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作物学报 ›› 2009, Vol. 35 ›› Issue (1): 1-10.doi: 10.3724/SP.J.1006.2009.00001

• 作物遗传育种·种质资源·分子遗传学 •    下一篇

基于EST-PCR的簇毛麦染色体特异分子标记筛选及应用

曹亚萍1,2,曹爱忠1,王秀娥1,陈佩度1,*
  

  1. 1南京农业大学作物遗传与种质创新国家重点实验室,江苏南京 210095;2山西省农业科学院小麦研究所,山西临汾 041000
  • 收稿日期:2008-06-26 修回日期:2008-09-01 出版日期:2009-01-12 网络出版日期:2008-11-17
  • 基金资助:

    本研究由国家自然科学基金项目(30270827,30871519),教育部高等学校创新引智计划(111计划)项目(B08025)资助

Screening and Application of EST-based PCR Markers Specific to Individual Chromosomes of Haynaldia villosa

CAO Ya-Ping12,CAO Ai-Zhong1,WANG Xiu-E1,CHEN Pei-Du1*   

  1. 1National Key Laboratory of Crop Genetics and Germplasm Enhancement, Cyto genetics Institute, Nanjing Agricultural University,Nanjing 210095,China;2Wheat Research Institute,Shanxi Academy of Agricultural Sciences, Linfen 041000,China
  • Received:2008-06-26 Revised:2008-09-01 Published:2009-01-12 Published online:2008-11-17

摘要:

为定位、转移和利用簇毛麦有益基因, 通过花粉辐射, 获得一批包括小麦-簇毛麦易位染色体的异染色体系。为了鉴定这批材料中的簇毛麦染色体身份, 根据水稻、小麦的EST序列合成了240STS引物, 其中34对引物在普通小麦中国春与簇毛麦间存在多态性;进一步对亲本及簇毛麦二体异附加系进行PCR扩增分析, 标记CINAU32-300可追踪簇毛麦1V染色体, 标记CINAU33-280CINAU34-510CINAU35-1100CINAU36-380CINAU37-400可追踪簇毛麦2V染色体, 标记CINAU38-250可追踪簇毛麦3V染色体, 标记CINAU39-950CINAU40-800可追踪簇毛麦4V染色体, 标记CINAU41-745CINAU42-1050可追踪簇毛麦5V染色体, 标记CINAU44-765CINAU45-495可追踪簇毛麦7V染色体。加上本室已开发的26V染色体特异标记, 用这些簇毛麦特异分子标记鉴定辐射诱导材料的部分回交后代, 选育出小麦背景中只包含单条簇毛麦染色体的整套1V7V染色体系, 同时有18条易位染色体的簇毛麦身份得到确定, 表明这些标记可以用来快速检测普通小麦背景中的簇毛麦染色体或染色体片段。

关键词: 小麦, 簇毛麦, EST-STS标记, 小麦-簇毛麦异染色体系, 小麦-簇毛麦易位染色体

Abstract:

To localize, transfer and use interested genes of Haynaldia villosa, a series of wheat-H. villosa alien chromosome lines including translocation lines induced by irradiation have been developed. To identify H. villosa chromosomes or chromosome segments in these materials, 240 STS primer pairs were designed based on EST sequences of rice and wheat, and 34 of them could amplify specific polymorphic bands between common wheat cv. Chinese Spring and H. villosa. These 34 STS primer pairs were further used for screening markers specific to individual chromosomes of H. villosa using 1V to 7V disomic additional lines and their parents. The results showed that the marker CINAU32-300 could be used to trace chromosome 1V, CINAU33-280, CINAU34-510, CINAU35-1100, CINAU36-380 and CINAU37-400 to 2V, CINAU38-250 to 3V, CINAU39-950 and CINAU40-800 to 4V, CINAU41-745 and CINAU42-1050 to 5V, CINAU44-765 and CINAU45-495 to 7V. These EST-STS markers combined with the two 6V specific markers previously in our institute were used to identify the H. villosa chromosome and chromosome segments of backcrossed generations derived from pollen irradiation. A set of 1V to 7V addition lines and 18 translocation chromosomes involved in different H. villosa chromosomes were identified. Therefore, these chromosome-specific EST-STS markers could be used to detect chromosomes and chromosome segments of H. villosa in common wheat background.

Key words: Wheat, Haynaldia villose, EST-STS marker, Wheat-H.villosa alien chromosome line, Wheat-H.villosa translocation chromosome

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