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作物学报 ›› 2008, Vol. 34 ›› Issue (04): 551-556.doi: 10.3724/SP.J.1006.2008.00551

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水稻种子耐低温发芽力的QTL定位及上位性分析

纪素兰1;江玲1;王益华1;刘世家1;刘喜1;翟虎渠2;吉村醇3;万建民1,2,*   

  1. 1 南京农业大学作物遗传与种质创新国家重点实验室, 江苏南京210095; 2 中国农业科学院作物科学研究所, 北京100081; 3日本国立九州大学农学部, 日本福冈 812-8581
  • 收稿日期:2007-09-17 修回日期:1900-01-01 出版日期:2008-04-12 网络出版日期:2008-04-12
  • 通讯作者: 万建民

QTL and Epistasis for Low Temperature Germinability in Rice

JI Su-Lan1,JIANG Ling1,WANG Yi-Hua1,LIU Shi-Jia1,LIU Xi1,ZHAI Hu-Qu2,YOSHIMURA Atsushi3,WAN Jian-Min12*   

  1. 1 State Key Laboratory for Crop Genetics & Germplasm Enhancement, Nanjing Agricultural University, Nanjing 210095, Jiangsu; 2 Institute of Crop Sciences, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Beijing 100081, China; 3 Faculty of Agriculture, Kyushu University, Fukuoka 812-8581, Japan
  • Received:2007-09-17 Revised:1900-01-01 Published:2008-04-12 Published online:2008-04-12
  • Contact: WAN Jian-Min

摘要: 利用种植在不同环境[南京(2002)、海南(2002—2003)、南京(2003)]下的Kinmaze/DV85重组自交系(RILs)群体, 对水稻种子萌发第10天的低温发芽力进行QTL分析。利用QTL mapping 2.0软件共检测到11个QTL, 其中qLTG-7qLTG-11可在3个环境中稳定表达, 且最大贡献率均达到27.93%, 增强低温发芽的基因分别来自Kinmaze和DV85。与前人的研究比较发现, 这2个QTL可以在不同环境下和遗传背景中稳定表达。进一步上位性分析的结果表明, qLTG-11并不参与上位性互作, 而qLTG-7虽参与互作但其贡献率较小。1

关键词: 水稻, RIL群体, 低温发芽力, QTL

Abstract: High germination ability at relatively low temperature is essential for direct-seeding rice varieties. A recombinant inbred line population (RILs), derived from a cross between varieties Kinmaze (japonica) and DV85 (indica) was used to detect QTL for low temperature germinability (LTG). The germination rate at 15℃ after 10 d germination culture in Nanjing, Jiangsu Province, and in Lingshui, Hainan Province, in 2002 and in Nanjing in 2003 was taken as LTG indicator. A total of 11 QTL on
chromosomes 2, 5, 7, 8, 11, and 12 were detected in the above three seed production environments. Of these, QTL on
chromosomes 7 and 11 mapped in similar genomic regions in all experiments and the maximum percentage of phenotypic variation explained (PVE) by each QTL was 27.93%, while epistatic interaction had slightly low PVE.

Key words: Rice, RIL population, Low temperature germinability, QTL analysis

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