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作物学报 ›› 2023, Vol. 49 ›› Issue (9): 2582-2593.doi: 10.3724/SP.J.1006.2023.24195

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378份甘薯引进种遗传多样性及群体结构分析

苏一钧1(), 赵路宽2, 唐芬3, 戴习彬1, 孙亚伟1, 周志林1, 刘亚菊1, 曹清河1,2,3,*()   

  1. 1江苏徐淮地区徐州农业科学研究所 / 中国农业科学院甘薯研究所, 江苏徐州 221131
    2江苏师范大学生命科学学院, 江苏徐州 221116
    3海南大学园艺学院, 海南海口 570228
  • 收稿日期:2022-08-24 接受日期:2023-02-13 出版日期:2023-09-12 网络出版日期:2023-03-23
  • 通讯作者: *曹清河, E-mail: caoqinghe@jaas.ac.cn
  • 作者简介:苏一钧, E-mail: suyijun@jaas.ac.cn
  • 基金资助:
    财政部和农业农村部国家现代农业产业技术体系建设专项(CARS-10-GW01-2022);国家自然科学基金国际(地区)合作与交流项目(31461143017);农业农村部物种资源保护项目(19210138);江苏省根茎类种质资源库项目(JSGB2018-03);江苏省种业振兴揭榜挂帅项目(JBGS[2021]010)

Genetic diversity and population structure analysis of 378 introduced sweetpotato germplasm collections

SU Yi-Jun1(), ZHAO Lu-Kuan2, TANG Fen3, DAI Xi-Bin1, SUN Ya-Wei1, ZHOU Zhi-Lin1, LIU Ya-Ju1, CAO Qing-He1,2,3,*()   

  1. 1Jiangsu Xuhuai Regional Agricultural Academy of Sciences / Sweetpotato Research Institute, China Agricultural Academy of Sciences, Xuzhou 221131, Jiangsu, China
    2School of Life Sciences, Jiangsu Normal University, Xuzhou 221116, Jiangsu, China
    3Department of Horticulture, Hainan University, Haikou 570228, Hainan, China
  • Received:2022-08-24 Accepted:2023-02-13 Published:2023-09-12 Published online:2023-03-23
  • Supported by:
    China Agriculture Research System of MOF and MARA(CARS-10-GW01-2022);National Natural Science Foundation of China(31461143017);Species Resource Conservation Project of MARA(19210138);Jiangsu Root and Stem Germplasm Bank Project(JSGB2018-03);Jiangsu Seed Industry Revitalizing Project(JBGS[2021]010)

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摘要：

甘薯起源于中南美洲, 国外引进种不仅能够提升我国资源总量而且将会极大改变甘薯遗传基础狭窄的育种瓶颈。本文利用30对Simple sequence repeat (SSR)引物通过高通量核酸片段分析仪对378份甘薯种质资源进行基因分型, 鉴定了国家甘薯种质资源试管苗库(徐州)中的引进种种质, 分析了引进种之间的亲缘关系, 为甘薯引进种的利用和种质创新提供理论依据。利用PROSize 3.0软件读取条带, 获得01数据库, 将01数据导入Darwin软件计算Jaccard遗传距离矩阵, 利用MEGA 10对遗传距离矩阵聚类分析, 并用iTOL进行注释, 利用Structure 2.3.4对甘薯种质进行群体结构分析。结果表明, 对378份引进种进行分析, 共扩增获得120个多态性位点, 平均每对引物4个多态性位点。遗传距离矩阵结果显示种质间遗传距离最大为0.6207, 遗传距离最小为0.0448, 平均遗传距离为0.4027。利用MEGA 10进行聚类, 在遗传距离为0.2960处划分为3个类群, 类群I包含29份种质、类群II包含104份种质、类群III包含245份种质; 群体结构分析表明在ΔK=2时值最大, 划分为2个组群, 聚类与群体结构分析结果类似。组群2中, 主要以2015年以后新引进种质为主(95.4%), 表明新引进种质丰富了甘薯引进种的遗传多样性, 拓宽了原有资源库中的群体结构。本文通过SSR引物对378份甘薯引进种种质进行遗传多样性和群体结构分析, 可为甘薯种质创新、遗传育种、优异基因挖掘利用提供参考。

关键词: 甘薯引进种, 遗传多样性, 群体结构

Abstract:

Sweetpotato is originated from South and Central America, and the introduction of foreign species can not only increase the total quantity amount of germplasm resources of China, but also dramatically change the breeding bottleneck of sweetpotato with narrow genetic base. In this study, 378 sweetpotato germplasm collections from the national sweetpotato in vitro Genebank in Xuzhou were genotyped using 30 pairs of simple sequence repeat (SSR) primers by high-throughput nucleic acid fragment analyzer. Phylogenetic affinities among the introduced sweetpotato germplasm were analyzed to provide a theoretical basis for sweetpotato germplasm innovation and utilization. The bands were read using PROSize 3.0 software to establish the 01 database. The 01 database were imported into Darwin software to calculate Jaccard genetic distance matrix, clustered analysis of genetic distance matrix using MEGA 10, and then annotated with iTOL. Population structure of sweetpotato germplasm was constructed using Structure 2.3.4. The results showed that a total of 120 polymorphic loci were amplified in 378 sweetpotato germplasm, with an average of four polymorphic loci per primer pair. The genetic distance matrix revealed that the average genetic distance was 0.4027, the maximum genetic distance was 0.6207 and the minimum genetic distance was 0.0448. Clustering analysis of 378 sweetpotato germplasm were divided into three groups in 0.2960 genetic distance. Group I, II, and III contained 29, 104, and 245 collections, respectively. Population structure analysis indicated two clades were identified base on the largest value at ΔK=2. Clade II (95.4%) was dominated by newly introduced germplasm after 2015, indicating that the newly introduced germplasm enriched the genetic diversity of sweetpotato collections and broadening the population structure in the original resource base. Therefore, the genetic diversity and population structure analysis of 378 introduced sweetpotato germplasm can provide a reference for sweetpotato germplasm innovation, genetic breeding, and elite alleles mining and utilization.

Key words: introduced sweetpotato germplasm, genetic diversity, population structure

表1

种质资源信息"

编号
No.		 品种名称
Variety name		 来源地
Origin		 编号
No.		 品种名称
Variety name		 来源地
Origin
1 南瑞苕 Nanruishao 美国USA 190 美1-110 Mei1-110 美国USA
2 五魁好 Wukuihao 美国USA 191 CIP94-22 国际马铃薯中心CIP
3 澳墨红 Aomohong 美国USA 192 Excel 国际马铃薯中心CIP
4 白星 Baixing 美国USA 193 CIP-Jeve 国际马铃薯中心CIP
5 洛伽白 Luojiabai 美国USA 194 美洲7号America 7 美国USA
6 南后 Nanhou 美国USA 195 440390 国际马铃薯中心CIP
7 美24 Mei 24 美国USA 196 CIP黄心红皮CIP Huangxinhongpi 国际马铃薯中心CIP
8 美10 Mei 10 美国USA 197 440001 国际马铃薯中心CIP
9 农林31号 Nonglin 31 日本JPN 198 西蒙1号Ximeng 1 巴西BRA
10 引92878 Yin 92878 保加利亚BGR 199 黄金千贯Huangjinqianguan 日本JPN
11 马六甲 Maliujia 马来西亚MYS 200 PR-S16-6 菲律宾PHL
12 美国红 Meiguohong 美国USA 201 440334 国际马铃薯中心CIP
13 胜利百号 Shenglibaihao 日本JPN 202 CEMSA74-228 国际马铃薯中心CIP
14 高系14 Gaoxi 14 日本JPN 203 阿马里洛 Amarillo 国际马铃薯中心CIP
15 百年纪念 Bainianjinian 美国USA 204 九十九 Ninety-nine 国际马铃薯中心CIP
16 乔治红 Georgian red 美国USA 205 440019 国际马铃薯中心CIP
17 维斯卡20 Visca 20 菲律宾PHL 206 189121.14 国际马铃薯中心CIP
18 PR-S13-30 菲律宾PHL 207 440429 国际马铃薯中心CIP
19 UPLB-7 菲律宾PHL 208 Y10-5 韩国KOR
20 PI286629 菲律宾PHL 209 440029 国际马铃薯中心CIP
21 印第安金 Copperskin Gold 菲律宾PHL 210 CIP0628 日本JPN
22 凯比特 Kabiti 菲律宾PHL 211 EXCEL 美国USA
23 本各特 Benguet 菲律宾PHL 212 HYDRY 美国USA
24 NAS (美国引) NAS (Meiguoyin) 美国USA 213 106448.2 国际马铃薯中心CIP
25 改良普利苕 Gailiangpulishao 美国USA 214 106603.1 国际马铃薯中心CIP
26 沃克罗火玛 Luokeluohuoma 美国USA 215 106605.1 国际马铃薯中心CIP
27 美实 Meishi 美国USA 216 106861.3 国际马铃薯中心CIP
28 L-5-4 美国USA 217 106984.1 国际马铃薯中心CIP
29 农林10号 Nonglin 10 日本JPN 218 195037.2 国际马铃薯中心CIP
30 农林23号 Nonglin 23 日本JPN 219 199035.7 国际马铃薯中心CIP
31 农林26号 Nonglin 26 日本JPN 220 400060 国际马铃薯中心CIP
32 九州3号 Jiuzhou 3 日本JPN 221 401170 国际马铃薯中心CIP
33 九州5号 Jiuzhou 5 日本JPN 222 401396 国际马铃薯中心CIP
34 九州37号 Jiuzhou 37 日本JPN 223 421111 国际马铃薯中心CIP
35 日本566 Riben 566 日本JPN 224 421239 国际马铃薯中心CIP
36 日本种 Ribenzhong 日本JPN 225 422546 国际马铃薯中心CIP
37 摩洛哥 Moluoge 摩洛哥MAR 226 440004 国际马铃薯中心CIP
38 乌干达 Wuganda 乌干达UGA 227 441725 国际马铃薯中心CIP
39 刺伯塔 Cibota 马来西亚MYS 228 194573.9 国际马铃薯中心CIP
40 玉丰 Yufeng 日本JPN 229 199004.2 国际马铃薯中心CIP
41 Y1 中国CHN 230 199024.1 国际马铃薯中心CIP
42 Y2 中国CHN 231 199027.1 国际马铃薯中心CIP
43 Y-4 中国CHN 232 199027.12 国际马铃薯中心CIP
44 PR-S252 菲律宾PHL 233 199064.1 国际马铃薯中心CIP
45 苗不知 Miaobuzhi 日本JPN 234 199073.1 国际马铃薯中心CIP
46 红隼人 Hongsunren 日本JPN 235 199073.6 国际马铃薯中心CIP
47 白丰 Baifeng 日本JPN 236 400372 国际马铃薯中心CIP
48 白萨摩 Baisamo 日本JPN 237 400476 国际马铃薯中心CIP
49 Yen 139-2 日本JPN 238 401055 国际马铃薯中心CIP
50 萨摩光 Samoguan 日本JPN 239 401225 国际马铃薯中心CIP
51 红高系 Honggaoxi 日本JPN 240 420005 国际马铃薯中心CIP
52 九州58 Jiuzhou 58 日本JPN 241 440374 国际马铃薯中心CIP
53 红乙女 Hongyinyu 日本JPN 242 420027 国际马铃薯中心CIP
54 DJ6-31 日本JPN 243 420040 国际马铃薯中心CIP
55 总红 Zonghong 日本JPN 244 420079 国际马铃薯中心CIP
56 IV411 日本JPN 245 420114 国际马铃薯中心CIP
57 BSY147 国际马铃薯中心CIP 246 420249 国际马铃薯中心CIP
58 CN1108-13 世界蔬菜中心WVC 247 420318 国际马铃薯中心CIP
59 CN1280-3 世界蔬菜中心WVC 248 420746 国际马铃薯中心CIP
60 CN1208-15 世界蔬菜中心WVC 249 420807 国际马铃薯中心CIP
61 CI412-2 世界蔬菜中心WVC 250 420886 国际马铃薯中心CIP
62 PC#9 世界蔬菜中心WVC 251 422595 国际马铃薯中心CIP
63 I444 世界蔬菜中心WVC 252 422649 国际马铃薯中心CIP
64 Tc82-2 世界蔬菜中心WVC 253 440055 国际马铃薯中心CIP
65 TiB9 国际热带农业研究所IITA 254 187017.1 国际马铃薯中心CIP
66 TiB11 国际热带农业研究所IITA 255 194541.45 国际马铃薯中心CIP
67 TiS2544 国际热带农业研究所IITA 256 2006Y11 日本JPN
68 TiS8250 国际热带农业研究所IITA 257 2006Y13 日本JPN
69 TiS3290 国际热带农业研究所IITA 258 105086.1 国际马铃薯中心CIP
70 九州101 Jiuzhou 101 日本JPN 259 400062 国际马铃薯中心CIP
71 Ungbuay 世界蔬菜中心WVC 260 400069 国际马铃薯中心CIP
72 美绿 Meilyu 日本JPN 261 400148 国际马铃薯中心CIP
73 美88 Mei 88 美国USA 262 400188 国际马铃薯中心CIP
74 Toquecita 国际马铃薯中心CIP 263 400189 国际马铃薯中心CIP
75 CIP94-13 国际马铃薯中心CIP 264 400202 国际马铃薯中心CIP
76 PSB SP19 国际马铃薯中心CIP 265 400212 国际马铃薯中心CIP
77 440075 国际马铃薯中心CIP 266 440353 国际马铃薯中心CIP
78 440185 国际马铃薯中心CIP 267 441710 国际马铃薯中心CIP
79 PSB SP16 国际马铃薯中心CIP 268 Y09-5 美国USA
80 博勒加德 Beauregard 美国USA 269 106878.1 国际马铃薯中心CIP
81 AB94078.1 国际马铃薯中心CIP 270 421260 国际马铃薯中心CIP
82 CIP400036 国际马铃薯中心CIP 271 421262 国际马铃薯中心CIP
83 SR91109 国际马铃薯中心CIP 272 421781 国际马铃薯中心CIP
84 阿根廷 Argentina 阿根廷ARG 273 440088 国际马铃薯中心CIP
85 Coeuyo blane 古巴CUB 274 440396 国际马铃薯中心CIP
86 韩国2号 Korea-2 韩国KOR 275 188001 国际马铃薯中心CIP
87 韩国3号 Korea-3 韩国KOR 276 188001.2 国际马铃薯中心CIP
88 199062.1 国际马铃薯中心CIP 277 188003.1 国际马铃薯中心CIP
89 No2743 国际马铃薯中心CIP 278 188004.3 国际马铃薯中心CIP
90 CIP0604 日本JPN 279 191002.55 国际马铃薯中心CIP
91 CIP0611 日本JPN 280 420019 国际马铃薯中心CIP
92 CIP0623 日本JPN 281 420071 国际马铃薯中心CIP
93 安纳红 Annahong 日本JPN 282 420090 国际马铃薯中心CIP
94 LA10-16P 日本JPN 283 440049 国际马铃薯中心CIP
95 LA10-27P 日本JPN 284 400283 国际马铃薯中心CIP
96 LA10-33P 日本JPN 285 400306 国际马铃薯中心CIP
97 日本绫紫 Ribenlingzi 日本JPN 286 400363 国际马铃薯中心CIP
98 187003.1 国际马铃薯中心CIP 287 400378 国际马铃薯中心CIP
99 187016.2 国际马铃薯中心CIP 288 400411 国际马铃薯中心CIP
100 188022.1 国际马铃薯中心CIP 289 400417 国际马铃薯中心CIP
101 189123.25 国际马铃薯中心CIP 290 400445 国际马铃薯中心CIP
102 189123.68 国际马铃薯中心CIP 291 400457 国际马铃薯中心CIP
103 189135.9 国际马铃薯中心CIP 292 400504 国际马铃薯中心CIP
104 189140.32 国际马铃薯中心CIP 293 400515 国际马铃薯中心CIP
105 189148.18 国际马铃薯中心CIP 294 400517 国际马铃薯中心CIP
106 189148.21 国际马铃薯中心CIP 295 400575 国际马铃薯中心CIP
107 189150.1 国际马铃薯中心CIP 296 400784 国际马铃薯中心CIP
108 189165.37 国际马铃薯中心CIP 297 400785 国际马铃薯中心CIP
109 190094.52 国际马铃薯中心CIP 298 400786 国际马铃薯中心CIP
110 194513.15 国际马铃薯中心CIP 299 400819 国际马铃薯中心CIP
111 194515.15 国际马铃薯中心CIP 300 400905 国际马铃薯中心CIP
112 194521.2 国际马铃薯中心CIP 301 400912 国际马铃薯中心CIP
113 194539.36 国际马铃薯中心CIP 302 400924 国际马铃薯中心CIP
114 194541.28 国际马铃薯中心CIP 303 401068 国际马铃薯中心CIP
115 194569.1 国际马铃薯中心CIP 304 401101 国际马铃薯中心CIP
116 199025.2 国际马铃薯中心CIP 305 401117 国际马铃薯中心CIP
117 Y08-31 国际马铃薯中心CIP 306 401153 国际马铃薯中心CIP
118 400039 国际马铃薯中心CIP 307 401188 国际马铃薯中心CIP
119 400917 国际马铃薯中心CIP 308 401211 国际马铃薯中心CIP
120 440011 国际马铃薯中心CIP 309 440384 国际马铃薯中心CIP
121 440015 国际马铃薯中心CIP 310 401301 国际马铃薯中心CIP
122 440031 国际马铃薯中心CIP 311 401316 国际马铃薯中心CIP
123 440034 国际马铃薯中心CIP 312 401446 国际马铃薯中心CIP
124 440057 国际马铃薯中心CIP 313 401453 国际马铃薯中心CIP
125 440093 国际马铃薯中心CIP 314 401459 国际马铃薯中心CIP
126 440099 国际马铃薯中心CIP 315 401489 国际马铃薯中心CIP
127 440132 国际马铃薯中心CIP 316 401512 国际马铃薯中心CIP
128 440135 国际马铃薯中心CIP 317 402938 国际马铃薯中心CIP
129 440136 国际马铃薯中心CIP 318 420001 国际马铃薯中心CIP
130 440139 国际马铃薯中心CIP 319 420068 国际马铃薯中心CIP
131 440170 国际马铃薯中心CIP 320 420169 国际马铃薯中心CIP
132 440185 国际马铃薯中心CIP 321 420174 国际马铃薯中心CIP
133 440189 国际马铃薯中心CIP 322 420183 国际马铃薯中心CIP
134 440328 国际马铃薯中心CIP 323 420188 国际马铃薯中心CIP
135 441247 国际马铃薯中心CIP 324 420206 国际马铃薯中心CIP
136 441771 国际马铃薯中心CIP 325 420225 国际马铃薯中心CIP
137 Y09-6 美国USA 326 420255 国际马铃薯中心CIP
138 Y09-7 美国USA 327 420270 国际马铃薯中心CIP
139 印尼3号 Yinni 3 印度尼西亚IDN 328 420319 国际马铃薯中心CIP
140 印尼1号 Yinni 1 印度尼西亚IDN 329 420345 国际马铃薯中心CIP
141 401430 国际马铃薯中心CIP 330 420395 国际马铃薯中心CIP
142 420014 国际马铃薯中心CIP 331 420436 国际马铃薯中心CIP
143 421132 国际马铃薯中心CIP 332 420446 国际马铃薯中心CIP
144 440001 国际马铃薯中心CIP 333 420497 国际马铃薯中心CIP
145 440004 国际马铃薯中心CIP 334 420553 国际马铃薯中心CIP
146 440008 国际马铃薯中心CIP 335 420696 国际马铃薯中心CIP
147 440018 国际马铃薯中心CIP 336 420760 国际马铃薯中心CIP
148 440019 国际马铃薯中心CIP 337 420788 国际马铃薯中心CIP
149 440019 国际马铃薯中心CIP 338 420845 国际马铃薯中心CIP
150 440024 国际马铃薯中心CIP 339 420884 国际马铃薯中心CIP
151 440107 国际马铃薯中心CIP 340 420912 国际马铃薯中心CIP
152 440112 国际马铃薯中心CIP 341 420913 国际马铃薯中心CIP
153 440214 国际马铃薯中心CIP 342 420937 国际马铃薯中心CIP
154 440740 国际马铃薯中心CIP 343 420947 国际马铃薯中心CIP
155 441357 国际马铃薯中心CIP 344 421070 国际马铃薯中心CIP
156 441768 国际马铃薯中心CIP 345 421071 国际马铃薯中心CIP
157 卡文顿 Cvington 美国USA 346 421113 国际马铃薯中心CIP
158 美国7号 Meiguo 7 美国USA 347 421122 国际马铃薯中心CIP
159 印尼6号 Yinni 6 印度尼西亚IDN 348 421126 国际马铃薯中心CIP
160 CIP0602 日本JPN 349 421318 国际马铃薯中心CIP
161 CIP0609 日本JPN 350 421334 国际马铃薯中心CIP
162 CIP0627 日本JPN 351 422536 国际马铃薯中心CIP
163 693019 国际马铃薯中心CIP 352 441701 国际马铃薯中心CIP
164 埃文Kprocl Evankprocl 美国USA 353 440025 国际马铃薯中心CIP
165 斯科特农场Scott Farms 美国USA 354 440027 国际马铃薯中心CIP
166 187016.1 国际马铃薯中心CIP 355 440036 国际马铃薯中心CIP
167 400177 国际马铃薯中心CIP 356 440037 国际马铃薯中心CIP
168 420014 国际马铃薯中心CIP 357 440045 国际马铃薯中心CIP
169 420017 国际马铃薯中心CIP 358 440056 国际马铃薯中心CIP
170 420026 国际马铃薯中心CIP 359 440068 国际马铃薯中心CIP
171 420028 国际马铃薯中心CIP 360 440095 国际马铃薯中心CIP
172 420031 国际马铃薯中心CIP 361 440105 国际马铃薯中心CIP
173 420048 国际马铃薯中心CIP 362 440111 国际马铃薯中心CIP
174 440218 国际马铃薯中心CIP 363 440125 国际马铃薯中心CIP
175 440284 国际马铃薯中心CIP 364 440130 国际马铃薯中心CIP
176 440366 国际马铃薯中心CIP 365 440146 国际马铃薯中心CIP
177 441724 国际马铃薯中心CIP 366 440166 国际马铃薯中心CIP
178 SUWONG 美国USA 367 440167 国际马铃薯中心CIP
179 556937 美国USA 368 440173 国际马铃薯中心CIP
180 BETA-2 印度尼西亚IDN 369 440184 国际马铃薯中心CIP
181 106212.1 国际马铃薯中心CIP 370 440227 国际马铃薯中心CIP
182 106282.1 国际马铃薯中心CIP 371 440234 国际马铃薯中心CIP
183 106469.3 国际马铃薯中心CIP 372 440246 国际马铃薯中心CIP
184 188002.1 国际马铃薯中心CIP 373 440256 国际马铃薯中心CIP
185 189151.8 国际马铃薯中心CIP 374 440285 国际马铃薯中心CIP
186 401562 国际马铃薯中心CIP 375 440309 国际马铃薯中心CIP
187 420607 国际马铃薯中心CIP 376 440421 国际马铃薯中心CIP
188 421100 国际马铃薯中心CIP 377 441006 国际马铃薯中心CIP
189 山川紫 Shanchuanzi 日本JPN 378 441149 国际马铃薯中心CIP

表2

SSR引物信息"

引物编号
Primer		 前引物
Forward sequence (5°-3°)		 后引物
Reverse sequence (5°-3°)		 退火温度
Tm (℃)		 多态为点数
Polymorphic loci
C22 CCATTCACTCCATCGTTTCA GGTCCCCAACAGCTCAAATA 55.8 4
C24 GCACTCAAACCAGGGATCAT TCCCACAGTTCTGACCATCA 57.8 4
C27 GAATCACAGCAAGCAACTAAGAGA AGAAAACCCCGACGATCTTT 58.6 6
C30 GGCTTACGAGGTTGTTCCAA ATAGTCGTCTTCGCCCTCAA 55.8 4
C32 GACCTGCGAATCGAAATCTT CTTGGACTTCCTCTGCCTTG 57.8 4
C33 GCTTATATTGCGCCATGGTT TTGCCTCCAGAGCGTTATCT 55.8 4
C36 ATGGATTCCAAGAGCACCAG TGTAGGGCACTTCCCTTTTG 57.8 4
C48 ATCCACTTCCGTTCATCCAC CGCAAATCCCAGGTCTTTTA 57.8 4
C5 GTGCCATCTGATCACCCAAT TCCCAGGTGGTTAGGCATAC 59.8 4
C51 GAGGACTTCTCCGACCAGTG ACCAGATCCGTGTTCGTCTC 59.9 10
C52 CCAACAGGACTTCGGTGTCT ATAGTCGTCTTCGCCCTCAA 58.8 6
C53 ACCAGGGCTTTTGCTCTCTT AGACTGCAGCATGGCTTCTT 57.8 3
C55 TACGCCTATCATCCACGTCA CCTCTGGCAAGCACTTCATT 57.8 3
C56 CCACCCTAAGACTGAAGAAGAAA GCAAAGCAAACAAAGCAAAA 58.8 3
C58 TTGTACCATTCGCTGATCCA ATAGCCAAGCCTCGGGAAAT 55.8 3
C59 CCCGTGATCAACATCCTCTT AGACTGCAGCATGGCTTCTT 57.8 3
C6 ATGGATTCCAAGAGCACCAG AGACTGCAGCATGGCTTCTT 57.8 4
C60 ATGGCGCCAATCTCTCTCTA GATGAGGTTGAGTTGCCTGA 57.8 4
C66 ATGGATTCCAAGAGCACCAG GAGCAGCCCATTCAGAACAT 57.8 3
C67 GGGCTTTCGCTCTCTTTCTT CCTTTGGAACCTTCTTGCTG 57.8 3
C71 CCCCATGTTTAGGATGGATG AAACAAAACAAGGTTAGGATGGA 55.0 6
Z113 CTGTGCCTTGACTTTGTTGG CCTTGGCTTGAGCTAACCTCT 57.0 2
Z135 CGAGTTGGTTTTGAGGAACC GAGTGTGCGTTGCGTTTATTT 57.0 3
Z25 AGCAGTTTCGCCATATCCAG CACCGTTTTGAATCAGCAAA 55.7 4
Z37 GGCGACTGTAATGTGGTGAA CGGGAGGTATCTTGGATTGA 58.7 10
Z57 AGCTGAGTGGAGGTGGAAGA ATAATTGCTGTGGGGCTGTT 55.8 2
Z69 AATTTTCCGCTCTTCGAGTG CGCCGTTGATCTTGATGAGT 57.8 2
Z71 AAGAGAAGGATGGGGAATGC GCGAAGGGAATTAAACAGACA 55.0 3
Z91 CACCAAGAAACGAAGCAGAA CAAGGTTTATTGTTGACATGGAGA 55.0 2
ZY5 TCGTCACTTTCTCTCTCCTG GCTCTCCTCCATCTCTTCTG 58.8 3

图1

引物Z135-3与Z71-1分别在甘薯种质中扩增的结果 A: 引物Z135-3在95份甘薯中的位点信息; B: 引物Z71-1在95份甘薯中的位点信息。"

图2

378份甘薯种质资源的聚类分析"

图3

K值曲线"

图4

378份甘薯种质资源群体结构"

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