基于高通量测序的大麦InDel标记开发及应用

doi:10.3724/SP.J.1006.2020.91076

Abstract

Abstract:

Molecular markers are the basic tools in genetic research and widely used in genetic diversity analysis, germplasm identification, genetic map construction and gene mapping. Based on the whole genome re-sequencing data of barley, we developed 118 pairs of InDel markers covering the whole barley genome. Forty-nine barley germplasms from different geographical regions were used to detect the effectiveness of primers. And 72 co-dominant InDel markers with two alleles were selected for further genetic distance analysis in 288 barley germplasm and constructing phylogenetic tree. Thirty-two core InDel markers were screened, covering seven chromosomes of barley, with an average PIC of 0.44, and an average MAF of 0.34. The tested barley germplasms were rich in genetic diversity and could cluster most of the varieties with the same geographical origin. This study indicated that the 32 dimorphic InDel markers developed not only effectively reflect the genetic relationship between varieties, but also enrich the molecular markers used for the identification of barley varieties. The above core InDel markers have provided certain the theoretical significance and application value in on the identification of barley varieties, the relationship analysis of barley resources and group division of barley resources.

Key words: barley, re-sequencing, InDel markers, variety identification

XU Ting-Ting, WANG Qiao-Ling, ZOU Shu-Qiong, DI Jia-Chun, YANG Xin, ZHU Yin, ZHAO Han, YAN Wei. Development and application of InDel markers based on high throughput sequencing in barley[J].Acta Agronomica Sinica, 2020, 46(9): 1340-1350.

Figures/Tables 6

Table 1

Information of InDel markers"

引物编号 Primer No.	染色体 Chr.	正向引物 Forward primer (5′-3′)	反向引物 Reverse primer (5′-3′)	起始位置 Start site (bp)	插入/缺失碱基数 No. of InDel base		MAF	PIC
JSB008	1H	GTTCCGTCACTTCTGGCATTCG	TGTCTCTCCCGCCCTCTCTTC	504080409	43		0.46	0.50
JSB011	2H	CGTTGAGAAAGGATGCGGAGAC	TGAAGCTGCGCGAACAAAGAC	3890795	61		0.35	0.46
JSB019	2H	TGGTTGCTCTTGTTGCCGTATC	GGACGCCCTAGCTGGTGATG	102398868	66		0.34	0.45
JSB021	2H	ATGCTCCGTGTCCCGTATCTTG	CACTGGCGTGGATCCTGACTG	672027714	40		0.37	0.46
JSB028	2H	AACATGGCCTCGTGCTAACCG	GCGGCGGCGTTCCGATTAG	724170740	32		0.42	0.49
JSB029	2H	CTCATGGTTCGAGTTGCTTGCG	GCTGCTTGTTGCTGGTGAAGG	726868326	48		0.36	0.46
JSB030	2H	ACCGCTGCCAAGCCCATTC	TGAAGAGCAACCGGCGATGTG	727308287	62		0.43	0.49
JSB034	2H	ACCGACCGTCAGAAGCATAGC	TGAGGCAAGCGAAGCGAGAG	741235783	43		0.25	0.37
JSB036	2H	CAAGCGTGCGAACACTCCAAG	TGCTGCCTGTGTGTGAAAAGTC	756450751	87		0.25	0.38
JSB039	3H	TTAATCGATGTGACGCCTTCCG	CGACAACCCTCGAAGCTTATGG	13443810	48		0.46	0.50
JSB045	3H	TGCGCGAAGGTGTGGTAGTC	GGCACAAAGGTGGGCTTCAAAG	653794647	34		0.20	0.31
JSB048	3H	GCTCAATGGCTGATGCGTGTG	GCCTCGGTGCCTCACATGG	660696828	58		0.24	0.37
JSB053	3H	ATAGCCTTGCGTGCAGACAAAG	TCCCAGTCCGATGACGAGAGAG	682310294	33		0.46	0.50
JSB056	3H	ACCGCACAAAGTACAGTTCAGG	GCGCCGGTGCTCTTCGAG	695541052	49		0.39	0.47
JSB058	4H	GCTGATGGTGCTGACTTGAAGG	TGGTGCTTGGCGGATACTTGG	10559789	38		0.28	0.40
引物编号 Primer No.	染色体 Chr.	正向引物 Forward primer (5′-3′)	反向引物 Reverse primer (5′-3′)	起始位置 Start site (bp)	插入/缺失碱基数 No. of InDel base	MAF		PIC
JSB060	4H	GGCCTTCCGGTTCCTTGTTCC	GCTCATCCGAGAAGACCTGACC	582592562	45	0.23		0.35
JSB064	5H	GGCGAAGGTTCCATCTGAGCAG	TGGTCGTTGTGGTTGGCGTTC	5795294	52	0.42		0.49
JSB066	5H	ACAAGCAAGCGAGTTCATGTCC	GCTGAGGCAAGACGGGTGTTAC	9482417	51	0.47		0.50
JSB068	5H	TTTGTGCCAGCAGTTCACTGTG	CCAGAGCAAAGCAACCAACATG	16013429	123	0.49		0.50
JSB070	5H	TCAGTCCCACTTCCTCGTTTCC	TGGAATGCCCGAACTGCTACG	187268036	83	0.24		0.36
JSB072	5H	ACCCAACAGAAGGCAAGCTGAG	TGGCGGGAGAGACGGGATG	454577201	44	0.34		0.45
JSB073	5H	CTCGTCGCAACCGCCTCTG	TCCATCCGCCTCCCTCCATTG	499579120	49	0.30		0.42
JSB075	5H	ACCAGCGAGCATGAGGTCTATG	AGCCACCCATGAAACCGTAGC	586304246	37	0.30		0.42
JSB077	5H	TCTTCACTCTGCCTGCACTTGG	AAAAGCCAGCCCATTCTTTCCC	598316392	30	0.27		0.39
JSB087	6H	ATGGCAACCACAGCAACAATCC	TTGCTGGTGGAGATGGTGAAAC	1170815	98	0.37		0.47
JSB090	6H	AAGTCCCTGCTCGCTAGACAAG	CGATGGCTCCAAGGGTTCTCC	13520409	30	0.34		0.45
JSB093	6H	AGCACATCTGAGACACCGATCC	TTGCCGTTTTGGTTGGTTCCTG	555335793	71	0.49		0.50
JSB105	7H	CCTGGTTGGTGGTTGTCACTG	TGCTGTAACGGAGAGTTTGCTC	58182221	43	0.31		0.43
JSB107	7H	GCTCCAAGGTTGAATGCAAGGG	GCTGGGCACAAAGCTGAAGG	600763810	63	0.29		0.42
JSB115	7H	CGGTCATGGCACTTGGTTCTG	GTGGGCATCCATCCAACGTAAC	647630299	67	0.32		0.44
JSB116	7H	GGTTGCGAGTGAGGAACTGATG	CCCGCCACCGACTTCCATG	648588179	36	0.27		0.39
JSB117	7H	CATCCACGACGCCACATTGTTG	TGGCTCGCTGATGGGCATTG	648931581	63	0.34		0.45

Table 1

Fig. 1

Fig. 2

Table 2

Statistics of genetic distance"

编号 No.	最小遗传距离 Minimum genetic distance			最大遗传距离 Maximum genetic distance							编号 No.	最小遗传距离 Minimum genetic distance		最大遗传距离 Maximum genetic distance
	距离 Distance		对应种质编号 No.	距离 Distance				对应种质编号 No.				距离 Distance	对应种质编号 No.	距离 Distance				对应种质编号 No.
	X1	0		X2			0.70			X4		X145	0.18	X272			0.68		X15
X2	0		X1	0.70				X4				X146	0.08	X123			0.70		X107
X3	0.08		X25	0.73				X189			X147	0.13	X205	0.73				X254
X4	0.22		X29	0.70				X1			X148	0.15	X213	0.73				X262
X5	0.14		X279	0.64				X95			X149	0.08	X262	0.71				X148
X6	0.22		X31	0.73				X88			X150	0.08	X251	0.76				X189
X7	0.15		X107	0.75				X125			X151	0.10	X48	0.71				X107
X8	0.27		X9	0.74				X257			X152	0.17	X248	0.68				X114
X9	0.19		X7	0.71				X263			X153	0.13	X154	0.67				X33
X10	0.26		X205	0.71				X257			X154	0.13	X258	0.66				X107
X11	0.13		X137	0.70				X278			X155	0.15	X168	0.64				X88
X12	0.15		X68	0.70				X189			X156	0.16	X134	0.69				X95
X13	0.20		X15	0.68				X250			X157	0.14	X137	0.66				X113
X14	0.19		X53	0.73				X238			X158	0.19	X155	0.73				X88
X15	0.20		X13	0.77				X32			X159	0.13	X166	0.69				X107
X16	0.17		X162	0.68				X164			X160	0.21	X74	0.73				X139
X17	0.15		X148	0.69				X262			X161	0.16	X257	0.78				X94
X18	0.30		X242	0.68				X113			X162	0.13	X270	0.69				X189
X19	0.28		X111	0.62				X173			X163	0.21	X152	0.72				X282
X20	0.18		X226	0.68				X215			X164	0.22	X156	0.72				X176
X21	0.23		X29	0.69				X104			X165	0.19	X180	0.70				X101
X22	0.21		X171	0.70				X85			X166	0.06	X253	0.64				X4
X23	0.11		X198	0.72				X107			X167	0.06	X194	0.70				X95
X24	0.25		X20	0.68				X177			X168	0.08	X192	0.69				X15
X25	0.08		X3	0.72				X189			X169	0.05	X192	0.67				X97
X26	0.22		X13	0.67				X247			X170	0.13	X174	0.68				X107
X27	0.20		X162	0.58				X6			X171	0.21	X22	0.76				X88
X28	0.27		X114	0.67				X204			X172	0.13	X121	0.69				X88
X29	0.15		X107	0.73				X268			X173	0.32	X122	0.79				X284
X30	0.22		X80	0.66				X173			X174	0.13	X170	0.62				X106
X31	0.12		X212	0.69				X103			X175	0.13	X3	0.76				X173
X32	0.15		X44	0.77				X15			X176	0.18	X25	0.72				X107
X33	0.23		X207	0.67				X153			X177	0.30	X148	0.75				X221
X34	0.31		X28	0.68				X281			X178	0.23	X283	0.65				X221
X35	0.16		X3	0.69				X95			X179	0.21	X119	0.68				X221
X36	0.21		X82	0.68				X173			X180	0.13	X48	0.72				X107
X37	0.11		X46	0.77				X114			X181	0.18	X188	0.63				X94
X38	0.15		X279	0.68				X280			X182	0.14	X54	0.71				X106
X39	0.19		X230	0.64				X113			X183	0.25	X155	0.65				X80
X40	0.32		X66	0.69				X15			X184	0.15	X257	0.80				X94
X41	0.24		X163	0.65				X95			X185	0.21	X170	0.60				X29
X42	0.22		X57	0.71				X103			X186	0.17	X131	0.66				X107
X43	0.21		X148	0.69				X158			X187	0.18	X119	0.68				X89
X44	0.09		X67	0.70				X95			X188	0.18	X181	0.67				X65
X45	0.15		X166	0.65				X15			X189	0.24	X105	0.76				X150
X46	0.11		X37	0.76				X118			X190	0.26	X250	0.65				X9
X47	0.18		X48	0.73				X107			X191	0.08	X129	0.73				X231
X48	0.10		X151	0.72				X107			X192	0.05	X169	0.68				X97
X49	0.16		X198	0.69				X88			X193	0.16	X278	0.72				X117
X50	0.19		X123	0.72				X106			X194	0.06	X167	0.70				X95
X51	0.16		X37	0.67				X15			X195	0.13	X146	0.70				X15
X52	0.19		X84	0.75				X7			X196	0.23	X259	0.65				X106
X53	0.19		X14	0.73				X118			X197	0.14	X284	0.77				X173
X54	0		X198	0.72				X107			X198	0	X54	0.70				X107
X55	0.16		X201	0.73				X7			X199	0.22	X112	0.67				X247
X56	0.13		X235	0.69				X7			X200	0.22	X205	0.71				X247
X57	0.19		X37	0.72				X94			X201	0.06	X216	0.68				X107
X58	0.19		X54	0.66				X189			X202	0.14	X218	0.66				X88
X59	0.20		X268	0.66				X149			X203	0.09	X213	0.71				X173
X60	0.14		X223	0.68				X107			X204	0.17	X162	0.73				X276
X61	0.11		X91	0.65				X177			X205	0.13	X147	0.83				X257
X62	0.19		X234	0.75				X94			X206	0.19	X107	0.70				X125
X63	0.21		X112	0.61				X273			X207	0.06	X208	0.66				X52
X64	0.23		X5	0.66				X189			X208	0.06	X207	0.61				X173
X65	0.19		X233	0.72				X7			X209	0.21	X111	0.66				X77
X66	0.14		X46	0.71				X106			X210	0.23	X107	0.67				X125
X67	0.09		X44	0.72				X88			X211	0.21	X136	0.65				X135
X68	0.15		X72	0.65				X88			X212	0.12	X31	0.70				X95
X69	0.13		X72	0.60				X164			X213	0.09	X203	0.71				X173
X70	0.22		X69	0.64				X280			X214	0.18	X208	0.63				X204
X71	0.04		X73	0.69				X107			X215	0.27	X118	0.70				X182
X72	0.12		X198	0.63				X280			X216	0.06	X201	0.67				X107
X73	0.04		X71	0.69				X107			X217	0.29	X170	0.66				X114
X74	0.16		X198	0.71				X189			X218	0.03	X54	0.68				X107
X75	0.09		X198	0.66				X105			X219	0.19	X98	0.70				X247
X76	0.20		X87	0.74				X257			X220	0.23	X88	0.66				X263
X77	0.08		X235	0.71				X107			X221	0.18	X225	0.75				X177
X78	0.13		X225	0.69				X7			X222	0.14	X123	0.71				X15
X79	0.19		X243	0.69				X106			X223	0.13	X242	0.68				X107
X80	0.20		X38	0.69				X114			X224	0.14	X198	0.63				X107
X81	0.24		X246	0.76				X88			X225	0.11	X225	0.66				X278
X82	0.14		X84	0.70				X164			X226	0.06	X54	0.66				X107
X83	0.19		X69	0.66				X269			X227	0.25	X224	0.75				X255
X84	0.09		X73		0.71			X177			X228	0.26	X188		0.68			X177
X85	0.16		X225		0.70			X22			X229	0.17	X195		0.67			X114
X86	0.28		X154		0.63			X81			X230	0.14	X198		0.69			X189
X87	0.20		X76		0.65			X247			X231	0.16	X263		0.73			X191
X88	0.11		X89		0.76			X81			X232	0.15	X274		0.75			X114
X89	0.11		X88		0.77			X269			X233	0.13	X84		0.63			X189
X90	0.20		X94		0.71			X257			X234	0.10	X44		0.76			X94
X91	0.11		X61		0.64			X264			X235	0.08	X77		0.69			X107
X92	0.27		X82		0.69			X164			X236	0.23	X113		0.65			X52
X93	0.20		X76		0.77			X257			X237	0.23	X103		0.65			X20
X94	0.20		X90		0.80			X184			X238	0.21	X100		0.73			X14
X95	0.25		X15		0.77			X141			X239	0.15	X205		0.73			X257
X96	0.22		X93		0.72			X266			X240	0.21	X248		0.67			X13
X97	0.24		X118		0.74			X127			X241	0.16	X198		0.67			X189
X98	0.16		X99		0.69			X259			X242	0.08	X123		0.70			X114
X99	0.11		X118		0.73			X259			X243	0.18	X32		0.67			X15
X100	0.15		X103		0.77			X257			X244	0.19	X169		0.63			X20
X101	0.19		X99		0.70			X165			X245	0.22	X267		0.63			X40
X102	0.24		X250		0.70			X15			X246	0.24	X45		0.64			X88
X103	0.15		X100		0.75			X257			X247	0.23	X53		0.77			X94
X104	0.18		X103		0.74			X81			X248	0.14	X123		0.66			X280
X105	0.24		X189		0.73			X108			X249	0.13	X260		0.69			X94
X106	0.24		X116		0.74			X247			X250	0.19	X141		0.68			X13
X107	0.15		X29		0.73			X47			X251	0.08	X150		0.76			X189
X108	0.11		X285		0.73			X105			X252	0.08	X137		0.70			X97
X109	0.11		X234		0.69			X95			X253	0.06	X166		0.66			X106
X110	0.21		X56		0.63			X105			X254	0.18	X134		0.82			X205
X111	0.07		X112		0.63			X269			X255	0.27	X135		0.75			X227
X112	0.07		X111		0.66			X268			X256	0.16	X120		0.72			X114
X113	0.22		X7		0.75			X52			X257	0.15	X184		0.83			X205
X114	0.18		X118		0.77			X123			X258	0.10	X123		0.73			X107
X115	0.09		X201		0.66			X9			X259	0.20	X131		0.75			X276
X116	0.11		X118		0.70			X247			X260	0.13	X249		0.72			X94
X117	0.15		X78		0.73			X278			X261	0.17	X229		0.63			X15
X118	0.11		X99		0.76			X46			X262	0.08	X149		0.73			X148
X119	0.18		X187		0.73			X221			X263	0.16	X144		0.71			X9
X120	0.16		X256		0.66			X175			X264	0.23	X248		0.69			X106
X121	0.13		X172		0.69			X97			X265	0.13	X69		0.65			X15
X122	0.23		X143		0.66			X52			X266	0.13	X168		0.73			X15
X123	0.08		X242		0.77			X114			X267	0.20	X266		0.67			X96
X124	0.20		X157		0.66			X7			X268	0.20	X59		0.73			X106
X125	0.19		X170		0.75			X7			X269	0.19	X161		0.77			X89
X126	0.05		X143			0.66			X164		X270	0.13	X162			0.69		X189
X127	0.16		X162			0.74			X97		X271	0.17	X131			0.67		X99
X128	0.26		X9			0.66			X173		X272	0.13	X131			0.69		X114
X129	0.08		X191			0.73			X231		X273	0.29	X50			0.72		X96
X130	0.03		X133			0.73			X93		X274	0.13	X266			0.73		X114
X131	0.13		X272			0.71			X107		X275	0.25	X60			0.65		X189
X132	0.15		X222			0.66			X114		X276	0.23	X280			0.77		X161
X133	0.03		X130			0.72			X93		X277	0.17	X272			0.64		X193
X134	0.12		X212			0.69			X205		X278	0.16	X193			0.73		X117
X135	0.24		X269			0.66			X239		X279	0.14	X5			0.64		X280
X136	0.18		X168			0.68			X177		X280	0.23	X276			0.70		X150
X137	0.08		X252			0.70			X15		X281	0.21	X131			0.68		X13
X138	0.21		X250			0.70			X8		X282	0.28	X286			0.72		X163
X139	0.24		X122			0.73			X160		X283	0.21	X119			0.67		X89
X140	0.23		X46			0.70			X118		X284	0.13	X150			0.79		X173
X141	0.19		X250			0.77			X95		X285	0.11	X108			0.69		X107
X142	0.16		X260			0.72			X276		X286	0.22	X283			0.70		X88
X143	0.05		X126			0.66			X88		X287	0.30	X280			0.67		X14
X144	0.16		X263			0.72			X15		X288	0.15	X285			0.73		X107

Table 2

Fig. 3

Supplementary table 1

Information of 288 barley germplasm in present study"

编号 No.	材料名称 Accession	来源 Origin
X1	Morex	美国 USA
X2	鄂941049 E 941049	中国湖北 Hubei, China
X3	AC Bacon	加拿大 Canada
X4	四国裸89号 Siguoluo 89	日本 Japan
X5	AC Burman	加拿大 Canada
X6	行幸大麦 Xingxingdamai	日本 Japan
X7	旱地兰 Handilan	中国 China
X8	宜平四棱大麦 Yipingsilengdamai	中国云南 Yunnan, China
X9	柱大麦 Zhudamai	中国河南 Henan, China
X10	C2118	加拿大 Canada
X11	品H0909 Pin H0909	中国北京 Beijing, China
X12	济皮02 Jipi 02	中国山东 Shandong, China
X13	孔措蓝 Kongcuolan	中国西藏 Tibet, China
X14	GAIRDNER	澳大利亚 Australia
X15	龙中蓝 Longzhonglan	中国西藏 Tibet, China
X16	鬼怒3号 Guinu 3	日本 Japan
X17	克山城区大麦 Keshanchengqudamai	中国黑龙江 Heilongjiang, China
X18	武威黑大麦 Wuweiheidamai	中国甘肃 Gansu, China
X19	倍取10号 Beiqu 10	日本 Japan
X20	驻87-3-2 ZHU 87-3-2	中国河南 Henan, China
X21	安吉落芒毛大麦 Anjiluomangdamai	中国浙江 Zhejiang, China
X22	八楞子大麦 Balengzidamai	中国 China
X23	盐91128 Yan 91128	中国江苏 Jiangsu, China
X24	长芒六棱露仁 Changmangliulengluren	中国 China
X25	西海皮44号 Xihaipi 44	日本 Japan
X26	沪麦4号 Humai 4	中国上海 Shanghai, China
X27	洛松 Luosong	中国 China
X28	耐盐C2118 Naiyan C2118	中国北京 Beijing, China
X29	嵊县无芒六棱 Shengxianwumangliuleng	中国浙江 Zhejiang, China
X30	天台白四棱 Tiantaibaisileng	中国浙江 Zhejiang, China
X31	新登蒙古麦 Xindengmenggumai	中国内蒙古 Inner Mongolia, China
X32	秀9560 Xiu 9560	中国浙江 Zhejiang, China
X33	永嘉元麦 Yongjiayuanmai	中国浙江 Zhejiang, China
X34	崇信春大麦 Chongxinchundamai	中国甘肃 Gansu, China
X35	鉴35 (元麦) Jian 35 (Yuanmai)	中国江苏 Jiangsu, China
X36	北青三号 Beiqing 3	中国青海 Qinghai, China
X37	美丽黄金 Meilihuangjin	日本 Japan
X38	MORRISON	美国 USA
X39	宽颖裸麦 Kuanyinluomai	中国 China
X40	懒黄种 Lanhuangzhong	中国西藏 Tibet, China
X41	沪01-2946 Hu 01-2946	中国上海 Shanghai, China
X42	哈铁系1号 Hatiexi 1	中国黑龙江 Heilongjiang, China
X43	短钩裸大麦 Duangouluodamai	中国 China
X44	秀麦2号 Xiumai 2	中国浙江 Zhejiang, China
X45	新啤一号 Xinpi 1	中国新疆 Xinjiang, China
X46	关东二条19号 Gongdong’ertiao 19	日本 Japan
X47	TALLON	澳大利亚 Australia
X48	KAPUTOR	澳大利亚 Australia
X49	星胜NO.1 Xingsheng NO.1	中国山东 Shandong, China
X50	草麦 Caomai	中国 China
X51	港啤1号 Gangpi 1	中国江苏 Jiangsu, China
X52	缟检-4 Gaojian 4	日本 Japan
X53	SCHOONER	澳大利亚 Australia
X54	Mikanwgold	日本 Japan
X55	莆895067 Pu 895067	中国福建 Fujian, China
X56	浙皮1号 Zhepi 1	中国浙江 Zhejiang, China
X57	NAMOI	美国 USA
X58	通麦10号 Tongmai 10	中国江苏 Jiangsu, China
X59	Gobernadora	英国 Britain
X60	吉8701 Ji 8701	中国吉林 Jilin, China
X61	乐清洋大麦 Yueqingyangdamai	中国浙江 Zhejiang, China
X62	米麦114 Mimai 114	中国浙江 Zhejiang, China
X63	矮脚二棱 Aijiao’erleng	中国 China
X64	扬饲麦1号 Yangsimai 1	中国江苏 Jiangsu, China
X65	粑地虎 Padihu	中国 China
X66	单二 Sahner	中国江苏 Jiangsu, China
X67	花11 Hua 11	中国上海 Shanghai, China
X68	蒙啤一号 Mengpi 1	中国内蒙古 Inner Mongolia, China
X69	BARI287	—
X70	TRADITION	美国 USA
X71	LEGACY	加拿大 Canada
X72	COLLINS	—
X73	盐05023 Yan 05023	中国江苏 Jiangsu, China
X74	扬辐7110 Yangfu 7110	中国江苏 Jiangsu, China
X75	如东203-1 Rudong 203-1	中国江苏 Jiangsu, China
X76	莆848104 Pu 848104	中国福建 Fujian, China
X77	驻06095-2-1 Zhu 06095-2-1	中国河南 Henan, China
X78	鄂大麦32122 Edamai 32122	中国湖北 Hubei, China
X79	黑09-26 Hei 09-26	中国黑龙江 Heilongjiang
X80	驻大麦5号 Zhudamai 5	中国河南 Henan, China
X81	印度矮生 Yindu’aisheng	印度 India
X82	通0306 Tong 0306	中国江苏 Jiangsu, China
X83	保大麦13号 Baodamai 13	中国云南 Yunnan, China
X84	盐2013品15 Yan 2013 Pin 15	中国江苏 Jiangsu, China
X85	盐黑1号 Yanhei 1	中国江苏 Jiangsu, China
X86	萨加青稞 Sajiaqingke	中国青海 Qinghai, China
X87	湟源蓝青稞 Huangyuanlanqingke	中国青海 Qinghai, China
X88	西宁红服泥 Xininghongfuni	中国青海 Qinghai, China
X89	无皮青稞 (甘南) Wupiqingke (Gannan)	中国甘肃 Gansu, China
X90	甘孜白六棱Ganzibailiuleng	中国四川 Sichuan, China
X91	苏裸麦1号 Suluomai 1	中国青海 Qinghai, China
X92	勾芒白青稞 Goumangbaiqingke	中国青海 Qinghai, China
X93	长身子青稞 (甘南) Changshenziqingke (Gannan )	中国青海 Qinghai, China
X94	藏830563 Zang 830563	中国西藏 Tibet, China
X95	足捉春青稞 (甘孜) Zuzhuochunqingke (Ganzi)	中国四川 Sichuan, China
X96	甘青1号 Ganqing 1	中国甘肃 Gansu, China
X97	珉县青稞 Minxianqingke	中国青海 Qinghai, China
X98	循化黑青稞 Xunhuaheiqingke	中国青海 Qinghai, China
X99	矮杆齐 Aiganqi	中国青海 Qinghai, China
X100	民和四棱蓝青稞 Minhesilenglanqingke	中国青海 Qinghai, China
X101	小金沙龙狗尾 (甘孜) Xiaojinshalonggouwei (Ganzi)	中国四川 Sichuan, China
X102	涅如姆扎ZDM7701 Nierumuza ZDM7701	中国西藏 Tibet, China
X103	大粒98-714 Dali 98-714	墨西哥 Mexico
X104	权青稞 Quanqingke	中国西藏 Tibet, China
X105	大通白六棱 Datongbailiuleng	中国青海 Qinghai, China
X106	小青稞 (金塔) Xiaoqingke (Jinta)	中国甘肃 Gansu, China
X107	嵊县无芒大麦 Shengxianwumangdamai	中国浙江 Zhejiang, China
X108	浙原18 Zheyuan 18	中国浙江 Zhejiang, China
X109	秀麦3号 Xiumai 3	中国浙江 Zhejiang, China
X110	嵊县209 Shengxian 209	中国浙江 Zhejiang, China
X111	临海光头大麦 Linhaiguangtoudamai	中国浙江 Zhejiang, China
X112	玉环洋大麦 Yuhuanyangdamai	中国浙江 Zhejiang, China
X113	紫皮大麦 Zipidamai	中国 China
X114	新民大麦 Xinmindamai	中国 China
X115	甘木二条 Amagi Nijo	日本 Japan
X116	冬青15号Dongqing 15	中国西藏 Tibet, China
X117	浙农白壳 Zhenongbaike	中国浙江 Zhejiang, China
X118	藏83062 Zang 83062	中国西藏 Tibet, China
X119	Mirra	德国 Germany
X120	MARION	德国 Germany
X121	KASKADE	德国 Germany
X122	HALCYON	英国 Britain
X123	Micmac	加拿大 Canada
X124	TOKAK	土耳其 Turkey
X125	FLAMENCO	法国 France
X126	PANDA	法国 France
X127	KARAT	捷克 Czekh
X128	ZAVET-3	苏联 the Soviet Union
X129	HORDEUM SPONTANEUM VAR SPONTANEUM	德国 Germany
X130	ATHS	埃及 Egypt
X131	SHANNON	澳大利亚 Australia
X132	ALFA	丹麦 Denmark
X133	ALKAR	克罗地亚 Croatia
X134	ARIANA	突尼斯 Tunis
X135	ATHENAIS	塞浦路斯 Cyprus
X136	BANNACKY II	捷克 Czekh
X137	BOHEMIAN	奥地利 Austria
X138	Boyer	美国 USA
X139	BUCHER	伊拉克 Iraq
X140	CHEVRON	瑞士 Japan
X141	FREJA	瑞典 Japan
X142	Glacier	美国 USA
X143	ISABELLA	德国 Germany
X144	DIAMOND	加拿大 Canada
X145	CAMEO	英国 Britain
X146	BONITA	乌拉圭 Ukraine
X147	ARABIAN BLUE	澳大利亚 Australia
X148	BARBLESS	美国 USA
X149	BLACK 2 ROW-HULLED	—
X150	CLAUDE	加拿大 Canada
X151	FAVORIT	捷克斯洛伐克 Czechoslovakia
X152	GOLDTHORPE SPRATT	英国 Britain
X153	HATVANI	匈牙利 Hungary
X154	HEINES HANNA	德国 Germany
X155	HILAND	美国 USA
X156	ORGE (ESPERANCE)	摩洛哥 Morocco
X157	PUSA NO.1	印度 India
X158	RAGUSA B	前南斯拉夫Yugoslavia
X159	SLOVAK	加拿大 Canada
X160	SPARTAN (DEHISCENT AWN)	美国 USA
X161	STEVELAND	美国 USA
X162	FORREST (USA)	美国 USA
X163	ULANDRA	澳大利亚 Australia
X164	SHERPA	英国 Britain
X165	H. DISTICHUM NUTANS	葡萄牙 Portuguesa
X166	CANADA 574234	加拿大 Canada
X167	JAPAN 47C11-24	日本 Japan
X168	H.SPONT. X-15	以色列 Israel
X169	HERMON	以色列 Israel
X170	WINCHESTER	美国 USA
X171	TAPGOLBORI	韩国 Korea
X172	HOHENFINOWER	德国 Germany
X173	TURKEY 568	土耳其 Turkey
X174	GOLDIE	瑞典 Japan
X175	HEITPAS-5	美国 USA
X176	MAMLUK	苏联 the Soviet Union
X177	DAEJINBORI	韩国 Korea
X178	CHOCHALUNG	尼泊尔 Nepal
X179	VIOLA	德国 Germany
X180	ARUPO S	墨西哥 Mexico
X181	PALLIDUM 043	乌克兰 Ukraine
X182	RUSSIA	美国 USA
X183	KHEMUS	保加利亚 Bulgaria
X184	WHITE NAKED ATLAS - SUSPECT	埃塞俄比亚 Ethiopia
X185	LUKJANOVAE	苏联 the Soviet Union
X186	CHEPUA	尼泊尔 Nepal
X187	AKHELOL 1	保加利亚 Bulgaria
X188	H.VULG. VAR PALLIDUM	阿尔及利亚 Algeria
X189	藏青85 Zangqing 85	中国西藏 Tibet, China
X190	RIHANE 'S'	叙利亚 Syria
X191	SPONTANEUM 2	伊朗 Iran
X192	KELT	以色列 Israel
X193	九州二条 Jiuzhou’ertiao	日本 Japan
X194	三月黄 Sanyuehuang	中国浙江 Zhejiang, China
X195	Araplies	加拿大 Canada
X196	京裸11 Jingluo 11	中国北京 Beijing, China
X197	宾县皮4号 Binxianpi 4	中国四川 Sichuan, China
X198	盐选1号 Yanxuan 1	中国江苏 Jiangsu, China
X199	六棱黑青稞 Liulengheiqingke	中国西藏 Tibet, China
X200	龙中黄 Longzhonghuang	中国西藏 Tibet, China
X201	关东二条22号 Gongdongertiao 22	日本 Japan
X202	Kinuya tata	日本 Japan
X203	拜泉皮1号 Baiquanpi 1	中国黑龙江 Heilongjiang, China
X204	美97-1338 Mei 97-1338	美国 USA
X205	麻青稞 Maqingke	中国甘肃 Gansu, China
X206	济南火烧头露仁 Jinanhuoshaotouluren	中国山东 Shandong, China
X207	绥定青稞 Suidingqingke	中国四川 Sichuan, China
X208	泰顺四棱米麦 Taishunsilengmimai	中国浙江 Zhejiang, China
X209	义乌早大麦 Yiwuzaodamai	中国浙江 Zhejiang, China
X210	御岛裸 Yudaoluo	日本 Japan
X211	红露仁青稞 Honglurenqingke	中国陕西 Shaanxi, China
X212	黄青稞 Huangqingke	中国甘肃 Gansu, China
X213	U.S.D.A.2474	美国 USA
X214	临海老来红 Linhailaolaihong	中国浙江 Zhejiang, China
X215	绵阳87-10 Mianyang 87-10	中国四川 Sichuan, China
X216	不知梅雨 Buzhimeiyu	日本 Japan
X217	野生皮大麦-1 Yeshengpidamai -1	中国西藏 Tibet, China
X218	乐啤4号 Lepi 4	中国四川 Sichuan, China
X219	紫青稞 Ziqingke	中国青海 Qinghai, China
X220	POCO	澳大利亚 Australia
X221	凉城大粒洋大麦 Liangchengdaliyangdamai	中国内蒙古 Inner Mongolia, China
X222	敖德萨 Aodesa	苏联 the Soviet Union
X223	KLAGES	美国 USA
X224	浙农大3号 Zhenongda 3	中国浙江 Zhejiang, China
X225	矮秆-4 Aigan-4	中国 China
X226	早熟3号 Zaoshu 3	日本 Japan
X227	单3 Shan 3	中国江苏 Jiangsu, China
X228	驻112 Zhu 112	中国河南 Henan, China
X229	甘啤2号 Ganpi 2	中国甘肃 Gansu, China
X230	沪麦12号 Humai 12	中国上海 Shanghai, China
X231	通鉴43 Tongjian 43	中国江苏 Jiangsu, China
X232	LARA	澳大利亚 Australia
X233	矮壮21 Aizhuang 21	中国江苏 Jiangsu, China
X234	丰农啤1号 Fengnongpi 1	中国江苏 Jiangsu, China
X235	扬农啤2号 Yangnongpi 2	中国江苏 Jiangsu, China
X236	盐丰1号 Yanfeng 1	中国江苏 Jiangsu, China
X237	康青9号 Kangqing 9	中国四川 Sichuan, China
X238	昆仑14 Kunlun 14	中国青海 Qinghai, China
X239	民和长芒青稞 Minhechangmangqingke	中国青海 Qinghai, China
X240	Rainbow	英国 Britain
X241	AKKA	瑞典 Sweden
X242	Birka	加拿大 Canada
X243	WINTERMALT	美国 USA
X244	GALLEON	澳大利亚 Australia
X245	MELUSINE	法国 France
X246	ABLYN	澳大利亚 Australia
X247	ABUSIR	埃及 Egypt
X248	ADORRA	奥地利 Austria
X249	AIM	埃及 Egypt
X250	AKELA	德国 Germany
X251	AKER	美国 USA
X252	ALBERT	法国 France
X253	ALBERTA 1	加拿大 Canada
X254	ALGERIA 6	阿尔及利亚 Algeria
X255	ANOIDIUM	阿根廷 Argentina
X256	ARAMIR	荷兰 Holland
X257	ARGENTINE	阿根廷 Argentina
X258	ASPA	德国 Germany
X259	BADGER	墨西哥 Mexico
X260	BALODI	英国 Britain
X261	BERAC	荷兰 Holland
X262	BLACK EGYPTIAN	美国 USA
X263	Gateway	加拿大 Canada
X264	GOLDMARKER	英国 Britain
X265	VISTA	英国 Britain
X266	PARWAN	澳大利亚 Australia
X267	CHALET	瑞士 Japan
X268	EMMA	荷兰 Holland
X269	FAMESH	美国 USA
X270	GAZELLE	加拿大 Canada
X271	GOLDEN MELON	日本 Japan
X272	GUYMALAYE	丹麦 Denmark
X273	HEY SPECIAL	葡萄牙 Portuguesa
X274	HISPONT	德国 Germany
X275	LUBAS	伊拉克 Iraq
X276	RASPUT	俄罗斯 Russia
X277	GOLD MEDAL	德国 Germany
X278	ACUMAI-89	巴西 Brazil
X279	AGNETA	瑞典 Japan
X280	GURZAN	阿富汗 Afghanistan
X281	JASPIS (SPRING)	捷克 Czekh
X282	LAND RACE 3832/29	澳大利亚 Australia
X283	KIMALUNG	尼泊尔 Nepal
X284	海盐大麦 Haiyandamai	中国浙江 Zhejiang, China
X285	泰兴8425 Taixing 8425	中国江苏 Jiangsu, China
X286	PUSA R1	印度 India
X287	CHALUS	伊朗 Iran
X288	Franklin	澳大利亚 Australia

Supplementary table 1

References 32

[1]	Heun M, Kennedy A E, Anderson J A, Lapitan N L V, Sorrells M E, Tanksley S D. Construction of a restriction fragment length polymorphism map for barley (Hordeum vulgare). Genome, 1991,34:437-447.
[2]	Van Hintum T J. Comparison of marker system and construction of a core collection in pedigree of European spring barley. Theor Appl Genet, 1994,89:991-997.
[3]	Davila J A, Sanchez M P, Loarce Y, Ferrer E. The use of random amplified microsatellite polymorphic DNA and coefficients of parentage to determine genetic relationships in barley. Genome, 1998,41:477-486.
[4]	Hanif Z, Swatiz A, Khan I, Hassant G, Marwat K B, Ali S, Ishfaq Khan M. RAPD and SSR analysis of wild oats (Avena species) from north west frontier province of Pakistan. Albrecht Von Graaes Archiv Für Ophthalmol, 2008,245:1229-1231.
[5]	黄祥斌, 杨华林. 采用PCR-RAPD技术鉴定16种北美啤酒大麦. 啤酒科技, 2003, (10):52-54.
	Huang X B, Yang H L. Identification of 16 North American beer barley by PCR-RAPD. Beer Sci Technol, 2003, (10):52-54.
[6]	吴亚君, 王斌, 韩建勋, 张振民, 杨海荣, 陈颖. 采用RAPD-毛细管芯片电泳法鉴定啤酒大麦品系. 食品与发酵工业, 2012,38(2):174-180.
	Wu Y J, Wang B, Han J X, Zhang Z M, Yang H R, Chen Y. Identification of beer barley strain by RAPD-capillary chip electrophoresis. Food Ferment Ind, 2012,38(2):174-180.
[7]	谷方红, 张五九, 冯景章, 林智平. 酿造大麦品种鉴定技术的研究. 啤酒科技, 2003, (11):27-29.
	Gu F H, Zhang W J, Feng J Z, Lin Z P. Study on identification techniques of brewed barley varieties. Beer Sci Technol, 2003, (11):27-29.
[8]	初雷. 酿酒大麦种质资源AFLP分子指纹图谱构建. 大连工业大学硕士论文, 辽宁大连, 2011. pp 37-42.
	Chu L. Construction of AFLP Molecular Fingerprints of Wine Barley Germplasm Resources. MS Thesis of Dalian University of Technology, Dalian, Liaoning, China, 2011. pp 37‒42 (in Chinese with English abstract).
[9]	Russel J R, Fuller J D, Macaulay M. Direct comparisons of level of genetic variation among barley accessions detected by RFLPs, AFLPs, SSRs, and RAPD. Theor Appl Genet, 1997,95:714-722.
[10]	朱彩梅, 张京. 应用SSR标记分析中国糯大麦种质的遗传多样性. 植物遗传资源学报, 2010,11:57-64.
	Zhu C M, Zhang J. Genetic diversity analysis of waxy barley in China based on SSR markers. J Plant Genet Resour, 2010,11:57-64 (in Chinese with English abstract).
[11]	王艳平, 沈奇, 张继红, 李华勇, 吴燕. 大麦DUS测试标准品种的遗传多样性分析及指纹图谱的构建. 麦类作物学报, 2013,33:273-278.
	Wang Y P, Shen Qi, Zhang J H, Li H Y, Wu Y. Genetic diversity analysis and building of DNA fingerprints of barley standard varieties in DUS testing based on SSR markers. J Triticeae Crops, 2013,33:273-278 (in Chinese with English abstract).
[12]	杨振华. 啤酒大麦SSR分子标记PCR反应体系的建立与优化. 黑龙江农业科学, 2015, (5):26-29.
	Yang Z H. Establishment and optimization of SSR molecular marker PCR reaction system for beer barley. Heilongjiang Agric Sci, 2015, (5):26-29.
[13]	张利莎, 董国清, 扎桑, 卓嘎, 王德良, 谷方红, 袁兴淼, 张京, 郭刚刚. 基于EST-SSR和SNP标记的大麦麦芽纯度检测. 作物学报, 2015,41:1147-1154.
	Zhang L S, Dong G Q, Zha sang, Zhuo ga, Wang D L, Gu F H, Yuan X M, Zhang J, Guo G G. EST-SSR and SNP markers based barley malt purity detection. Acta Agron Sin, 2015,41:1147-1154 (in Chinese with English abstract).
[14]	Pattemore J A, Rice N, Marshall D F, Waugh R, Henry R J. Cereal variety identification using MALDI-TOF mass spectrometry SNP genotyping. J Cereal Sci, 2010,52:356-361.
[15]	徐东东, 张利莎, 董国清, 谷方红, 王德良, 袁兴淼, 张京, 郭刚刚. SNP标记分型与品质分析联合的麦芽纯度及品种真实性鉴定. 啤酒科技, 2015, (1):28-31.
	Xu D D, Zhang L S, Dong G Q, Gu F H, Wang D L, Yuan X M, Zhang J, Guo G G. Identification of malt purity and variety authenticity combined with SNP marker typing and quality analysis. Beer Sci Technol, 2015, (1):28-31.
[16]	冯芳君, 罗利军, 李荧, 周立国, 徐小艳, 吴金红, 陈宏伟, 陈亮, 梅捍卫 . 水稻 InDel和SSR标记多态性的比较分析. 分子植物育种, 2005,3:725-730.
	Feng F J, Luo L J, Li Y, Zhou L G, Xu X Y, Wu J H, Chen H W, Chen L, Mei H W. Comparative analysis of polymorphism InDel and SSR markers in Rice. Mol Plant Breed, 2005,3:725-730 (in Chinese with English abstract).
[17]	杨德卫, 曾美娟, 卢礼斌, 叶宁, 刘成德, 郑向华, 叶新福. 一个水稻矮秆突变体的遗传分析及基因定位. 植物学报, 2011,46:617-624.
	Yang D W, Zeng M J, Lu L B, Ye N, Liu C D, Zheng X H, Ye X F. Genetic analysis and gene mapping of a rice dwarf mutant. Acta Bot Sin, 2011,46:617-624.
[18]	葛敏, 蒋璐, 张晓林, 赵涵, 张体付. 利用Insertion/Deletion (InDel)分子标记检测玉米互交种混杂的原理及应用. 分子植物育种, 2013,11:37-47.
	Ge M, Jiang L, Zhang X L, Zhao H, Zhang T F. The principle of distinguishing maize hybrids of direct and reciprocal crosses using Insertion/Deletion (InDel) markers and its application. Mol Plant Breed, 2013,11:37-47 (in Chinese with English abstract).
[19]	张体付, 葛敏, 韦玉才, 赵涵. 玉米功能性Insertion/Deletion (InDel)分子标记的挖掘及其在杂交种纯度鉴定中的应用. 玉米科学, 2012,20(2):64-68.
	Zhang T F, Ge M, Wei Y C, Zhao H. Discovery for maize function Insertion/Deletion (InDel) polymorphic marker and its implication in purity identification of maize hybrid seeds. J Maize Sci, 2012,20(2):64-68 (in Chinese with English abstract).
[20]	周玲, 梁帅强, 林峰, 吕远大. 玉米二态性InDel位点的鉴定和分子标记开发. 江苏农业学报, 2016,32:1223-1231.
	Zhou L, Liang S Q, Lin F, Lyu Y D. Biallelic InDel loci detection and molecular marker development in maize. Jiangsu J Agric Sci, 2016,32:1223-1231 (in Chinese with English abstract).
[21]	陈吉宝, 景蕊莲, 员海燕, 卫波, 昌小平. 小麦TaDREB1基因的单核苷酸多态性分析. 中国农业科学, 2005,38:2387-2394.
	Chen J B, Jing R L, Yuan H Y, Wei B, Chang X P. Study on single nucleotide polymorphism of TaDREB1 gene in wheat. Sci Agric Sin, 2005,38:2387-2394 (in Chinese with English abstract).
[22]	尚世界. 小麦抗病基因类似序列(RGA)标记开发及其利用. 中国农业科学院研究生院硕士学位论文, 北京, 2009. pp 36-41.
	Shang S J. Development and Application of RGA Markers in Wheat. MS Thesis of Chinese Academy of Agricultural Sciences, Beijing, China, 2009. pp 25-27 (in Chinese with English abstract)
[23]	刘栓桃, 张志刚, 王荣花, 王立华, 李巧云, 赵智中. 基于InDel标记的大白菜育种材料分子身份证构建. 中国蔬菜, 2019, (2):34-41.
	Liu S T, Zhang Z G, Wang R H, Wang L H, Li Q Y, Zhao Z Z. Molecular ID card construction of Chinese cabbage breeding materials based on InDel marker. China Veget, 2019, (2):34-41.
[24]	兰青阔, 张桂华, 王永, 赵新, 朱珠, 杜胜利, 程奕. 基于InDel标记快速检测黄瓜津优38种子纯度. 种子, 2011,30(6):19-23.
	Lan Q K, Zhang G H, Wang Y, Zhao X, Zhu Z, Du S L, Cheng Y. Detecting seed purity quickly by InDel molecular of cucumber Jinyou-38. Seed, 2011,30(6):19-23 (in Chinese with English abstract).
[25]	张圣平, 苗晗, 程周超, 张忠华, 武剑, 孙日飞, 顾兴芳. 黄瓜果实苦味(Bt)基因的插入缺失(InDel)标记. 农业生物技术学报, 2011,19:649-653.
	Zhang S P, Miao H, Cheng Z C, Zhang Z H, Wu J, Sun R F, Gu X F. The insertion-deletion (InDel) marker linked to the fruit bitterness gene (Bt) in cucumber. J Agric Biotechnol, 2011,19:649-653 (in Chinese with English abstract).
[26]	李斯更, 沈镝, 刘博, 邱杨, 张晓辉, 张忠华, 王海平, 李锡香. 基于黄瓜基因组重测序的InDel标记开发及其应用. 植物遗传资源学报, 2013,14:278-283.
	Li S G, Shen W, Liu B, Qiu Y, Zhang X H, Zhang Z H, Wang H P, Li X X. Development and application of cucumber InDel markers based on genome re-sequencing. J Plant Genet Resour, 2013,14:278-283 (in Chinese with English abstract).
[27]	Mayer K F, Waugh R, Brown J W, Schulman A, Langridge P. A physical, genetic and functional sequence assembly of the barley genome. Nature, 2012,544:427-433.
[28]	Mascher M, Gundlach H, Himmelbach A, Beier S, Twardziok S O, Wicker T, Radchuk V, Dockter C, Hedley P E, Russell J, Bayer M, Ramsay L, Liu H, Haberer G, Zhang X. Q, Zhang Q, Barrero R A, Li L, Taudien S, Groth M, Felder M, Hastie A, Šimková H, Staňková H, Vrána J, Chan S, Muñoz-Amatriaín M, Ounit R, Wanamaker S, Bolser D, Colmsee C, Schmutzer T, Aliyeva-Schnorr L, Grasso S, Tanskanen J, Chailyan A, Sampath D, Heavens D, Clissold L, Cao S, Chapman B, Dai F, Han Y, Li H, Li X, Lin C, McCooke J K, Tan C, Wang P, Wang S, Yin S, Zhou G, Poland J A, Bellgard M I, Borisjuk L, Houben A, Doležel J, Ayling S, Lonardi S, Kersey P, Langridge P, Muehlbauer G J, Clark M D, Caccamo M, Schulman A H, Mayer K F X, Platzer M, Close T J, Scholz U, Hansson M, Zhang G, Braumann I, Spannagl M, Li C, Waugh R, Stein N. A chromosome conformation capture ordered sequence of the barley genome. Nature, 2017,491:711-716.
[29]	Lü Y D, Liu Y H, Zhao H. mInDel: a high-throughput and efficient pipeline for genome-wide InDel marker development. BMC Genomics, 2016,17:290.
[30]	陆海燕, 程璐, 王显生, 赵涵, 沈奇. 基于高通量测序的棉花InDel标记开发及其应用. 棉花学报, 2019,31:297-306.
	Lu H Y, Chen L, Wang X S, Zhao H, Shen Q. Development and application of cotton InDel markers based on high throughput sequencing. Cotton Sci, 2019,31:297-306 (in Chinese with English abstract).
[31]	Saitou N, Nei M. The neighbor-joining method: A new method for reconstructing phylogenetic trees. Mol Biol Evol, 1987,4:406-425.
[32]	张英虎, 沈会权, 臧慧, 栾海业, 乔海龙, 陶红, 陈健, 陈和. 1982-2011年江苏大麦育成品种亲本分析. 江苏农业科学, 2016,44(4):141-145.
	Zhang Y H, Shen H Q, Zang H, Luan H Y, Qiao H L, Tao H, Chen J, Chen H. Analysis of parents of Jiangsu barley breeding varieties from 1982 to 2011. Jiangsu Agric Sci, 2016,44(4):141-145.

Metrics

Viewed

Full text

819

HTML			PDF

Just accepted	Online first	Issue	Just accepted	Online first	Issue
0	0	25	6	0	788

From	Others	local

Times	81	738
Rate	10%	90%

Abstract

1276

Just accepted	Online first	Issue

12	0	1264

From	Others	local

Times	4	1272
Rate	0%	100%

Cited

Web of Science	Crossref	ScienceDirect	Search for Citations in Google Scholar >>


This page requires you have already subscribed to WoS.

Shared

Discussed

Comments

Recommended 0

No Suggested Reading articles found!

Development and application of InDel markers based on high throughput sequencing in barley

RichHTML372

PDF

Abstract

Cite this article

share this article

Figures/Tables 6

References 32

Related Articles 15

Metrics

Comments

Recommended 0

[1]	WANG Xing-Rong, LI Yue, ZHANG Yan-Jun, LI Yong-Sheng, WANG Jun-Cheng, XU Yin-Ping, QI Xu-Sheng. Drought resistance identification and drought resistance indexes screening of Tibetan hulless barley resources at adult stage [J]. Acta Agronomica Sinica, 2022, 48(5): 1279-1287.
[2]	YAO Xiao-Hua, WANG Yue, YAO You-Hua, AN Li-Kun, WANG Yan, WU Kun-Lun. Isolation and expression of a new gene HvMEL1 AGO in Tibetan hulless barley under leaf stripe stress [J]. Acta Agronomica Sinica, 2022, 48(5): 1181-1190.
[3]	WANG Rui, CHEN Xue, GUO Qing-Qing, ZHOU Rong, CHEN Lei, LI Jia-Na. Development of linkage InDel markers of the white petal gene based on whole-genome re-sequencing data in Brassica napus L. [J]. Acta Agronomica Sinica, 2022, 48(3): 759-769.
[4]	HE Jun-Yu, ZHONG Wei, CHEN Yun-Qiong, WANG Wei-Bin, XIONG Jing-Lei, JIANG Ya-Li, SHI Hui-Meng, CHEN Sheng-Wei. Analysis on the accumulation characteristics of seven flavonoids at grain development stage in barley [J]. Acta Agronomica Sinica, 2021, 47(8): 1624-1630.
[5]	GENG La, HUANG Ye-Chang, LI Meng-Di, XIE Shang-Geng, YE Ling-Zhen, ZHANG Guo-Ping. Genome-wide association study of β-glucan content in barley grains [J]. Acta Agronomica Sinica, 2021, 47(7): 1205-1214.
[6]	LI Jie, FU Hui, YAO Xiao-Hua, WU Kun-Lun. Differentially expressed protein analysis of different drought tolerance hulless barley leaves [J]. Acta Agronomica Sinica, 2021, 47(7): 1248-1258.
[7]	ZHANG Fan, YANG Qian. Effects of combined application of organic materials and chemical fertilizers in barley-double cropping rice rotation system on barley resource utilization efficiency and yield [J]. Acta Agronomica Sinica, 2021, 47(12): 2522-2531.
[8]	JIANG Shu-Kun,WANG Li-Zhi,YANG Xian-Li,LI Bo,MU Wei-Jie,DONG Shi-Chen,CHE Wei-Cai,LI Zhong-Jie,CHI Li-Yong,LI Ming-Xian,ZHANG Xi-Juan,JIANG Hui,LI Rui,ZHAO Qian,LI Wen-Hua. Detection of QTLs controlling cold tolerance at bud bursting stage by using a high-density SNP linkage map in japonica rice [J]. Acta Agronomica Sinica, 2020, 46(8): 1174-1184.
[9]	ZHAO Xiao-Hong,BAI Yi-Xiong,WANG Kai,YAO You-Hua,YAO Xiao-Hua,WU Kun-Lun. Effects of planting density on lodging resistance and straw forage characteristics in two hulless barley varieties [J]. Acta Agronomica Sinica, 2020, 46(4): 586-595.
[10]	Yin-Ping XU, Yong-Dong PAN, Qiang-De LIU, Yuan-Hu YAO, Yan-Chun JIA, Cheng REN, Ke-Cang HUO, Wen-Qing CHEN, Feng ZHAO, Qi-Jun BAO, Hua-Yu ZHANG. Drought resistance identification and drought resistance indexes screening of barley resources at mature period [J]. Acta Agronomica Sinica, 2020, 46(3): 448-461.
[11]	YANG Xiao-Meng, LI Xia, PU Xiao-Ying, DU Juan, Muhammad Kazim Ali, YANG Jia-Zhen, ZENG Ya-Wen, YANG Tao. QTL mapping for total grain anthocyanin content and 1000-kernel weight in barley recombinant inbred lines population [J]. Acta Agronomica Sinica, 2020, 46(01): 52-61.
[12]	SHI Li-Jie,JIANG Cong-Cong,WANG Fang-Mei,YANG Ping,FENG Zong-Yun. Genome-wide characterization and transcriptional analysis of the protein disulfide isomerase-like genes in barley (Hordeum vulgare) [J]. Acta Agronomica Sinica, 2019, 45(9): 1365-1374.
[13]	WANG Kai,ZHAO Xiao-Hong,YAO Xiao-Hua,YAO You-Hua,BAI Yi-Xiong,WU Kun-Lun. Relationship of stem characteristics and lignin synthesis with lodging resistance of hulless barley [J]. Acta Agronomica Sinica, 2019, 45(4): 621-627.
[14]	Xiao-Ding MA,Jiang-Hong TANG,Jia-Ni ZHANG,Di CUI,Hui LI,Mao-Mao LI,Long-Zhi HAN. Development of molecular markers polymorphic between Dongxiang wild rice and Geng rice cultivar ‘Nipponbare’ [J]. Acta Agronomica Sinica, 2019, 45(2): 316-321.
[15]	Lhundrupnamgyal,Hui-Hui LI,Gang-Gang GUO, Chemiwangmo,Li-Yun GAO,Ya-Wei TANG, Nyematashi, Dawadondrup, Dolkar. Growth habit identification and diversity and stability analysis of heading date in Tibetan barley (Hordeum vulgare L.) [J]. Acta Agronomica Sinica, 2019, 45(12): 1796-1805.