欢迎访问作物学报，今天是
作物学报

作物学报 ›› 2009, Vol. 35 ›› Issue (3): 459-466.doi: 10.3724/SP.J.1006.2009.00459

• 作物遗传育种·种质资源·分子遗传学 • 上一篇    下一篇

广东高州野生稻应用核心种质取样策略

陈雨1，潘大建1，杨庆文2，刘斌1，范芝兰1，陈建酉1，李晨1,*   

  1. 1广东省农业科学院水稻研究所，广东广州510640；2中国农业科学院作物科学研究所，北京100081
  • 收稿日期:2008-04-18 修回日期:2008-10-15 出版日期:2009-03-12 网络出版日期:2008-12-11
  • 通讯作者: 李晨
  • 基金资助:

    本研究由国家科技支撑计划项目（2006BAD13B01-11），广东省科技基础条件项目（2006B60101021），中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金（2004DIB3J090）资助

Sampling Strategy for an Applied Core Collection of Gaozhou Wild Rice(Oryza rufipogon Griff.)in Guangdong Province of China

CHEN Yu1,PAN Da-Jian1,YANG Qing-Wen2,LIU Bin1,FAN Zhi-Lan1,CHEN Jian-You1,LI Chen1,*   

  1. 1Rice Research Institute, Guangdong Academy of Agricultural Sciences, Guangzhou 510640,China;2Institute of Crop Sciences,Chinese Academy of Agricultural Sciences, Beijing 100081,China
  • Received:2008-04-18 Revised:2008-10-15 Published:2009-03-12 Published online:2008-12-11
  • Contact: LI Chen

PDF

1236

被引次数

11

摘要：

广东省高州野生稻(简称“高野”，下同)具有丰富的遗传多样性，是水稻遗传改良的重要基因库。以217份高野保存材料为对象，结合按居群分类和系统聚类选择的方法，通过多重比较认为20%为最佳取样比例，从中筛选出了43份材料作为应用核心种质。对表型保留比例、表型方差、多样性指数、变异系数、极差符合率、均值符合率、标准差符合率等重要检验指标的分析表明，该应用核心种质很好地代表了总样品的遗传多样性和变异幅度。利用34对SSR引物对应用核心种质进行分析表明，其平均等位基因数为6.879，平均遗传多样性指数达0.656，基因杂合度达0.558，76.7%的材料在遗传背景上不同，且各居群材料相对较为独立。高野应用核心种质的筛选为该资源的高效研究利用奠定了良好的材料基础。

关键词: 普通野生稻, 应用核心种质, 表型, 遗传背景, SSR

Abstract:

There is abundant genetic diversity for the wild rice (Oryza rufipogon Griff.) in Gaozhou of Guangdong in China. They are the precious resources for rice genetic improvement. Two hundred and seventeen materials of Gaozhou wild rice were used for this study. An optimal sampling scale of 20% was determined by combining population classification with systematic cluster selection and confirmed by multiple comparisons. Finally, forty three materials were selected as the applied core collection. The analysis of parameters, such as ratio of phenotype retained, variance of phenotype, Shanno-wavear index and coefficient of variation indicated that the applied core collection well represented the total population in genetic diversity and range of variation. The SSR assay with 34 pairs of SSR primers for this core collection showed that the average number of alleles was 6.879, the average genetic diversity index was up to 0.655, gene heterozygosity was 0.558, and 76.7% of materials tested were different in genotypes. This study has laid down a good foundation for effective study and utilization of Gaozhou wild rice.

Key words: Common wild rice, Applied core collection, Phenotype, Genetic background, SSR

[1] 王泽, 周钦阳, 刘聪, 穆悦, 郭威, 丁艳锋, 二宫正士. 基于无人机和地面图像的田间水稻冠层参数估测与评价[J]. 作物学报, 2022, 48(5): 1248-1261.
[2] 陈小红, 林元香, 王倩, 丁敏, 王海岗, 陈凌, 高志军, 王瑞云, 乔治军. 基于高基元SSR构建黍稷种质资源的分子身份证[J]. 作物学报, 2022, 48(4): 908-919.
[3] 张霞, 于卓, 金兴红, 于肖夏, 李景伟, 李佳奇. 马铃薯SSR引物的开发、特征分析及在彩色马铃薯材料中的扩增研究[J]. 作物学报, 2022, 48(4): 920-929.
[4] 王琰琰, 王俊, 刘国祥, 钟秋, 张华述, 骆铮珍, 陈志华, 戴培刚, 佟英, 李媛, 蒋勋, 张兴伟, 杨爱国. 基于SSR标记的雪茄烟种质资源指纹图谱库的构建及遗传多样性分析[J]. 作物学报, 2021, 47(7): 1259-1274.
[5] 罗兰, 雷丽霞, 刘进, 张瑞华, 金桂秀, 崔迪, 黎毛毛, 马小定, 赵正武, 韩龙植. 利用东乡普通野生稻染色体片段置换系定位产量相关性状QTL[J]. 作物学报, 2021, 47(7): 1391-1401.
[6] 韩贝, 王旭文, 李保奇, 余渝, 田琴, 杨细燕. 陆地棉种质资源抗旱性状的关联分析[J]. 作物学报, 2021, 47(3): 438-450.
[7] 刘少荣, 杨扬, 田红丽, 易红梅, 王璐, 康定明, 范亚明, 任洁, 江彬, 葛建镕, 成广雷, 王凤格. 基于农艺及品质性状与SSR标记的青贮玉米品种遗传多样性分析[J]. 作物学报, 2021, 47(12): 2362-2370.
[8] 郭艳春, 张力岚, 陈思远, 祁建民, 方平平, 陶爱芬, 张列梅, 张立武. 黄麻应用核心种质的DNA分子身份证构建[J]. 作物学报, 2021, 47(1): 80-93.
[9] 赵孟良,王丽慧,任延靖,孙雪梅,侯志强,杨世鹏,李莉,钟启文. 257份菊芋种质资源表型性状的遗传多样性[J]. 作物学报, 2020, 46(5): 712-724.
[10] 王恒波,祁舒婷,陈姝琦,郭晋隆,阙友雄. 甘蔗栽培种单倍体基因组SSR位点的发掘与应用[J]. 作物学报, 2020, 46(4): 631-642.
[11] 闫彩霞,王娟,张浩,李春娟,宋秀霞,孙全喜,苑翠玲,赵小波,单世华. 基于表型性状构建中国花生地方品种骨干种质[J]. 作物学报, 2020, 46(4): 520-531.
[12] 张红岩,杨涛,刘荣,晋芳,张力科,于海天,胡锦国,杨峰,王栋,何玉华,宗绪晓. 利用EST-SSR标记评价羽扇豆属(Lupinus L.)遗传多样性[J]. 作物学报, 2020, 46(3): 330-340.
[13] 张力岚, 张列梅, 牛焕颖, 徐益, 李玉, 祁建民, 陶爱芬, 方平平, 张立武. 黄麻SSR标记与纤维产量性状的相关性[J]. 作物学报, 2020, 46(12): 1905-1913.
[14] 刘荣, 王芳, 方俐, 杨涛, 张红岩, 黄宇宁, 王栋, 季一山, 徐东旭, 李冠, 郭瑞军, 宗绪晓. 利用2个F2群体整合中国豌豆高密度SSR遗传连锁图谱[J]. 作物学报, 2020, 46(10): 1496-1506.
[15] 谢园华,李凤菲,马晓慧,谭佳,夏赛赛,桑贤春,杨正林,凌英华. 水稻半外卷叶突变体sol1的表型分析与基因定位[J]. 作物学报, 2020, 46(02): 204-213.
Viewed
Full text


Abstract

Cited
  Shared   
  Discussed   
No Suggested Reading articles found!
京ICP备15008789号-2