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作物学报 ›› 2009, Vol. 35 ›› Issue (3): 459-466.doi: 10.3724/SP.J.1006.2009.00459

• 作物遗传育种·种质资源·分子遗传学 • 上一篇    下一篇

广东高州野生稻应用核心种质取样策略

陈雨1，潘大建1，杨庆文2，刘斌1，范芝兰1，陈建酉1，李晨1,*   

  1. 1广东省农业科学院水稻研究所，广东广州510640；2中国农业科学院作物科学研究所，北京100081
  • 收稿日期:2008-04-18 修回日期:2008-10-15 出版日期:2009-03-12 网络出版日期:2008-12-11
  • 通讯作者: 李晨
  • 基金资助:

    本研究由国家科技支撑计划项目（2006BAD13B01-11），广东省科技基础条件项目（2006B60101021），中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金（2004DIB3J090）资助

Sampling Strategy for an Applied Core Collection of Gaozhou Wild Rice(Oryza rufipogon Griff.)in Guangdong Province of China

CHEN Yu1,PAN Da-Jian1,YANG Qing-Wen2,LIU Bin1,FAN Zhi-Lan1,CHEN Jian-You1,LI Chen1,*   

  1. 1Rice Research Institute, Guangdong Academy of Agricultural Sciences, Guangzhou 510640,China;2Institute of Crop Sciences,Chinese Academy of Agricultural Sciences, Beijing 100081,China
  • Received:2008-04-18 Revised:2008-10-15 Published:2009-03-12 Published online:2008-12-11
  • Contact: LI Chen

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摘要：

广东省高州野生稻(简称“高野”，下同)具有丰富的遗传多样性，是水稻遗传改良的重要基因库。以217份高野保存材料为对象，结合按居群分类和系统聚类选择的方法，通过多重比较认为20%为最佳取样比例，从中筛选出了43份材料作为应用核心种质。对表型保留比例、表型方差、多样性指数、变异系数、极差符合率、均值符合率、标准差符合率等重要检验指标的分析表明，该应用核心种质很好地代表了总样品的遗传多样性和变异幅度。利用34对SSR引物对应用核心种质进行分析表明，其平均等位基因数为6.879，平均遗传多样性指数达0.656，基因杂合度达0.558，76.7%的材料在遗传背景上不同，且各居群材料相对较为独立。高野应用核心种质的筛选为该资源的高效研究利用奠定了良好的材料基础。

关键词: 普通野生稻, 应用核心种质, 表型, 遗传背景, SSR

Abstract:

There is abundant genetic diversity for the wild rice (Oryza rufipogon Griff.) in Gaozhou of Guangdong in China. They are the precious resources for rice genetic improvement. Two hundred and seventeen materials of Gaozhou wild rice were used for this study. An optimal sampling scale of 20% was determined by combining population classification with systematic cluster selection and confirmed by multiple comparisons. Finally, forty three materials were selected as the applied core collection. The analysis of parameters, such as ratio of phenotype retained, variance of phenotype, Shanno-wavear index and coefficient of variation indicated that the applied core collection well represented the total population in genetic diversity and range of variation. The SSR assay with 34 pairs of SSR primers for this core collection showed that the average number of alleles was 6.879, the average genetic diversity index was up to 0.655, gene heterozygosity was 0.558, and 76.7% of materials tested were different in genotypes. This study has laid down a good foundation for effective study and utilization of Gaozhou wild rice.

Key words: Common wild rice, Applied core collection, Phenotype, Genetic background, SSR

[1] 马小倩, 秦娜, 代书桃, 秦家范, 李小艳, 王淑婷, 刘忠玲, 李君霞. 175份谷子种质在2种环境下的表型变异分析[J]. 作物学报, 2026, 52(6): 1757-1773.
[2] 张颖星, 宋裕祯, 王跃, 曹越, 曹晓宁, 王瑞云. EMS诱导糜子优异性状突变体的筛选及表型分析[J]. 作物学报, 2026, 52(5): 1388-1400.
[3] 杨扬, 常诗惠, 田红丽, 易红梅, 王璐, 任洁, 范亚明, 刘亚维, 王凤格, 赵久然. 不同生态区国审玉米品种的遗传多样性分析[J]. 作物学报, 2026, 52(5): 1352-1364.
[4] 徐建霞, 丁延庆, 曹宁, 程斌, 高旭, 李文贞, 王若若, 王磊, 张立异. 397份高粱种质资源在贵州表型多样性分析及综合评价[J]. 作物学报, 2026, 52(4): 1073-1087.
[5] 田春艳, 陆鑫, 吴才文, 徐超华, 刘家勇, 边芯, 桃联安. 基于荧光SSR的甘蔗创新种质遗传多样性分析及育种潜力评估[J]. 作物学报, 2026, 52(4): 1057-1072.
[6] 张超, 郭欢, 李忠玲, 岳淑宁, 赵娜. 基于BSA-seq技术定位玉米籽粒花青素关联基因[J]. 作物学报, 2026, 52(3): 780-789.
[7] 刘迪, 黎瑞源, 石茂竹, 李洪有, 陈庆富, 石桃雄. 苦荞半矮秆突变体sd3的表型鉴定及转录组分析[J]. 作物学报, 2026, 52(1): 316-328.
[8] 旺姆, 卓嘎, 扎桑, 西若曲宗, 达瓦顿珠, 郭刚刚, 张京, 卓嘎, 伦珠朗杰. 基于6个表型性状的青稞种质遗传多样性分析及综合评价[J]. 作物学报, 2025, 51(6): 1526-1537.
[9] 王浩辰, 王克晶, 韩娟, 李向华. 东南沿海短绒野大豆两种代表性生境自然种群的空间遗传结构特征:种群内取样策略研究[J]. 作物学报, 2025, 51(11): 2875-2885.
[10] 郑栋, 周仙莉, 滕长才, 侯万伟, 张红岩, 刘玉皎. 基于SSR标记的青海蚕豆品种亲缘关系分析与指纹图谱构建[J]. 作物学报, 2025, 51(1): 79-90.
[11] 匡博文, 韦妳, 刘金典, 陈美燕, 毛兴洁, 段维兴, 杨细平. 基于甘蔗及其近缘属参考基因组开发SSR标记及数据库[J]. 作物学报, 2025, 51(1): 103-116.
[12] 丁艺冰, 辛旭霞, 冯智尊, 曹越, 郭娟, Dipak K SANTRA, 王瑞云, 陈喜明. 东北春播区糜子核心种质及其DNA分子身份证构建[J]. 作物学报, 2024, 50(5): 1181-1192.
[13] 田春艳, 边芯, 郎荣斌, 俞华先, 桃联安, 安汝东, 董立华, 张钰, 经艳芬. 甘蔗3个育种性状与SSR标记的关联分析及优异等位变异发掘[J]. 作物学报, 2024, 50(2): 310-324.
[14] 陈天, 李昱樱, 荣二花, 吴玉香. 棉属人工异源四倍体后代性状鉴定及花器转录组学分析[J]. 作物学报, 2024, 50(2): 325-339.
[15] 陈志凯, 周仙莉, 张红岩, 滕长才, 侯万伟. 320份蚕豆蛋白质含量的SSR关联分析[J]. 作物学报, 2024, 50(11): 2775-2786.
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