豇豆种质资源SSR标记遗传多样性分析

作物学报 ›› 2007, Vol. 33 ›› Issue (07): 1206-1209.

豇豆种质资源SSR标记遗传多样性分析

徐雁鸿;关建平;宗绪晓*

中国农业科学院作物科学研究所/国家农作物基因资源与基因改良重大科学工程，北京100081

收稿日期:2006-09-01 修回日期:1900-01-01 出版日期:2007-07-12 网络出版日期:2007-07-12
通讯作者: 宗绪晓

Genetic Diversity Analysis of Cowpea Germplasm Resources by SSR

XU Yan-Hong,GUAN Jian-Ping,ZONG Xu-Xiao*

Institute of Crop Sciences, Chinese Academy of Agricultural Sciences/The National Key Facility for Crop Gene Resources and Genetic Improvement, Beijing 100081, China

Received:2006-09-01 Revised:1900-01-01 Published:2007-07-12 Published online:2007-07-12
Contact: ZONG Xu-Xiao

摘要/Abstract

摘要：

从46对备选的豇豆SSR引物中鉴定筛选出扩增带单一、稳定清晰且多态性强的13对引物。用这13对引物，对来自中国、非洲和亚洲其他国家的共316份栽培豇豆[Vigna unguiculata (Linn) Walp.]资源的DNA进行SSR扩增，以研究其遗传多样性。结果共检测到47个等位位点，平均每对引物扩增出3.692个等位位点，有效等位基因平均2.003个；5对SSR引物VM16、VM26、VM20、VM25和VM23，对于检测豇豆遗传变异最为有效。UPGMA聚类图显示，13对SSR引物即能将其中的260份参试资源区分开，其中国内、外资源差异明显，被划为2大类群；国内资源类群又可分为与地理来源的气候生态区明显关联的2个北方组群、4个南方组群和2个混合组群，8个组群间相对独立又相互渗透；国内育种高代材料的遗传多样性狭窄。

关键词: 豇豆, SSR, 聚类分析, 遗传多样性

Abstract:

Thirteen reproducible and informative SSR primer pairs were selected from the 46 candidates. A representative set of 316 cowpea genetic resources from China, Africa and other countries of Asia, were analyzed by SSR methodology using these informative primer pairs. A total of 47 alleles were detected with an average of 3.692 alleles per SSR primer pair, and on an average 2.003 alleles from each SSR primer pair were effective. According to integrated evaluation, five SSR primer pairs, VM16, VM26, VM20, VM25, and VM23, were most effective for genetic diversity studies of cowpea. The dendrogram by UPGMA cluster analysis showed that 260 accessions of the 316 were distinct and revealed enough genetic diversity for identification and classification of accessions within Vigna unguiculata. There was a clear difference between foreign and Chinese genetic resources. Within Chinese accessions, 8 distinct groups including two northern groups, four southern groups and two complex groups, were detected, indicationg that the Chinese breeding lines have a narrow genetic background.

Key words: Pigeonpea, SSR, Cluster analysis, Genetic diversity

徐雁鸿;关建平;宗绪晓. 豇豆种质资源SSR标记遗传多样性分析[J]. 作物学报, 2007, 33(07): 1206-1209.

XU Yan-Hong;GUAN Jian-Ping;ZONG Xu-Xiao. Genetic Diversity Analysis of Cowpea Germplasm Resources by SSR[J]. Acta Agron Sin, 2007, 33(07): 1206-1209.

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