China
    2Cotton Institute, Xinjiang Academy of Agricultural and Reclamation Science Xinjiang Academy of Agricultural and Reclamation Science / Northwest Inland Region Key Laboratory of Cotton Biology and Genetic Breeding (Xinjiang), Ministry of Agriculture and Rural Affairs, Shihezi 832000, Xinjiang, China
  • Received:2020-03-12 Accepted:2020-10-14 Online:2021-03-12 Published:2020-11-20
  • Contact: TIAN Qin,YANG Xi-Yan E-mail:bhan_z@163.com;wxw629@163.com;tq2005@126.com;yxy@mail.hzau.edu.cn
  • Supported by:
    National Natural Science Foundation of China(31560410);Innovation Team in Key Fields of Xin- jiang Production and Construction Corps(2017CB011)

Abstract:

Drought stress is an important factor that leads to severe reduction in cotton fiber yield and quality worldwide, and new cotton varieties with high-yield, high-quality and drought-tolerant characteristics have been the goal for cotton breeding. In this study, 217 upland cotton accessions were selected for drought stress experiments and association study. The drought stress treatment panels were supplied with 50% the water volume of the controls, until the seedlings emerged. A total of 18 traits including agronomic traits, fiber yield indices and fiber quality indices, were investigated at two locations and for two years. After drought stress, there were significant differences in response between populations, and significant differences in phenotypic traits between control and treatments. The phenotypic data were analyzed by BLUP, and the drought resistance coefficient of each trait was calculated. A total of 393 loci were detected by 214 SSR marker in the tested cotton accessions. The average gene diversity coefficient was 0.402, with the range of 0.072-0.631; and the average PIC value was 0.329, ranging from 0.070 to 0.560. Genetic structure analysis showed that the group could be divided into two subgroups and it had no obvious correspondence with geographical origin. There were detected extremely 76 significant loci (P < 0.01), with explanation rate ranging from 2.931% to 7.218%, by association study using drought resistance coefficient (DRC) of 18 traits. Fourteen SSR marker could be detected by two or more traits at the same time. These results could provide a theoretical basis and reference for the parents selection and drought-resistant molecular marker-assisted breeding in cotton.

Key words: upland cotton accessions, drought resistance, drought resistance coefficient, SSR maker, association analysis

Table s1

Table S1 Germplasm number and population structure division"

材料编号
Germplasm number
品种名称
Cultivar name
地理来源
Geographic origin
生态区分布
Ecological division
群体结构划分
Population structure division
YU004 中棉所35 Zhongmiansuo 35 中国河南 Henan, China 中国黄河流域棉区 YRR Pop1
YU075 99B 99B 美国 America 美国 USA Pop1
YU081 SGK 321 SGK 321 中国河北 Hebei, China 中国黄河流域棉区 YRR Pop1
YU099 中棉所30 Zhongmiansuo 30 中国河南 Henan, China 中国黄河流域棉区 YRR Pop1
YU127 新陆早10号 Xinluzao 10 中国新疆 Xinjiang, China 中国西北内陆棉区 NIR Pop1
YU129 新陆早12号 Xinluzao 12 中国新疆 Xinjiang, China 中国西北内陆棉区 NIR Pop1
YU134 新陆早18号 Xinluzao 18 中国新疆 Xinjiang, China 中国西北内陆棉区 NIR Pop1
YU137 新陆早21号 Xinluzao 21 中国新疆 Xinjiang, China 中国西北内陆棉区 NIR Pop1
YU141 新陆早25号 Xinluzao 25 中国新疆 Xinjiang, China 中国西北内陆棉区 NIR Pop1
YU152 新陆早37号 Xinluzao 37 中国新疆 Xinjiang, China 中国西北内陆棉区 NIR Pop1
YU163 新陆早50号 Xinluzao 50 中国新疆 Xinjiang, China 中国西北内陆棉区 NIR Pop1
YU176 新陆中12 Xinluzhong 12 中国新疆 Xinjiang, China 中国西北内陆棉区 NIR Pop1
YU177 新陆中13 Xinluzhong 13 中国新疆 Xinjiang, China 中国西北内陆棉区 NIR Pop1
YU179 新陆中15 Xinluzhong 15 中国新疆 Xinjiang, China 中国西北内陆棉区 NIR Pop1
YU180 新陆中16 Xinluzhong 16 中国新疆 Xinjiang, China 中国西北内陆棉区 NIR Pop1
YU181 新陆中17 Xinluzhong 17 中国新疆 Xinjiang, China 中国西北内陆棉区 NIR Pop1
YU187 新陆中23 Xinluzhong 23 中国新疆 Xinjiang, China 中国西北内陆棉区 NIR Pop1
YU193 新陆中30 Xinluzhong 30 中国新疆 Xinjiang, China 中国西北内陆棉区 NIR Pop1
YU213 惠和28号 Huihe 28 中国新疆 Xinjiang, China 中国西北内陆棉区 NIR Pop1
YU270 中棉所50 Zhongmiansuo 50 中国河南 Henan, China 中国黄河流域棉区 YRR Pop1
YU275 晋中200 Jinzhong 200 中国山西 Shanxi, China 中国黄河流域棉区 YRR Pop1
YU291 鄂棉24 Emian 24 中国湖北 Hubei, China 中国长江流域棉区 YtRR Pop1
YU292 银山4号 Yinshan 4 中国河南 Henan, China 中国黄河流域棉区 YRR Pop1
YU293 中棉所12 Zhongmiansuo 12 中国河南 Henan, China 中国黄河流域棉区 YRR Pop1
YU294 鄂荆1号 Ejin 1 中国湖北 Hubei, China 中国长江流域棉区 YtRR Pop1
YU295 泗棉3号 Simian 3 中国江苏 Jiangsu, China 中国长江流域棉区 YtRR Pop1
YU296 鲁棉6号 Lumian 6 中国山东 Shandong, China 中国黄河流域棉区 YRR Pop1
YU297 鲁棉9号 Lumian 9 中国山东 Shandong, China 中国黄河流域棉区 YRR Pop1
YU298 斯字棉4B Sizimian 4B 美国 America 美国 USA Pop1
YU299 晋棉28号 Jinmian 28 中国山西 Shanxi, China 中国黄河流域棉区 YRR Pop1
YU300 晋棉36号 Jinmian 36 中国山西 Shanxi, China 中国黄河流域棉区 YRR Pop1
YU301 冀棉8号 Jimian 8 中国河北 Hebei, China 中国黄河流域棉区 YRR Pop1
YU302 冀棉10号 Jimian 10 中国河北 Hebei, China 中国黄河流域棉区 YRR Pop1
YU303 冀棉11号 Jimian 11 中国河北 Hebei, China 中国黄河流域棉区 YRR Pop1
YU304 冀棉12号 Jimian 12 中国河北 Hebei, China 中国黄河流域棉区 YRR Pop1
YU305 冀棉228 Jimian 228 中国河北 Hebei, China 中国黄河流域棉区 YRR Pop1
YU306 冀合321 Jihe 321 中国河北 Hebei, China 中国黄河流域棉区 YRR Pop1
YU307 豫棉4号 Yumian 4 中国河南 Henan, China 中国黄河流域棉区 YRR Pop1
YU308 豫棉11号 Yumian 11 中国河南 Henan, China 中国黄河流域棉区 YRR Pop1
YU309 鄂棉16号 Emian 16 中国湖北 Hubei, China 中国长江流域棉区 YtRR Pop1
YU310 鄂棉17号 Emian 17 中国湖北 Hubei, China 中国长江流域棉区 YtRR Pop1
YU311 鄂棉21号 Emian 21 中国湖北 Hubei, China 中国长江流域棉区 YtRR Pop1
YU312 苏棉4号 Sumian 4 中国江苏 Jiangsu, China 中国长江流域棉区 YtRR Pop1
YU313 鄂抗棉2号 Ekangmian 2 中国湖北 Hubei, China 中国长江流域棉区 YtRR Pop1
YU314 鄂抗棉3号 Ekangmian 3 中国湖北 Hubei, China 中国长江流域棉区 YtRR Pop1
YU315 鄂抗棉6号 Ekangmian 6 中国湖北 Hubei, China 中国长江流域棉区 YtRR Pop1
YU317 徐州142 Xuzhou 142 中国江苏 Jiangsu, China 中国长江流域棉区 YtRR Pop1
YU318 苏棉9号 Sumian 9 中国江苏 Jiangsu, China 中国长江流域棉区 YtRR Pop1
YU319 苏棉12号 Sumian 12 中国江苏 Jiangsu, China 中国长江流域棉区 YtRR Pop1
YU320 苏抗191 Sukang 191 中国江苏 Jiangsu, China 中国长江流域棉区 YtRR Pop1
YU322 冈棉2号 Gangmian 2 中国湖北 Hubei, China 中国长江流域棉区 YtRR Pop1
YU323 珂字201 Kezi 201 美国 America 美国 USA Pop1
YU324 珂字312 Kezi 312 美国 America 美国 USA Pop1
YU325 陕401 Shaan 401 中国陕西 Shaanxi, China 中国黄河流域棉区 YRR Pop1
YU326 岱字棉15号 Daizimian 15 美国 America 美国 USA Pop1
YU327 岱红岱 Daihongdai 美国 America 美国 USA Pop1
YU328 荆1246 Jin 1246 中国湖北 Hubei, China 中国长江流域棉区 YtRR Pop1
YU329 荆楚201 Jinchu 201 中国湖北 Hubei, China 中国长江流域棉区 YtRR Pop1
YU331 八一棉 Bayimian 中国湖北 Hubei, China 中国长江流域棉区 YtRR Pop1
YU332 渤棉1号 Bomian 1 中国山东 Shandong, China 中国黄河流域棉区 YRR Pop1
YU333 洞庭1号 Dongting 1 中国湖南 Hunan, China 中国长江流域棉区 YtRR Pop1
YU334 孝棉1号 Xiaomian 1 中国湖北 Hubei, China 中国长江流域棉区 YtRR Pop1
YU336 宛棉3号 Wanmian 3 中国河南 Henan, China 中国黄河流域棉区 YRR Pop1
YU337 科棉4号 Kemian 4 中国江苏 Jiangsu, China 中国长江流域棉区 YtRR Pop1
YU338 南通5号 Nantong 5 中国江苏 Jiangsu, China 中国长江流域棉区 YtRR Pop1
YU339 赣棉11号 Ganmian 11 中国江西 Jiangxi, China 中国长江流域棉区 YtRR Pop1
YU340 赣棉12号 Ganmian 12 中国江西 Jiangxi, China 中国长江流域棉区 YtRR Pop1
YU341 湘棉13 Xiangmian 13 中国湖南 Hunan, China 中国长江流域棉区 YtRR Pop1
YU342 新棉33B Xinmian 33B 美国 America 美国 USA Pop1
YU343 沪棉204 Humian 204 中国上海 Shanghai, China 中国长江流域棉区 YtRR Pop1
YU348 鸡脚德字棉 Jijiaodezimian 美国 America 美国 USA Pop1
YU349 中棉所2 Zhongmiansuo 2 中国河南 Henan, China 中国黄河流域棉区 YRR Pop1
YU350 中棉所3号 Zhongmiansuo 3 中国河南 Henan, China 中国黄河流域棉区 YRR Pop1
YU352 中棉所21 Zhongmiansuo 21 中国河南 Henan, China 中国黄河流域棉区 YRR Pop1
YU353 中棉所43 Zhongmiansuo 43 中国河南 Henan, China 中国黄河流域棉区 YRR Pop1
YU354 中棉所69 Zhongmiansuo 69 中国河南 Henan, China 中国黄河流域棉区 YRR Pop1
YU355 中棉所79 Zhongmiansuo 79 中国河南 Henan, China 中国黄河流域棉区 YRR Pop1
YU356 中棉所8010 Zhongmiansuo 8010 中国河南 Henan, China 中国黄河流域棉区 YRR Pop1
YU360 DP99B DP99B 美国 America 美国 USA Pop1
YU361 NC20B NC20B 美国 America 美国 USA Pop1
YU363 北农1号 Beinong 1 中国河北 Hebei, China 中国黄河流域棉区 YRR Pop1
YU367 德字棉531 Dezimian 531 中国山东 Shandong, China 中国黄河流域棉区 YRR Pop1
YU368 敦棉1号 Dunmian 1 中国甘肃 Gansu, China 中国西北内陆棉区 NIR Pop1
YU371 赣棉3号 Ganmian 3 中国江西 Jiangxi, China 中国长江流域棉区 YtRR Pop1
YU372 赣棉13 Ganmian 13 中国江西 Jiangxi, China 中国长江流域棉区 YtRR Pop1
YU373 赣棉47 Ganmian 47 中国江西 Jiangxi, China 中国长江流域棉区 YtRR Pop1
YU374 关农1号 Guannong 1 中国辽宁 Liaoning, China 中国北方特早熟棉区 NSEMR Pop1
YU375 光叶岱字棉 Guangyedaizimian 美国 America 美国 USA Pop1
YU376 邯棉885 Hanmian 885 中国河北 Hebei, China 中国黄河流域棉区 YRR Pop1
YU378 冀棉1号 Jimian 1 中国河北 Hebei, China 中国黄河流域棉区 YRR Pop1
YU379 冀棉19 Jimian 19 中国河北 Hebei, China 中国黄河流域棉区 YRR Pop1
YU380 冀棉25 Jimian 25 中国河北 Hebei, China 中国黄河流域棉区 YRR Pop1
YU382 晋棉3号 Jinmian 3 中国山西 Shanxi, China 中国黄河流域棉区 YRR Pop1
YU384 晋棉29 Jinmian 29 中国山西 Shanxi, China 中国黄河流域棉区 YRR Pop1
YU385 晋棉38 Jinmian 38 中国山西 Shanxi, China 中国黄河流域棉区 YRR Pop1
YU387 科遗181 Keyi 181 中国河北 Hebei, China 中国黄河流域棉区 YRR Pop1
YU388 克克1543 Keke 1543 前苏联
Former Soviet Union
前苏联 SU Pop1
YU391 鲁棉研28 Lumianyan 28 中国山东 Shandong, China 中国黄河流域棉区 YRR Pop1
YU392 鲁棉研32 Lumianyan32 中国山东 Shandong, China 中国黄河流域棉区 YRR Pop1
YU393 宁棉1号 Ningmian 1 中国江苏 Jiangsu, China 中国长江流域棉区 YtRR Pop1
YU394 宁棉12 Ningmian 12 中国江苏 Jiangsu, China 中国长江流域棉区 YtRR Pop1
YU395 宁棉22 Ningmian 22 中国江苏 Jiangsu, China 中国长江流域棉区 YtRR Pop1
YU396 农大94-7 Nongda 99-7 中国河北 Hebei, China 中国黄河流域棉区 YRR Pop1
YU397 农大棉8号 Nongdamian 8 中国河北 Hebei, China 中国黄河流域棉区 YRR Pop1
YU398 黔农465 Qiannong 465 中国贵州 Guizhou, China 中国南方棉区 SCR Pop1
YU399 蜀棉1号 Sumian 1 中国四川 Sichuan, China 中国长江流域棉区 YtRR Pop1
YU404 江苏棉1号 Jiangsumian 1 中国江苏 Jiangsu, China 中国长江流域棉区 YtRR Pop1
YU411 徐州58 Xuzhou 58 中国江苏 Jiangsu, China 中国长江流域棉区 YtRR Pop1
YU412 徐州219 Xuzhou 219 中国江苏 Jiangsu, China 中国长江流域棉区 YtRR Pop1
YU030 中棉所36 Zhongmiansuo36 中国河南 Henan, China 中国黄河流域棉区 YRR Pop2
YU032 渝棉1号 Yumian 1 中国重庆
Chongqing, China
中国长江流域棉区 YtRR Pop2
YU033 辽棉10号 Liaomian 10 中国辽宁 Liaoning, China 中国北方特早熟棉区 NSEMR Pop2
YU034 辽棉15号 Liaomian 15 中国辽宁 Liaoning, China 中国北方特早熟棉区 NSEMR Pop2
YU042 中棉所27 Zhongmiansuo 27 中国河南 Henan, China 中国黄河流域棉区 YRR Pop2
YU051 9456D 9456D 中国新疆 Xinjiang, China 中国西北内陆棉区 NIR Pop2
YU054 系9 Xi 9 中国新疆 Xinjiang, China 中国西北内陆棉区 NIR Pop2
YU062 602 602 不详 Unknown 不详 Unknown Pop2
YU097 GK26 GK26 不详 Unknown 不详 Unknown Pop2
YU100 中棉所41 Zhongmiansuo 41 中国河南 Henan, China 中国黄河流域棉区 YRR Pop2
YU101 鄂抗虫棉1号 Ekangchongmian 1 中国湖北 Hubei, China 中国长江流域棉区 YtRR Pop2
YU118 新陆早1号 Xinluzao 1 中国新疆 Xinjiang, China 中国西北内陆棉区 NIR Pop2
YU119 新陆早2号 Xinluzao 2 中国新疆 Xinjiang, China 中国西北内陆棉区 NIR Pop2
YU120 新陆早3号 Xinluzao 3 中国新疆 Xinjiang, China 中国西北内陆棉区 NIR Pop2
YU121 新陆早4号 Xinluzao 4 中国新疆 Xinjiang, China 中国西北内陆棉区 NIR Pop2
YU122 新陆早5号 Xinluzao 5 中国新疆 Xinjiang, China 中国西北内陆棉区 NIR Pop2
YU123 新陆早6号 Xinluzao 6 中国新疆 Xinjiang, China 中国西北内陆棉区 NIR Pop2
YU124 新陆早7号 Xinluzao 7 中国新疆 Xinjiang, China 中国西北内陆棉区 NIR Pop2
YU125 新陆早8号 Xinluzao 8 中国新疆 Xinjiang, China 中国西北内陆棉区 NIR Pop2
YU126 新陆早9号 Xinluzao 9 中国新疆 Xinjiang, China 中国西北内陆棉区 NIR Pop2
YU128 新陆早11 Xinluzao 11 中国新疆 Xinjiang, China 中国西北内陆棉区 NIR Pop2
YU130 新陆早13号 Xinluzao 13 中国新疆 Xinjiang, China 中国西北内陆棉区 NIR Pop2
YU131 新陆早15号 Xinluzao 15 中国新疆 Xinjiang, China 中国西北内陆棉区 NIR Pop2
YU132 新陆早16 Xinluzao 16 中国新疆 Xinjiang, China 中国西北内陆棉区 NIR Pop2
YU133 新陆早17号 Xinluzao 17 中国新疆 Xinjiang, China 中国西北内陆棉区 NIR Pop2
YU135 新陆早19 Xinluzao 19 中国新疆 Xinjiang, China 中国西北内陆棉区 NIR Pop2
YU136 新陆早20 Xinluzao 20 中国新疆 Xinjiang, China 中国西北内陆棉区 NIR Pop2
YU139 新陆早23 Xinluzao 23 中国新疆 Xinjiang, China 中国西北内陆棉区 NIR Pop2
YU140 新陆早24号 Xinluzao 24 中国新疆 Xinjiang, China 中国西北内陆棉区 NIR Pop2
YU142 新陆早26号 Xinluzao 26 中国新疆 Xinjiang, China 中国西北内陆棉区 NIR Pop2
YU143 新陆早27号 Xinluzao 27 中国新疆 Xinjiang, China 中国西北内陆棉区 NIR Pop2
YU144 新陆早28号 Xinluzao 28 中国新疆 Xinjiang, China 中国西北内陆棉区 NIR Pop2
YU145 新陆早29号 Xinluzao 29 中国新疆 Xinjiang, China 中国西北内陆棉区 NIR Pop2
YU146 新陆早30号Xinluzao 30 中国新疆 Xinjiang, China 中国西北内陆棉区 NIR Pop2
YU147 新陆早32号 Xinluzao 32 中国新疆 Xinjiang, China 中国西北内陆棉区 NIR Pop2
YU148 新陆早33号 Xinluzao 33 中国新疆 Xinjiang, China 中国西北内陆棉区 NIR Pop2
YU149 新陆早34号 Xinluzao 34 中国新疆 Xinjiang, China 中国西北内陆棉区 NIR Pop2
YU150 新陆早35号 Xinluzao 35 中国新疆 Xinjiang, China 中国西北内陆棉区 NIR Pop2
YU151 新陆早36号 Xinluzao 36 中国新疆 Xinjiang, China 中国西北内陆棉区 NIR Pop2
YU153 新陆早38号 Xinluzao 38 中国新疆 Xinjiang, China 中国西北内陆棉区 NIR Pop2
YU154 新陆早39号 Xinluzao 39 中国新疆 Xinjiang, China 中国西北内陆棉区 NIR Pop2
YU155 新陆早40号 Xinluzao 40 中国新疆 Xinjiang, China 中国西北内陆棉区 NIR Pop2
YU157 新陆早42号 Xinluzao 42 中国新疆 Xinjiang, China 中国西北内陆棉区 NIR Pop2
YU158 新陆早45号 Xinluzao 45 中国新疆 Xinjiang, China 中国西北内陆棉区 NIR Pop2
YU159 新陆早46号 Xinluzao 46 中国新疆 Xinjiang, China 中国西北内陆棉区 NIR Pop2
YU160 新陆早47号 Xinluzao 47 中国新疆 Xinjiang, China 中国西北内陆棉区 NIR Pop2
YU161 新陆早48号 Xinluzao 48 中国新疆 Xinjiang, China 中国西北内陆棉区 NIR Pop2
YU162 新陆早49号 Xinluzao 49 中国新疆 Xinjiang, China 中国西北内陆棉区 NIR Pop2
YU164 新陆早51号 Xinluzao 51 中国新疆 Xinjiang, China 中国西北内陆棉区 NIR Pop2
YU165 新陆中1号 Xinluzhong 1 中国新疆 Xinjiang, China 中国西北内陆棉区 NIR Pop2
YU166 新陆中2号 Xinluzhong 2 中国新疆 Xinjiang, China 中国西北内陆棉区 NIR Pop2
YU167 新陆中3号 Xinluzhong 3 中国新疆 Xinjiang, China 中国西北内陆棉区 NIR Pop2
YU168 新陆中4号 Xinluzhong 4 中国新疆 Xinjiang, China 中国西北内陆棉区 NIR Pop2
YU169 新陆中5号 Xinluzhong 5 中国新疆 Xinjiang, China 中国西北内陆棉区 NIR Pop2
YU170 新陆中6号 Xinluzhong 6 中国新疆 Xinjiang, China 中国西北内陆棉区 NIR Pop2
YU171 新陆中7号 Xinluzhong 7 中国新疆 Xinjiang, China 中国西北内陆棉区 NIR Pop2
YU172 新陆中8号 Xinluzhong 8 中国新疆 Xinjiang, China 中国西北内陆棉区 NIR Pop2
YU174 新陆中10 Xinluzhong 10 中国新疆 Xinjiang, China 中国西北内陆棉区 NIR Pop2
YU175 新陆中11 Xinluzhong 11 中国新疆 Xinjiang, China 中国西北内陆棉区 NIR Pop2
YU182 新陆中18 Xinluzhong 18 中国新疆 Xinjiang, China 中国西北内陆棉区 NIR Pop2
YU183 新陆中19 Xinluzhong 19 中国新疆 Xinjiang, China 中国西北内陆棉区 NIR Pop2
YU184 新陆中20 Xinluzhong 20 中国新疆 Xinjiang, China 中国西北内陆棉区 NIR Pop2
YU185 新陆中21 Xinluzhong 21 中国新疆 Xinjiang, China 中国西北内陆棉区 NIR Pop2
YU186 新陆中22 Xinluzhong 22 中国新疆 Xinjiang, China 中国西北内陆棉区 NIR Pop2
YU196 新陆中34 Xinluzhong 34 中国新疆 Xinjiang, China 中国西北内陆棉区 NIR Pop2
YU215 金垦1042 Jinken 1042 中国新疆 Xinjiang, China 中国西北内陆棉区 NIR Pop2
YU217 墨玉1号 Moyu 1 中国新疆 Xinjiang, China 中国西北内陆棉区 NIR Pop2
YU220 中植棉2号 Zhongzhimian 2 中国河南 Henan, China 中国黄河流域棉区 YRR Pop2
YU232 军棉1号 Junmian 1 中国新疆 Xinjiang, China 中国西北内陆棉区 NIR Pop2
YU240 芽黄 Yahuang 不详 Unknown 不详 Unknown Pop2
YU243 辽棉16 Liaomain 16 中国辽宁 Liaoning, China 中国北方特早熟棉区 NSEMR Pop2
YU244 辽棉17号 Liaomian 17 中国辽宁 Liaoning, China 中国北方特早熟棉区 NSEMR Pop2
YU245 辽棉18 Liaomian 18 中国辽宁 Liaoning, China 中国北方特早熟棉区 NSEMR Pop2
YU246 辽棉19号 Liaomian 19 中国辽宁 Liaoning, China 中国北方特早熟棉区 NSEMR Pop2
YU250 晋棉10号 Jinmian 10 中国山西 Shanxi, China 中国黄河流域棉区 YRR Pop2
YU252 晋棉18号 Jinmian 18 中国山西 Shanxi, China 中国黄河流域棉区 YRR Pop2
YU257 锦棉2号 jinmian 2 中国辽宁 Liaoning, China 中国北方特早熟棉区 NSEMR Pop2
YU259 朝阳棉1号 Chaoyangmian 1 中国辽宁 Liaoning, China 中国北方特早熟棉区 NSEMR Pop2
YU266 黑山棉1号 Heishanmian 1 中国辽宁 Liaoning, China 中国北方特早熟棉区 NSEMR Pop2
YU268 中棉所37 Zhongmiansuo 37 中国河南 Henan, China 中国黄河流域棉区 YRR Pop2
YU269 中棉所45 Zhongmiansuo 45 中国河南 Henan, China 中国黄河流域棉区 YRR Pop2
YU271 中棉所58 Zhongmiansuo 58 中国河南 Henan, China 中国黄河流域棉区 YRR Pop2
YU276 晋中169 Jinzhong 169 中国山西 Shanxi, China 中国黄河流域棉区 YRR Pop2
YU283 晋棉6号 Jinmian 6 中国山西 Shanxi, China 中国黄河流域棉区 YRR Pop2
YU287 惠远718 Huiyuan 718 中国新疆 Xinjiang, China 中国西北内陆棉区 NIR Pop2
YU288 中705 Zhong 705 中国新疆 Xinjiang, China 中国西北内陆棉区 NIR Pop2
YU290 FY11 FY 11 中国新疆 Xinjiang, China 中国西北内陆棉区 NIR Pop2
YU316 鄂岱棉 Edaimain 中国湖北 Hubei, China 中国长江流域棉区 YtRR Pop2
YU321 冈棉1号 Gangmian 1 中国湖北 Hubei, China 中国长江流域棉区 YtRR Pop2
YU330 一树红 Yishuhong 中国河北 Hebei, China 中国黄河流域棉区 YRR Pop2
YU335 科遗2号 Keyi 2 中国河北 Hebei, China 中国黄河流域棉区 YRR Pop2
YU344 斯字棉4号 Sizimian 4 美国 America 美国 USA Pop2
YU346 泾斯棉 Jingsimain 中国陕西 Shaanxi, China 中国黄河流域棉区 YRR Pop2
YU347 鸭鹏棉 Yapengmian 中国湖北 Hubei, China 中国长江流域棉区 YtRR Pop2
YU351 中棉所5号 Zhongmiansuo 5 中国河南 Henan, China 中国黄河流域棉区 YRR Pop2
YU358 108夫 108 Fu 前苏联
Former Soviet Union
前苏联 SU Pop2
YU359 611波 611 Bo 前苏联
Former Soviet Union
前苏联 SU Pop2
YU362 安农121 Annong 121 中国安徽 Anhui, China 中国长江流域棉区 YtRR Pop2
YU364 岱字棉14 Daizimian 14 美国 America 美国 USA Pop2
YU365 岱字棉16 Daizimian 16 美国 America 美国 USA Pop2
YU366 德夏棉1号 Dexiamian 1 中国山东 Shandong, China 中国黄河流域棉区 YRR Pop2
YU369 敦棉2号 Dunmian 2 中国甘肃 Gansu, China 中国西北内陆棉区 NIR Pop2
YU370 赣棉2号 Ganmian 2 中国江西 Jiangxi, China 中国长江流域棉区 YtRR Pop2
YU381 锦棉5号 Jinmian 5 中国辽宁 Liaoning, China 中国北方特早熟棉区 NSEMR Pop2
YU383 晋棉25 Jinmian 25 中国山西 Shanxi, China 中国黄河流域棉区 YRR Pop2
YU386 珂字棉100 Kezimain 100 美国 America 美国 USA Pop2
YU389 辽棉5号 Liaomian 5 中国辽宁 Liaoning, China 中国北方特早熟棉区 NSEMR Pop2
YU400 司1470 Si 1470 前苏联
Former Soviet Union
前苏联 SU Pop2

Table S2

Water Treatment in Korla and Shihezi, Xinjiang (2016/2017)"

次数
Times
库尔勒Korla 石河子Shihezi
日期
Date
(month/day)
正常
CK
(m3 hm-2)
干旱
Drought
(m3 hm-2)
日期
Date
(month/day)
正常
CK
(m3 hm-2)
干旱
Drought
(m3 hm-2)
1 6/12 423 211.5 6/5 525 262.5
2 6/19 564 282 6/15 525 262.5
3 6/27 564 282 6/25 525 262.5
4 7/4 564 282 7/5 525 262.5
5 7/12 564 282 7/15 525 262.5
6 7/20 634.5 317.25 7/25 525 262.5
7 7/28 705 352.5
8 8/3 564 282 8/5 525 262.5
9 8/10 564 282 8/15 525 262.5
10 8/18 564 282 8/25 450 225
11 8/26 564 282
12 9/3 493.5 246.75 9/10 300 150
合计Total 6768 3384 4950 2475

Fig. s1

Fig. S1 Meteorological data of the whole growth period of cotton in Shihezi and Korla, Xinjiang in 2016-2017"

Table 1

Descriptive statistics about phenotypic variations for 18 traits under two treatments by BLUP analysis"

性状
Trait
对照
CK
方差分析
ANOVA
干旱
Drought
均值
Mean
最大值Max. 最小值Min. 标准偏差
SD
变异系数CV(%) 遗传力(H2) P
P-value
均值
Mean
最大值
Max.
最小值
Min.
标准偏差
SD
变异系数CV (%) 遗传力(H2)
生育期 GP (d) 135.433 141.447 129.515 2.481 1.832 0.566 1.921E-26** 132.847 138.175 128.001 2.232 1.680 0.548
株高 PH (cm) 65.876 74.726 53.809 3.526 5.353 0.536 2.021E-37** 60.371 72.811 42.913 4.525 7.496 0.572
果枝始节高 FFSH (cm) 20.999 27.115 13.573 2.294 10.924 0.676 9.859E-06** 20.032 26.303 13.238 2.196 10.963 0.670
第一果枝节位 FFSBN 5.986 6.935 5.159 0.267 4.453 0.319 2.067E-03** 6.045 6.250 5.736 0.088 1.459 0.112
果枝数 FSBN 7.674 8.246 6.969 0.231 3.004 0.214 0.529 7.687 7.984 7.189 0.116 1.508 0.106
空果枝数 EFSBN 2.504 3.676 1.714 0.361 14.434 0.361 1.580E-13** 2.728 3.782 2.258 0.237 8.691 0.241
单株有效铃数 EBN 6.377 7.515 5.378 0.400 6.278 0.470 8.657E-16** 6.059 6.957 5.008 0.395 6.519 0.481
外围铃数 PBN 1.166 2.144 0.773 0.196 16.832 0.286 5.132E-24** 1.001 1.378 0.771 0.114 11.359 0.185
单铃重 BW (g) 7.163 8.743 5.409 0.403 5.632 0.590 0.890 7.169 8.191 6.004 0.367 5.115 0.555
衣分 LP (%) 39.038 42.635 32.480 1.716 4.396 0.621 4.718E-05** 39.941 59.450 32.488 2.734 6.846 0.644
籽指 SI (g) 11.126 14.043 9.638 0.775 6.964 0.711 0.098 11.000 14.328 9.352 0.811 7.375 0.714
衣指 LI (g) 7.102 8.313 5.318 0.553 7.792 0.772 1.880E-03** 7.269 8.658 5.630 0.558 7.683 0.753
理论籽棉产量TSCY (kg hm-2) 7473.908 8357.364 6848.882 292.433 3.913 0.307 1.100E-25** 7111.924 8282.359 6234.227 378.011 5.315 0.390
上半部纤维长度FUHML (mm) 28.808 31.503 25.713 0.970 3.366 0.725 5.650E-08** 28.285 30.877 25.880 0.998 3.528 0.702
纤维整齐度 FU (%) 84.617 85.760 81.823 0.629 0.743 0.542 0.619 84.646 86.167 82.570 0.593 0.700 0.514
马克隆值 MV 4.144 4.879 3.468 0.224 5.404 0.634 4.489E-36** 4.437 5.056 3.817 0.218 4.913 0.602
纤维比强度 FS (cN tex-1) 28.422 32.700 25.488 1.284 4.516 0.653 7.062E-03** 28.076 32.203 25.412 1.371 4.885 0.683
纤维伸长率 FE (%) 6.721 6.957 6.570 0.070 1.038 0.476 5.178E-22** 6.651 6.835 6.466 0.073 1.090 0.529

Table 2

Phenotypic correlation coefficients among the DRCs of 18 traits"

性状
Traits
生育期
GP
株高
PH
果枝始节高
FFSH
第一果枝节位
FFSBN
果枝数
FSBN
空果枝数
EFSBN
单株有效铃数
EBN
外围铃数
PBN
单铃重
BW
衣分
LP
籽指
SI
衣指
LI
理论籽棉产量
TSCY
上半部纤维长度
FUHML
纤维整齐度
FU
马克隆值
MV
纤维比强度
FS
PH 0.271**
FFSH 0.250** 0.319**
FFSBN 0.087 0.036 0.212**
FSBN -0.110 0.282** -0.153 -0.269**
EFSBN 0.035 -0.002 0.009 0.028 -0.278**
EBN 0.004 0.292** -0.185** -0.065 0.490** -0.433**
PBN 0.174* 0.238** -0.007 0.192** 0.147* -0.274** 0.335**
BW -0.095 -0.055 0.027 -0.068 -0.007 -0.031 -0.007 -0.093
LP -0.047 0.098 -0.002 -0.033 0.049 0.143* 0.054 0.037 0.039
SI -0.023 -0.062 -0.040 -0.126 0.033 -0.102 0.006 -0.182** 0.296** -0.223**
LI -0.146* -0.088 -0.076 -0.209** 0.002 -0.050 0.033 -0.102 0.490** 0.068 0.477**
TSCY -0.053 0.274** -0.188** -0.096 0.431** -0.323** 0.904** 0.274** 0.324** 0.100 0.086 0.215**
FUHML 0.164* 0.146* -0.004 -0.072 0.080 -0.088 0.237** 0.188** 0.026 -0.054 0.171* 0.097 0.228**
FU 0.112 0.202** 0.168* 0.028 0.009 0.014 -0.001 0.025 0.035 -0.029 0.096 0.068 0.002 0.270**
MV -0.264** -0.223** -0.131 -0.097 0.037 -0.031 -0.027 -0.257** 0.426** 0.025 0.200** 0.497** 0.104 -0.130 0.042
FS 0.015 0.038 -0.045 -0.055 0.000 -0.036 0.076 0.243** -0.031 -0.111 -0.007 -0.097 0.066 0.571** 0.247** -0.264**
FE 0.068 -0.026 -0.184** -0.039 0.088 -0.016 0.061 0.294** -0.017 -0.066 -0.081 -0.040 0.107 0.433** -0.030 -0.132 0.624**

Table s3

Normality test"

性状
Trait
偏度
Skewness
偏度标准误
Skewness error
偏度U值
Skewness U value
峰度
Kurtosis
峰度标准误
Kurtosis error
峰度U值
Kurtosis U value
K-S检验
Kolmogorov-Smirnov test
生育期 GP 0.225 0.165 1.364 0.568 0.329 1.726 0.200
株高 PH 0.204 0.165 1.236 0.814 0.329 2.474 0.096
果枝始节高 FFSH 0.114 0.165 0.691 0.497 0.329 1.511 0.200
第一果枝节位 FFSBN 0.290 0.165 1.758 0.487 0.329 1.480 0.200
果枝数 FSBN 0.436 0.165 2.642 0.471 0.329 1.432 0.009
空果枝数 EFSBN 0.299 0.165 1.812 0.958 0.329 2.912 0.200
单株有效铃数 EBN 0.229 0.165 1.388 0.276 0.329 0.839 0.200
外围铃数 PBN 0.208 0.165 1.261 0.506 0.329 1.538 0.200
衣分 LP -0.294 0.166 -1.775 0.618 0.330 1.874 0.200
单铃重 BW 0.199 0.165 1.206 0.615 0.329 1.869 0.200
籽指 SI 0.114 0.165 0.691 0.218 0.329 0.663 0.200
衣指 LI 0.271 0.165 1.642 0.278 0.329 0.845 0.200
理论籽棉产量 TSCY 0.197 0.165 1.194 -0.269 0.329 -0.818 0.200
上半部纤维长度 FUHML 0.179 0.165 1.085 0.104 0.329 0.316 0.200
纤维整齐度 FU 0.260 0.165 1.576 -0.275 0.329 -0.836 0.200
马克隆值 MV 0.403 0.165 2.442 1.310 0.329 3.982 0.200
纤维比强度 FS -0.031 0.165 -0.188 -0.158 0.329 -0.480 0.200
纤维伸长率 FE 0.189 0.165 cail45 -0.293 0.329 -0.891 0.200

Fig. 1

Marker screening and amplification display A: screening of partial markers; B: amplification products of marker NAU3377 in some accessions. 1-12: 12 accessions with extremely different geographical origins; p1-p27: some varieties from 217 natural populations; M: marker."

Fig. 2

Gene diversity (A) and PIC frequency (B) profiles of 214 marker sites"

Table s4

Gene diversity and polymorphism information content"

标记
Marker
染色体
Chromosome
位置
Position
基因多样性
Gene diversity
多态性信息含量
PIC
NAU2083 A01 2780968 0.485 0.380
NAU2437a A01 117610973 0.413 0.353
NAU2437b A01 117610973 0.507 0.411
NAU2437c A01 117610973 0.505 0.409
NAU3911 A01 Unknown 0.452 0.362
NAU5163a A01 110126985 0.442 0.356
NAU5163b A01 110126985 0.399 0.329
NAU7195 A01 101362742 0.516 0.401
NAU2265a A02 107706133 0.515 0.408
NAU2265b A02 107706133 0.519 0.410
NAU437a A02 100427971 0.510 0.405
NAU437b A02 100427971 0.503 0.401
NAU5499a A02 2635809 0.485 0.380
NAU5499b A02 2635809 0.501 0.389
NAU1071b A03 106637739 0.517 0.401
NAU1167a A03 4391385 0.495 0.385
NAU1167b A03 4391385 0.355 0.301
NAU1167c A03 4391385 0.390 0.324
NAU1167d A03 4391385 0.485 0.380
NAU3016a A03 4006753 0.325 0.292
NAU3016b A03 4006753 0.495 0.407
NAU3016c A03 4006753 0.225 0.212
NAU3639a A03 23809975 0.529 0.419
NAU3639b A03 23809975 0.530 0.420
NAU483a A03 110023937 0.336 0.299
NAU483b A03 110023937 0.324 0.290
NAU6104 A03 1350357 0.154 0.146
BNL0530 A04 77214336 0.533 0.472
BNL3089a A04 1540330 0.305 0.266
BNL3089b A04 1540330 0.509 0.393
NAU7182 A04 83581454 0.171 0.162
NAU2701 A04 Unknown 0.080 0.079
BNL3452a A05 4448024 0.460 0.354
BNL3452b A05 4448024 0.301 0.255
CIR062a A05 22056200 0.443 0.349
CIR062b A05 22056200 0.458 0.357
DPL641a A05 2941652 0.434 0.354
DPL641b A05 2941652 0.434 0.354
DPL641c A05 2941652 0.170 0.161
DPL641d A05 2941652 0.089 0.087
JESPR065a A05 98149721 0.355 0.301
JESPR065b A05 98149721 0.287 0.253
JESPR065c A05 98149721 0.281 0.249
NAU1042a A05 15535848 0.514 0.395
NAU1042b A05 15535848 0.507 0.392
NAU1156a A05 21325479 0.529 0.419
NAU1156b A05 21325479 0.530 0.420
NAU2121a A05 105667071 0.483 0.379
NAU2121b A05 105667071 0.514 0.395
NAU2957 A05 34370549 0.271 0.234
NAU3036a A05 107748182 0.380 0.318
NAU3036b A05 107748182 0.487 0.381
NAU3529a A05 32011590 0.437 0.342
NAU3529b A05 32011590 0.392 0.315
NAU6094a A05 103382079 0.509 0.393
NAU6094b A05 103382079 0.503 0.389
NAU6966 A05 108024271 0.299 0.262
NAU797a A05 15535921 0.517 0.401
NAU797b A05 15535921 0.498 0.391
NAU934a A05 107002392 0.385 0.321
NAU934b A05 107002392 0.262 0.234
NAU1200a A05 67092496 0.535 0.426
NAU1200b A05 67092496 0.427 0.362
NAU4057a A05 105666831 0.449 0.360
NAU4057b A05 105666831 0.340 0.291
BNL3650a A06 116539321 0.489 0.435
BNL3650b A06 116539321 0.236 0.215
BNL3650c A06 116539321 0.493 0.438
CIR280 A06 6580622 0.448 0.373
NAU2679a A06 67697637 0.416 0.340
NAU2679b A06 67697637 0.350 0.298
NAU3206a A06 120517070 0.407 0.335
NAU3206b A06 120517070 0.416 0.340
NAU3427 A06 123792689 0.339 0.282
NAU7121a A06 7809936 0.168 0.155
NAU7121b A06 7809936 0.190 0.174
NAU874a A06 112365204 0.522 0.408
NAU874b A06 112365204 0.464 0.376
HAU1355a A06 8067852 0.506 0.391
HAU1355b A06 8067852 0.470 0.372
HAU1355c A06 8067852 0.228 0.208
NAU1043a A07 5574496 0.521 0.407
NAU1043b A07 5574496 0.519 0.406
NAU1043c A07 5574496 0.244 0.223
NAU1362a A07 21914654 0.380 0.318
NAU1362b A07 21914654 0.485 0.380
NAU1362c A07 21914654 0.514 0.395
NAU845a A07 9082964 0.464 0.369
NAU845b A07 9082964 0.467 0.370
NAU1085a A07 17517122 0.501 0.410
NAU1085b A07 17517122 0.538 0.431
BNL3257a A08 75471450 0.452 0.362
BNL3257b A08 75471450 0.467 0.370
BNL1231a A08 Unknown 0.505 0.391
BNL1231b A08 Unknown 0.480 0.377
NAU1369a A08 116120479 0.452 0.365
NAU1369b A08 116120479 0.464 0.372
NAU3201a A08 111954481 0.284 0.257
NAU3201b A08 111954481 0.155 0.149
NAU6761 A08 121988408 0.238 0.221
NAU5357a A08 117866133 0.163 0.155
NAU5357b A08 117866133 0.098 0.095
NAU5368a A08 117866202 0.467 0.370
NAU5368b A08 117866202 0.080 0.079
BNL3173a A09 81621533 0.355 0.301
BNL3173b A09 81621533 0.483 0.379
NAU2354a A09 81112818 0.305 0.266
NAU2354b A09 81112818 0.345 0.294
NAU2723 A09 81084858 0.435 0.352
NAU3052a A09 70893120 0.467 0.370
NAU3052b A09 70893120 0.380 0.318
NAU3414a A09 78743809 0.513 0.395
NAU3414b A09 78743809 0.511 0.394
NAU462 A09 77167956 0.509 0.393
NAU859a A09 53596735 0.500 0.438
NAU859b A09 53596735 0.425 0.383
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BNL2960b A10 104965293 0.434 0.354
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CIR183a D12 Unknown 0.517 0.401
CIR183b D12 Unknown 0.401 0.334
HAU1292a D12 44125895 0.263 0.237
HAU1292b D12 44125895 0.229 0.210
NAU3881a D12 38589423 0.390 0.324
NAU3881b D12 38589423 0.458 0.365
NAU3881c D12 38589423 0.192 0.178
NAU4926a D12 5980182 0.498 0.409
NAU4926b D12 5980182 0.401 0.347
NAU4926c D12 5980182 0.441 0.374
NAU4926d D12 5980182 0.313 0.283
BNL3280 D13 41263713 0.106 0.102
BNL3558 D13 5643212 0.121 0.113
NAU2443a D13 48572734 0.263 0.237
NAU2443b D13 48572734 0.229 0.210
NAU2443c D13 48572734 0.476 0.379
NAU3589a D13 55405550 0.288 0.256
NAU3589b D13 55405550 0.282 0.251
NAU3861a D13 60004305 0.509 0.393
NAU3861b D13 60004305 0.412 0.337
NAU3948a D13 5376165 0.357 0.305
NAU3948b D13 5376165 0.336 0.290
NAU5262a D13 59990797 0.532 0.425
NAU5262b D13 59990797 0.505 0.409

Fig. 3

ln P(D) and ?K based on population structure analysis and population structure for 217 upland cotton accessions A: magnitude of ln P(D) as a function of K; B: magnitude of ?K as a function of K; C: population structure of 217 upland cotton accessions."

Table 3

Correlation analysis of drought resistance coefficient and markers for phenotypic traits"

表型
Trait
标记
Marker
P R2 性状
Trait
标记
Marker
P R2
纤维比强度
FS
NAU2152b 0 5.425 株高
PH
CIR280 0 6.320
NAU2152a 0.001 4.785 NAU3377c 0.003 4.327
JESPR181 0.004 3.683 CIR246b 0.003 4.520
NAU859a 0.005 3.707 NAU4926c 0.005 3.879
NAU3589b 0.007 3.167 NAU3881a 0.006 3.616
NAU3529a 0.008 3.045 NAU859b 0.007 3.741
NAU1362c 0.009 3.020 NAU3995a 0.009 3.327
上半部纤维长度
FUHML
NAU1042b 0.004 4.233 第一果枝节位
FFSBN
NAU911c 0.001 4.894
NAU797a 0.007 3.628 JESPR153c 0.002 4.486
HAU1355c 0.005 3.704 NAU1274b 0.004 3.951
NAU5260b 0.006 3.716 NAU6109b 0.006 3.608
NAU3277a 0.008 3.332 BNL1122a 0.006 3.526
NAU2274a 0.008 3.331
衣分
LP
NAU3100b 0.002 4.379 NAU1375b 0.010 3.201
NAU2016b 0.002 4.232
NAU2016a 0.003 4.137 果枝数 NAU3522b 0.002 4.754
CIR280 0.003 3.983 NAU3522a 0.003 4.152
NAU1375b 0.005 3.672 NAU3031b 0.004 4.017
NAU1156a 0.006 3.523 BNL1122a 0.007 3.461
NAU3016a 0.008 3.292
NAU1156b 0.008 3.262 空果枝
EFSBN
NAU5189a 0.001 4.684
JESPR065b 0.008 3.239 NAU1167a 0.003 3.931
HAU1434b 0.008 3.229 NAU4926b 0.006 3.564
HAU2147b 0.008 3.171
NAU3100a 0.009 3.140 理论籽棉产量
TSCY
NAU4073a 0.004 3.913
BNL3976b 0.010 3.071 NAU2016a 0.009 3.269
NAU1028a 0.010 3.049
单株有效铃数
EBN
NAU4926b 0.006 3.653
马克隆值
MV
NAU5499a 0.004 3.838 NAU2078b 0.008 3.325
NAU6104 0.005 3.595
JESPR065b 0.005 3.592 单铃重
BW
NAU6104 0 5.791
NAU1156b 0.003 4.174
果枝始节高
FFSH
NAU3948b 0 7.218 NAU1156a 0.005 3.827
NAU3948a 0.001 4.854 NAU478b 0.007 3.439
HAU1355a 0.002 4.758 NAU478a 0.009 3.200
NAU3308b 0.008 3.337
NAU3522a 0.009 3.208 纤维伸长率
FE
BNL3875b 0.003 3.880
CIR183b 0.003 3.755
外围铃数
PBN
NAU6104 0.003 4.151 NAU5428b 0.004 4.076
NAU1028a 0.004 3.965 JESPR181 0.004 3.613
NAU5428b 0.005 3.950 NAU2317a 0.006 3.258
NAU3377a 0.007 3.170
生育期GP JESPR065b 0.004 4.058 NAU5005b 0.009 2.931
NAU4926c 0.010 2.970

Table 4

Markers associated with multiple-effect traits"

标记
Marker
染色体
Chromosome
位置
Position (bp)
性状
Trait
NAU6104 A03 1,350,357 马克隆值MV, 单铃重BW, 外围铃数 PBN
NAU1156a A05 21,325,479 单铃重 BW, 衣分 LP
JESPR065b A05 98,149,579 生育期 GP, 马克隆值 MV, 衣分 LP
CIR280 A06 6,580,622 株高 PH, 衣分 LP
HAU1355 A06 8,067,852 果枝始节高 FFSH, 上半部纤维长度 FUHML
NAU859 A09 53,596,735 纤维比强度 FS, 株高 PH
NAU3377c D11 379,087 纤维伸长率 FE, 株高 PH
NAU5428b A11 119,324,448 纤维伸长率 FE, 外围铃数 PBN
NAU3522a A12 106,203,559 果枝数 FSBN, 果枝始节高 FFSH
JESPR181 D05 10,325,076 纤维比强度 FS, 纤维伸长率 FE
BNL1122a D07 30,098,941 第一果枝节位 FFSBN, 果枝数 FSBN
NAU1375b D09 9,223,243 衣分 LP, 第一果枝节位 FFSBN
NAU4926c D12 5,980,182 株高 PH, 纤维伸长率 FE
NAU4926b D12 5,980,182 空果枝数 EFSBN, 单株有效铃数 EBN
[1] Passioura J B. Drought and drought tolerance. Plant Growth Regul, 1996,20:79-83.
[2] Passioura J. The drought environment: physical, biological and agricultural perspectives. J Exp Bot, 2007,58:113-117.
doi: 10.1093/jxb/erl212 pmid: 17122406
[3] Levi A, Paterson A H, Barak V, Yakir D, Wang B H, Chee P W, Saranga Y. Field evaluation of cotton near-isogenic lines introgressed with QTLs for productivity and drought related traits. Mol Breed, 2008,23:179-195.
[4] Xiao Y L, Yu C Y, Lei J G, Cruz Q D D, Yabes J M, Tabanao D A. Association mapping for drought tolerance of rice (Oryza sativa L.) at vegetative stage. Agric Sci Technol, 2012,13:1385-1394.
[5] Savage M J, Ritchie J T, Bland W L, Dugas W A. Lower limit of soil water availability. Agron J, 1996,88:644-651.
[6] Cook C G, Elzik K M. Fruiting and lint yield of cotton cultivars under irrigated and nonirrigated conditions. Field Crops Res, 1993,33:411-421.
[7] Tuberosa R. Phenotyping for drought tolerance of crops in the genomics era. Front Physiol, 2012,3:347.
doi: 10.3389/fphys.2012.00347 pmid: 23049510
[8] 桑晓慧, 赵云雷, 王红梅, 陈伟, 龚海燕, 赵佩, 崔艳利. 陆地棉抗旱性与SSR分子标记的关联分析. 棉花学报, 2017,29:241-252.
Sang X H, Zhao Y L, Wang H M, Chen W, Gong H Y, Zhao P, Cui Y L. Association analysis of drought tolerance and SSR markers in upland cotton. Cotton Sci, 2017,29:241-252 (in Chinese with English abstract).
[9] Baytar A A, Peynircioğlu C, Sezener V, Basal H, Frary A, Doğanlar S. Genome-wide association mapping of yield components and drought tolerance-related traits in cotton. Mol Breed, 2018,38:74.
[10] Hou S, Zhu G Z, Li Y, Li W X, Fu J, Niu E, Li L C, Zhang D Y, Guo W Z. Genome-wide association studies reveal genetic variation and candidate genes of drought stress related traits in cotton (Gossypium hirsutum L.). Front Plant Sci, 2018,9:1276.
doi: 10.3389/fpls.2018.01276 pmid: 30233620
[11] Ulloa M, Santiago L M D, Hulse-Kemp A M, Stelly D M, Burke J J. Enhancing upland cotton for drought resilience, productivity, and fiber quality: comparative evaluation and genetic dissection. Mol Genet Genomics, 2020,295:155-176.
[12] 杜雄明, 周忠丽. 棉花种质资源描述规范和数据标准. 北京: 中国农业出版社, 2005. pp 8-32.
Du X M, Zhou Z L. Descriptors and Data Standard for Cotton (Gossypium spp.). Beijing: China Agriculture Press, 2005. pp 8-32(in Chinese).
[13] Paterson A H, Brubaker C L, Wendel J F. A rapid method for extraction of cotton (Gossypium spp.) genomic DNA suitable for RFLP or PCR analysis. Plant Mol Biol Rep, 1993,11:122-127.
[14] 张军, 武耀廷, 郭旺珍, 张天真. 棉花微卫星标记的PAGE/银染快速检测. 棉花学报, 2000,12:267-269.
Zhang J, Wu Y T, Guo W Z, Zhang T Z. Fast screening of microsatellite markers in cotton with PAGE/silver staining. Cotton Sci, 2000,12:267-269 (in Chinese with English abstract).
[15] Zhao L, Lyu Y, Cai C P, Tong X C, Chen X D, Zhang W, Du H, Guo X H, Guo W Z. Toward allotetraploid cotton genome assembly: integration of a high-density molecular genetic linkage map with DNA sequence information. BMC Genomics, 2012,13:539.
[16] 钱能. 陆地棉遗传多样性与育种目标性状基因(QTL)的关联分析. 南京农业大学博士学位论文, 江苏南京, 2009.
Qian N. Genetic Diversity and Association of Gene (QTL) of Breeding Target Traits of Upland Cotton. PhD Dissertation of Nanjing Agricultural University, Nanjing, Jiangsu, China, 2009 (in Chinese with English abstract).
[17] Song X L, Zhang T Z. Quantitative trait loci controlling plant architectural traits in cotton. Plant Sci, 2009,177:317-323.
[18] 薛艳, 张新宇, 沙红, 李雪源, 孙杰, 李保成. 新疆早熟棉品种SSR指纹图谱构建与品种鉴别. 棉花学报, 2010,22:360-366.
Xue Y, Zhang X Y, Sha H, Li X Y, Sun J, Li B C. Construction of fingerprinting map based on SSR and identification of cultivars for earliness cultivars in upland cotton in Xinjiang. Cotton Sci, 2010,22:360-366 (in Chinese with English abstract).
[19] Sun F D, Zhang J H, Wang S F, Gong W K, Shi Y Z, Liu A Y, Li J W, Gong J W, Shang H H, Yuan Y L. QTL mapping for fiber quality traits across multiple generations and environments in upland cotton. Mol Breed, 2012,30:569-582.
[20] 艾先涛, 梁亚军, 沙红, 王俊铎, 郑巨云, 吐尔逊江, 多力坤, 李雪源, 华金平. 新疆自育陆地棉品种 SSR 遗传多样性分析. 作物学报, 2014,40:369-379.
Ai X T, Liang Y J, Sha H, Wang J Z, Zheng J Y, Tu E X J, Duo L K, Li X Y, Hua J P. Genetic diversity analysis on local upland cotton cultivars in Xinjiang based on SSR markers. Acta Agron Sin, 2014,40:369-379 (in Chinese with English abstract).
[21] Bates D, Machler M, Bolker B M, Walker S C. Fitting linear mixed-effects models using lme4. J Stat Softw, 2015,67:1-48.
[22] Nyquist W E, Baker R J. Estimation of heritability and prediction of selection response in plant populations. Crit Rev Plant Sci, 1991,10:235-322.
[23] 兰巨生. 农作物综合抗旱性评价方法的研究. 西北农业学报, 1998,7(3):85-87.
Lan J S. Comparison of evaluating methods for agronomic drought resistance in crops. Acta Agric Boreali-Occident Sin, 1998,7(3):85-87 (in Chinese with English abstract).
[24] 冯方剑, 宋敏, 陈全家, 姚正培, 李杨阳, 刘艳, 王兴安, 曲延英. 棉花苗期抗旱相关指标的主成分分析及综合评价. 新疆农业大学学报, 2011,34:211-217.
Feng F J, Song M, Chen Q J, Yao P Z, Li Y Y, Liu Y, Wang X A, Qu Y Y. Analysis and comprehensive evaluation on principal component of relative indices of drought resistance at the seedling stage of cotton. J Xinjiang Agric Univ, 2011,34:211-217.
[25] Liu K, Muse S. PowerMarker: an integrated analysis environment for genetic marker analysis. Bioinformatics, 2005,21:2128-2129.
[26] Hubisz M J, Daniel F, Matthew S, Pritchard J. Inferring weak population structure with the assistance of sample group information. Mol Ecol Resour, 2010,9:1322-1332.
doi: 10.1111/j.1755-0998.2009.02591.x pmid: 21564903
[27] Earl D A, Vonholdt B M. STRUCTURE HARVESTER: a website and program for visualizing STRUCTURE output and implementing the Evanno method. Conserv Genet Resour, 2012,4:359-361.
[28] Evanno G, Regnaut S, Goudet J. Detecting the number of clusters of individuals using the software STRUCTURE: a simulation study. Mol Ecol, 2010,14:2611-2620.
pmid: 15969739
[29] Hardy O J, Vekemans X. SPAGeDI: a versatile computer program to analyse spatial genetic structure at the individual or population levels. Mol Ecol Resour, 2010,2:618-620.
[30] Bradbury P J, Zhang Z W, Kroon D E, Casstevens T M, Ramdoss Y, Buckler E S. TASSEL: software for association mapping of complex traits in diverse samples. Bioinformatics, 2007,23:2633-2635.
[31] Abdurakhmonov I Y, Saha S, Jenkins J N, Buriev Z T, Shermatov S E, Scheffler B E, Pepper A E, Yu J Z, Kohel R J, Abdukarimov A. Linkage disequilibrium based association mapping of fiber quality traits inG. hirsutum L. variety germplasm. Genetica, 2009,136:401-417.
pmid: 19067183
[32] Schuler G D. Sequence mapping by electronic PCR. Genome Res, 1997,7:541-550.
doi: 10.1101/gr.7.5.541 pmid: 9149949
[33] Wang M J, Tu L, Yuan D J, Zhu D, Shen C, Li J Y, Liu F Y, Pei L Y, Wang P C, Zhao G N, Ye Z X, Huang H, Yan F L, Ma Y Z, Zhang L, Liu M, You J Q, Yang Y C, Liu Z P, Huang F, Li B Q, Qiu P, Zhang Q H, Zhu L F, Jin S X, Yang X Y, Min L, Li G L, Chen L L, Zheng H K, Lindsey K, Lin Z H, Udall J A, Zhang X L. Reference genome sequences of two cultivated allotetraploid cottons, Gossypium hirsutum and Gossypium barbadense. Nat Genet, 2019,51:224-229.
doi: 10.1038/s41588-018-0282-x pmid: 30510239
[34] Said J I, Knapka J A, Song M Z, Zhang J F. Cotton QTLdb: a cotton QTL database for QTL analysis, visualization, and comparison betweenGossypium hirsutum and G. hirsutum × G. barbadense populations. Mol Genet Genomics, 2015,290:1615-1625.
doi: 10.1007/s00438-015-1021-y pmid: 25758743
[35] Said J I, Lin Z X, Zhang X L, Song M Z, Zhang J F. A comprehensive meta QTL analysis for fiber quality, yield, yield related and morphological traits, drought tolerance, and disease resistance in tetraploid cotton. BMC Genomics, 2013,14:776.
doi: 10.1186/1471-2164-14-776 pmid: 24215677
[36] Said J I, Song M Z, Wang H T, Lin Z H, Zhang X L, Fang D D, Zhang J F. A comparative meta-analysis of QTL between intraspecificGossypium hirsutum and interspecific G. hirsutum × G. barbadense populations. Mol Genet Genomics, 2015,290:1003-1025.
doi: 10.1007/s00438-014-0963-9 pmid: 25501533
[37] 唐凯, 王柏林, 姜海波, 何新林. 新疆石河子市近51年蒸发量变化特征分析. 水电能源科学, 2016,34(11):17-21.
Tang K, Wang B L, Jiang H B, He X L. Variation characteristics of evaporation in Shihezi of Xinjiang in recent 51 years. Water Resour Power, 2016,34(11):17-21 (in Chinese with English abstract).
[38] 文强, 韩炜. 天山南北坡近46年蒸发量变化及相关因素对比分析——以呼图壁和库尔勒为例. 伊犁师范学院学报: 自然科学版, 2019,13(4):43-50.
Wen Q, Han W. Changes in evaporation over the last 46 years of the Tianshan Mountains and comparative analysis of related Factors—Take Hutubi and Korla for example. J Yili Normal Univ (Nat Sci Edn) 2019,13(4):43-50 (in Chinese with English abstract).
[39] Paterson A H, Saranga Y, Menz M, Jiang C X, Wright R J. QTL analysis of genotype × environment interactions affecting cotton fiber quality. Theor Appl Genet, 2003,106:384-396.
doi: 10.1007/s00122-002-1025-y pmid: 12589538
[40] Campbell B T, Jones M A. Assessment of genotype × environment interactions for yield and fiber quality in cotton performance trials. Euphytica, 2005,144:69-78.
[41] Farias F J C, Carvalho L P, Silva Filho J L, Teodoro P E. Biplot analysis of phenotypic stability in upland cotton genotypes in Mato Grosso. Genet Mol Res, 2016,15:1-8.
[42] Li B Q, Tian Q, Wang X W, Han B, Liu L, Kong X H, Si A J, Wang J, Lin Z X, Zhang X L, Yu Y, Yang X Y. Phenotypic plasticity and genetic variation of cotton yield and its related traits under water-limited conditions. Crop J, 2020,8:966-976.
[43] Zheng J Y, Oluoch G, Riaz Khan M K, Wang X X, Cai X Y, Zhou Z L, Wang C Y, Wang Y H, Li X Y, Liu X Y, Wang K B. Mapping QTLs for drought tolerance in an F2:3 population from an inter-specific cross betweenGossypium tomentosum and Gossypium hirsutum. Genet Mol Res, 2016. doi: 10.4238/gmr.15038477.
[44] Frova C, Krajewski P, Fonzo N D, Villa M, Sari-Gorla M. Genetic analysis of drought tolerance in maize by molecular markers: I. Yield components. Theor Appl Genet, 1999,99:280-288.
[45] 吴迷, 汪念, 沈超, 黄聪, 温天旺, 林忠旭. 基于重测序的陆地棉InDel标记开发与评价. 作物学报, 2019,45:196-203.
Wu M, Wang N, Shen C, Huang C, Wen T W, Lin Z X. Deve lopment and evaluation of InDel markers in cotton based on whole-genome re-sequencing data. Acta Agron Sin, 2019,45:196-203 (in Chinese with English abstract).
[1] WANG Xing-Rong, LI Yue, ZHANG Yan-Jun, LI Yong-Sheng, WANG Jun-Cheng, XU Yin-Ping, QI Xu-Sheng. Drought resistance identification and drought resistance indexes screening of Tibetan hulless barley resources at adult stage [J]. Acta Agronomica Sinica, 2022, 48(5): 1279-1287.
[2] XU De-Rong, SUN Chao, BI Zhen-Zhen, QIN Tian-Yuan, WANG Yi-Hao, LI Cheng-Ju, FAN You-Fang, LIU Yin-Du, ZHANG Jun-Lian, BAI Jiang-Ping. Identification of StDRO1 gene polymorphism and association analysis with root traits in potato [J]. Acta Agronomica Sinica, 2022, 48(1): 76-85.
[3] YU Rui-Su, TIAN Xiao-Kang, LIU Bin-Bin, DUAN Ying-Xin, LI Ting, ZHANG Xiu-Ying, ZHANG Xing-Hua, HAO Yin-Chuan, LI Qin, XUE Ji-Quan, XU Shu-Tu. Dissecting the genetic architecture of lodging related traits by genome-wide association study and linkage analysis in maize [J]. Acta Agronomica Sinica, 2022, 48(1): 138-150.
[4] ZHAO Jia-Jia, QIAO Ling, WU Bang-Bang, GE Chuan, QIAO Lin-Yi, ZHANG Shu-Wei, YAN Su-Xian, ZHENG Xing-Wei, ZHENG Jun. Seedling root characteristics and drought resistance of wheat in Shanxi province [J]. Acta Agronomica Sinica, 2021, 47(4): 714-727.
[5] TANG Jing-Quan, WANG Nan, GAO Jie, LIU Ting-Ting, WEN Jing, YI Bin, TU Jin-Xing, FU Ting-Dong, SHEN Jin-Xiong. Bioinformatics analysis of SnRK gene family and its relation with seed oil content of Brassica napus L. [J]. Acta Agronomica Sinica, 2021, 47(3): 416-426.
[6] JIANG Wei, PAN Zhe-Chao, BAO Li-Xian, ZHOU Fu-Xian, LI Yan-Shan, SUI Qi-Jun, LI Xian-Ping. Genome-wide association analysis for late blight resistance of potato resources [J]. Acta Agronomica Sinica, 2021, 47(2): 245-261.
[7] XIE Lei, REN Yi, ZHANG Xin-Zhong, WANG Ji-Qing, ZHANG Zhi-Hui, SHI Shu-Bing, GENG Hong-Wei. Genome-wide association study of pre-harvest sprouting traits in wheat [J]. Acta Agronomica Sinica, 2021, 47(10): 1891-1902.
[8] LI Jing-Cai, WANG Qiang-Lin, SONG Wei-Wu, HUANG Wei, XIAO Gui-Lin, WU Cheng-Jin, GU Qin, SONG Bo-Tao. Association analysis of dormancy QTL in tetraploid potato via candidate gene markers [J]. Acta Agronomica Sinica, 2020, 46(9): 1380-1387.
[9] PENG Bo,ZHAO Xiao-Lei,WANG Yi,YUAN Wen-Ya,LI Chun-Hui,LI Yong-Xiang,ZHANG Deng-Feng,SHI Yun-Su,SONG Yan-Chun,WANG Tian-Yu,LI Yu. Genome-wide association studies of leaf orientation value in maize [J]. Acta Agronomica Sinica, 2020, 46(6): 819-831.
[10] Yin-Ping XU, Yong-Dong PAN, Qiang-De LIU, Yuan-Hu YAO, Yan-Chun JIA, Cheng REN, Ke-Cang HUO, Wen-Qing CHEN, Feng ZHAO, Qi-Jun BAO, Hua-Yu ZHANG. Drought resistance identification and drought resistance indexes screening of barley resources at mature period [J]. Acta Agronomica Sinica, 2020, 46(3): 448-461.
[11] Yun-Fu LI,Jing-Xian WANG,Yan-Fang DU,Hua-Wen ZOU,Zu-Xin ZHANG. Identification of indeterminate domain protein family genes associated with flowering time in maize [J]. Acta Agronomica Sinica, 2019, 45(4): 499-507.
[12] Mi WU,Nian WANG,Chao SHEN,Cong HUANG,Tian-Wang WEN,Zhong-Xu LIN. Development and evaluation of InDel markers in cotton based on whole-genome re-sequencing data [J]. Acta Agronomica Sinica, 2019, 45(2): 196-203.
[13] Yang-Yang LI,Rong-Rong JING,Rong-Rong LYU,Peng-Cheng SHI,Xin LI,Qin WANG,Dan WU,Qing-Yuan ZHOU,Jia-Na LI,Zhang-Lin TANG. Genome-wide association analysis and candidate genes prediction of waterlogging-responding traits in Brassica napus L. [J]. Acta Agronomica Sinica, 2019, 45(12): 1806-1821.
[14] ZHANG Xiao-Xiao,PAN Ying-Hong,REN Fu-Li,PU Wei-Jun,WANG Dao-Ping,LI Yu-Bin,LU Ping,LI Gui-Ying,ZHU Li. Establishment of an accurate evaluation method for drought resistance based on multilevel phenotype analysis in sorghum [J]. Acta Agronomica Sinica, 2019, 45(11): 1735-1745.
[15] Mei DENG, Yuan-Jiang HE, Lu-Lu GOU, Fang-Jie YAO, Jian LI, Xue-Mei ZHANG, Li LONG, Jian MA, Qian-Tao JIANG, Ya-Xi LIU, Yu-Ming WEI, Guo-Yue CHEN. Genetic Effects of Key Genomic Regions Controlling Yield-Related Traits in Wheat Founder Parent Fan 6 [J]. Acta Agronomica Sinica, 2018, 44(05): 706-715.
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