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Acta Agronomica Sinica ›› 2018, Vol. 44 ›› Issue (04): 473-482.doi: 10.3724/SP.J.1006.2018.00473

• CROP GENETICS & BREEDING·GERMPLASM RESOURCES·MOLECULAR GENETICS •     Next Articles

Characterization of Fusarium Head Blight Resistance Gene Fhb1 and Its Putative Ancestor in Chinese Wheat Germplasm

Zhan-Wang ZHU1,2(), Deng-An XU1, Shun-He CHENG3,*(), Chun-Bao GAO2, Xian-Chun XIA1, Yuan-Feng HAO1,*(), Zhong-Hu HE1,4   

  1. 1 Institute of Crop Science, Chinese Academy of Agricultural Sciences (CAAS), Beijing 100081, China
    2 Institute of Food Crops, Hubei Academy of Agricultural Sciences, Wuhan 430064, Hubei, China
    3 Institute of Agricultural Sciences of Lixiahe District in Jiangsu Province, Yangzhou 225007, Jiangsu, China
    4 CIMMYT-China Office, c/o CAAS, Beijing 100081, China
  • Received:2017-07-19 Accepted:2017-12-08 Online:2018-01-31 Published:2017-12-27
  • Contact: Shun-He CHENG,Yuan-Feng HAO E-mail:zhuzhanwang@163.com;yzcsh1939@126.com;haoyuanfeng@caas.cn
  • Supported by:
    This study was supported by the National Key Research and Development Program of China (2016YFD0101802, 2016YFE0108600), National Natural Science Foundation of China (31301306), and the Technology Innovation Program of Hubei Province (2016AHB022).

Abstract:

Enhancing resistance to Fusarium head blight (FHB) has become one of important breeding objectives in the major wheat-growing regions in China. A prominent locus Fhb1 conferring stable FHB resistance with the largest effect is the major source of resistance in wheat breeding. Understanding the distribution and putative donor of Fhb1 in Chinese wheat cultivars will facilitate the application of this gene and thus benefit FHB resistance breeding in China. Haplotype analysis of PFT (pore-forming toxin-like), HC (HCBT-like defense response protein) and His (histidine-rich calcium-binding protein) genes in the Fhb1 region of 229 wheat cultivars and advanced lines indicated that PFT-I/His-I was a resistant haplotype. Both pedigree and marker (or sequence) information revealed that Fhb1 in Chinese wheat cultivars was mainly derived from Sumai 3 and Ningmai 9, in which Ningmai 9 was the major donor. The Fhb1 diagnostic markers PFT-CAPS and His-InDel developed in this study can be used effectively in marker-assisted selection for improving FHB resistance.

Key words: bread wheat, Fusarium head blight, Fhb1, diagnostic marker, marker-assisted selection

Supplementary table 1

Origins of 229 wheat cultivars (lines) and their His and PFT genotypes"

品种(系)
Cultivars (lines)
来源
Origin
His PFT
等位基因
Allele
检测方法
Detection method
等位基因
Allele
检测方法
Detection method
宁7840 中国江苏 His-I His-Indel标记、测序 PFT-I PFT-CAPS标记、测序
宁麦13 中国江苏 His-I His-Indel标记、测序 PFT-I PFT-CAPS标记、测序
宁麦16 中国江苏 His-I His-Indel标记、测序 PFT-I PFT-CAPS标记、测序
宁麦9号 中国江苏 His-I His-Indel标记、测序 PFT-I PFT-CAPS标记、测序
苏麦3号 中国江苏 His-I His-Indel标记、测序 PFT-I PFT-CAPS标记、测序
镇麦5号 中国江苏 His-I His-Indel标记、测序 PFT-I PFT-CAPS标记、测序
郑麦9023 中国河南 His-II His-Indel标记、测序 PFT-I PFT-CAPS标记、测序
鄂07901 中国湖北 His-II His-Indel标记、测序 PFT-I PFT-CAPS标记
济麦19 中国山东 His-II His-Indel标记、测序 PFT-I PFT-CAPS标记
济宁16号 中国山东 His-II His-Indel标记、测序 PFT-I PFT-CAPS标记、测序
烟农22 中国山东 His-II His-Indel标记、测序 PFT-I PFT-CAPS标记、测序
长6359 中国山西 His-II His-Indel标记、测序 PFT-I PFT-CAPS标记、测序
荔垦2号 中国陕西 His-II His-Indel标记、测序 PFT-I PFT-CAPS标记、测序
陕麦159 中国陕西 His-II His-Indel标记、测序 PFT-I PFT-CAPS标记、测序
陕253 中国陕西 His-II His-Indel标记、测序 PFT-I PFT-CAPS标记
陕715 中国陕西 His-II His-Indel标记、测序 PFT-I PFT-CAPS标记、测序
陕麦150 中国陕西 His-II His-Indel标记、测序 PFT-I PFT-CAPS标记、测序
西农88 中国陕西 His-II His-Indel标记、测序 PFT-I PFT-CAPS标记、测序
西农979 中国陕西 His-II His-Indel标记、测序 PFT-I PFT-CAPS标记、测序
西农9871 中国陕西 His-II His-Indel标记、测序 PFT-I PFT-CAPS标记、测序
小偃107 中国陕西 His-II His-Indel标记、测序 PFT-I PFT-CAPS标记
小偃22 中国陕西 His-II His-Indel标记、测序 PFT-I PFT-CAPS标记、测序
小偃6号 中国陕西 His-II His-Indel标记、测序 PFT-I PFT-CAPS标记、测序
烟2415 中国山东 His-III His-Indel标记、测序 PFT-I PFT-CAPS标记
兰天12 中国甘肃 His-I His-Indel标记 PFT-II PFT-CAPS标记、测序
衡观35 中国河北 His-I His-Indel标记 PFT-II PFT-CAPS标记、测序
衡4422 中国河北 His-I His-Indel标记 PFT-II PFT-CAPS标记、测序
百农160 中国河南 His-I His-Indel标记 PFT-II PFT-CAPS标记、测序
金丰3号 中国河南 His-I His-Indel标记 PFT-II PFT-CAPS标记、测序
洛旱2号 中国河南 His-I His-Indel标记 PFT-II PFT-CAPS标记、测序
洛旱7号 中国河南 His-I His-Indel标记 PFT-II PFT-CAPS标记、测序
平安3号 中国河南 His-I His-Indel标记 PFT-II PFT-CAPS标记、测序
温麦18 中国河南 His-I His-Indel标记 PFT-II PFT-CAPS标记、测序
温麦6号 中国河南 His-I His-Indel标记 PFT-II PFT-CAPS标记、测序
温麦7号 中国河南 His-I His-Indel标记 PFT-II PFT-CAPS标记、测序
新麦26 中国河南 His-I His-Indel标记 PFT-II PFT-CAPS标记、测序
新麦9817 中国河南 His-I His-Indel标记 PFT-II PFT-CAPS标记、测序
新麦11 中国河南 His-I His-Indel标记 PFT-II PFT-CAPS标记、测序
新麦16 中国河南 His-I His-Indel标记 PFT-II PFT-CAPS标记、测序
新麦18 中国河南 His-I His-Indel标记 PFT-II PFT-CAPS标记、测序
新麦9817 中国河南 His-I His-Indel标记 PFT-II PFT-CAPS标记、测序
许科1号 中国河南 His-I His-Indel标记 PFT-II PFT-CAPS标记、测序
豫麦49-168 中国河南 His-I His-Indel标记 PFT-II PFT-CAPS标记、测序
豫麦49-198 中国河南 His-I His-Indel标记 PFT-II PFT-CAPS标记、测序
豫麦52 中国河南 His-I His-Indel标记 PFT-II PFT-CAPS标记、测序
郑麦366 中国河南 His-I His-Indel标记 PFT-II PFT-CAPS标记、测序
郑育麦9987 中国河南 His-I His-Indel标记 PFT-II PFT-CAPS标记、测序
中育10号 中国河南 His-I His-Indel标记 PFT-II PFT-CAPS标记、测序
鄂恩5号 中国湖北 His-I His-Indel标记 PFT-II PFT-CAPS标记、测序
鄂恩6号 中国湖北 His-I His-Indel标记 PFT-II PFT-CAPS标记、测序
宁春4号 中国宁夏 His-I His-Indel标记 PFT-II PFT-CAPS标记、测序
济南17 中国山东 His-I His-Indel标记 PFT-II PFT-CAPS标记、测序
鲁麦21 中国山东 His-I His-Indel标记 PFT-II PFT-CAPS标记、测序
青丰1号 中国山东 His-I His-Indel标记 PFT-II PFT-CAPS标记、测序
泰山21 中国山东 His-I His-Indel标记 PFT-II PFT-CAPS标记、测序
烟5158 中国山东 His-I His-Indel标记 PFT-II PFT-CAPS标记、测序
烟5286 中国山东 His-I His-Indel标记 PFT-II PFT-CAPS标记、测序
临Y7287 中国山西 His-I His-Indel标记 PFT-II PFT-CAPS标记、测序
临汾137 中国山西 His-I His-Indel标记 PFT-II PFT-CAPS标记、测序
皖麦38 中国安徽 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
皖麦50 中国安徽 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
皖麦52 中国安徽 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
北京0045 中国北京 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
京冬17 中国北京 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
京冬8号 中国北京 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
轮选987 中国北京 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
中农2号 中国北京 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
中麦9号 中国北京 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
兰天13 中国甘肃 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
兰天15 中国甘肃 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
兰天17 中国甘肃 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
兰天18 中国甘肃 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
兰天21 中国甘肃 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
兰天22 中国甘肃 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
兰天23 中国甘肃 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
14FHBSN6402 国际玉米小麦改良中心 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
14FHBSN6404 国际玉米小麦改良中心 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
14FHBSN6405 国际玉米小麦改良中心 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
14FHBSN6408 国际玉米小麦改良中心 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
14FHBSN6409 国际玉米小麦改良中心 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
14FHBSN6411 国际玉米小麦改良中心 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
14FHBSN6418 国际玉米小麦改良中心 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
Gamenya 国际玉米小麦改良中心 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
Mayoor 国际玉米小麦改良中心 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
Ocoroni 国际玉米小麦改良中心 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
SYN1 国际玉米小麦改良中心 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
邯3475 中国河北 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
邯5316 中国河北 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
邯6172 中国河北 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
衡115 中国河北 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
衡136 中国河北 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
冀麦30 中国河北 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
冀麦38 中国河北 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
科农9204 中国河北 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
良星99 中国河北 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
石家庄8号 中国河北 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
中麦12 中国天津 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
矮抗58 中国河南 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
矮早781-99系选 中国河南 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
泛麦5号 中国河南 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
开麦18 中国河南 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
科大9612 中国河南 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
科农199 中国河南 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
洛麦21 中国河南 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
洛新998 中国河南 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
洛旱6号 中国河南 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
漯4-168 中国河南 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
漯麦6010 中国河南 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
内麦8号 中国河南 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
平安6号 中国河南 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
濮麦10号 中国河南 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
温麦19 中国河南 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
项麦99 中国河南 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
新麦13 中国河南 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
新麦19 中国河南 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
新麦20 中国河南 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
新麦208 中国河南 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
新麦22 中国河南 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
偃展4110 中国河南 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
豫麦10号 中国河南 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
豫麦38 中国河南 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
豫麦48 中国河南 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
豫麦69 中国河南 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
豫麦70 中国河南 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
豫麦70-36 中国河南 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
豫农035 中国河南 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
豫农202 中国河南 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
郑麦004 中国河南 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
郑麦9694 中国河南 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
郑麦98 中国河南 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
郑农17 中国河南 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
郑育麦958 中国河南 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
众麦1号 中国河南 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
周麦16 中国河南 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
周麦17 中国河南 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
周麦18 中国河南 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
周麦22 中国河南 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
周麦23 中国河南 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
04中36 中国湖北 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
武汉1号 中国湖北 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
鄂麦352 中国湖北 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
鄂麦596 中国湖北 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
鄂麦12 中国湖北 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
鄂麦18 中国湖北 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
鄂麦23 中国湖北 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
鄂麦27 中国湖北 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
鄂麦580 中国湖北 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
华2566 中国湖北 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
荆辐麦1号 中国湖北 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
荆麦103 中国湖北 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
襄麦25 中国湖北 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
襄麦55 中国湖北 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
淮麦17 中国江苏 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
淮麦18 中国江苏 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
淮麦20 中国江苏 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
连麦1号 中国江苏 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
连麦2号 中国江苏 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
宁麦11 中国江苏 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
宁麦8号 中国江苏 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
徐麦216 中国江苏 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
徐麦27 中国江苏 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
扬05-117 中国江苏 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
扬06-144 中国江苏 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
扬麦20 中国江苏 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
扬麦22 中国江苏 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
扬06G86 中国江苏 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
扬07-129 中国江苏 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
扬07-15 中国江苏 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
扬07-44 中国江苏 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
扬07-81 中国江苏 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
扬辐麦2号 中国江苏 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
扬麦11 中国江苏 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
扬麦12 中国江苏 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
扬麦13 中国江苏 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
扬麦14 中国江苏 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
扬麦15 中国江苏 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
扬麦158 中国江苏 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
扬麦16 中国江苏 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
扬麦17 中国江苏 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
镇麦168 中国江苏 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
宁春43 中国宁夏 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
宁春47 中国宁夏 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
宁冬10号 中国宁夏 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
宁冬11 中国宁夏 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
菏麦13 中国山东 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
济麦20 中国山东 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
济麦21 中国山东 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
济麦22 中国山东 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
鲁农116 中国山东 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
山农664 中国山东 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
山农15 中国山东 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
山农16 中国山东 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
山农189 中国山东 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
山农8355 中国山东 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
泰农18 中国山东 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
泰山23 中国山东 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
潍麦8号 中国山东 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
烟农19 中国山东 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
烟农21 中国山东 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
烟农24 中国山东 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
临Y867 中国山西 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
临汾138 中国山西 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
临优2069 中国山西 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
陕627 中国陕西 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
陕麦139 中国陕西 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
远丰175 中国陕西 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
陕农138 中国陕西 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
陕农757 中国陕西 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
陕农78 中国陕西 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
西农2000 中国陕西 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
西农3517 中国陕西 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
小偃166 中国陕西 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
秦农142 中国陕西 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
XK0106-1-0806 中国四川 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
川麦42 中国四川 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
川麦43 中国四川 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
川麦50 中国四川 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
川麦51 中国四川 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
川麦52 中国四川 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
川麦42 中国四川 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
绵麦1403 中国四川 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
绵麦185 中国四川 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
绵麦37 中国四川 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
绵麦42 中国四川 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
绵阳99-3 中国四川 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
双抗7438 中国四川 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
西科麦2号 中国四川 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
西科麦4号 中国四川 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记
西科麦5号 中国四川 His-I His-Indel标记 PFT-III PFT-CAPS标记

Supplementary table 2

Detection of Fhb1 in 73 Yangmai and Ningmai cultivars (lines)"

序号
No.
品种(系)
Cultivars (lines)
Fhb1 序号
No.
品种(系)
Cultivars (lines)
Fhb1 序号
No.
品种(系)
Cultivars (lines)
Fhb1
1 宁麦4号 - 26 扬14-52 + 50 扬辐麦2149 +
2 宁麦14 + 27 扬14-61 - 51 扬辐麦3046 +
3 宁麦18 + 28 扬14-67 - 52 扬麦1号 -
4 宁麦26 + 29 扬14-88 - 53 扬麦3号 -
5 扬10-66 - 30 扬14-163 + 54 扬麦4号 -
6 扬11-125 - 31 扬14-166 + 55 扬麦5号 -
7 扬11G33 - 32 扬14-179 - 56 扬麦9号 -
8 扬12-25 + 33 扬14-197 - 57 扬麦10号 -
9 扬12-54 - 34 扬14-214 - 58 扬麦11 -
10 扬12-144 + 35 扬14-237 - 59 扬麦12 -
11 扬12-145 + 36 扬14-253 - 60 扬麦13 -
12 扬12G16 - 37 扬14-282 - 61 扬麦14 -
13 扬13-40 + 38 扬14品37 - 62 扬麦15 -
14 扬13-68 - 39 扬15-126 - 63 扬麦16 -
15 扬13-122 - 40 扬15G7 - 64 扬麦17 -
16 扬13-134 - 41 扬15G35 - 65 扬麦18 +
17 扬13-154 + 42 扬15G41 - 66 扬麦19 -
18 扬13G24 + 43 扬15G70 - 67 扬麦20 -
19 扬14-7 - 44 扬15G72 - 68 扬麦21 +
20 扬14-21 + 45 扬15G78 - 69 扬麦22 -
21 扬14-22 + 46 扬15G81 + 70 扬麦23 -
22 扬14-42 - 47 扬15G83 - 71 扬麦24 -
23 扬14-48 + 48 扬15品29 - 72 扬麦25 -
24 扬14-49 - 49 扬辐麦2054 - 73 扬麦158 -
25 扬14-50 -

Table 1

Specific primers used to amplify the open reading frames (ORF) of PFT, His, and HC"

引物
Primer
序列
Sequence (5′-3′)
退火温度
Tm (°C)
目的片段
Target fragment
PFT-1 F: ACAGGCACACACGGCTATAAATACC 61 PFT ORF片段1
Part 1 of PFT ORF
R: AGATGGCGACTCTGCTAGACTATCA
PFT-2 F: GCAACTCTATCAACATCGTCAATCTACC 61 PFT ORF片段2
Part 2 of PFT ORF
R: AGAACTGGATAGCACGCAAGCATAT
PFT-3 F: AGGCGGCATTATTGATGTTGAGGTAA 61 PFT ORF片段3
Part 3 of PFT ORF
R: GGTTTCACCTCTCACGACCCATG
HC3B-3 F: CAACCCAGTATCCGATACTTGTATAA 63 HC ORF
R: CTGCTCCAAGCAAGCACGTA
His3B-4 F: ATGCGTGCGCTGTACTTG 65 His ORF
R: CGTCACAGAGTCCAGTGAAA

Table 2

Analysis of variance (ANOVA) of Fusarium head blight index in 229 wheat cultivars"

变异来源
Source
自由度
df
平方和
SS
均方
MS
F P
基因型 Genotype 228 485051.53 2127.42 9.34 <0.0001
年份 Year 2 101181.96 50590.98 222.13 <0.0001
基因型×年份 Genotype × year 456 278453.19 610.64 2.68 <0.0001
重复(年份) Replication (year) 3 4285.51 1428.50 6.27 0.0003

Fig. 1

Structure, primer binding sites and three alleles of PFT gene The first nucleotide of the initiation codon reads as +1"

Fig. 2

Amplification profiles of marker PFT-CAPS in partial Chinese cultivars M: DL5000 DNA marker; 1-4: PFT-I cultivars, namely Sumai 3, Ningmai 9, Xinong 9871, and Xiaoyan 22; 5-8: PFT-II cultivars, namely Zhengmai 366, Lumai 21, Hengguan 35, and Ningchun 4. PCR products were digested with Dra I restriction endonuclease."

Table 3

Alleles of His and HC genes for the cultivars with PFT-I and their FHB indexes"

品种(系)
Cultivar (line)
来源
Origin
PFT检测方法
PFT detection method
His等位基因
His allele
HC等位基因
HC allele
病情指数
FHB index
苏麦3号 Sumai 3 江苏 Jiangsu 1, 2 His-I HC-I 7.97±6.86
宁7840 Ning 7840 江苏 Jiangsu 1, 2 His-I HC-I 20.12±17.35
镇麦5号 Zhenmai 5 江苏 Jiangsu 1, 2 His-I HC-I 30.23±8.78
宁麦9号 Ningmai 9 江苏 Jiangsu 1, 2 His-I HC-I 27.29±21.45
宁麦13 Ningmai 13 江苏 Jiangsu 1, 2 His-I HC-I 46.87±21.09
宁麦16 Ningmai 16 江苏 Jiangsu 1, 2 His-I HC-I 46.62±17.80
西农9871 Xinong 9871 陕西 Shaanxi 1, 2 His-II HC-I 94.33±4.97
小偃22 Xiaoyan 22 陕西 Shaanxi 1, 2 His-II HC-I 82.30±15.66
西农979 Xinong 979 陕西 Shaanxi 1, 2 His-II HC-I 76.46±26.53
荔垦2号 Liken 2 陕西 Shaanxi 1, 2 His-II HC-I 51.29±7.38
西农88 Xinong 88 陕西 Shaanxi 1, 2 His-II HC-I 77.05±19.41
陕麦150 Shaanmai 150 陕西 Shaanxi 1, 2 His-II HC-I 38.20±10.61
陕159 Shaan 159 陕西 Shaanxi 1, 2 His-II HC-I 59.93±6.15
陕253 Shaan 253 陕西 Shaanxi 1 His-II HC-I 65.93±6.29
陕715 Shaan 715 陕西 Shaanxi 1, 2 His-II HC-I 60.93±21.00
小偃6号 Xiaoyan 6 陕西 Shaanxi 1, 2 His-II HC-I 48.42±19.93
小偃107 Xiaoyan 107 陕西 Shaanxi 1 His-II HC-I 51.48±35.45
鄂07901 E07901 湖北 Hubei 1 His-II HC-I 47.02±35.36
烟农22 Yannong 22 山东 Shandong 1, 2 His-II HC-I 69.33±18.41
济宁16 Jining 16 山东 Shandong 1, 2 His-II HC-I 78.08±19.30
济麦19 Jimai 19 山东 Shandong 1 His-II HC-I 66.55±26.55
长6359 Chang 6359 山西 Shanxi 1, 2 His-II HC-I 60.61±33.45
郑麦9023 Zhengmai 9023 河南 Henan 1, 2 His-II HC-I 41.14±10.44
烟2415 Yan 2415 山东 Shandong 1 His-III HC-II 42.44±26.00

Fig. 3

Structure, primer binding sites, and alleles of HC and His genes for the cultivars with PFT-I"

Fig. 4

Amplification profiles of marker His-InDel in partial Chinese cultivars M: DL5000 DNA marker; 1-4: His-I cultivars, namely Sumai 3, Ning 7840, Ningmai 9, and Ningmai 13; 5-11: non His-I cultivars, namely Xinong 9871, Xiaoyan 22, Zhengmai 9023, Yan 2415, Yangmai 158, Jimai 22, and Aikang 58."

Fig. 5

Average FHB indexes of cultivars or lines with different PFT/His haplotypes"

Fig. 6

Gene flow of Fhb1 in 73 cultivars (lines) of Yangmai and Ningmai through founder parent Ningmai 9 Cultivars or lines in solid boxes were characterized carrying Fhb1 using PFT-CAPS and His-InDel markers, while those in dotted boxes were uncharacterized."

Supplementary table 3

Supplementary table 3 Pedigrees of Chinese wheat cultivars (lines) carrying Fhb1"

序号No. 品种
Cultivars (lines)
系谱
Pedigrees
1 苏麦3号 阿夫/台湾小麦
2 宁7840 阿芙乐尔/安徽11//苏麦3号
3 宁麦9号 扬麦6号/西风
4 宁麦13 宁麦9号系统选育
5 宁麦14 宁麦9号系统选育
6 宁麦16 宁麦8号/宁麦9号
7 宁麦18 宁麦9号2//宁麦9号/扬麦10号
8 宁麦26 宁9351/宁麦9号
9 扬麦18 宁麦9号4/3/扬麦1586//扬88-128/南农P045
10 扬麦21 宁麦9号/红蜷芒
11 扬12-144 扬麦162/山红麦//扬麦18/3/扬麦162
12 扬12-145 扬麦182/元友-2
13 扬12-25 宁麦13/5/宁93124/3/扬麦1586//扬88-128 /南农P045/4/扬麦15
14 扬13-154 镇麦8号//扬麦17/扬麦15
15 扬13-40 北京2620/扬麦18
16 扬13G24 镇麦8号/扬麦182
17 扬14-163 扬麦15/扬麦18
18 扬14-166 扬麦15/扬麦18
19 扬14-21 扬麦9号/扬麦18
20 扬14-22 扬麦9号/扬麦18
21 扬14-48 扬06G5//扬麦9号/扬辐麦3046
22 扬14-52 宁麦14//扬麦18/扬麦9号
23 扬15G81 镇021682/11/扬麦18/10/扬辐麦3046/9/扬麦18/8/扬麦6号/7/宁麦14/6/扬02G48/5/扬N28/4/扬麦17/3/扬麦6号2//扬麦9号/K107WX1
24 扬辐麦3046 宁麦8号/宁麦9号
25 扬辐麦2149 扬辐麦3046/扬麦19
26 镇麦5号 扬麦158/宁麦9号
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