欢迎访问作物学报，今天是
作物学报

作物学报 ›› 2007, Vol. 33 ›› Issue (04): 523-530.

• 综述 •    下一篇

植物数量性状关联分析研究进展

杨小红1;严建兵1;郑艳萍1;余建明2;李建生1,*   

  1. 1中国农业大学，国家玉米改良中心，农业部作物基因组学与遗传改良重点实验室；北京100094；23004 Throckmorton Plant Science Center, Kansas State University, Manhattan, KS, 66506-5501, USA
  • 收稿日期:2006-06-08 修回日期:1900-01-01 出版日期:2007-04-12 网络出版日期:2007-04-12
  • 通讯作者: 李建生

Reviews of Association Analysis for Quantitative Traits in Plants

YANG Xiao-Hong1,YAN Jian-Bing1,ZHENG Yan-Ping1,YU Jian-Ming2,LI Jian-Sheng1*   

  1. 1National Maize Improvement Center of China, Key Lab of Crop Genomics & Genetic Improvement of Ministry of Agriculture, China Agricultural University, Beijing, 100094, China; 23004 Throckmorton Plant Science Center, Kansas State University, Manhattan, KS, 66506-5501, USA
  • Received:2006-06-08 Revised:1900-01-01 Published:2007-04-12 Published online:2007-04-12
  • Contact: LI Jian-Sheng

PDF

2185

被引次数

566

摘要：

关联分析是新近开始在植物数量性状研究和植物育种中应用的一种分析方法。它以连锁不平衡为基础鉴定某一群体内性状与遗传标记或候选基因间的关系。本文在介绍连锁不平衡的定义和度量方法的基础上，综述了连锁不平衡和关联分析在植物方面的研究进展，并讨论了交配体系、重组、遗传漂变等对连锁不平衡程度的影响，以及连锁不平衡程度、群体结构对关联分析的影响，最后讨论了关联分析在植物数量性状和分子育种研究中可能的应用。

关键词: 关联分析, 连锁不平衡, 数量性状

Abstract:

Recently, association analysis has been widely employed to investigate quantitative traits in plant genetics and breeding. Association analysis is an approach to identify the relationship of molecular markers or candidate genes with traits in a given population based on linkage disequilibrium (LD). Here, we introduced the definition and measurements of LD and reviewed the advances of association analysis for the investigation of quantitative traits in plants. The effects of mating systems, such as recombination, genetic drift, and population structure to the patterns of LD were discussed. Finally, we also discussed the potential application of association analysis for dissecting quantitative traits and plant molecular breeding.

Key words: Association analysis, Linkage disequilibrium (LD), Quantitative trait

[1] 陈玲玲, 李战, 刘亭萱, 谷勇哲, 宋健, 王俊, 邱丽娟. 基于783份大豆种质资源的叶柄夹角全基因组关联分析[J]. 作物学报, 2022, 48(6): 1333-1345.
[2] 王靖天, 张亚雯, 杜应雯, 任文龙, 李宏福, 孙文献, 葛超, 章元明. 数量性状主基因+多基因混合遗传分析R软件包SEA v2.0[J]. 作物学报, 2022, 48(6): 1416-1424.
[3] 孙思敏, 韩贝, 陈林, 孙伟男, 张献龙, 杨细燕. 棉花苗期根系分型及根系性状的关联分析[J]. 作物学报, 2022, 48(5): 1081-1090.
[4] 王小雷, 李炜星, 欧阳林娟, 徐杰, 陈小荣, 边建民, 胡丽芳, 彭小松, 贺晓鹏, 傅军如, 周大虎, 贺浩华, 孙晓棠, 朱昌兰. 基于染色体片段置换系群体检测水稻株型性状QTL[J]. 作物学报, 2022, 48(5): 1141-1151.
[5] 黄莉, 陈玉宁, 罗怀勇, 周小静, 刘念, 陈伟刚, 雷永, 廖伯寿, 姜慧芳. 花生种子大小相关性状QTL定位研究进展[J]. 作物学报, 2022, 48(2): 280-291.
[6] 渠建洲, 冯文豪, 张兴华, 徐淑兔, 薛吉全. 基于全基因组关联分析解析玉米籽粒大小的遗传结构[J]. 作物学报, 2022, 48(2): 304-319.
[7] 赵海涵, 练旺民, 占小登, 徐海明, 张迎信, 程式华, 楼向阳, 曹立勇, 洪永波. 水稻协优9308重组自交系群体白叶枯病抗性的全基因组关联分析[J]. 作物学报, 2022, 48(1): 121-137.
[8] 许德蓉, 孙超, 毕真真, 秦天元, 王一好, 李成举, 范又方, 刘寅笃, 张俊莲, 白江平. 马铃薯StDRO1基因的多态性鉴定及其与根系性状的关联分析[J]. 作物学报, 2022, 48(1): 76-85.
[9] 于芮苏, 田小康, 刘斌斌, 段迎新, 李婷, 张秀英, 张兴华, 郝引川, 李勤, 薛吉全, 徐淑兔. 玉米抗倒伏相关性状QTL的关联和连锁分析[J]. 作物学报, 2022, 48(1): 138-150.
[10] 耿腊, 黄业昌, 李梦迪, 谢尚耿, 叶玲珍, 张国平. 大麦籽粒β-葡聚糖含量的全基因组关联分析[J]. 作物学报, 2021, 47(7): 1205-1214.
[11] 马娟, 曹言勇, 李会勇. 玉米穗轴粗全基因组关联分析[J]. 作物学报, 2021, 47(7): 1228-1238.
[12] 陈灿, 农保选, 夏秀忠, 张宗琼, 曾宇, 冯锐, 郭辉, 邓国富, 李丹婷, 杨行海. 广西水稻地方品种核心种质稻瘟病抗性位点全基因组关联分析[J]. 作物学报, 2021, 47(6): 1114-1123.
[13] 王吴彬, 童飞, KHAN Mueen Alam, 张雅轩, 贺建波, 郝晓帅, 邢光南, 赵团结, 盖钧镒. 大豆根部水压胁迫耐逆指数遗传体系解析[J]. 作物学报, 2021, 47(5): 847-859.
[14] 张春, 赵小珍, 庞承珂, 彭门路, 王晓东, 陈锋, 张维, 陈松, 彭琦, 易斌, 孙程明, 张洁夫, 傅廷栋. 甘蓝型油菜千粒重全基因组关联分析[J]. 作物学报, 2021, 47(4): 650-659.
[15] 靳义荣, 刘金栋, 刘彩云, 贾德新, 刘鹏, 王雅美. 普通小麦氮素利用效率相关性状全基因组关联分析[J]. 作物学报, 2021, 47(3): 394-404.
Viewed
Full text


Abstract

Cited
  Shared   
  Discussed   
No Suggested Reading articles found!
京ICP备15008789号-2